Tenacibaculum maritimum: MARIT_3003
Help
Entry
MARIT_3003 CDS
T05240
Name
(GenBank) TonB-dependent outer membrane receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
tmar
Tenacibaculum maritimum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tmar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tmar02000
]
MARIT_3003
Transporters [BR:
tmar02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MARIT_3003
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
DUF3869
Ig_CYK3_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SFZ84991
UniProt:
A0A2H1ED96
LinkDB
All DBs
Position
3226897..3229236
Genome browser
AA seq
779 aa
AA seq
DB search
MRFLFIFALLLSINVHAQIIIKGQITDKDGALPFASITIKNTSQGVTSDDNGRYSISTKK
EGKITITAAFTGYLSERKTIDVSNKNQKIILNFQLTEHAEILDQVTITGTRTDKRRTNSP
VIVNVVNSETLANVQACTLSEGLKFQTGLRVETDCQTCNYTQLRMNGLAGGYSQILINGR
PIFSPLTGLYGLEQIPTNMIDRIEVVRGGGSALYGSSAIGGTVNVITKIPKKNNYEVSYT
YQNTKGMNDHIITGNATIVNEEKNAGASFFINNRNRGLYDANGDNFSELPELKNNSFGTN
IFFLPTENQKLEINFSKMNEYRYGGEMVDKAPHLALQSEERTHDVYIGNIDYQINFNDNK
SAIITYAAAQYTGRDHYTGIFPDDPTAIQEHLKRPPYGTSETTTFQGGVQLNHQVENFLN
GNAVFTVGSEYVQDDVFDEITAYEYKVDQLTKNLGIFFQSDWEITNKLNLLAGIRFDNHQ
LNTKPTQENIPQTVTNNVLSPRISFLFKPFENSQLRATWGTGFRAPQAFDTDLHIAFAGG
GVSRVQLAQGLKRERSNSYNVSFNYDKPTEHYIYGFTVESFYTQLKDAFFLYPIGEDQFG
ERFEKRNGDGAIVQGITLETRLNYDQILQLETGFTFQSSLFDTAVKNSDVLEAKREFLRT
PNNYGYATLTYQPSKSFTTAFNYIYTGSMDILHLAGAPELPQNDTYVTSPSYHELSVKSS
YTFNLNQLKTGLQIFGGVKNIFDAYQTNFDSGKNRDSNFIYGPSTPRTIFVGLKLGTGL
NT seq
2340 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagatttttattcatttttgcattgctccttagtataaatgtgcatgcacaaataatt
ataaaggggcaaatcactgataaagacggagcattaccttttgcttctataactataaaa
aacacttctcaaggagtaacaagtgacgataatggccgctattctatttctacaaaaaaa
gaaggaaaaataactattacagctgcttttacagggtatttatctgaacgaaaaactatt
gacgtttcaaacaagaaccaaaagattattttaaattttcagttaactgagcatgcggag
atattagatcaagttactattactggaacaaggactgacaaaagaagaaccaatagccct
gtaatcgtaaatgtggtgaatagcgaaacgctcgctaatgttcaagcatgtactctttct
gaaggtttaaaatttcaaactggattaagagtagaaactgattgccaaacctgtaactac
acacaattgcgtatgaatggtcttgcaggaggttattctcaaatacttatcaacggacgt
cccatattcagccctctaacgggtttatacggcttagaacaaatacctaccaatatgatt
gatagaattgaagtcgttagaggaggaggatctgcattgtatggctcaagtgctattgga
ggtaccgtaaatgtaattactaaaattcctaaaaaaaacaactatgaagtaagttatact
tatcagaatactaaaggaatgaatgaccatatcattactggtaatgctaccattgtaaat
gaagaaaaaaatgctggtgcttctttttttatcaataatagaaatagaggtttatatgat
gcaaatggcgataatttttcagaacttcctgagctaaaaaacaactcttttggtactaat
attttctttttacctacagaaaatcaaaagttagaaattaattttagcaaaatgaacgaa
tatcgatacggaggagaaatggttgataaagctccacatcttgcactacaatcagaagaa
agaactcatgatgtatatattggaaatattgactatcaaatcaacttcaatgacaataaa
agcgctattattacttatgctgctgcacaatacacaggaagagatcattacacaggaata
ttccctgatgatccaacagctattcaagagcacttaaaaagacctccttatggaacttct
gaaaccactacctttcaaggaggagttcaattaaatcatcaggttgaaaattttttaaat
ggcaatgccgttttcaccgttggttcagaatacgtacaagatgatgtttttgatgaaatt
actgcttatgagtataaagtagatcaactaacaaaaaacctaggtattttctttcaaagt
gattgggaaattactaacaaactaaatttgcttgctggtattcgttttgacaaccaccaa
ctaaacacgaagcctacccaagaaaacatcccccaaaccgttactaataatgttcttagc
cctagaatctcattcctttttaaaccattcgaaaatagtcaattgagagctacttggggt
acaggatttagagctcctcaagcttttgatactgacttgcatattgcttttgcaggaggt
ggtgtttctagggttcaattagcacaaggtttaaaaagagagcgctctaatagctataat
gtttcttttaactatgataaaccaacggaacattatatttacggatttactgttgaaagc
ttctatacacagctaaaagacgcttttttcttatatccaattggagaagatcaatttgga
gaacgttttgaaaaacgaaatggagatggcgctatagtccaaggaattacattggaaact
aggttgaattatgatcaaatactccaattagaaacaggatttactttccaatctagttta
tttgataccgctgtaaaaaattcagatgtattagaagctaaacgtgaatttctaagaacg
cctaataattatggttatgccacattgacctaccaacctagtaaaagttttactaccgct
ttcaattatatatataccggatcaatggacattcttcatttagctggtgctcctgaatta
cctcaaaacgacacctatgtaacatctccatcatatcatgaattaagtgtaaaatcaagt
tatacttttaatctaaatcagctaaaaacaggacttcaaatttttggaggagttaaaaat
atatttgatgcgtatcaaactaatttcgattctggtaaaaatcgtgatagtaactttatt
tatggacctagtacccctagaactatttttgtaggtttaaaacttggtacaggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system