Tenacibaculum maritimum: MARIT_2572
Help
Entry
MARIT_2572 CDS
T05240
Symbol
secDF
Name
(GenBank) Preprotein translocase SecD and SecF subunits
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
tmar
Tenacibaculum maritimum
Pathway
tmar02024
Quorum sensing
tmar03060
Protein export
tmar03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tmar00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
MARIT_2572 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
MARIT_2572 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
MARIT_2572 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
tmar02044
]
MARIT_2572 (secDF)
Secretion system [BR:
tmar02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
MARIT_2572 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SFZ84123
UniProt:
A0A2H1EC17
LinkDB
All DBs
Position
2780771..2783752
Genome browser
AA seq
993 aa
AA seq
DB search
MQNKGLIKLFAILFGLVSLYQLSFTFFANRVEDEAKAFAKSNVTGNNGRELAKLERKYLD
SVANKDVINLGFAKYSYNDIKNKEMNLGLDLKGGINAILQVSVKDILVGLSNNSKNAVFN
EALAKADEAQKDSQENYLDLFFTQFENLSNNSIKLSDPAIFGTKALREKIDFNKTNAQVK
EVLQDEINSSINTAFEVLRSRIDKFGVVQPSIQRIGNSGRIQVELPGAKDIERVQKLLQS
TAELQFWEVFTNIEVQNFFFQANAKATEILKEKEEIKEEAKDSTKTDSIDDLLGASADST
KVNQQKSLFTYLYPNVAQNQNQASSLVAQAKVSDTAMVNKLLKMKEIRSLLPKNLKYAKF
LWDYKAQPSADKTSEIIGLYAIKSNRYDEATIDGDVIADAKQEYDQLSKPVVSMLMNGSG
TKKWAKMTGENVGKFVAVVLDNYVYTAPIVNGAITGGSTQISGGQMTVNEAQDIATVLKA
GKLPAPARIIQAEVVGPSLGKESINASMWSFGLAILLVLIWMLLYYGKAGLYANIALLVN
ILFIFGILASFNSVLTLPGIAGIILTIGMSVDANVIIFERIKEGLTSGKGLATSVEEGFS
VKGALSAIIDANITTLLTGIILYVFGTGPIKGFALTLMIGIATSLFTAVFITRLLIDGAV
LKGANLTFNTNISKNWFQNISFKFLQKRKAAYIFSGAIILAGLISIFSIGLKQGVDFKGG
RSYVVRFDQPMNATEVASALKDSFGAAPEVKTYGADNQLKITTVYKIDEEGKEIDESVQS
TLFTGLKPYLGATSYEDFKPGFEKAGNGIMSYMKVEPTIADDIKKAALWAVLGSLIVVFL
YILLRFRKMSYSIGAVVAVFHDVLIVLGIFSILYQFMPFDMEIGQSFIAAILTVVGYSLN
DTVVIFDRIREYAGDHKSFDASLVDKALSSTLGRTINTSLTTLLVMLAIFFFGGDSIKGF
MFALIVGVIVGTYSSLFVATPVMFDTSKEENKE
NT seq
2982 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagaacaaaggtcttattaaattatttgctatcctttttggattagtaagtttgtac
caattatcatttacgtttttcgccaatagagttgaagacgaagctaaagcatttgctaaa
agcaatgtaacaggaaacaatggtagagaacttgccaagttagaaagaaaatatttagat
agcgtagcaaataaagatgttattaatttaggatttgcaaagtacagctacaatgatatc
aaaaacaaggaaatgaaccttggtttggatttaaaggggggtattaatgctattttacaa
gtatctgtaaaggatattttagtgggattatctaacaattctaaaaatgcggtttttaat
gaagctttagctaaagcagatgaagcccaaaaggatagtcaagaaaactacttagattta
ttttttactcaatttgagaatttaagtaataacagtatcaaacttagtgatcctgctatt
tttggaaccaaggctttacgtgaaaaaatcgactttaataaaacgaatgctcaagtaaaa
gaagtgctacaagatgaaattaactcttctatcaataccgcttttgaagttttacgtagt
cgtattgataaatttggagttgttcaaccaagcatacaacgtattggtaattcaggtaga
attcaagtagagttacctggtgctaaagatatcgagcgtgttcaaaaattattacaaagt
actgctgaattacaattttgggaagtatttacaaatattgaggtgcaaaatttcttcttt
caagctaatgcaaaagctactgaaatcttaaaagagaaagaagagattaaggaagaagct
aaagattctacaaaaacagatagtattgatgatctattaggtgcttctgctgattctaca
aaagtaaatcaacaaaaaagcttatttacttatttgtatcctaatgtagctcaaaaccaa
aaccaagcgagttctttagtagctcaggcaaaagtgtctgacactgctatggttaataag
ctattgaagatgaaagagattcgttctttattacctaagaatctaaaatacgctaaattt
ttgtgggattataaagcccaaccaagtgctgataaaacttctgaaatcataggtttatat
gccataaaatcaaacagatatgatgaagctactattgatggtgacgttatcgctgatgcc
aagcaagaatacgatcagttaagcaaacctgttgtaagcatgcttatgaacgggtctgga
actaaaaaatgggcaaaaatgacaggcgaaaatgtaggtaaatttgttgctgttgtttta
gataattatgtatatacagctcctatagtgaatggcgctattacaggaggaagcactcaa
atttctggtggtcaaatgacggttaatgaagctcaagatattgccactgttttaaaagct
ggtaagttacctgctcctgcaagaataattcaagcagaagtagtaggtccttctttagga
aaagaatctatcaatgctagtatgtggtcatttggtttggctattttgctagtcttaata
tggatgctactttactatggtaaagctggtttgtatgccaatattgctttattagtgaat
atcttatttatttttggaattttagcttctttcaattctgtattaacactgcctgggatt
gctggtattattttaacaatcggtatgtccgtagatgctaatgttatcatctttgaaaga
atcaaagaaggattgacttcaggtaaaggattagctacttctgttgaagaaggttttagt
gtaaaaggagctttatctgctattattgatgcaaatattactactttactaacaggtatt
attttatatgtgtttggaactggacctattaaaggttttgccttaacgttaatgattggt
attgctacctcattatttacagctgtatttatcactcgcttattaatagatggagctgtc
ttaaaaggggcaaaccttacttttaatactaatatttcgaaaaattggtttcagaatatt
agttttaaattcttacaaaagcgtaaagctgcatacatcttctctggagctattatctta
gctggtttaatctcaattttttcaattggactaaagcaaggtgttgattttaaaggaggg
agatcttatgttgttcgttttgatcagcctatgaatgccactgaagttgcttcagcctta
aaagatagttttggagctgctccagaagtaaaaacttatggtgctgataaccaactaaaa
ataacaactgtttacaaaatagatgaggaaggtaaagagatagacgaaagtgttcaaagt
actttattcacaggattaaaaccttatttaggagctacttcttatgaggattttaaacct
gggtttgaaaaagcaggaaatggaattatgagctatatgaaagtagagcctacaattgct
gacgatattaagaaagctgctttatgggctgtattgggttctttaattgtagtgttttta
tacatattattgcgttttagaaaaatgtcttattctattggcgctgttgttgctgttttc
catgatgtgctaatcgtattaggaatcttctctatactgtatcaatttatgccttttgac
atggaaatagggcaatcatttattgctgctattttaacagtagtaggatattcattgaat
gatactgtggttatttttgatagaattagagagtatgcaggtgatcacaaatcttttgat
gcaagcttagttgataaagctttaagtagtacattaggaagaaccatcaatacttcatta
accactttattagtaatgctagctattttcttcttcggaggtgattctattaaagggttt
atgtttgcattaattgttggggttattgtaggtacatattcttcattatttgttgcaact
cctgttatgtttgatacatctaaagaagaaaacaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
