KEGG   Tenacibaculum mesophilum: F9Y86_10875
Entry
F9Y86_10875       CDS       T06242                                 
Name
(GenBank) protein kinase
  KO
K04067  primosomal replication protein N''
Organism
tmp  Tenacibaculum mesophilum
Pathway
tmp03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tmp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    F9Y86_10875
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:tmp03400]
    F9Y86_10875
DNA repair and recombination proteins [BR:tmp03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     F9Y86_10875
SSDB
Motif
Pfam: Pkinase AAA_12 AAA_11 MTES_1575 PK_Tyr_Ser-Thr AAA_19 DUF1128 Kdo DEAD SLFN-g3_helicase Helicase_RecD AAA_30
Other DBs
NCBI-ProteinID: QFS28874
LinkDB
Position
complement(2393202..2399393)
AA seq 2063 aa
MKHIRLCPACNTERPVTEMYCQNIISNSTCSWLLMNVPQTPVGGRIEIHPEAEESIKRLC
ENGHEVGEDDFMCMECGADIQELTIKEEALKKIDAYTIIEPIEISGATKECFLVKDTNEK
HFFLTYYHENSEPDKTIYDVLHRADVDHIARLVKTGYWNNRFFEVSEHIEGGSLNDLGYI
KENRLETLVNEIGRALRDFSEAGFRHRNLCPKNILIRDNETFDLVIIDYSSARLSDYDLD
TDTPIQLTRYTAPEAIIGGVSPASDWWSLGMIVLEQITKGAFFENINDKAFMIHLVTRGV
QIPEGIDERILLLLKGLLCRDPLKRWRWEQVEKWLNKEYVAPPIEATSGTDQKKEKTIQL
GDTTYTNVSYFALAAAEENNWKKSLTLFTSGEISNWVKEILGEGKIAATIRNLRSKEDID
LEWRFSLALMHLNEALPLTWRGQIIIPAWLLGNPTLASELIEGNIPDYLNTLSREKWLVN
LKSRKQNVLQKAKSLGIELDNDKLKINTLSTSRVRLKSELNLLRQIYPDAKNISLSDLMG
DIRLSEEDLILILSAQQDQFISLNQLVKEATNLAREIKIESNESFFRETLIKSRLEIYES
LHELLEGFSLSDNNNLNRWADRFRIERRLPILQSILCLSIPKDKWITPPKHEYASSLLNF
FEKKIIHTSSRGPLVRLVISKHSPRLDLKTLGTSLKPSEKILNSIINRSSSTEKIDPLSF
SQNPLLSYRTRRLVLRTANFKRDTGLDSLYLGFPFLISQFKKNNRPRILPIILWPITLEF
KYRSNPTLKIGFDKVREEIRLNPALSSSLEPENYKRITQIYNEVLSRQSLSVSEVIDAFG
SFVKHKTSKLVTHPEVTYMMEDIGLELHSSGVIFNANFTGQSISEDLRLLQKLPHSGTAM
EPILKISTPQTPEYKPIQSENNRFTVVNVDPSQEHAVMHSRLKPGIVIEGPPGTGKSQTI
VNIISDCIGRKEKVLVVSQKRAAIQVIMKRLEAVGLEKRALSITDIAKDRQEIIRSIREQ
VSFDLNKSEQQNILEKITFKRNNLAKQIDRIESKLNIISKEIHVLDDQAGASYRNILSEL
IEIQHSDYIDIPEARNFLENTSADDLNILETEISTLMREWVPSKYENNALSNLKITQYDD
ATKKAIKQDIELFNEIEEKRVDCIKQTTGVYDNEHAQFYKAWLYKNEQKLLNITDTEAKN
AKIWLDFIWDEFNEKSIGDDILDELKQLLSDLKILIFKYKKIYFSSWLIQTDNEILEEVI
RACDSYLNTSIFKFLNPLTWKHQFLLKKVLKELELHSNKENIKLLKTNSEYEITFRAYRN
HFNDILIKLNNTVETITNPKFLAVKISDKISELLDTIVLVKALKKCPLKDEAKKVLKSGK
ESEFQNFIKELSSASNRFEKRQESYEKLTDLKQWLIDSSFNFFHSNIKNNNTDLSVIQKM
SQDINHFIPYQKFRIRLGDKLQEDKTLQLLAIFRNYENKITQYTSERWPKIIQKTIRREG
LLGWKQRIEKETPALLMADSEIDQNVRLLENSLAEIKTLNKELLNLNYDFEKIGSKSQWH
GITRLRGQNYKKLREFIHLGNNLGLMNIRPIWLMSPEVVSQALPLQAGLFDVVIFDEASQ
MLIDHSIPSLYRAKRVIVSGDEKQMPPANFFGHKMDDDESEGINIELSEDNSEEELTLYE
EAWNKKEVKDCPDLLTLAKTVLPTTTLQIHYRSQYKALINFSNHAFYAGQLHIPAYHPKN
EIKKVKPLEVIRVNGVYNEQTNETEAEVLIEYLYNHWQLTENEILSTGIVTFNKKQADLI
EDKIEEKALSDDAFMEVLNRERNKQQEGEAMGFFVKNVENVQGDERDMILFSTTFGFNKQ
GVFRRNFGALGHRGGERRLNVAITRARHKVVIATSMPIKDISDMLSTGRSPSKPRDYIQG
YLKYTETHFSNQIEVANQSLKRLSSRKIEESKTLNNDGFKNTVRNYIHSLGYETVENNDN
NVFYLDLAIEDKNTGRFVIGIECDVPQNSLLKDARHREIWRPLILKKSIPHIHRTTSYKW
LQDTDNEKLRLKHAIQNALNNTP
NT seq 6192 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaacacatacgactttgtcctgcatgtaatactgaacgaccagtaaccgaaatgtat
tgccaaaacataatcagtaattcaacatgtagttggttattaatgaatgtaccccaaact
ccagtaggcggtcgaatcgaaattcatcctgaagctgaagaatcaatcaaacgcctttgt
gaaaacgggcatgaagttggagaagacgattttatgtgcatggaatgtggtgctgacatt
caagaattaacaattaaagaagaagccctcaagaaaattgatgcatacaccattattgaa
cctatcgagatttcaggagctaccaaagaatgttttttagttaaagacactaatgaaaaa
cacttttttttaacttactatcatgaaaattctgagcctgataaaacaatttatgatgta
ctgcaccgagcagatgttgatcatattgctagattagtaaaaacaggttattggaacaat
cgattttttgaagtttctgagcatatcgaaggaggatcactcaatgatttaggatatata
aaagaaaacagactcgaaactttagtaaacgaaatcggtcgagcactacgagatttctca
gaagctggttttagacatcgtaatttatgtcctaaaaacattctaatccgtgataatgaa
accttcgatttggtaattatcgattacagttctgcaaggttatcagattatgatcttgat
accgatacccctatacaattaactcggtatacagctccggaagctatcattggcggagta
agtcctgcctcggattggtggagtttaggaatgatagttttagagcaaattaccaaagga
gcgttctttgaaaacattaatgacaaggcgttcatgatccatttggtaaccagaggcgtt
caaattccagaaggtattgatgaacgtatacttttattgctaaaaggcttgttatgtaga
gaccctcttaaacgttggcgctgggaacaagtagaaaaatggctgaataaagaatatgtt
gctcctcctatagaagctacttcggggactgatcaaaaaaaggaaaaaaccatccaactt
ggagatacaacttacaccaatgtaagctattttgcacttgcggcagcagaggaaaataat
tggaaaaaaagtttgaccttatttacttctggtgaaatttcaaattgggtaaaagaaatc
cttggagaaggaaaaatagctgctactattagaaacttacgctctaaagaagatatcgat
ttggagtggaggttttccttagctttaatgcacctcaatgaagctttaccacttacttgg
cgaggacaaattattattcctgcatggttacttggcaatccaacactcgcttcagagctt
atagaaggaaacattcctgattatttaaacacactttcacgtgaaaaatggttggttaac
ctcaagagtagaaaacaaaatgttttgcaaaaagcaaagagtttaggtattgaattggat
aatgacaagctcaagattaatacactaagtacttctagggtacgattaaaatctgaattg
aatctgttacgtcaaatttatcctgatgccaaaaacatcagtttatctgatttaatggga
gacatccgacttagtgaagaagatttgatacttattttaagcgctcaacaagatcaattt
atctccttaaatcaattagtaaaagaagctactaatttggcaagagaaataaaaattgaa
tctaatgaaagtttttttagagaaactctaataaaatccagactagaaatttacgaatct
ctacacgagcttttagaagggttttcactaagtgataacaataacttaaatcgttgggca
gatcgtttcaggatagaaagacgattacccatattgcaatcaattttatgtttatctatt
cccaaagataaatggattacaccaccaaagcatgaatatgcttctagtttattaaacttt
tttgaaaaaaagattattcatacttcctctagaggtcctttagttagattagttatttct
aaacattcacctcgtttagatttaaagacattaggaacctcattaaaaccttcagaaaaa
atactcaatagtattattaatcgctcatctagtacggaaaaaatagatccattaagtttc
agccaaaacccattacttagttaccgaacaaggaggttagttttaagaacagcaaacttt
aaacgcgataccggtttagactctttatatttagggtttccgttcctaattagtcagttc
aaaaaaaataatcgtccccgaatattacctattattttatggccaattacactggaattt
aaataccgatcaaaccctacactaaaaattggtttcgacaaagttcgtgaagaaattcga
ctaaacccagctctttcaagctccttagaacctgaaaattacaaaagaataacacaaatt
tataatgaggttttaagtaggcaatctctaagtgtttctgaggttatcgatgccttcggt
tcatttgtaaaacacaaaacttcaaaacttgttactcatcctgaagttacttacatgatg
gaagatataggtcttgaactacatagctctggagtaatttttaatgccaattttacaggt
caatcaattagtgaagatttgcgtttacttcaaaaattaccacattcgggaacagctatg
gaaccaattttaaaaataagcacgccacaaacacccgaatataagcccatacaatcagaa
aataatcgatttactgtcgttaatgtagatccttcacaagaacacgcagtaatgcatagt
cgattaaaaccaggtattgtcattgaaggtccacctggaacagggaaaagccagacgatt
gttaatattatttccgattgtattggtagaaaggaaaaagtattagtagtctctcaaaaa
agagcagcaattcaggtaattatgaaacggttagaggctgtaggtctagaaaaaagagct
ctttctatcactgatattgctaaagatagacaagaaattattcgaagtattcgtgaacag
gtttctttcgatttaaacaaatctgagcaacaaaatattcttgaaaaaatcacattcaag
cgaaataacttggcaaaacaaattgatagaatcgaatcgaaattgaatataatttctaaa
gagattcatgtactggacgatcaagcaggcgcaagttatcgaaacattttatctgaactc
attgaaattcaacatagtgattatattgatattcctgaagcccgaaattttctagaaaat
acttcagcagatgatttgaacattcttgaaacggaaatcagtacgttaatgcgtgaatgg
gtgccttcaaaatatgaaaataatgcgctttccaatttaaaaataacacaatatgatgac
gcaacaaaaaaagcaattaagcaagatatagagctttttaatgagattgaagaaaaaaga
gtagattgtataaaacaaaccacaggagtctatgataatgaacacgctcaattttataaa
gcatggctgtataaaaacgaacaaaaactcctaaatattactgatacagaagctaaaaat
gctaaaatttggcttgattttatttgggatgaattcaatgaaaagtccattggtgacgat
attcttgatgaactaaaacaattactatcagacctcaaaatactgattttcaaatacaaa
aaaatctatttttcgagttggttaatacaaactgataatgaaatcctagaagaagtaatt
cgagcttgtgacagctatctaaatacatccatttttaagtttcttaatcctttaacatgg
aaacatcaatttctattgaagaaagtcttaaaagaacttgaacttcactccaataaagaa
aatataaaactattaaaaacaaattctgagtacgaaattacttttagagcttaccgaaat
cactttaatgatatattaataaagttaaacaatacagtagaaaccattacaaaccctaag
tttcttgctgtgaaaattagtgataaaatcagcgaactattagacacgattgttttagta
aaagcattaaaaaaatgccctttaaaagatgaagctaaaaaagttttaaaatccggaaaa
gaatctgaatttcaaaatttcataaaagaattaagcagtgctagtaatcgttttgaaaaa
agacaagaatcctacgaaaaactaactgacttaaaacaatggttaatagattctagtttt
aattttttccattcaaacataaaaaataacaataccgatttatctgtcattcaaaaaatg
tcccaagacataaaccactttattccatatcaaaaatttaggataagactaggagataaa
cttcaagaagacaaaacattacaacttttagcaatttttaggaattacgaaaataaaatt
actcaatacacctctgaacgttggcctaaaattatccaaaaaacaatacgacgagaaggt
ttattgggttggaaacaacgtattgaaaaagaaacaccagccttactaatggctgatagt
gaaattgaccaaaatgtacgattgttagaaaatagtttagctgaaataaaaacattaaac
aaagaactacttaacttaaactatgactttgaaaaaattggctcaaagtcacaatggcat
ggtattacacgtctacgagggcagaactataaaaaactacgagaatttattcatttaggc
aacaatttaggcttaatgaatattcgtccaatttggttgatgagcccagaggtagtttca
caagctttacctttacaagcgggattgtttgatgtagtaatttttgatgaagcttctcaa
atgttaattgatcattcaatcccttcactttatcgtgcaaaacgtgtaattgtaagtggt
gatgaaaagcaaatgcctccggcaaacttctttggtcataaaatggatgatgacgaaagt
gaaggcataaatatcgaactcagtgaggataattccgaagaagaattaactctatatgaa
gaggcttggaataaaaaagaagtcaaagattgtccagatttattaacattagccaaaacg
gttcttcccaccacaacacttcaaattcattaccgttctcaatacaaagcacttatcaac
ttttctaaccatgccttttatgctggtcaattacatattcctgcttatcatcctaaaaac
gaaattaaaaaagtaaaacctctagaagtcattcgagttaatggtgtttataatgaacaa
accaacgaaactgaagctgaagtgctaattgaatacttatataaccactggcaattaact
gaaaatgaaattttaagtacaggtattgtaaccttcaataaaaaacaagcagatcttatt
gaagataaaattgaagaaaaagcgctttcagatgatgcttttatggaagttttaaatcgt
gaacgtaacaaacaacaagaaggagaagccatgggcttttttgttaagaatgtagagaat
gttcaaggagatgaacgtgatatgattttatttagcactacatttggttttaataaacaa
ggagttttccgccgcaattttggagctttagggcatcgtggtggagaaagaagactcaat
gtagctattacaagagcaagacataaagtagttattgccacctcaatgcccatcaaagat
atttctgatatgctttctacaggacgatctccatcaaaaccaagagattatattcagggc
tatttgaaatataccgaaacacattttagtaatcaaatagaggttgctaatcaatcgtta
aaaaggctttcatcaagaaaaatagaagaaagtaaaacactaaataacgatggttttaaa
aatactgttagaaattacattcacagcttgggttatgaaaccgtggaaaataatgataac
aatgttttttatttagatttagccattgaagataaaaacacaggacgatttgttattgga
attgaatgtgatgtacctcaaaactcattacttaaagatgcaagacatcgtgaaatatgg
cgcccattgattttaaaaaaatcgattcctcatatacatagaactacctcttataagtgg
ttacaagatacagataatgaaaaattaaggctgaaacacgccatacaaaatgctttaaac
aacacaccatga

DBGET integrated database retrieval system