KEGG   Candidatus Tyloplasma litorale: TYPL_3980
Entry
TYPL_3980         CDS       T09841                                 
Symbol
cas9
Name
(GenBank) CRISPR-associated endonuclease Cas9
  KO
K09952  CRISPR-associated endonuclease Csn1 [EC:3.1.-.-]
Organism
tll  Candidatus Tyloplasma litorale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tll00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:tll02048]
    TYPL_3980 (cas9)
Prokaryotic defense system [BR:tll02048]
 CRISPR-Cas system
  Type II CRISPR-Cas system
   Type II signiture cas proteins
    TYPL_3980 (cas9)
SSDB
Motif
Pfam: HNH_4 RuvC_III Rogdi_lz PDDEXK_10
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDU67745
LinkDB
Position
454426..457803
AA seq 1125 aa
MSKKILGLDIGVASLGWAVTKYSEENKKWEIDDFGVRLWNASEESKTLESKAQKARNFRS
QRRLVKRRLQRTIDLKNYFINQNFMTKDEIEEHFKKLTEKDNGYNSENEELNPLELRFRG
LNNELTLKQIFIVCFHIAKNRGYENMFSFDSLDNKDSRQGLKFAQDLINKYGTPIEAIKE
DEFFKGNWYRNTKTKDSKGKVILRKEKDILFTRQDLKNELTKILDKQIEFNKINEEQKNE
ILNKIIFRQRYFEDGPGRANEEMRKKEYDISKRNFSSFHDTIGKCRFYPEENRLSYNSIY
GDIFFIINELSKMFTGELKDINEEDLTQENFELNEKAKENRIKILKYVIQKYLDKKEFKE
RYVKEIFEKLEIPYSRKEKGISFSSAKLFLYNLNKNFPNWTKSELEKSNYELNLIDSNSK
IEQLGEILSNYMTPKKIIEEIKKEEININQLDEIENEIDLLKRMNKISNSGRFNVSKKYV
QDLIDESFDNGIIIGKFQDQKIKENEELIINNRKEKINNPKDIWNHVFNINSIDKDTKSN
AVVFRSINQTRIIIRALLKKYNNFSTINIEAARDLYAAKTERTAIRKSQDKFEDYNNKIK
IELEEIGAIVNSTNIERLKLFKQQAYKGSDSIAIDFYDINLKEQIKKEDIFTNEYEVDHI
YPFSKSSDNTLWNKVLTKRVYNQAKGNRTPIEYFESKNINNKQIALWLKNLKTNFKIFSK
KEIAKDSHTRKFNYLSLNKALREEDFSSRDLNDVRYIGKYLLGYFRREFNLYEELTGYKV
PKINVIRGMVTSQFRKEWLKFYIEDGERHLNPWGFDVKTRDLSPYHHSVDAIILAQFESY
SQIEYYSMFIKLKSYTSTLRKKVRLDKNFTLNDAKEELYKAFDSLKKSIKNLYISNKNEE
KINSFIKEDLTRMLDPINKAQVWFNLYPIINSLSLKIKNLVPVQLEVTKTWDDEKNRTIY
NVEYKDELLPKDWSRINNRNINEFPYPSYKIERRIRGPITGSELMVAKKEFKEDKHFKDQ
NGNIWDKSKYIGMNLDDGSKLSRYDILNKKISTTKILSINEPFEFEGKIYLYKGFSNNQI
IRGNIFYKWASNEKYKKIYGEWPYTNINKYMNFKKINISKMGKIQ
NT seq 3378 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtccaaaaaaatactaggtttagatataggagttgcatcattaggatgagcagttact
aaatatagtgaagaaaacaaaaaatgagaaattgatgattttggagttagactttgaaac
gcatctgaagaaagtaaaactttagaatcaaaagctcaaaaagcaagaaattttagatct
caaagaagattagttaagagaagacttcaaagaacaattgatttaaaaaattactttatt
aaccaaaatttcatgacaaaggatgaaattgaagaacactttaaaaaattaactgaaaaa
gataatggatataattctgaaaatgaagaattaaatccacttgaattaagatttaggggt
ttaaacaatgaattgacattaaagcaaatatttattgtttgttttcatattgctaaaaat
agaggatatgaaaatatgttctcttttgatagtctagataacaaagattcaagacaaggg
ttaaaatttgcacaagacttaatcaataaatatggaacacctattgaagcaattaaagag
gatgaattttttaaaggcaattgatatagaaatacaaaaacaaaagattcaaaaggaaaa
gtaattttaagaaaagaaaaagatattttatttacaagacaagatcttaaaaatgaatta
acaaaaatacttgataagcaaattgaatttaataaaataaacgaagaacaaaaaaatgaa
atattaaataaaatcatatttagacaaagatacttcgaagatggtccaggtagagcaaat
gaggaaatgagaaagaaagaatatgatatttcaaaaagaaatttttcatctttccatgat
actataggaaaatgtagattttatcctgaagaaaatagattatcttacaattctatatat
ggagatatattctttattattaatgaattatctaaaatgttcactggagaattaaaagat
attaatgaagaagatttaactcaagaaaattttgaattaaatgaaaaagctaaagaaaat
cgtataaaaattttaaaatatgttattcaaaaatacctagataaaaaagaatttaaagaa
agatatgtaaaggaaatatttgaaaaattagaaattccatattcaagaaaagaaaaagga
ataagtttttctagtgctaaattatttttatacaatttaaataaaaattttcctaattga
actaaaagtgaattagaaaaaagcaattatgaattaaatttaattgattcaaattccaaa
attgaacaattaggcgaaattctttctaattacatgacacctaaaaaaatcattgaagaa
attaaaaaagaagaaattaatattaatcaactagatgaaatagaaaatgaaattgattta
ctaaaaagaatgaacaaaataagtaattctggaagatttaatgtttctaaaaaatatgtt
caagatttaatcgatgagtcatttgataatggaatcatcattggcaaatttcaagatcaa
aaaataaaagaaaatgaagagttaataataaacaatagaaaagaaaaaatcaataatccc
aaagatatttgaaatcatgttttcaatataaatagtattgataaagacacaaaatctaat
gctgttgtatttagatctattaatcaaactagaattattattagagctttattaaaaaaa
tataacaatttttcaacaataaatattgaagcagcaagggatttatatgctgcaaaaact
gaaagaactgctattagaaaaagtcaagataaatttgaagattataataacaaaattaaa
attgaattagaagaaattggtgcaatagtaaattcaacaaatattgaaagattaaaatta
tttaaacaacaagcatataaaggttcagattctatagcgattgatttttatgacatcaac
ttaaaagaacaaattaaaaaagaggatatattcactaatgaatatgaagttgatcatata
tatcctttttcaaaaagttctgataatacattgtgaaataaagttttaacaaaaagagtt
tataatcaagcaaaaggaaatagaactcctattgaatattttgaatcaaaaaatatcaat
aataaacaaatagctctttgattaaaaaatttaaaaactaattttaaaatattttcaaaa
aaagaaattgctaaagattcacatactagaaaatttaattatctttctttaaacaaagca
ttaagagaagaagacttttcttcaagggatcttaatgatgttagatatattggtaaatat
ttattaggatactttagaagagaatttaatttatatgaagaattaactggttataaagtg
cctaaaataaatgtgattagaggaatggtaactagtcaatttagaaaagaatgattaaaa
ttttatatagaagatggtgaaagacatttaaatccatgaggatttgatgttaaaacaaga
gatttaagcccttatcatcactctgttgatgccataatattagctcaatttgaaagctat
tctcaaattgaatattattcaatgtttattaaattaaaatcatatacatcaacattaaga
aaaaaagtacgtttagataaaaactttactttaaatgatgctaaagaagaattatataaa
gcttttgattcattaaaaaaatcaattaaaaatttatatatttcaaacaaaaatgaagaa
aaaataaattcatttattaaagaagatttaacaagaatgttagatccaataaataaagca
caagtttgatttaatttatatccaataataaatagcctttctttaaaaattaaaaatctt
gttcctgttcaacttgaagttacaaaaacatgagatgatgaaaaaaatagaactatttat
aatgtagaatataaagatgaacttctacccaaagattgatcaagaattaataatagaaat
ataaatgaatttccttacccttcttataaaattgaaagaagaattcgtggaccaatcaca
ggtagtgaattaatggttgcaaaaaaagaatttaaagaagataaacactttaaagatcaa
aatggaaatatttgagataaatctaaatatataggaatgaatcttgatgatggttctaaa
ttaagtagatatgatattttaaataagaaaatatcaacaactaaaatcctttctattaat
gaaccatttgaatttgaaggaaaaatttatttatataaaggtttctcaaacaatcaaatt
attcgtggaaatatattttataaatgagcgtcaaatgaaaaatataaaaaaatttatgga
gaatgaccctatacaaatataaataaatatatgaattttaaaaaaattaatatatcaaaa
atgggaaaaatacaataa

DBGET integrated database retrieval system