Thermosipho melanesiensis: Tmel_0548
Help
Entry
Tmel_0548 CDS
T00550
Name
(GenBank) glycogen debranching enzyme GlgX
KO
K01214
isoamylase [EC:
3.2.1.68
]
Organism
tme
Thermosipho melanesiensis
Pathway
tme00500
Starch and sucrose metabolism
tme01100
Metabolic pathways
tme01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tme00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
Tmel_0548
Enzymes [BR:
tme01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.68 isoamylase
Tmel_0548
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
CBM_48
ISOA1-3_C
Isoamylase_C
Arb2-like
baeRF_family7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR30415
UniProt:
A6LKG4
LinkDB
All DBs
Position
complement(582593..584782)
Genome browser
AA seq
729 aa
AA seq
DB search
MADYPLQYDNPDSTVKLKTKRGYPRLGATPDDTGVNFALFSRHAERVILELYQNYYDEKP
SHSFELDPILNKTGDIWHIYVYGVKHGQYYGWRVDGPYNPEEGKRFNLNKLLVDPYAKAI
SSSFDWDSSSVYGYDKNSPLKDLSFSTEDSAKSPTKSIVIDDSKYDWGNDKQLHIPWEDT
VIYEMHVRLFTISPTSNVKFRGTFLGIIEKLDHLKELGVTTIELMPVFEFNVNSIDRINP
ITGKKLKDVWGYNPLGFFAVTGNYSVGLKLGEQVFLFKDFVKELHKNGFEVILDVVYNHT
GEGNELGPTLNFRGIDNEIYYMLNPKNKRYYLNYSGCGNTLNCNHPVVKQLIIDSLRYWV
TEMHVDGFRFDLAAVLGRTPDGRWIGDFSLLKDISEDPILHNLKLIAEGWDAAGGYFLGE
FPQGWAEWNGKYRDIVRKFVRGDEGVIIELAKRITGSEDLYGNRNPQASINFITCHDGFT
MRDLVSYNEKHNEENGEDNRDGTNENFSYNHGVEGETDEPKIIKIRKQQVKNFITILMIS
HGTPMILMGDEIYRTQYGNNNAYCQDNEKTWLDWTLKEKHYDIFRFFKKMIEFRKKHHAL
RRRHFFTGKDLTGDGIADISWHGIMPFEPDWSYNSHSIAFMISGSDFLCENAKEDNDIFV
ILNQWIEPLQFTLPILHNKTWYRVVDTSKDSPNDFLDVPEQVGFNYIAQPKSSVVLISQK
SYQGSSFPV
NT seq
2190 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagattatccattacaatatgataatcctgattcaactgttaaattaaaaaccaaa
agaggatatccaaggcttggtgccacaccagatgatactggtgtaaattttgcgttattc
tcaaggcatgccgaaagggtaattttagaattgtatcaaaactattacgatgaaaaacca
tctcatagttttgagttagaccctatcttgaataagacgggagatatttggcatatatac
gtttatggtgtaaaacatggtcaatactatggttggcgggtggatggtccctacaatcca
gaagaggggaaaaggtttaatcttaataagttgttagttgatccgtatgccaaggcaatt
tcaagttcctttgattgggattcatcatctgtatatggatatgataaaaattctccttta
aaagatttgtcattttctacagaggattctgcaaaaagtcccacaaaatcaatagttata
gatgattcaaaatatgattggggtaatgacaaacaattacatattccatgggaagatact
gttatatacgaaatgcatgtaaggttatttaccataagccctacttcaaatgtaaaattc
cgtggaacgtttctgggaataattgagaagcttgatcatttaaaagaattgggagttacg
acgattgaattaatgccagtttttgaatttaatgtgaattcaattgacagaattaatccc
ataactggtaaaaaattaaaagatgtttggggttacaatccgttgggtttttttgcggtg
actggtaattactctgttggtcttaaacttggtgaacaagtatttttatttaaggatttt
gtaaaagaactccataaaaatggttttgaggttatacttgatgttgtttataaccataca
ggtgaaggtaatgaattaggtcccactttaaactttaggggaatagataatgaaatatat
tacatgcttaacccaaagaataaaagatattatttaaattattcggggtgtggaaataca
ctaaactgtaatcatcctgttgtaaagcagcttataatagatagtcttaggtattgggtt
actgaaatgcatgttgatggttttagatttgatcttgctgctgtgttgggtagaacccct
gatggaaggtggataggtgatttttcacttcttaaggatatttctgaagatcccatatta
cataatttaaaacttattgcagaaggttgggatgcagcaggagggtattttttaggtgaa
tttccacagggttgggcggaatggaacggaaaatatagagacatagtaagaaagtttgta
agaggagatgaaggagtaataatagaacttgcaaaaaggataacaggtagtgaggatttg
tatggtaatagaaatccccaagcaagtataaatttcattacttgtcatgatggatttact
atgagagatcttgttagttataatgaaaagcataatgaggaaaatggtgaggataataga
gatggtaccaatgaaaattttagttacaatcacggcgttgaaggagaaactgacgaacca
aaaataataaaaattaggaaacaacaagtaaaaaactttattactattcttatgatatcg
cacggtacccctatgattttaatgggtgatgaaatctacagaacacaatatggcaataac
aatgcatattgtcaagataatgaaaagacatggcttgattggacgttaaaggaaaagcat
tatgacatttttagattttttaaaaaaatgattgaatttagaaaaaaacatcacgcattg
agaagaagacatttttttaccggtaaagatttgacaggagatggaatagcagatattagt
tggcatggtattatgccatttgaaccagattggtcatataattctcactctattgctttt
atgataagcggaagtgattttttatgtgaaaatgcaaaagaagataatgatatatttgtg
attttgaaccaatggatagaaccattacaatttaccttgccaattcttcacaataaaact
tggtacagggtagtagatacttcaaaggattcacctaacgattttttagatgtgccagaa
caagttggttttaattatatagcccaaccaaaaagttctgttgttctaattagtcaaaaa
agttaccaaggaagcagttttcccgtataa
DBGET
integrated database retrieval system