Trichoplusia ni (cabbage looper): 113500588
Help
Entry
113500588 CDS
T05757
Name
(RefSeq) protein artichoke-like
Organism
tnl
Trichoplusia ni (cabbage looper)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRR_9
LRR_1
fn3
Pur_ac_phosph_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113500588
NCBI-ProteinID:
XP_026737244
UniProt:
A0A7E5W9B9
LinkDB
All DBs
Position
14:434247..455998
Genome browser
AA seq
1376 aa
AA seq
DB search
MGVITLLSRLKCGVYAFLIIIHIPILQGEEHSQCPSLAENPICPCYNFKEGLFLECPSAT
PGVVKNVLSKIRGTIQSLSIYDLEISTTELKSDIFPPKIKITNLQISQSEINKISSNAFT
SLRDSLGSLSIISSKLSKIPHESFLELYNIEALDLQLNDIKDVQANTFRNLKLKKINLKG
NKIADISENAFNNLEESLIELDISENFLTVFPLKSLGKLNKLNNLRLAWNKINSIPDDIN
ATVPNLLSLDLNSNDFTKIERNWFRCMPKIKTLIFFSNRIQHIDEEAFYSLEKLETVDLS
RNKITSLAKNVFKRNRNIRTIDLSHNHLHHINGVFSNLQNLSEIFLSENNILEISDDAFE
NAFGLTVLNLEHNAVQKLHPNCFSSLQNLTQLHMGTNFLNKLPRSVFQMNRKLVTLSLDN
NEITELDELIFEKLDELKEIRLQNNKLSQIKRNVFSPLPGLLELHLQNNLVQTIDSHAFI
TLKSLQHINLQGNRLTTIGDVFPNRNSSLVSIQLGANYLSMLKNSSLRGQLNVQIMWLSQ
NNIKMLTSNLFNDLLNIQRLYLKNNSIVHIENRTFMHLRKIKFLDLSNNKLVKLSNETFY
KLVTLEELYLQNNLINQVTENTFQFLTKLKILDLSKNDIVLFNFDISSLPIKQLRLNRNS
IANIKVESLKNLPNLSDLEINSNDLTWEDIIQIQIPGLKSLIISENNFTLLENKTFAHLP
SLQTLSLELSNISQLPPTTFIKNQNLLRINLAFNNLRDLHKDVFAYTTILLELNLKGNNF
TEFPHHALFNVTSLEILDLCSNQLHSIDFFKFIGLQNLRTLSLCNNKISMLNGFNSPSLK
NLATLNLSNNMLTALPPNFFQHSVGLKEIDLSHNLFTYIPSNGLSEAVLAALTTLNMSAN
PLVQLLQTYPSKLFPLLEELVVTNTNLTIITSKDFENFPSLKRLTLSQNSIIRLSPGAFS
KLHNLEKLDLSQNKLENIPRERLQGLYSARTLNISQNIIRELEDFTSDLQSLQKLDISLN
HITRINRDVFRGLQSLTELYLSGNWLSAISADAFRNLNKLSFLDLSRNYFEIIQMKMLNV
LETQIKTIHFNENPLTCNCETQEVWRWMKEHYKIIIKGSRNLRCEHPEDLHGYSFIELPS
QKLCDIPTVIRIAIQDIQTHSIIVSWQSRNLTGLNAYQVAYFSEDHPITIRGKLVNATAR
STRLNHLTPGSRYTVCVIAVGNFGAMTSTGFSVPDARIALSPDNTAMNLYGDEQIFNHLR
PLMNDSLNSKCTSVGTIEIFGAAMESPFSNTYMDIADILTRRLSLVVGCCIGFIVFVVIV
SGLGYIKTKKRQVIVKAEVQQAPQYISYDNFNTTGVEVQTTDMDINTITDKTKVRD
NT seq
4131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcgttatcactcttctgtctcgcctgaaatgcggcgtatatgcatttctaatcatt
atccacatacccatactacaaggagaagaacattctcaatgtccaagtttagcagagaac
ccaatttgtccatgttataactttaaagaaggattatttttggagtgccccagcgctacc
cccggggtagtgaaaaatgtgctgtccaagataagaggaaccatccaatcgctatcgatt
tatgatttagaaatatcaacgacggaactcaagtctgacatttttccaccgaaaatcaaa
ataaccaatctacagatatcacagtcggaaataaacaaaataagctctaacgcttttaca
tctctacgtgactcgttagggtctttgagcataatttccagtaaattaagcaaaattccg
catgaatcattcttggaactttacaacattgaggcacttgatttacagctcaacgacatc
aaagatgttcaagcaaacactttcagaaaccttaagttgaagaaaatcaatctgaaggga
aataaaatagccgatatatcggaaaatgcatttaacaacttagaagaatctttgattgaa
ctcgacataagtgaaaattttcttactgtttttcctttgaagtctttgggaaaattgaac
aaactcaataacctgcggcttgcgtggaataaaataaactcaatacctgacgatataaac
gccacagtaccgaatttgctgtcgttggatctgaactcaaacgactttactaaaattgaa
aggaattggtttcgctgtatgccaaaaataaaaacattaatattttttagtaatcggatt
cagcacatcgacgaggaagcgttctactcattagagaaattagaaaccgtggacttaagt
cgcaacaaaataacgtcactcgccaaaaatgtatttaaaaggaatcgaaacattcgcaca
atagatctgagtcacaaccaccttcatcacataaatggtgttttttcaaatttgcagaac
ctctccgaaatatttctatccgaaaacaatattttggagatatctgatgacgcatttgag
aatgcctttggactgacagttcttaatttagaacacaatgcggtacaaaagttacatcca
aattgcttttcgtctctacaaaatttgacacagctacatatgggaacaaactttttaaat
aaacttcctcgtagtgtatttcaaatgaatcgtaaactagtaactttaagcttagataat
aatgaaattacagaattagatgaattgatatttgagaaactcgatgagttgaaagaaata
cgtttgcaaaataataagttaagtcagattaaaaggaatgtattcagtcccttgccagga
cttctagaactgcatttgcaaaacaatcttgtacaaaccatagactctcatgcatttatt
actcttaaaagtcttcaacatattaatttgcagggtaatcgtttaactactattggcgat
gtgtttcctaataggaattcgtctttggtttctatacaacttggtgcaaattatttatca
atgttgaaaaatagctctcttagagggcagttgaatgtgcaaatcatgtggcttagccaa
aacaatataaagatgttgacatctaatctgttcaatgatttgcttaatattcaaaggctg
tatctaaaaaataatagtattgtacatatagagaacagaacttttatgcacttaaggaaa
attaagttcttagatttaagtaacaataaacttgtaaagttaagtaacgagacattttat
aaacttgtaacgttggaagagctgtatctacagaataatctaattaatcaagttactgaa
aatacctttcagtttttaactaagttaaaaattttagatttgtcaaagaatgacatcgtt
ttgtttaactttgatatatcctcattgcctatcaagcagctacgacttaatagaaattct
atagcgaatataaaagtagagtctttgaaaaacttaccaaatctgagtgatctagagata
aacagtaatgacttgacttgggaagacataatccagatacaaatacccggactgaaatcc
ctcataatatcggaaaacaacttcaccttgttggaaaataaaacattcgcccatttacct
tccttgcaaactttgtccttagaactatcgaatatatcacaactgccgccgacaactttc
ataaaaaatcagaatttgttaagaatcaatttggcattcaacaatttacgagatttacac
aaagacgtgtttgcctacacgacaatactgcttgagctcaatttaaaaggaaacaatttt
acagagtttcctcatcatgctttgtttaatgttacgtctttagaaattttagatttatgt
tctaatcagctgcacagtattgacttttttaagttcattggtttacaaaatttaaggaca
ttaagcttatgtaacaacaaaatatccatgctaaacggtttcaattcaccatcacttaaa
aatttggcaactttgaatttaagtaacaatatgttaacagctcttccaccgaactttttt
caacattctgttggcctcaaggagattgacctctcccataacctctttacatacatacct
agcaacggcttgtctgaagctgtcctagcagcactaacaactctgaacatgtctgcaaat
cctctagtgcaattactacaaacatatccatcaaaattgtttccacttttggaggagtta
gttgtgacaaatacaaacttaaccatcattactagtaaggactttgaaaatttcccttca
ctaaagaggttgacgttatcccaaaactcgattattcgtctatcaccaggagctttctct
aagctacataatttggaaaaactcgatctgagtcagaataagctggaaaacatcccgagg
gaacggctccagggattgtattctgcacgtacattaaacatctctcagaacattatcaga
gaactggaagatttcacatcagacttgcaaagtcttcagaagttagacatttcattaaac
cacatcactagaatcaacagagacgtgttccgaggactccagagcctgacagaactctat
ctgagcggtaactggttatcagccatatctgcagacgcctttagaaacttaaataagtta
tcgtttctagatttgagccgaaactactttgaaataatacaaatgaaaatgctcaatgtt
ttagaaacgcaaatcaaaactatacatttcaatgaaaacccattgacgtgcaattgcgaa
actcaagaagtttggcgatggatgaaagaacattacaaaataatcatcaaagggagtcgt
aacttgcgctgcgaacacccggaagacctccacggttatagctttatcgaattaccatca
cagaaactttgcgatataccgacagttatccgtatcgcaatacaagatattcaaacacat
tcgatcatcgtctcttggcagagtcgcaatttaactggtttgaatgcatatcaagtagct
tattttagtgaagaccacccaatcacgataagggggaaattagttaatgcgacggccaga
tcaacaagactgaaccatttgacaccgggatctcgttacacagtttgtgtaattgcagtt
ggtaacttcggagcgatgacatctacagggttttcagtgcccgatgcccggatagctctt
tcacctgataatacggccatgaatctgtacggagatgaacaaattttcaaccacctccga
cctctcatgaacgattctttgaatagcaaatgtaccagcgtcggtacgatagaaatcttt
ggcgctgcgatggagagtccattctcaaatacgtacatggacattgctgatattctaaca
aggagactaagtttggttgtgggctgttgtatcgggtttatagtgttcgtcgtgatagtt
tccgggttaggttacattaagactaagaagcgacaggtcatcgtcaaagctgaagtgcag
caagccccccagtatatatcgtatgataactttaatactactggcgtagaagtccagact
actgacatggacattaatactattacggataaaacaaaagtccgtgactga
DBGET
integrated database retrieval system