KEGG   Thiothrix litoralis: J9253_13500
Entry
J9253_13500       CDS       T07754                                 
Name
(GenBank) choice-of-anchor L domain-containing protein
Organism
tlo  Thiothrix litoralis
SSDB
Motif
Pfam: Choice_anch_L Cadherin BamM_C CLIPPER TSP3_bac
Other DBs
NCBI-ProteinID: QTR45022
UniProt: A0ABX7WNU3
LinkDB
Position
complement(2792090..2795938)
AA seq 1282 aa
MSYNAVTPLGVILLFLWATVVQAAPAYNANVSPSQMSAILDGPGLSVRNLSVTQGANQQY
GIFSSGGDVLGVSTGVFLNTGNLGSIQAPNSSAAYSSNTKVQYLDPDLATISANAKYDPS
IIEFDITPEGDRLNFVFAFGSEEYPEYVCSRFNDAFGLFVSGPGLSGVRNAAFMPDTGDA
IAVNNVNAGAKGVNADGAACNLGNTAYFVDNGNGSGSSSSQLDGYTRPITASMGGLTPGQ
SYHVKLALADAGDPAYDSGAFFKWLTSTQSTPVDLSLQAAASSLSPAWNSEVEISYTLKN
ASSISTSLVQVGLEWPAGLEWVSDDSAGSYNASTGEWNADVLPANGAKTLKIRARVGTAS
SYRVDGEITFAFNEDPDSTAFNRRSFPNEDDTAGLTLNPVDKPVNLSPVINSNGGNATAT
LPIPEGQTAVTAVKAVDPEGVGITYSISGGSDAARFSINTATGALSFKVAPDYEVPTDVD
LNNTYEVQVTASDGTLANTQMITVQVTNITENVAPTITSNGAGVVAYMNAEENQVEVTYV
EATDANNDDLVYSITGGADAALFKIIASSGRLRFMTAPDYEKPLDADRNNRYDVQVTVSD
GSLTDQQMIYVSIVNLPDENLPPDIVSNGGAASAAVAINENQTLVTVVIATDGNGDKPVY
SISGGVDAATFTINTSTGVLSFVTDPDYELPTDSDKNNVYEVKVTASDGSLSDTQTLEVA
VADVVENQAPSIINPSAVLYPENASAIVMDINATHKTESEGHGLVYSFAGQLDDVLFQVD
SMTGVLSFNKLPDYEKPLDANKDNAYIVSVRVCDSLASCADRVVIVSVQDVDEDSDSDGL
MDSVEKIIGTDPWKADTDGDGIGDLQEVHDFTVPLDHDKDGLIDALDADDDDDGIPTRYE
MPDPNGDGNPVDARDSDKDGQPDYLDTDDDGDTVLTRYEAPDPNGDGNPADARDTDGDGK
PDYLDADDDNDGSPTATEKPDPNGDGNPADAVDNNANGLATYLDVEEDFLVTLQLRVALQ
GPYDKSTGLMNNELFSQGLVPLLQPYGELKSAFGYVDSGSTISPFDYHGTETAASGVWKA
TGKDAPVDWVLIELRDKFDPTVRVAAIAALLQRDGDVVDAVTGSKTLQLFNVTDGDYYVV
VRHRNHLGVMTNAPIALKTSAELIDFTHLGTKVYGGVNTRLLSSSVALLWAGDTNNSSTI
IISGPGSDSNVILGAILVSPDNKLVNTAFRLVGYYATDLNMDGAAVYTGPQNDTNVLLGN
VLLHPGNLTFSSNYIIQGSLPR
NT seq 3849 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagttacaatgcagtaacaccgttaggtgttatcttgctttttttgtgggcgacggtt
gtgcaggcagcacctgcctataatgctaatgtcagcccttcgcagatgtcagctattctt
gatggccctggcttgtcagtcaggaatttgtcggtaacacagggtgctaaccagcaatac
ggtatctttagcagtggcggggatgtgctgggtgtcagtaccggcgtattcctgaatacg
ggtaatctggggagtattcaagccccgaacagcagcgctgcgtattccagtaacaccaaa
gtacaataccttgaccccgatctggcgacgatcagtgccaatgctaaatatgacccctcc
attattgagttcgatattaccccggaaggtgaccggcttaacttcgtgtttgcgtttggt
tcggaagagtacccggagtatgtgtgtagccgtttcaatgatgcctttgggttgtttgtt
tccgggccggggctaagtggtgtcaggaatgcggctttcatgccggatacgggcgatgca
atagcggtcaacaacgtcaatgccggggctaagggcgtgaatgccgatggggcggcctgt
aatctggggaatactgcttactttgtggataacggcaatggcagcggtagcagttcaagc
caactggatggctatacgcgtccgataaccgcttcaatggggggcttgacgccggggcag
agctatcatgtcaagctggcgttggcggatgcaggcgacccggcctacgattccggggcg
tttttcaaatggctgaccagtacccagtcaaccccggtggatttgtccttgcaggcagca
gccagcagccttagccccgcctggaacagtgaggtggaaatcagttacacccttaaaaat
gcttcatctatctccaccagtctggtgcaggtagggctggaatggcccgcagggctggag
tgggtcagcgatgattcggcaggcagttataacgccagcaccggcgagtggaatgcggat
gtgcttccagcgaatggcgcgaaaaccctcaaaatccgcgcacgggttggcacagccagc
agctaccgggtggatggtgaaattacctttgctttcaatgaagaccctgattccaccgca
tttaaccgtcgcagctttcctaatgaagacgatactgctggccttaccttgaacccggtg
gataagcccgtgaacttgtcgcccgtgattaacagtaacggcggtaatgccacggcgact
ttgccgataccggaaggccaaacggcagtgacggcagttaaggcggttgacccggagggg
gtgggcattacctatagcattagcggcggatcggatgcggcacgtttcagcatcaatacc
gccacgggcgcgttgagtttcaaggtagcgccggattatgaagtgccaaccgatgtcgat
ttgaataatacctatgaagttcaggtgacagcgagtgatggtacgctggccaatacccag
atgatcacggtgcaggttaccaatattaccgagaatgtagcgcccactattaccagtaat
ggcgctggcgtagtagcttacatgaatgcggaagagaatcaggtcgaggtcacttatgtt
gaggctaccgatgccaacaatgatgacttggtttacagcattaccggtggggcggatgcg
gcgttatttaaaataattgctagctctggtcgattacgtttcatgacagcgcctgattac
gaaaagccgctggatgctgaccgcaacaaccgttacgacgtgcaggttaccgtgagtgat
ggcagtttgaccgaccagcagatgatttacgtgagtattgtgaacttgccggatgaaaac
ttaccgccggatatagtgagtaatggcggtgcggcgagtgctgcggttgcgatcaatgaa
aatcagacgctggtaacggtggtgatagcgacagatggtaacggtgacaagccggtttac
agcattagcggtggggtagatgccgcaacgtttaccatcaataccagcacgggtgtgttg
agttttgtgacggatcctgattacgaactccccactgacagcgacaaaaacaatgtatat
gaagtgaaagtgaccgcgagtgatggcagcctgagcgacacccaaaccttggaggttgcg
gttgccgatgttgtcgaaaaccaggcaccgagcattatcaatcccagcgcggttctttac
cctgaaaatgccagtgctattgtcatggatattaatgctacccataaaaccgagtcggaa
ggtcatggtttggtttacagttttgcggggcaattggatgacgtgctgtttcaggtagac
tcgatgaccggggtcttgtctttcaataaactacccgattatgaaaagccgttggatgct
aataaggataatgcctacattgttagtgtccgtgtgtgtgactccttggcaagctgtgcc
gatcgggtggtgattgttagcgtacaggatgtggacgaggatagtgacagcgacggcttg
atggattcagtcgaaaaaataatcggaactgatccgtggaaagccgataccgatggcgat
ggtattggcgatttgcaagaagtacatgattttaccgtcccgttggatcacgacaaggat
ggccttattgatgcgctggatgcggatgatgatgacgatggtattccaacccgttacgaa
atgcccgaccccaatggtgatggcaatccggtagatgcccgtgattccgataaggatggc
caacccgattatctggatacggatgacgacggcgatacggtgctgacccgttacgaagca
cctgacccgaatggtgatggcaatccggcagatgcacgggatactgacggtgatggtaag
ccggattatctggatgcggatgacgacaatgatggttcacccactgccacagagaagcct
gacccgaatggtgatggtaatccggctgatgcggttgataacaacgccaatggtcttgct
acttacctcgatgttgaagaagattttctggtcacgctacaactgcgggtagctttgcaa
gggccatacgataaatccaccggtttgatgaacaatgagttgttcagccaggggctggtg
ccgctcttgcagccctatggtgagttgaaatcagcatttggctatgtggattcgggtagt
acgatatccccgtttgattatcatggcaccgaaacagcagcatcgggggtgtggaaggct
acaggtaaggatgcccctgtcgattgggtattgattgagctacgcgataagtttgaccct
acagtgcgggttgccgcaatagctgcgctgttgcaacgtgatggcgatgtcgtggacgcg
gtaactggctcgaagacgctgcaactgttcaatgtaacggatggtgattattatgtggtg
gtgcgtcaccgcaaccatttaggggttatgaccaatgcccctattgccttgaaaacatcc
gctgaactgattgattttacccacctaggaaccaaggtttacggtggtgtcaatacccgt
ttgctgagttcctccgtcgccttgttatgggcgggggataccaataacagcagtaccatt
atcatcagtgggccgggcagtgacagcaatgtaattttgggggcgattctggtttcacct
gataacaagctggttaacaccgctttccgtttggtggggtattatgccactgacctgaat
atggatggtgcagcggtgtacacggggccccaaaatgatactaacgtgttgttggggaat
gtattgctgcatccgggtaacctgacatttagcagtaattacatcattcaaggaagcttg
ccgcgttag

DBGET integrated database retrieval system