Thiomicrospira microaerophila: JX580_00550
Help
Entry
JX580_00550 CDS
T08259
Name
(GenBank) carboxysome shell protein
Organism
tmh
Thiomicrospira microaerophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CsoS2_M
DUF2285
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQB42439
LinkDB
All DBs
Position
106533..108713
Genome browser
AA seq
726 aa
AA seq
DB search
MSDNTQALSGRAVARARRQALTKGKGAKVDYAAVAQSTSAPVKSSAPERSEPKFTPSSRE
RSRDVVQQQPVLSAGRKASIERRKQQVKGSTSRGGSQPTRQPRKSVEPVIETAVVEPVAS
SERNYTAPASAAKGRSKVNAVKPTVAAQPKGRLVARAYRKAACEGKAKLQAKMSQNSALT
CITAAESGASCREIARQVREQRATQGKVKSTSSRPTGRMSKKSESSSPSKVGFAMTSHEQ
EVSGTVLANTQRMTGSEAGSCRVISGTEYTGPDEYQAKCSFKPDPSIRKVAMTSTISGRT
VSGTEVGLSESVTGTEPGQCRHVTGTEYMPADQGEKFCGTKPEPGVAKVSQSRTAKNQVI
SGPSMQKRDGMTGTEVGETRHITGSQYVSNTTPIANKQTREMRGSIMSAPVKSDSSSTGA
GNNVSGTNVNFNAPVTGDDAGFCQSLTGSEYQSQQVRNERCGDTLTSAVKKSIESQTFNG
QRITGDRAGLGGKITGANAGLCKSVTGSSYLSFDAVEGCAVDKSALKPDARAKGTQLNVG
RPATGSQPGPMGLTGAQKGVCQSVSGTAYMGSDQVSALCQVSAPANMGDSDFPVMMNQPM
PMMAASMPMHNYGYVPPLQQPGEVFVGSEELSEADKVVSRITGDGGDGSTSITGDSWSRD
SKVSGTEGRWAQKRNVSIPGNRSAMNAGASSFRPKENPKVSDSPITGSAGNTKSGSTVTV
SGGARA
NT seq
2181 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgataatactcaagccttgtcgggtcgtgcggttgctcgtgcgagacgtcaagca
ttaaccaagggcaagggcgctaaagtcgattatgctgccgttgctcagagtacctctgca
cctgtaaagagttcggcgcctgagcggagtgagcctaagttcactccgtctagtcgcgaa
agatcaagagatgtagttcagcagcagccagttttgtctgctggcagaaaggcatctatt
gagcgtcgaaaacagcaggttaaaggtagtacttcacgtggtggttcacaaccaactcgt
cagcctagaaagtctgtcgagccagtcattgaaacagcagttgttgagccagtggctagt
tctgagcgtaattacacggcacctgctagtgctgcgaaaggtcgttcaaaagttaacgca
gttaaaccaaccgtagcggctcagccaaaaggtcgtttagttgcgcgtgcttacagaaag
gcagcatgtgaaggtaaggcaaagttgcaagcaaagatgagccaaaatagtgcattaaca
tgtattacagcggcagagtcaggtgcaagttgtcgtgaaattgcacgtcaagttcgtgag
cagcgtgctactcaaggtaaagttaaatctacttcttcgcgccctacaggtcgcatgtca
aaaaagtccgagagcagctcaccgagtaaggttgggtttgcgatgacatctcatgaacaa
gaagtaagtggaactgttttagcaaatacacaaagaatgacaggatcagaagcaggttct
tgtcgtgtaatttctggaacagagtacacaggtcctgatgaatatcaggcaaaatgcagt
tttaaacctgatccatctattcggaaagtggctatgacttcaacaatttcaggaagaaca
gtaagtggaactgaggtaggtttgtctgaatcagttacaggtactgaacctggtcaatgt
cgtcatgtaaccggtaccgagtatatgcctgctgatcaaggtgaaaaattttgtggtact
aagcctgagccgggtgtagctaaagttagccaatctcgcactgcaaagaaccaagttatt
tctggtccttcaatgcaaaaacgtgatggtatgacgggcactgaggtgggtgaaacacgc
catatcacgggtagtcagtatgtgtctaacacaacaccgattgcaaacaagcaaacacgt
gaaatgcgcggttctattatgtcagcgcctgttaagagtgattctagctcaaccggtgca
ggtaataacgtttcaggtactaatgtaaattttaatgcgcctgttacaggcgatgatgct
ggtttttgccaaagtttaactggcagtgaatatcaatctcagcaggttcgtaatgaacgc
tgtggtgatacgctgacttcggcagttaaaaaaagcattgaatcacaaacttttaatggt
caaaggattactggcgatcgtgcaggcttaggtggcaagattactggagctaatgcaggt
ttgtgtaagagtgtaacaggctcgtcttatttaagttttgatgctgtggaaggctgtgct
gttgataagtcagcattaaaacctgatgcaagagcaaagggcactcagttgaatgtcggt
cgtccagcgacgggtagtcaacctggtcctatgggtttgacaggagctcaaaaaggggtt
tgccaatcagtgagcggcaccgcttatatgggttctgatcaagtttctgctctgtgccag
gtcagtgcgcctgctaacatgggtgattcagattttccagtaatgatgaatcaacctatg
cctatgatggcagcgagcatgcctatgcataattatggttatgtgccacctcttcagcag
ccaggcgaagtgtttgtcggttctgaagagttaagcgaagcggataaagttgtttctaga
ataacaggtgatggcggtgatggatcaacatctattaccggtgattcttggagtagagat
agcaaagtcagcggaacagaaggacgttgggctcaaaagcgtaatgtttcaatacctggt
aatcgttcagcaatgaatgcaggtgcgagcagctttagacctaaagaaaatcctaaagta
tcagacagcccgataacaggttcagctggaaacactaaaagtggttcaactgtaactgtt
tctggtggtgctagagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system