Tenacibaculum maritimum: MARIT_2995
Help
Entry
MARIT_2995 CDS
T05240
Name
(GenBank) OmpA family protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
tmar
Tenacibaculum maritimum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tmar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tmar02000
]
MARIT_2995
Transporters [BR:
tmar02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MARIT_2995
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SFZ84973
UniProt:
A0A2H1ED77
LinkDB
All DBs
Position
complement(3216243..3217619)
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MKQIKLAVIALFALATVSSVNAQDSDNPWVVGFGVNTVDVRTYSNNAGDILKDYVGTTEW
GDNTLPSISRITVDKYLDSGFSLQLAGSLNKVKTVLRKNDADALYYSIDAIVKYDLNNLV
GQTGWFDPYVALGGGYQSIDSEGDGVLIGAAGFNTWFNDNLGLNFQSGYKHGFEHTGRDV
FQHSIGLVFKFGGKDTDGDGIYDKEDACPEVAGLKEFNGCPDADKDGVKDSEDACPEVAG
LAALNGCPDTDGDGIADKDDACPNAKGTKAMNGCPDADKDGIADNKDKCPQEAGPAENGG
CPWGDADKDGVLDNVDKCPKVAGVASNNGCPVVEVITEEATKKLNDFARAIYFNSGRNSF
RPGVKGKLDLIATIMKEYPDANFSIQGHTDSQGPAASNQRLSDKRAKAVLDYLTGKGGIS
SSRLSSVGFGEEYPIASNKTRAGRAENRRVEIKLVKKK
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaatcaaattagctgtgatagctttatttgcgttagcaacagtaagcagcgta
aatgcacaggattctgataatccttgggtagtaggttttggtgttaacacagtagatgta
agaacttactcaaacaatgctggagacatcttaaaagattatgttggaactacggagtgg
ggagacaatacgttgccttctatttctagaattactgttgataaatatttagattctgga
ttttctttacagttagctggttctttaaataaggttaaaacagtattaagaaaaaatgat
gcagatgcattatattattctatcgatgcaatcgtaaagtacgatttaaacaacttagta
gggcaaacaggatggtttgatccttatgttgctttaggtggtggttaccagtctattgat
agcgaaggtgatggtgttttaattggtgcagctggttttaatacttggtttaatgataac
ttaggtttaaacttccagtcaggatataagcacggttttgaacatacaggtagagatgta
tttcaacattcaattggtttagtattcaaatttggaggtaaagatacagatggagatgga
atctatgataaagaagatgcttgtccagaagtagcaggtttaaaagaattcaatgggtgt
cctgatgctgataaagatggagttaaggattctgaagatgcttgtccagaagtagcaggt
ttagctgcattaaatggatgtcctgatacagatggagatggtattgctgataaagatgat
gcttgtccaaatgcaaaaggaacaaaagctatgaatggatgtcctgatgcggacaaagat
ggtatcgctgataacaaagacaaatgtccacaagaagctggtccagctgaaaatggagga
tgcccttggggagatgctgataaagatggtgttttagacaacgttgataagtgtccaaaa
gtagcaggtgttgcttcaaacaatggatgtccagtagtagaggtaattactgaagaggct
actaaaaagttaaatgattttgcaagagcaatttacttcaactcaggaagaaattcattc
agaccaggagttaaaggtaaattagacttaattgctactatcatgaaagaatacccagat
gctaacttcagtattcaaggacatactgatagccaaggtccagctgcttctaatcaaaga
ttatctgataaaagagctaaagcagtattagattatttaacaggtaaaggaggaatttct
tcaagcagattatcttctgttggatttggagaagagtaccctattgcttctaataaaaca
agagctggtagagctgaaaatagacgtgttgagattaaattagtaaagaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system