Tenacibaculum mesophilum: F9Y86_01230
Help
Entry
F9Y86_01230 CDS
T06242
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
tmp
Tenacibaculum mesophilum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_4
Ig_3
LRR_8
LRR_1
Ig_2
I-set
Ig_4
Ig_5
Por_Secre_tail
LRR_Zer-1
ig
LRR_At5g56370
TSP_3
V-set
LRR_10
Ig_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFS27096
LinkDB
All DBs
Position
complement(256479..261017)
Genome browser
AA seq
1512 aa
AA seq
DB search
MKRLLLFTLVLFGVYVNAQEISQSDKDALIALYNATDGANWTNKWDLNDSPQNWYGVVTS
VVFGASGAERHVDEINLLNNNLSGSIPADLGNLKSLNTLNLSNNNLTSAIPSALGNAKDL
NYLYLQNNQLTGNIPVELFTLNERHFVEINLSYNKLTGKLPVEIGESIANVGEVFVSNNL
LTDLPDYTNVSLFRINTLDISNNNINFSVFERVPSFDNIAKVLEDNVATFTYSPQNRVSE
IETIELNVGENISFSITGLTSANNTYQWYKNDVPIGGATNPTYQITGSTLTDAGVYYCEV
KNANVPNLTLKRNIINYNTIGAINDRNALISLYDATDGANWTDSWNLNEAMNSWEGVTVN
SLGRVTSLSLNYRKLNGELPNELGNLTELIKLHLNEGSSSSVRGSIPDSICNLVKVEDVI
IDMPGLTGAVPSCLFTIASLRSVYLIGNSPLLTLDFPDDLSNLTNLTTLSLSRIDLSSNG
GFPMSILDLTNLEKLSLYITRLTGNIPEQIGLLSNLTELSLRHSGALTGVIPSSIGDLTK
LNSLTIVSTNIEGEIPSSFSKLTSLRALDLSRNKLTGHIPSYINTFNTLTSLDFSHNNLS
GTIPDFTTLTNLQNLEFDNNKFVFKDFENEYTNYKNQIPYIFSYQPQLKIDEEQNITVIE
EESITLIAEATNSTNNSYQWRKDGVEINGATNRSYTINNLGFNDNGVYDCVIKNSIITDL
ILLKNEITLKVKSKGVIHDKNALIAFYNATDGANWTNPWDLNADISTWEGVTVNTVGRVT
ELDIRYRKLNGTLPDDLGNLTELRKLTLLGLGSTSNGLTGSIPSSLCNLTKIEEINIDQL
NLTGVIPSCLFNIISLKNVKIDGHGNMLTLDFPDDLSELINLTSLYLSNVDLSSEGDFPE
NILDLTNLERLTLFNNELTGSIPTTISNLTKLKELSIRAYKMSGSIPDEIGALVNLESLS
FNIPLTGLMPASIGDLIKLKSLRIYGNIEGEIPASFSKLTALYSLDFSRNKLTGQIPQFI
NTFSNLQLLELGGNKLSGVIPDLTSLTKLQILDIQDNQFVFEDFENEFNTYKTLFGFFYQ
PQSNIDTEEIITVIEEDEVRLTVEATKSTNNTYQWRKDGVDINGAKSREYVIESLKLTDK
GVYDCVISNSLITDLKLTKNRIILNVDPSDLDGDGIKDVDDLCLNTPAGESVNSNGCSES
QLDDDNDGINNDKDLCPNTPTGEPVNVDGCSESQLDDDNDGVFNNVDQCPNTSEGSIVDV
NGCAQYQLIDIVPSDIQVMVSSTTCPDKSNGIVNLSFKKNYIYKVILVGQGVINKTFENV
NYTSGLEITELPVGSYEICVTASELPSFSQCYNVMVSAPVALKVSQASLKGTSLTYQVSG
SENYKVTINNKEYLYTFKDTGEREITVNLNNGNNSVEITTNKPCQGVYNKSVTVKSITLY
PIPVTNYLNISGVTGNSAIVAVRSLEGATVLSAKLDVYNGGARLPMDTLATGMYLVTVTT
STQTVNTKIFKK
NT seq
4539 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagactactactttttacgctagtcctttttggcgtatatgtaaatgctcaagaa
atttctcaaagtgataaagatgctttaatagcgctttataatgctacagatggagcaaat
tggacaaacaaatgggatttgaatgactctccacagaattggtatggagtggttaccagt
gttgtttttggtgcttcaggagccgaaagacatgtggatgagataaatcttttaaataat
aatttaagtggatctatacctgctgatttaggtaacttaaaaagcttaaatacactaaat
ctttcaaataataacttgactagtgctattcctagtgctttggggaatgcaaaagatctt
aattatttataccttcaaaataaccaattaacagggaatatacctgtagagctttttacg
cttaatgagagacattttgttgaaatcaatttaagctataataaattgacaggtaagtta
ccagtggagattggagaatcaattgcaaacgtaggtgaagtttttgtatctaataaccta
ttaacagatttaccagattatactaatgtttctttattcagaataaacactttagatatc
agtaataacaatattaatttttctgtgtttgaaagagttccatcttttgacaatatagct
aaagttttagaagataatgttgctacatttacctatagtcctcaaaatagagttagtgaa
atagaaacaattgaattaaatgtaggagaaaatattagtttttcaattacagggttaaca
agcgctaataatacctatcagtggtataaaaatgatgttccaattggaggagctactaat
cctacctatcaaattacaggatcaactttaactgatgcaggtgtgtattactgtgaagta
aagaatgccaatgtaccaaaccttactttaaagagaaacattattaattacaatacaatt
ggagctataaacgatagaaatgctcttatatcgttatatgatgctactgatggcgcaaat
tggacagactcatggaatcttaatgaagctatgaattcttgggaaggagtaacggtaaat
tccttaggaagagtaacaagtttatcacttaattatagaaaacttaatggagaattacca
aatgaattaggaaacctaacagaattgatcaaattacatcttaatgaaggttcttctagt
agtgtgagaggtagtattcctgatagtatttgtaaccttgtaaaagttgaagatgttata
atagatatgccaggattgacaggagcagtaccgagttgtctttttactatagcatcattg
agaagtgtatatttaataggtaatagtcctttattaactctagattttcctgatgattta
tcaaaccttacaaatcttacaactctaagtttgagtcgaatagatctttcatctaatgga
ggatttccaatgagtattttagatttaaccaatttagaaaaattatctctttatattact
agattaactggaaacatacctgaacagatagggctacttagtaatttaacagagctttca
cttagacatagtggggcgttaactggagtgataccttcttcaataggtgatttaactaag
ttgaatagtttaacaatagtatcaacaaatattgaaggtgaaataccatcttctttttca
aaattaacatctcttcgtgctctggatctttctagaaataaactaacgggtcatatccct
tcttatattaatacttttaatactttaacaagtttagatttcagtcataataacttgtca
ggaactattcctgattttacaacattaacaaatttacagaacttagagtttgataataat
aaatttgttttcaaagattttgaaaatgaatatacaaactacaaaaatcaaataccatat
attttttcttaccaaccacaacttaaaatagatgaagagcaaaatattacggtaatagaa
gaagaatctattactttaattgcagaagcaaccaatagtactaataattcatatcaatgg
cgtaaagatggtgttgaaattaatggagcaacgaatcgttcttatacaataaataattta
ggttttaatgataatggagtatatgattgtgttataaaaaatagtattattaccgactta
atattattgaaaaatgaaataacattaaaagttaaatctaaaggtgtaatacatgataaa
aatgcccttatagcattttataatgctactgatggggcaaattggacaaatccttgggat
ctcaatgcagatataagtacttgggaaggagttacagtaaatacagttggtagagttaca
gaattagatattaggtatagaaagcttaatgggactttaccagatgatcttggaaatcta
acagaacttagaaaattaacgcttttagggttaggttctactagtaatgggctcacagga
agcattccttctagtttatgtaatcttacgaagattgaagagataaatatagatcaactt
aacttaactggtgttataccaagttgtctttttaatataatatcattaaaaaatgttaaa
attgatggtcatggaaacatgcttacattggattttcctgatgatttatcggagcttata
aatcttacatctctatatttaagtaatgtggatctttcttctgaaggtgattttccagaa
aatatattagatttaaccaatttagaaaggttgactttatttaataatgaattaacagga
agtatacctacgacaataagtaatttgactaaactaaaagaattaagtattagagcttat
aaaatgtcaggtagtataccagatgaaattggagcgcttgttaatctagaaagcctctca
tttaatatacctttgactggattaatgcctgcttcaataggggatttaatcaaactaaaa
agtttaagaatatatgggaatatagaaggagaaatacctgcttctttttctaaattaaca
gctctttattctctagatttttctagaaataagcttactggtcaaatacctcaatttatt
aatacttttagtaatttacaattactagaattaggaggaaacaaattatcaggagttatt
ccagatcttacgagtttgactaaattacaaattttggatattcaagataatcaattcgtt
tttgaagattttgaaaatgaatttaatacttataaaacattatttggtttcttttaccaa
cctcagtcgaatattgatacggaagaaataattacagtaatagaagaagatgaagttaga
ttaactgttgaagctactaaaagtactaacaatacttatcaatggcgtaaagatggggta
gatattaatggtgctaaaagcagagagtatgttattgagagtttaaaattaactgataag
ggtgtttatgattgtgttattagtaatagtcttattactgacttaaaattgacgaaaaac
agaataatattaaatgtggatccatcagatttagatggtgatggaataaaggatgtagat
gatttatgtctaaataccccagcaggagagtcggtaaactctaatggatgttccgaaagt
cagttagatgatgataatgatggaataaataatgacaaagatttatgccctaatactcca
acaggagaaccggtaaatgtagacggatgttcggagagtcaattagatgatgataatgat
ggtgtattcaataatgttgatcaatgtcctaatacaagtgaaggaagcattgttgatgtt
aatggttgtgctcaataccaattaattgatatagtgcctagtgatattcaggtcatggta
agcagtaccacttgtccagataaaagtaacggtattgtaaacctttcatttaaaaagaat
tatatttataaagtaattttggtaggacaaggtgtaataaataaaacttttgaaaatgta
aactatacttctggattagaaattacagagttacctgtaggaagttatgaaatatgtgtt
actgcgtcagagttacctagtttcagccaatgttataatgtaatggttagtgctccagta
gccttaaaagtttctcaagcgagtttaaaaggcacttcacttacttatcaagtatcaggt
agtgaaaactataaagtaacaattaataataaagagtatttgtatacttttaaagatact
ggtgaacgagaaataacagttaatctaaataatggaaataattctgtagagataacaaca
aataaaccatgtcaaggtgtttataacaagagcgttacagttaaaagtattacattgtac
cctattccagttacaaattacctaaacatttctggtgttacaggtaattctgccatagta
gccgtaagaagccttgagggagctactgtgttatcagctaagcttgatgtttataatgga
ggagctagattaccaatggatactctagctacaggaatgtatcttgtaacagttactact
tcaacacaaaccgttaacacaaaaatattcaaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system