Candidate division TM6 bacterium GW2011_GWF2_28_16: US01_C0001G0849
Help
Entry
US01_C0001G0849 CDS
T04457
Name
(GenBank) O-antigen polymerase
Organism
tmg
Candidate division TM6 bacterium GW2011_GWF2_28_16
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
TPR_17
TPR_2
TPR_11
TPR_1
TPR_16
TPR_19
TPR_8
TPR_12
TPR_CcmH_CycH
Wzy_C_2
TPR_9
TPR_MalT
DUF3017
TPR_20
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM81772
LinkDB
All DBs
Position
795533..797665
Genome browser
AA seq
710 aa
AA seq
DB search
MQINRSKISELLQKLIFVTFNLLFFLTPFIFTWMNQELFEFSKMLFVYLLTTIIAALWLT
RMVVTQKLIFKRSKLDYFLLAFLVSQVISTLFSLHPRTSWFGYYTRFNGGLLSTITYITL
FYAFVSNIKKTQLKAIYSSLFLSALIISLYAIPEHFAHSPSCWLITQKFDTNCWSDNNNP
RFRVFATFGQPNWLAAFLITIIPLNIDSLLKKKKWLDRLYLILVLGASTLALLFTKSRSG
LLGLGVALVFYAFWKILLNKKERLNNFLKLSGVALIILLISLFTGTPFTPKLSDLLQGKT
NISEATPVAETQAGGTPSEEIRKIVWQGAIKIWQRYPIFGSGVETFAYSYYLDRPLAHNL
VSEWDFLYNKAHNELLNFLANSGLVGLVSYLTLFVMIFYLGLKQFLNNKKDSRSLAILAG
LLAMFISNFFGFSTVMSNLLLFGLFAIVIMNEKNEKNEKLATIENIDKTEKINNIEYFLY
ALIGLGAILTSSKVWHIWQADYLFTQGQNTFEQGLYPSGLSTIQEAIKKSPKEAFFYDEL
AGDLAQWSIVTAKNGQSTASAQLAQKAIESNSYALELNPVHLNFYKSQARIYIRLAQLDS
RLYSYAEQALKKAITLSPTDAKLYYNLGLVLEVLGKDEEALQNMEYAIEIKSNYLQARDE
LARIYFGQGELEKAKGQYLYSLENIAPDDELVKEKLAIVEASLSAKIKKN
NT seq
2133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaattaatcgttcaaaaatttctgaactactacaaaaactaatttttgttactttt
aacctactatttttccttactccctttatttttacttggatgaaccaagaactatttgag
tttagtaaaatgctgtttgtttatttactaacaactatcatagcggctctatggctaaca
agaatggtggtgacacaaaaactaattttcaaaagaagtaaattagattatttcctttta
gcatttctcgtttctcaagtaatttcgactcttttctcgctccacccgcgcacttcttgg
tttggctattacactaggtttaatggtggactactttcaacaattacttacattactctt
ttttatgcttttgtttcgaacattaaaaaaacccaactaaaagctatttacagcagtctt
tttctctctgccttaatcatcagcttgtacgctattccagagcattttgctcattcccct
agttgctggctaattactcaaaaattcgacaccaattgctggtcggataacaacaatcct
cgttttagagtctttgctacctttggccaaccaaattggctagcagcttttttaatcact
attattcctcttaacattgattctcttttgaaaaaaaagaagtggctagatcgactttac
ttaatactcgtgcttggtgccagcactttggcgcttttgtttactaaatccaggtcagga
ttacttggattgggagttgctttagttttttatgcattttggaaaattttactgaataaa
aaagaaagattaaacaattttctcaaattaagtggagttgcactgataatcctactgatt
tctctcttcacgggcactccttttacacctaaattaagcgatctattgcaaggaaaaacc
aatattagtgaagccactcctgtagcagaaactcaagcaggcggcactccatcagaggaa
atcagaaaaatagtctggcaaggtgccattaagatttggcaacgttatcctatctttgga
tctggagtagaaacttttgcttatagctattatctagatcgaccgctggctcataactta
gtctctgagtgggacttcctctataacaaagcccacaatgaattgctcaatttcttggct
aattcaggcctagttggcttagttagctatctaactctttttgtcatgattttttatctt
ggcttgaaacagtttctgaacaataaaaaagatagtcgatctttagctattcttgcaggt
ctcttggcaatgtttatttctaactttttcggtttttctacggtgatgagcaatttgctc
ttattcggcctatttgccatcgtcatcatgaatgagaaaaatgaaaaaaatgaaaaatta
gctactatagaaaatattgataaaacagagaaaattaataacattgaatactttctttat
gctttaattggactcggcgcaattcttacaagcagtaaggtttggcacatttggcaagct
gattatttgtttactcagggtcaaaatacttttgagcaaggcttatatccatcaggacta
agtacaattcaagaagccattaagaaatcacctaaagaagcttttttttatgatgaacta
gctggagatcttgcacaatggagcatcgttactgctaaaaatggtcaatctacagccagt
gctcaacttgctcagaaagccattgaaagtaatagctatgctttagaactaaatcctgtt
catcttaatttttataagagccaagccagaatttatattcgtctcgctcaactcgattcg
agactctactcttatgcagagcaagctctcaaaaaagccatcactctttcaccaacagac
gccaaactttattacaacctaggcttagtgttggaggttttaggcaaagatgaagaagct
ttacaaaacatggaatatgccatcgaaattaagagtaattatttgcaagctagagatgaa
ttagctcgcatatatttcggtcaaggagagctagaaaaagccaaaggacaatatctctac
agtttagaaaatatcgctcctgatgatgagctcgtcaaagaaaaattggcaattgtagag
gctagcttgagcgcaaaaatcaaaaaaaactga
DBGET
integrated database retrieval system
