Temnothorax longispinosus: 139825204
Help
Entry
139825204 CDS
T10889
Name
(RefSeq) NBAS subunit of NRZ tethering complex isoform X1
KO
K20473
neuroblastoma-amplified sequence
Organism
tln Temnothorax longispinosus
Brite
Membrane trafficking [BR:
tln04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Retrieval pathways
NRZ (DSL1) complex
139825204
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nbas_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139825204
NCBI-ProteinID:
XP_071653841
LinkDB
All DBs
Position
2:7935160..7943232
Genome browser
AA seq
1928 aa
AA seq
DB search
MSNVDETSNEPILYELLEYFVRKQEPELIKCKNDAAILPATGTIKNALRYFNNRYSLPES
ILQQVSLTLPWKFAVGDHGRVLAILQENIIEIRKAKDEYSSIVGKASAPKDAFPQWRKLV
WSPNGMILVLASSSGYTSFYNALGNNIFNISPKTISQSPHILEAGDAIASMLFLKPRTTN
EKWAYEFILISYSGLLRSYHISTSGYSVNYDFSFGNFYKNGVNVIAYDEKRSLFYVAGNM
ITQKLTSTASESGLTSWRLLNDYPYCKLSFTFEDSATSNSLFSIWNLIPNFSFQSESIIF
SIKISPNGEFLVCLHTNGSVSLWGLPNLILQKKWKLPEQPEYNVPNPLGHTKSKKFPPGF
TEFHPIDIGWWSDQAIIIARYSGSTSVCSTWNLKNLLGVSPEFLAGQPQVCELGLEKGFL
CLDCETFITSKKRSREPTDGHLSASSESEKDDDELEPLTILNYTTNLVQSTLYSITDIER
FQPKRKKLKVLHRTYRILGLKSTTPEELYSRKIDIEEYEEALALANTYNLDTDLVYQTQW
RKSELSLNAIAEHLSKISKRSWVLNECVVRVPDTMEAARELLNFGLRGANLETLIAIDIC
DNDKFVTPDIEDDWQALDEITVSLRQVQKVNEMLEKIDIKNLSEAQKELIKYRRKLLNHL
DKLLTYEIILETPLKYKKEFYEEFRRLSPIENAIRFAKDSDCRAVEIMFTYYGESLLPHW
LAIISFFPETLNTLDYQKLLPECDSEGQLFLLDQRELRQKDWSEKHEFNEIINLDLDDRS
EILYELDPSLLIYRNTQLTPDLLQKWYKTRAFEIEKNSSLVDNALQLVKIGKSHNINGLV
DLLLELETLDDLVYTVHLEDMSLDKLEKLSNMEKIKLLMSTSNEINFVENIKNLLLPFIK
RRHQYLGGDLQKCLLSDYLICLSKDDLTFPVKFFKYLKQTQDIEIIEMIDDVASLALDCV
YACDDPDMYEKAKDILDSISKDDGKRTNAICILLEEFEGELDCIRLLSKYGVKTTLKFIR
KNRSDPDVAKSLLTQMARSLNKSLLPPDEREWAQLLNDMLDIHGLIFSCIAVETCFEICV
SARLLSRIKCTIRNCATLIETKKNEKSLLKVSYEKAVDLILEVSKEYFNGSRTLTDPHME
LAKTCLDLIEDDNVKIKEEYDLIRSLQILNEFNIDILPLQVRLTVDKLTLIEHCLNNQRD
AYKNRQRLLTLATYLRIEGNNSRLREGKISELIAKKALETEDYNTCAMICSQLAKNNYLL
AWEICLNLGRCDNYQDLKVRQKCLWFAINNGPSDILGNALEHMHLLEIQMLHKNLELWMP
SAEFESLKDEESDTSEDDFTDAMTTPQIEVKEFVPKMLETSTGIVKSSANIMKESTFSLL
RNISNTNFWKSRLNLNFKNDLETSAQQESEMEQNEEDINLQSFPCYYESLHELCRISVNE
TRYNKYSTTEIENTKLKCCRALLRITILSESSCYGLEISDINHLLLECAKHTMSDDWLLG
MAYLLSLNRNHILDAQAIFMDLPQVELYIQTALYYYSLELYKKLYTDCEKLYLYNPLDLM
KIMMVTAQKSEECDIVKALQYWQSYLLGGAQVTSMKQVEIKDLSALKLGQSSTRVHSEET
VKTSKSINEEQESVEYFDVNNILPSKSTADEDLKMAISDDIDAVEWTDDWGDFSDDSMEA
NNDKKDKIRFKEVSQEEIIFPLNHAIAECATEEDRFKLFQKRFNQINNLEQYQEVKKLIS
QWPKFNMPDHITIDNHPVLKMMKVITALTETNTANFEKRILQEHEELIRLLTSEGILKRF
LEVERDHISFVQSVYIRLCSQDVSMHEEAVNLIKEQQTIVLPPLVLEKLFLNDLTALFSP
DHVVYKQIIEHVFINEALTGIEENAEILIHELKRQKYILEALHIIKLMKRIPPALCTFDT
CFQLLMQE
NT seq
5787 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaacgtggacgaaacgtcaaacgagccgattctgtacgaactattggaatatttc
gttcgcaagcaggaaccggaattgataaaatgcaagaacgatgcggctatccttccagct
actggcaccataaaaaatgctctcaggtacttcaacaataggtactccctacctgagagc
atcttgcagcaagtcagtctcacgctaccatggaaatttgctgtcggcgatcatggtcgg
gtacttgctattttacaagagaatatcattgaaatacgaaaggccaaagatgaatattcc
tccatagtaggaaaggcatctgctccaaaggatgcctttcctcaatggcgtaagcttgtt
tggagtcccaacggaatgatcttagtattggcgtctagtagtggctatacatccttttac
aatgcattgggaaataatatctttaacataagtccaaaaacgatttcacaaagtcctcat
attcttgaagctggtgacgctatagcgtctatgttattccttaagccaaggacaacaaat
gaaaaatgggcctacgaatttattttaatttcgtatagcgggttgctgaggtcttatcat
atttctacaagtggctacagtgtaaattatgacttttctttcggcaatttttacaaaaac
ggtgttaacgtcattgcgtatgatgaaaaacgtagcttattctatgttgctggaaatatg
ataacacaaaaattgacgtccactgcatctgagtctggattaacttcgtggcgactcttg
aatgattatccatactgcaaattatcatttacgtttgaagattctgctaccagcaattcg
ctgttttccatatggaatttgattcccaactttagctttcaatcagagtcgattatattt
tcgataaaaatttcaccaaatggcgagtttctggtatgcttgcatacgaatggttcagtc
tcgctatggggtttgccaaacttaatactacagaaaaaatggaagttgcctgagcaaccg
gaatataatgtacctaatcctctgggacatacaaagtctaaaaaatttccaccaggattt
acagagtttcatccaatagatatcggttggtggtctgaccaggctatcataatagctcga
tattcaggttccacttcggtctgttctacatggaacttaaagaatctgctaggtgttagt
ccagaatttctagcaggacaaccacaagtatgcgagcttggtttagagaaaggattttta
tgtttagattgcgaaacctttattacaagtaaaaaacgaagtagagaacccaccgatggt
catttgtcagcatcatctgaaagcgagaaggacgatgatgagttagaacctcttactata
ttaaattataccacgaatttggtacaaagcacattgtattcaataaccgatattgaaaga
tttcaaccaaagagaaagaaattgaaagtattgcatcgaacttatagaattttgggcttg
aaaagcacgactccagaagagctctattctagaaaaatagacattgaggaatacgaggaa
gctttagctttagcaaacacatataatttggatacagatctcgtgtatcaaacacagtgg
agaaagtcagaattatcattgaacgccattgcagaacatttaagcaaaataagcaaaaga
tcttgggttttaaatgaatgtgttgtacgtgtccctgatactatggaagctgcaagggaa
ctattgaatttcggattgagaggcgcaaatctagaaactttaatagctatcgatatatgt
gacaatgacaaatttgtaactcctgatatagaggacgattggcaagcactggatgaaatc
actgtaagtttaagacaggtgcagaaagttaatgaaatgcttgaaaaaatagacataaaa
aatttatctgaggctcagaaagaattaattaagtatcggaggaagcttctaaatcattta
gataaattgcttacgtatgaaattatattagagacgccactcaaatataaaaaagaattt
tacgaggagtttcgaaggttatcacctattgaaaatgcaattagatttgccaaagatagt
gattgccgagctgttgaaattatgtttacttattatggagaaagtttgttgcctcattgg
ctggcaattatcagcttcttcccagaaactttaaatacgttggattatcaaaaactgcta
ccagaatgcgattcagaaggtcaactatttttgttagatcaacgtgaattacgacagaaa
gattggtcagaaaaacatgagtttaatgaaataataaatcttgatttagacgatcgatca
gaaatattgtatgaattggatccctctttgttaatatatagaaatacacaacttacacca
gatttattacaaaaatggtataagacacgtgcttttgaaattgaaaagaacagttcttta
gtagataatgctttgcaattagttaaaatcggaaagtctcataatattaatggcctggta
gatttgttattggaattggaaactttagacgatctcgtttacacagtacatttggaggat
atgtcattagataaattagagaaattgagtaacatggagaagataaaacttttgatgagt
acatcaaatgaaattaattttgttgaaaatataaagaaccttttgttaccttttattaaa
cgaaggcatcaatatttgggtggagatcttcagaaatgcttactaagcgattatctaatc
tgcttaagcaaagatgatttgacatttccagttaaatttttcaaatatttaaagcagacg
caggacattgagataattgaaatgatagatgatgtggctagcttagctttagattgtgta
tatgcctgtgatgatcccgacatgtatgaaaaagctaaagatatcttagattcgatatca
aaagatgatggaaaaaggacaaatgcaatatgcattctattagaggagtttgaaggagaa
cttgattgcattaggcttttaagtaaatatggtgtaaaaacaacgttaaaatttatacga
aagaatagaagcgatcctgatgttgctaaatcactattaacccaaatggcaagaagcttg
aataaaagtttgttacctccagatgaaagggaatgggcgcaattattaaacgatatgtta
gatatacatgggctaattttttcgtgtattgctgttgaaacctgtttcgaaatatgtgtt
tcagcccgtttactttcaagaattaaatgtaccattcgtaattgtgctaccttaatagaa
accaagaaaaatgagaaatctttattaaaagtatcctatgagaaagcggttgaccttata
ttggaagtgtccaaagaatattttaatggttcaaggacacttactgatccacatatggag
ttagctaaaacttgccttgatcttatcgaagatgataacgtgaaaattaaagaagaatat
gatcttatcaggtcgctccaaatattgaatgaattcaatattgatatattacctcttcaa
gttagattaacagtggacaaattaaccttgatcgaacactgtttaaataaccaaagagat
gcttataaaaatcgacagagattattaacgttagcaacttatttacgaattgaaggaaat
aacagtagactccgcgaaggaaaaatttcagaactaatagctaaaaaggcacttgagact
gaagattacaatacatgtgctatgatatgttcgcaattagcaaaaaacaattatcttctt
gcctgggaaatttgtttaaatttagggcgttgtgataattatcaggatctaaaagttagg
caaaagtgtctatggtttgcaataaataatggtcctagtgatatattgggtaatgcttta
gaacacatgcacttgttggaaatacaaatgctacataagaatttggaactgtggatgccc
tctgcggaatttgaaagtttaaaagatgaagaaagtgatacaagtgaagatgattttaca
gatgctatgacaacgccgcagatagaagtaaaagagtttgttccaaaaatgttggaaact
tcaacaggaattgtaaaaagttcagctaatattatgaaagaatctacattcagcttgctt
agaaacattagtaatactaatttttggaaatctagattgaatcttaactttaaaaacgat
ttagaaactagtgcacaacaagaatctgaaatggaacaaaacgaggaagatatcaatctt
caaagttttccgtgctattatgaatccttgcacgaactgtgtagaataagcgttaatgag
acaagatacaataagtattctacaacagaaatagaaaacacaaaattaaaatgttgccga
gcgcttttaagaataaccatactgagtgaatcctcttgctatgggctagaaataagtgac
attaatcatttacttctagaatgtgcaaagcacactatgtcagacgattggttacttggt
atggcgtatctactgagtttaaatagaaatcacatcttggatgctcaagcaatctttatg
gatttaccgcaagttgaattatatatacaaactgcgctttattactattcattagagctg
tacaagaaattgtacactgattgtgaaaagttatatttgtacaatccattagacttaatg
aaaatcatgatggttacagcacaaaagtctgaagaatgtgatattgttaaagcgttacaa
tattggcaaagttatctgctcggtggagcgcaagttactagtatgaaacaagtggaaata
aaagatttaagtgcgttaaaactaggacaaagtagtactcgtgtacattctgaagagact
gtgaaaacttcgaaatccataaatgaagaacaagaatctgtagaatattttgatgttaat
aatattctaccatcaaagtctacggcagatgaagatctaaaaatggctatctcagatgac
attgatgccgtagaatggacagatgattggggtgatttttctgatgatagcatggaagca
aataatgataagaaggataaaattagattcaaagaagtttcgcaagaagaaatcattttt
cctcttaatcacgccattgctgaatgtgcgacagaggaagatcgatttaaattatttcaa
aaacggtttaatcaaatcaataatttagagcaatatcaggaagtaaaaaaactaatatcg
caatggccgaaatttaatatgccagatcatatcacaatagataatcatccagttttaaaa
atgatgaaagtgataactgcgctcacagaaacaaatacagctaattttgaaaaaaggata
ttacaagagcacgaagaactcattcgattattaacgtctgaagggatcctcaaacggttc
ttggaagtcgagcgagatcacattagctttgtacaaagcgtttatataagattatgctcc
caggacgtgtcgatgcatgaagaagcagtaaatctcattaaagaacaacagactattgtg
ctaccgccattagtactggagaaacttttcctaaatgatttaacagcgttgttcagccca
gatcatgttgtatataaacagataatcgaacatgttttcataaatgaagctttaaccggc
attgaggaaaatgcagaaatactaatacatgaattaaaaagacagaaatatatactagag
gctttgcatattataaagttaatgaagagaataccgccggccttatgcacattcgatact
tgttttcagctattaatgcaggaatga
DBGET
integrated database retrieval system