KEGG   Candidatus Tyloplasma litorale: TYPL_5230
Entry
TYPL_5230         CDS       T09841                                 
Name
(GenBank) type I restriction endonuclease subunit R
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
tll  Candidatus Tyloplasma litorale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tll00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:tll02048]
    TYPL_5230
Enzymes [BR:tll01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     TYPL_5230
Prokaryotic defense system [BR:tll02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   TYPL_5230
SSDB
Motif
Pfam: SWI2_SNF2 T1R_D3-like ResIII HSDR_N DEAD
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDU67870
LinkDB
Position
complement(602828..605737)
AA seq 969 aa
MNKTDLEQQIERRFIQTLVKDLGWERTEIRDEHSLNLNILKQLTKINKNLNPELQLSDIQ
ELRRKIDATKFNVVKFNSWLKNGVEIRKNTKPQTLKLMNEDFCNNYFQVTNQFVVNSLSN
RDRRYDLTLLINGLPLVQIELKNPRINIKKAINQINFDYKDGYSGFFKLIQLFIVSNDVD
TRYFSNTGRRNEFKFDFAFNWSNYDKVVLRDSKSFSKDFLRKCQISKFLKDYIVPCQSQK
YEEESLIALRPYQVHAIEKIVENCESNTGKGGYVWHTTGSGKTITSYQASKLLSRVGKFE
KVLFIVDRTDLDAQTIEEFKKFDNNDEQVARAESVRDLINKLNSSKEKILITSIQKLNLL
ISDSKNESKVNSEIFNKKYVMIFDEAHRSQAGEMSLRIKNKFSNSIKFGFTGTPIFKENA
EKANKSSIPITTELLFGNLIHSYKMEEAIEDKAVLGFKYIEYNTLSDESKNKLREYKNSD
KKIDADEIENSLFYDANRMNQIVDAILKNHNDYTQNKYCSIFATYQIKNILKYFDIFKNE
KNHGFKIAALFSYNQDQDLNKIEEVLQHFNSLYPADHYNFTIKDAKDVQEVMRAYKKAVS
DKLKSGEIDIVIVHNMLLTGFDSKLINTLYVDKPLKYHGLIQAFSRTNRVYDKDKKFGKI
VSFRELKDNIDKAILLFNDGNPDAIGYRQINEFFDDLLNLFEELIGEKRIPTKEEIEAFV
DKNIDEEMLKNTEIMLKILKNYENLKYFPEFSKTENLEYVQANQVKEYVSLAFNNTREKL
IENNIINLNIRNHENEKEDEVVKLIIDFNVHEKSITTINNEYITELIIEFKNANLSEEEL
EKKLKEIESKLINLSERKKFIYLKDYIRRKFSEESFDDDPQKIENELEEEIASKQEKEFI
DFYNRNGILDIEYIDELEFYVQKITNYDKKFDDIKPDVKNFCKDKLNMDLRMRGNFFKEF
CELIEKVYY
NT seq 2910 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaacagatttagaacaacaaattgaacgtagatttatacaaacattagttaaa
gatttaggttgagaaagaacagaaattagagatgaacattctttaaatcttaatatttta
aaacaattaacaaaaataaataaaaatttaaatcctgaattacaattaagtgatattcaa
gaattaagaagaaaaatagatgcaacaaaatttaatgttgttaaatttaattcttgatta
aaaaatggagttgaaataagaaaaaacacaaaacctcaaacattaaaattaatgaatgag
gatttttgtaataactattttcaagtcacaaatcaatttgttgttaattcattatctaat
agagatagaagatatgatttgactttattaattaatggtcttcctttagtacaaattgaa
ttaaagaatccaagaatcaatattaaaaaagcaattaaccaaattaattttgattataaa
gatggatattcaggattttttaaattaattcaattatttattgtctcaaatgatgttgat
actagatattttagtaatacaggaagaagaaatgaatttaaatttgactttgcatttaat
tgatcaaattatgataaagtagttttaagagattcaaaaagcttttcaaaagatttttta
agaaagtgtcaaatttctaaatttttaaaagattatattgttccttgtcaatcacaaaaa
tacgaagaagaatcattaatagcattaagaccttatcaagttcatgcaattgaaaaaata
gttgaaaattgtgaatctaatactggaaaaggtggatatgtttgacatacaacaggttct
ggaaaaacaataacaagttaccaagcaagtaagttgctttcaagagttggaaaatttgaa
aaagttttatttatagttgatagaacagatttagatgctcaaacaattgaagaatttaag
aaatttgataataatgatgagcaagttgctcgtgctgagtctgttagagatttaattaat
aaacttaatagttcaaaagagaaaattttaataacttcaattcaaaaattaaatttatta
attagtgattctaaaaatgaaagtaaagttaattcagaaatattcaataagaaatatgtg
atgatttttgatgaagctcatagaagtcaagctggagaaatgtctttaagaattaaaaat
aaattctcaaattcaattaaatttggttttactggaactccaatttttaaagaaaatgct
gaaaaagcaaataaatcttcaataccaattacaacagaacttctttttggtaatttaatt
catagttacaaaatggaggaagcaattgaagataaagctgttttaggttttaaatatatt
gaatacaatacattaagtgatgaatcaaaaaataaattaagagaatataaaaatagtgat
aaaaaaattgatgcagatgaaattgagaattcattattttatgatgcaaacagaatgaac
caaattgtagatgcaattttaaaaaatcataatgattatactcaaaataaatattgttca
atttttgctacttatcaaataaagaatattttaaaatattttgatatattcaaaaatgaa
aaaaatcatggatttaaaattgctgctttattttcttataatcaagatcaagatttaaat
aaaattgaagaagttttacaacattttaattctctatatccagctgatcattataacttc
actattaaagatgcaaaagatgttcaagaagtaatgagagcatataaaaaagctgtttct
gataaattaaaaagtggtgaaatagatattgttatagttcataatatgttattaacaggt
tttgatagtaaattaataaatactttatatgttgataaaccattaaaataccatggatta
attcaagcatttagtagaactaatcgtgtttatgataaagataaaaaatttggaaaaata
gtttcttttagagagttaaaagataatattgataaagcaatcttattatttaatgatggt
aatcctgatgcaattggatatagacaaattaatgaattctttgatgatttattaaattta
tttgaagaattgataggtgaaaaaagaattccaacaaaagaagaaattgaagcatttgtt
gataaaaatatagatgaagaaatgcttaaaaatacagaaataatgttgaaaattctaaaa
aattatgaaaatttaaaatacttccctgaattttcaaaaactgaaaacttagaatatgta
caagctaatcaagttaaagaatatgtttcattagcttttaataacactagagaaaaatta
attgaaaataatattattaatcttaatattagaaatcatgaaaatgaaaaagaagatgaa
gttgtaaaactaattattgattttaatgttcatgaaaaaagtataactaccattaataat
gaatatataacagaattaattattgaatttaaaaatgctaatctttcagaagaagaatta
gaaaaaaaattaaaggaaatagaatcaaaattaataaacttaagtgaaagaaaaaaattt
atttaccttaaagattatataagaagaaaattttctgaagaatcttttgatgatgatcct
caaaagattgagaatgaattagaagaagaaattgcttctaaacaagaaaaagaatttatt
gatttctataacagaaatggaattctagatattgaatatattgacgaacttgaattttat
gttcaaaaaattactaattatgataaaaaattcgatgatataaaacctgatgttaaaaat
ttttgtaaggataaattaaatatggatcttagaatgagaggaaacttttttaaagaattt
tgtgaattaatagaaaaggtttattattaa

DBGET integrated database retrieval system