Tenacibaculum mesophilum: F9Y86_08485
Help
Entry
F9Y86_08485 CDS
T06242
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug domain-containing protein
KO
K16087
hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor protein
Organism
tmp
Tenacibaculum mesophilum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tmp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tmp02000
]
F9Y86_08485
Transporters [BR:
tmp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
F9Y86_08485
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
CarbopepD_reg_2
OMP_b-brl_3
CBM_5_12
BrxC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFS28423
LinkDB
All DBs
Position
1899016..1901481
Genome browser
AA seq
821 aa
AA seq
DB search
MKNIITVFFLLLTVTIFSQTITVIDAETGKPVEAVAVFNKNKTTSAISNELGKIDVSNFK
KNELLTFAHVSYAGYQEKISVIKKNNYHVYLSKNSEQLDEVVVSVFKNREKTNRIAEQIA
VVSSKEIEKLSPQTSADLLASVPGIKVQKSQFGGGSPVLRGMESNRVLLVVDGVRMNNAI
YRKGHLQNSITVAPNLLDRTEVVFGPSSVIYGSDALGGVIHYYTKPPKLSEKGSEIKGNT
FLRYSSANNEITNVASAELRFKKWASFTSVAHSNFGDLKMGENRSHGFENWGKVPFYSNN
TNTFYNETPVVNSNQNLQRNTGYSQTDVLQKFYVPFSKNTDFKLNLQYSTSSNIPRFDKL
TELKNGNLKFAEWYYGPQERLLVSPQLIINPKKKWMDNGTITLAYQNIKESRIQRKFGSL
DRSYREEKVDVFSLNGDFTIPLAKRRNLGYGVEVTYNDVASNSYGKTLRVNGNKIVGFDN
DFTVQSRYPDGGSSYLSSAFYVDYRQDINDKSTLNTGIRGTNTILKAKWLDETFIDIPQN
DIRLDNQSLTATIGYVYKPNKTWQLNTVLSSGFRSPNIDDVGKIREKNGKVTIPNTSLKP
EHAYNAEIGAQKYFNNRKFRVGANVYYTLLNNYIYRENFELNGSSTIEYDGEDGAIVANV
NKGTAYVTGATVSYQGKLHRNWNTSGFVTYTYGKTYDTNEPMSSIPPLFGRFDVSYVSKK
LEGGANLVFNAKKDISDYNITEGIDNHEQTPIVNADATEDIDKYYGSPSWMTVGLYGKYQ
FTKNIALQAQLSNLFDEHYKEFASGVSAAGRNISVSLLTNF
NT seq
2466 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacataattactgtattttttttacttttaactgttacaatcttttctcaaact
attactgtaattgatgctgaaacaggaaaacctgtagaagctgttgcagtttttaataaa
aacaaaacaacatctgcaataagtaatgaattaggtaaaattgatgtctctaattttaaa
aaaaatgaattgcttacgtttgctcatgtatcttatgcaggataccaagaaaaaatatct
gtaataaaaaagaataattaccacgtatatttatcaaaaaactcagaacagttagatgag
gtagttgtttctgtttttaagaacagagaaaaaaccaaccgtatagcagagcaaatagca
gtggtgtcttcaaaagaaatagaaaaactatctccacagacttcagcagatttattagcg
agtgtacctggaattaaagttcaaaaatcacaatttggaggagggagtcctgttttacgt
ggaatggaaagtaatcgagttcttttggtggttgacggtgttcgtatgaataatgcaatt
tatagaaaaggacacttacaaaactcaattacagtagctccaaacttattagatagaaca
gaggttgtttttggtccgtcatcagtaatttatggttcagatgcattaggtggtgtaatt
cactactatactaaacccccgaagttatcagaaaaaggaagtgaaattaaaggaaataca
tttttaagatatagttcagcaaacaatgaaataactaatgtagcttctgctgaattaaga
tttaaaaaatgggcgtcttttacaagtgtagctcatagtaattttggagatttaaagatg
ggagaaaaccgttctcatggttttgaaaactgggggaaggtgcctttttactctaacaat
actaatactttttataacgagacaccggttgttaattctaatcaaaacttacaaagaaat
acaggctatagtcaaacagatgtattacaaaagttttatgttcctttttcaaaaaacaca
gactttaaactaaacttacagtattcaacctcttcaaacattcctcgttttgataagtta
acagagttaaaaaatggaaatttaaagtttgctgaatggtattatggtccacaagaacgt
ttgttagtatctccacagttaattataaatcctaagaaaaaatggatggataatggaact
attactttagcataccaaaatataaaagaaagtcgaatacaaagaaagtttggaagctta
gataggtcttacagagaagaaaaagttgatgtttttagtttaaatggagactttacaata
cccttagctaaaagaaggaatttagggtatggagtagaagttacttacaatgatgtagca
tcaaactcttacggaaaaacattacgtgttaatggtaataaaattgttggttttgataat
gactttactgtacaatctcgatatcctgatggaggaagcagttacttaagttcagctttt
tatgtagattatcgtcaagatatcaatgataaatcaacattaaatacaggaattagaggc
actaatacaatattgaaagcaaaatggttagatgaaacgtttatagatattcctcaaaat
gatataaggctagataatcaatcgctaacagcaacgatagggtatgtatataagccaaat
aaaacttggcaattaaacacggtgttatcctctggatttagatcaccaaatattgatgat
gtaggaaaaataagagagaagaacggtaaggtaactataccgaatacaagtttaaaacca
gaacatgcatacaatgctgaaattggagctcaaaaatattttaacaatagaaaatttagg
gttggggcaaatgtgtattacactttgttgaataattacatttatagagaaaattttgaa
ctaaatggaagttcaactattgagtatgacggagaagacggagctattgtagctaatgtt
aataaaggaacagcttatgttacgggtgctacagttagttatcaaggaaagttacataga
aattggaatacttcaggatttgttacttatacgtatggaaaaacttatgataccaacgag
ccaatgtcgtctattcctccattatttggtcgttttgatgtaagttatgtaagcaagaag
ttagaaggtggagccaacttagtttttaatgcaaaaaaagatatttcagattataatata
actgagggtattgataaccatgaacaaacaccaattgtaaatgcagatgcgactgaggat
attgataaatactacggaagccctagttggatgactgttgggttgtatgggaaatatcag
ttcacaaaaaacattgctttgcaagcgcaattgtctaatttgtttgatgaacattataaa
gaatttgcttcaggggtttcagctgcaggacgtaatatttcagtatctttgctaaccaat
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
