Thalassotalea nanhaiensis: RI845_01940
Help
Entry
RI845_01940 CDS
T10168
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
tnn Thalassotalea nanhaiensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tnn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tnn02000
]
RI845_01940
Transporters [BR:
tnn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RI845_01940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC68927
UniProt:
A0ABY9TJD8
LinkDB
All DBs
Position
complement(419267..421903)
Genome browser
AA seq
878 aa
AA seq
DB search
MFKLSKINRSVLLYTSATLFTSTGFSAISAEDETDIERIEVTGSHIKRTDMEGPSPLTSL
SADDIAKSGVTDLISLFTKLPIAGQGTFSTQANSSDDTANGGSSVSLRGLGADSTLILVN
GRRVSVSPFAKGIDTAFVDINNIPLAAIKRVDILKDGASATYGSDAIAGVINIILRDDIE
GVEISAKIGDTADGGGEEENVSLVWGNSTETTSHTFVLDYFRRGEILYADRDYSESANQA
AQRPNDEFATDFRSSSGIPGTIALASDPTVRLPDTFGNDHCPAEDIDTANNLCRYDYAPH
MSMVPQTERFSYNYMGKYEINDNLEFFTELNGQNAKTMIRGAGSPSFNELFMSGDNANHP
MADDPTHPFYMQDLTMRRRMVDIGNRKKEVDTDYYRVITGLRGEFGEWNWEAAYSYIKSE
SVEMGVDGYPNSQRVQEAIDSELWNPFEPSSNSAEALAYIETNTTRVGKSTNKTIDAKIS
GPVFEMPAGDLMIGVGAEYREESISDNPDDQFLRGNVFGTEATQANGSRDNTAIFAELAI
PVLDSLEVQLAVRHEDYSDFGTTTDPKVSFLWAPLDNLSLRGSYGTAFRAPSLHQLGLGR
TDESPNLVDTVRCDAVGNINKACEPQEYTAVFEGNPDLGPEESTSYNLGVVYNVTDNLSF
SVDYYSYEIEDIIDSDTQFVFSNFGADPDVVERLPSTLPGDPGEVVQIFDSFQNIGDLDT
SGLDFDLRWNLDTGMGQFKLSYVLNYVLEYEDKRPDGNGGQRIDTEAGDFEQPEFRWTAG
VDWISGNGNIGANAAINYIDEFEQDASVQAPGISSLDSFVTVDAAVNYYGFENTVFTLGA
TNLFNEEPPFAYHDFMGFAVNVHSGQGQFAYLRASYKF
NT seq
2637 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaactatcaaaaataaaccgatcagttttactctatacaagtgcaactttattt
acttcaacaggatttagcgcgataagtgctgaagatgaaacagatattgaacgcattgaa
gtaaccggctcacacatcaaacgaacagatatggaagggccctcaccgttaaccagcttg
tcagccgatgacattgccaagtctggcgttaccgacctcatcagtttattcactaaactg
ccaattgccggtcaagggacattctctacccaagcaaacagtagtgatgacactgctaat
ggtggctctagtgtttcattgcgtggtttaggtgctgattcaacgctaattctagtcaac
ggtcgccgcgtatcagtcagcccatttgctaaaggtattgatacagcgtttgtggatatt
aataacattccgttagctgcgattaaacgagttgatattctcaaagatggtgcatcagca
acttatggctctgatgcgattgccggtgtaattaatattatcttacgtgatgatattgaa
ggcgttgaaataagcgctaaaattggtgacaccgctgatggtggtggtgaagaagaaaat
gttagccttgtttggggtaacagtacagaaaccactagccatacctttgttttagattac
ttccgacgcggagaaattttatacgcagatcgagattattctgaatcagcaaaccaagcg
gcacaacgccctaacgatgaatttgccactgactttagaagttcatcaggtattccgggc
acaattgctttagcatcagatccaacagttcgattaccagatacctttggtaatgatcac
tgtccagctgaagatattgataccgccaataatttatgtcgctatgattatgcgccgcac
atgtctatggtgccacaaactgagcgctttagttataactacatgggtaaatatgaaatc
aatgataatttagagttctttaccgagcttaacggacaaaacgccaaaaccatgatccgt
ggtgccggtagcccaagctttaatgagttattcatgagtggtgataacgccaatcatcct
atggctgatgatccaactcacccattttacatgcaagatttaactatgcgacgccgtatg
gttgatatcggcaatcgtaagaaagaagtagacactgattactatcgagtgattactggc
ttacgtggtgaatttggtgaatggaactgggaagctgcctacagttacattaaaagtgaa
tctgtagagatgggcgtagatggttatccaaactcacaacgcgtacaagaagcgatagat
agcgaactgtggaacccgtttgaaccgtcatcaaactcagcggaagcacttgcgtatatt
gaaactaatactacccgagtaggtaagtctaccaataaaaccattgatgcaaaaatttct
gggccggtatttgaaatgccagcgggcgatttaatgattggtgtaggtgcggaatatcgt
gaagagtcaattagcgataaccctgatgatcaattcttacgtggtaatgtatttggtact
gaagcaactcaagcgaatggtagtagagacaatactgcgatatttgctgagttagccatt
ccggtattagattcattagaagttcaattagctgttcgtcatgaagactatagtgacttt
ggtactacaaccgatccgaaagtatctttcttatgggcacctttggataatctaagttta
cgtggttcatatggtaccgcatttagagcaccttctttacatcaattaggtttaggtcgt
acagatgaatcgccaaacttagttgataccgtacgttgtgatgcggtaggtaatattaat
aaagcctgtgagccgcaagaatataccgcggtatttgaaggtaaccctgatttaggacca
gaagaatcaacaagttacaatctaggcgtagtatataatgttaccgataacttaagcttc
tcggtcgattattacagttacgagattgaagatattatcgactcagatacgcagtttgta
tttagtaattttggtgctgatcctgatgtggtagaacgcttaccatcgacattacctggc
gatcctggtgaggtcgtacaaatatttgattcattccaaaatataggtgatttagataca
tctggcttagatttcgatttacgttggaatttagacaccggcatgggtcaattcaaatta
tcttatgtacttaactatgtacttgagtatgaagataaacgtcctgatggtaacggtggt
caacgtattgatacggaagctggtgattttgaacaaccagaatttcgttggactgcaggg
gtagattggataagcggcaacggtaacatcggtgcaaacgctgcaataaactatattgat
gaatttgaacaagatgcttctgtgcaagcacctggtatttcatctttagattcatttgta
acggtcgatgcagcagtaaattactatggtttcgaaaacacagtatttactttaggtgca
acaaacctatttaatgaagagcctccttttgcctaccatgactttatgggctttgccgta
aatgtgcatagcggccaaggacaattcgcttacttaagagctagttacaagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system