Legionella micdadei: LMI_2016
Help
Entry
LMI_2016 CDS
T03810
Name
(GenBank) Putative sensory protein (PAS domain)
Organism
tmc
Legionella micdadei
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MASE3
HD_5
HD
PAS_9
PAS
PAS_4
PAS_8
PAS_3
HDOD
PHM7_cyt
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEG61301
UniProt:
A0A098GIJ9
LinkDB
All DBs
Position
I:2089154..2091331
Genome browser
AA seq
725 aa
AA seq
DB search
MDSQQGALLTGPIQPNLKKIFFPPIILVLISIFVLMKTNYLVFHILVELFSIIIVITALT
VATTTSQFTKNHFIIFIAIASGWCGSLDLIHMLVYKGMNLLPVQGSNVSTEFWVSARLIQ
ALAFLISPIFLRHTCPTYALHIGFACLIIVLSWAIFHDYFPDTYVERHGLTLFKRITEWL
VILILLSTLFSYWQMRALMSPRLFNYLILSLSAMALSEVFFSIYADMYGIENILGHIFKI
VAYWFIYVALVITTLTQPFNVLARTASTYDTVPDPTIIMESSGQIKTANLAAAQFTHSTP
ESLVGLENHTLFHNPNASKSECPICSQLNKTEPFMGEINRENDGWVECSLTPISSEFYPN
AWVQVIRDISDRKYLELERTNLVKELGQRIEELHRHQQALKEREHHFRAMIEQPITGIFV
RDEKKFIYTNPRFLEIIGYSREELQDKNILDLLNNDVPTKKLVIEIWQQIKAGQVGVSYQ
IPFRRKNGKPIILGLHATAITWYGKPAALTMVQDVTELKQAQDKINRYVKQLEKAINGTF
LAVSNMVELRDPYTAGHERRVGLVAKAIAEEMGWPPARCEALELIGLVHDIGKVSIPAEI
LSKPGKLSAMEMELVKGHARAGYEILKDIEFNAPVAETILQHHERMNGSGYPQGLMGNEI
LPEARIIAVADVLESMSSHRPYRPALGLEAALNELLRGRNELYDPEAVDAIVRLIREKGY
VLPAK
NT seq
2178 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagtcaacaaggtgcgcttttgacaggaccgattcaacctaatttaaagaaaata
ttttttccccctattattttagtgttgattagcatttttgtattaatgaagaccaattac
cttgtttttcatattttagttgaacttttttcaattattattgtaatcactgctttgaca
gtagcgacaactaccagccaatttacaaaaaatcattttattatttttatagcgattgct
tcaggatggtgcgggagcttagatttaattcatatgcttgtgtacaagggaatgaatctg
cttcccgtgcaagggtctaacgtgagcaccgaattttgggtttctgctcgccttattcaa
gcactagcctttttaatttctccaatatttttacgccatacctgtcctacttatgctctt
catattggcttcgcatgtttaattattgttctttcttgggcaatttttcatgactatttc
cctgatacttatgttgaaagacatggactaacattgtttaaaagaataactgaatggctt
gtcattctcatcttgctatccactctattcagctattggcaaatgcgcgcgcttatgtct
cctcgtttatttaattatttgatcctatcgctatcggcaatggctttgtcagaggtattt
ttctccatctatgccgatatgtacggcattgaaaatattttaggccatatctttaaaatc
gttgcgtactggtttatttatgtagccttggtgatcacaaccctaacacaaccttttaat
gtattggcacgaacagccagtacttacgataccgttccagatcccactatcattatggaa
tcgagcggccaaattaaaactgctaaccttgctgccgctcagtttacccactctacaccc
gagtctttggttggcttagagaaccataccctctttcataatcccaacgcttctaaaagc
gaatgccctatttgttcgcaattaaacaaaactgaaccattcatgggagaaattaataga
gaaaatgatggatgggtagaatgtagcttaacgccaatttcttctgaattttatccaaat
gcttgggtacaagtgattcgtgacatctctgatcgaaaatatttggagttagaaaggaca
aacttagtcaaggaattaggtcagcgaattgaagaattgcaccgacaccaacaagcttta
aaagaaagggaacatcattttcgggctatgattgaacagcccattacaggtatttttgtt
agggatgaaaagaaattcatttacacgaacccacggttcctcgaaatcattggttacagt
agagaagaattacaggataagaacatcttagatttgcttaacaatgatgtgcccactaaa
aaacttgttattgagatatggcaacagattaaagccggtcaagtcggtgtttcctatcag
attccgtttcgtcgaaaaaatggcaaaccgattattctcggtttgcacgccacagcaatc
acctggtatggtaagccagccgcgcttactatggttcaggatgtcacagagttaaagcaa
gcccaagacaagattaatcgctatgttaaacaattggaaaaagcaattaatggaaccttc
cttgctgtctctaatatggttgaattgcgtgatccttatactgcaggccatgaacgacgg
gtaggtttggttgcgaaagcaattgctgaggaaatgggttggcctcctgcccgctgcgag
gcactcgaattaattggacttgttcatgatattggcaaggtttcaatacctgcagaaata
ctttccaaaccaggcaaactttctgccatggaaatggagctcgtaaaaggtcatgcgcgg
gcaggatatgaaattctaaaagatattgaatttaatgcgcctgttgcggagacaatttta
caacaccacgaacgcatgaatggcagtggctatcctcaaggcctaatgggcaatgaaatc
ctgcctgaagcacggataattgccgtcgctgatgttctagaatcgatgtcttctcatcgc
ccctatcgtcctgccctaggtttagaggcagcgcttaatgaacttttacgtggtcgaaat
gaactttatgatcctgaagcagtcgacgctattgtacggctcatccgcgagaagggctat
gttctccccgccaagtga
DBGET
integrated database retrieval system