Candidatus Tyloplasma litorale: TYPL_3500
Help
Entry
TYPL_3500 CDS
T09841
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III PolC-type
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
tll
Candidatus Tyloplasma litorale
Pathway
tll03030
DNA replication
tll03430
Mismatch repair
tll03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tll00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
TYPL_3500 (polC)
03430 Mismatch repair
TYPL_3500 (polC)
03440 Homologous recombination
TYPL_3500 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
tll03032
]
TYPL_3500 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tll03400
]
TYPL_3500 (polC)
Enzymes [BR:
tll01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
TYPL_3500 (polC)
DNA replication proteins [BR:
tll03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
TYPL_3500 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
tll03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
TYPL_3500 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
HHH_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU67697
LinkDB
All DBs
Position
complement(375833..380125)
Genome browser
AA seq
1430 aa
AA seq
DB search
MNNFLTKIKASEDLRSKIRNGKVSALHNKIKRTIKVSFTEIEELSPKNNIELFDKTKEII
SSMGYSLEFISIDTSIKKDLLNVYHNIREFILQKVNWFNLSKIILIEKNQKFIILARDLE
TQENLFKFIENMNLFLNWMKIIDYDLEVEFIPEEFSNQKLENVINLDQQKIVNSYEKDEV
LNEEIRPNYKLINYNELDKSQTKIYYEGFVREIIKKDTKNGLSRIISFDLGYGSLSFFCS
IFDRDKKNNLNFNDGDSIRIYGNYEFDEYKKMMVIKSFNLDNIQKISRKTIMQIENDKSG
LSRYEFHLHTKMSTLDGVSYIKEYVEYAKAYNIKSLTITDHNSAQAFPEAYLVSKSTDLK
INYGVEFDVYDDLNTKIVINENNQEILTAEYVFFDLETTSVSAKYGEIIEFGGVKYKNNK
IIDKFQLFIKPKKPISEFTTSLTSITNDDVKDALDISEAIIKIKEWIGDSVLVAHNAFFD
YSFLRKAYLDNNLGEIKNLVVDSMKISWILHPNSRSHRLGVLSKHEFVEYDEKAAHRADY
DAEILCKIFERIIHKLLTNKNIRDFKTLNLESDKLKNYFFTKHLTIISKNQEGLKDINEL
VSLASINYFNTRKKTPMLPLSLFTDKSHRLLKNILIGSSCSNGFVFDMILNNDYKNLEKL
IKIYDYLEIFPPTSYDNLVNNGILTKEELNNTLKNIYELGKKNNIPVIVSSNAHYAGKKD
KKIRDVIISAKRVGGLYHPLYNFKNPNYEKPNAHLRSIDEIFEEFKNIFTKEEIIEITIT
NTKKLQSLISEQKPIKDKLYPPKIDHVEKTFKDNIENEIKKLYGDKPNQQIRDRVEREVN
SIVHHGFSIIYYLSAIAVKKSMKDGYLVGSRGSVGSSIAATFSGITEVNPLKPHYRCPKC
KWHEFEENNDITCGYDLPNKKCPKCKTEMIGDGHSIPFETFLGFNADKVPDIDLNFSREN
QSSIHHFMKEVLGEENVFRAGTISTAAFKTAVGFVKNYEELTGNYLNKSSIDLISKKIEG
IKRTTGQHPGGLIVIPNDMSIYDFTPINYPGDSADAEWKTTHFDFHSIHDNVLKLDFLGH
LDPSSIRMLQNLTKVDPQSIPMNDKEVISLFTSNKALKFKENYTNEELGIIGLPEFGTKF
VRDLVREAKPKSFADLVRISGLSHGTDVWTSNAQNLIKKQIATLSEVICVRDDIMSYLIE
KGVDNLTSFKIMESVRKGNGLTSEWEAEMIKNNVPEWYINSCKLIKYMFPKAHATAYVIM
AYRIAWYKINYPLEYYATFFSKRDVEINLKIVLKGINEMNKHIKEIKAIPRRERQKKDDD
LLDTYNIIFEMYSRGIEFDNINIHKSGSLNYNIDKENNKIIPPFSILEGVGESVAKSLTK
ARNEKSFDSIEDFKRRCNLPKKVIKLLEQMDVFETETSSIKFTKQLSLFE
NT seq
4293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataattttttaactaaaataaaagcatctgaagatttaagatctaaaataagaaat
ggaaaagtaagtgctttacataataaaataaaacgaacaattaaagtaagttttacagaa
atagaggaacttagtcctaaaaataatattgaattatttgataaaactaaagaaattatt
tcatcaatgggttattctttagagtttatttctatagatacttctattaaaaaagattta
ttaaatgtttatcataatattagagaattcatattacaaaaagttaattgatttaattta
tctaaaattattttaatagagaaaaatcaaaaattcattattttagcaagagatttggaa
actcaagaaaatttatttaagtttatagaaaatatgaatttatttttaaattgaatgaag
attattgattatgatttagaagttgaatttattcctgaagaattttcaaaccaaaaatta
gaaaatgtaattaatttagatcagcaaaaaatagttaattcatatgaaaaagatgaagtt
ttaaatgaagaaataagacctaactataaattgattaattataatgaacttgataaatca
caaacaaaaatatattatgaaggttttgtaagggagattataaaaaaagatactaaaaat
ggtttatctagaataatttcttttgatcttggatatggatctctttcatttttttgttct
atttttgatagagataaaaaaaataatttaaattttaatgatggcgattctataagaata
tatggtaattatgaatttgatgaatataagaagatgatggtaattaaatcctttaattta
gataatattcaaaaaatttcaagaaaaacaattatgcaaattgaaaatgataaatctgga
ctttctagatatgaatttcatttacatactaaaatgtcaactttagatggtgtatcttat
attaaagaatatgtggaatatgcaaaagcatataatattaaatcattaactataactgat
cataattcagcacaagcttttccagaagcttatttagtttctaagtcaactgatttaaaa
attaattatggagttgaatttgatgtttatgatgatttaaatactaaaattgtcattaat
gaaaataatcaagaaattttaactgctgagtatgttttttttgatttagaaacaacttca
gtatctgctaaatatggtgaaattattgaatttggtggtgttaaatataaaaataataaa
ataatagataagtttcaattatttataaagcctaaaaaaccaatttctgagtttacaact
tctttaacttctataactaatgatgatgttaaggatgcccttgatatttctgaagcaata
ataaaaattaaagaatgaataggtgattctgttcttgttgctcataatgctttttttgat
tattcatttttaagaaaagcatatcttgataataatttaggtgaaattaaaaatcttgtt
gttgattcaatgaaaatttcttgaatattacatcctaactctagatctcatcgattaggt
gtattatcaaaacatgaatttgttgaatatgatgaaaaagcagctcatagagcagattat
gatgctgaaattttatgtaagatttttgaaagaataattcataaacttttaacaaataaa
aacattagagattttaaaacattaaatttagaaagtgataaacttaaaaattatttcttt
acaaaacatttaacaattatttcaaaaaatcaagaaggtttaaaagatattaatgaatta
gtttcattggctagcatcaattattttaatactagaaaaaaaacaccaatgttaccacta
tcattatttactgataaatctcatcgattacttaaaaatattttaattggttcatcttgt
tcaaatggttttgtatttgatatgatactaaataatgattataagaatcttgaaaaactt
attaaaatttatgattatttagaaatttttccaccaacttcatatgataatttggtaaat
aatggaattctgacaaaagaagaattaaataatactttaaaaaatatatatgaattaggt
aaaaaaaataacattcctgttattgtttcttctaatgctcactatgctggtaaaaaagat
aaaaaaataagagatgttataatttctgctaaaagagttggaggattatatcatcctctt
tataactttaaaaatccaaattatgaaaaaccaaatgctcatttaagatcgatagatgaa
atatttgaagagtttaaaaatatttttactaaagaggaaataattgaaataacaataact
aatacaaaaaaattacaatctttaatttcagaacaaaaacccataaaagataaattatat
ccacctaaaattgatcatgttgaaaaaacattcaaagataatattgaaaatgaaattaaa
aaactttatggtgataaaccaaatcaacaaataagagatagagttgaaagagaagtaaat
tcaattgttcaccatggattttcaattatttattatctttctgctatagctgttaaaaaa
tctatgaaagatggttatttagttggttctagaggttctgttggttcatcaatagctgca
acattttcaggaattactgaagtaaatcctttaaaaccgcattatagatgtccaaaatgt
aaatgacatgaatttgaagaaaataatgatattacatgtggttatgatttaccaaataaa
aaatgtccaaaatgcaaaactgaaatgattggtgatggtcattcaataccctttgaaact
ttcttaggttttaatgcagataaagttccagatattgatcttaatttttcaagagaaaac
caatcttcaattcatcattttatgaaagaagttttgggtgaagaaaatgtttttagagca
gggacaatttctacagcggcatttaaaacagctgttggatttgttaaaaattatgaagaa
ttaacaggaaattatttaaataaatcatcgattgatttaatttctaaaaaaatagaggga
ataaaaagaactactgggcaacatcctggtgggttaatagttattcctaatgatatgtca
atatatgattttacaccaattaattatcctggtgattcagcagatgctgaatgaaaaaca
actcactttgatttccattccattcatgataatgttttaaaattagattttcttggtcat
ttagatccctcttcaattagaatgttacaaaatttaactaaagtggacccacaatcaatt
cctatgaatgataaagaagttatttctttatttacttcaaataaagctttaaaatttaaa
gaaaattatacaaatgaggagttaggaataattggtttaccagaatttggtactaaattt
gttagagatcttgtgagagaagctaaacctaaatcatttgctgacttagtgagaatatct
ggtttatcacatggaactgatgtttgaacatctaatgctcaaaatttaattaaaaaacaa
atcgcaacattatcagaggttatttgtgttcgtgatgatattatgagttatttaattgaa
aaaggtgttgataatttaacttcctttaaaataatggaatctgttcgtaaaggtaatggt
ttaacttctgaatgagaagctgaaatgattaaaaataatgttcctgaatgatatattaat
tcatgtaaattaattaagtatatgtttcctaaagctcatgccacagcttatgtaataatg
gcatatcgaattgcttgatacaaaataaattacccattagaatattatgcaactttcttt
tctaaaagagatgttgaaataaatctgaaaatagttttaaaaggcattaatgaaatgaat
aaacatattaaagaaattaaagcaatacctagaagagaacgtcaaaaaaaggatgacgat
ttattagatacatacaatattatttttgaaatgtattcaagaggaatagaatttgataat
attaatattcataaatcaggatctttaaactacaatattgacaaagaaaataataaaata
attcctcccttctctattcttgaaggtgtaggagaatcagttgcgaaatcattaacaaaa
gcaagaaatgaaaaatcatttgattcaattgaagattttaaaagaagatgtaatttacct
aaaaaagttattaagttactagagcaaatggatgtttttgaaactgaaacaagttctata
aaatttactaaacaattgtcattatttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
