KEGG   Thalassotalea nanhaiensis: RI845_01940
Entry
RI845_01940       CDS       T10168                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
tnn  Thalassotalea nanhaiensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tnn00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:tnn02000]
    RI845_01940
Transporters [BR:tnn02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   RI845_01940
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug OMP_b-brl_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: WNC68927
UniProt: A0ABY9TJD8
LinkDB
Position
complement(419267..421903)
AA seq 878 aa
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NT seq 2637 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system