Thermodesulfobium narugense: Thena_1019
Help
Entry
Thena_1019 CDS
T01488
Name
(GenBank) UvrD/REP helicase
Organism
tnr
Thermodesulfobium narugense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
DEAD
NERD
Terminase_6N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEE14648
UniProt:
M1E7H4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1022081..1025203)
Genome browser
AA seq
1040 aa
AA seq
DB search
MEDGLKRVSRLQRDDELTFPHFYLVSASAGSGKTYTLCMRFCQFLLSKCIQNNNLSNIIA
LTFTKNAANEMKQRILEWLKRISLGLLSEDDKNNLIELLSLPFNEIVTRSEKLIDLIFNN
FYEFQVSTIDSFMSKIFKVMAFETNILASNIKIDIEEIIDFAVDKFIQDIDFLELEEFIK
VIASNNSISFNPKEDLKKNLLTLLNLENRKLGYFKENKDIEPALDKVKLLMRNLALLAEK
SLRKSFKLNGKIKEENFYKLIEKLNNPEKNIINIIKSIYKTFPFNKEKSDDYIYLKSEWE
KNISEIYTYLPILSQIRFQPYIKLLSKFKLTLENCYKDFGAIYIGNMNKMIFENLNEETI
TKIQFCLGSYVYHILIDEFQDTDEVQWACIKKLCDDLLSRNGSVFAVGDIKQSIYSFRGA
NYKIMKETIEKPTKNTFLLNLEKNFRTDGIIIENIKNFFQRDISDKVSETNNISGLKDFI
QFPLEERKNSGFFKSQIVFFDEPEDKEILDSKDVRIGTLKTELLNLIYELSKRYKLSDIV
VLARSNSQVNKVATWLIENGYNVVSESSMDIRDRKIIREIVSLLKFIELPNDNLNFSIFI
LGKIMNKIFVDNNISQNEIREFIFLNRNKNLFNSFKNNYIDLWNKYFKEIYFKSGYISMY
NLITLIYSIFKIPENFPEESAYLVKLLEIISEIELTGYVDINKLLYLIEQDKSEFFRIEI
SNFTDALKLMTVHKAKGLEFPVVINVIDAENNYALINKKKLDYSFFIYEEKTNFEADKSS
LSLLHITREVAQKNNFLNEILSDKDVDCILDDLNLLYVAMTRAKFELYNFMCIKKIETSD
NLYNLEKEDGEKKKIIDVEVNDFEFDNFKINYEFTVEPLGIEQNWKKNDIASIKRGILFH
KILERIKYKEDLFGLENITKLYENDIKLFEPEIAKKISSIVMNEQFSKFFSPLNKIFTEV
DFVDKKGNLFRIDRLVIEKDIIYVVDYKTSLKEYYKNFEKKNYLRQIKLYMKLVKNFYRR
STVGVILDIDNMSKEIIKDE
NT seq
3123 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggaagatgggttaaagagagtatcaagattacaaagagatgatgaactaacttttccc
cacttttatttagtaagcgcatctgcaggttctggcaaaacttatactttgtgtatgagg
ttttgccagtttttgttgtcaaaatgtatacaaaataataatttatcaaatatcattgct
ctaacgtttacaaaaaatgctgcaaacgaaatgaagcaaaggattttggaatggttaaaa
agaatatctctaggtttgttaagcgaagatgataaaaataatttaattgaattactatct
ctcccctttaatgaaatcgttactcgatctgaaaagctaatagatttaatatttaataat
ttttatgaatttcaggtaagcacgatcgacagctttatgtcaaaaatttttaaggtgatg
gcatttgaaactaacattttagcaagtaatataaaaattgatattgaagaaataattgat
tttgctgttgataaattcatacaagacattgattttcttgagcttgaggagtttataaaa
gttattgcttcaaacaactctataagctttaacccaaaagaagatttgaaaaaaaattta
ttaactttattgaatttagagaataggaaactaggatactttaaagaaaataaggatatt
gagccagctttagataaagtaaaattactcatgagaaatttagctttattggctgaaaag
tctttaagaaagagttttaagctaaacggaaaaattaaagaagagaatttctataaactt
atagaaaaattaaataatcctgaaaaaaatataatcaacattattaaaagtatttataaa
accttcccctttaataaagaaaaaagtgatgattatatctatttgaaatctgaatgggaa
aaaaatatttctgagatatacacatatttaccaattttgagtcaaataagatttcagcca
tacattaaattgcttagtaaattcaaattaactttagaaaattgctataaagattttggt
gctatttatattggcaacatgaataaaatgatttttgaaaatcttaatgaagaaactatt
acaaagattcagttttgcttaggaagttacgtttatcatattttaatagatgaatttcag
gatacagatgaagttcaatgggcctgtataaaaaaactttgtgatgatcttttgtctaga
aatggttcagtctttgctgtcggggacataaagcagtctatttatagttttagaggggcc
aactataagattatgaaggaaacaatagaaaaaccaactaaaaatacttttttgctgaat
cttgagaaaaattttagaactgatggaattataattgaaaatatcaagaatttttttcaa
agggatatatctgacaaagtatctgaaacgaataatatttcaggcttaaaggattttatt
caatttcctttggaagaaagaaagaattcaggattttttaaaagccaaatagtttttttt
gatgagcctgaagataaagagattctcgatagtaaagatgttagaataggtactttaaaa
actgaactgcttaatttgatttatgaattgagtaaaagatataaattaagtgatattgta
gtactagctagatcaaattctcaagtaaacaaagttgccacgtggcttatagaaaatgga
tataacgtagtttcagaaagctcaatggatatcagagataggaaaataattcgagaaatt
gtttcgttactaaaattcatagaattgcctaatgataacttaaatttttctatttttatt
ttaggcaagataatgaacaaaatttttgttgataataatatttctcaaaatgagataaga
gaatttatatttttaaacagaaataaaaatttatttaactcatttaagaataattatata
gacttatggaataaatatttcaaagaaatatattttaaatctggctatatctcaatgtat
aatcttattactttgatttactcaatttttaaaattcctgaaaacttcccagaggagtcg
gcctatttagtaaaattgttggaaattatttctgaaatagaattgacaggatatgtagac
ataaataagctgctatatcttatcgaacaagataaaagtgagttttttagaattgaaatt
tctaattttactgatgcattaaaattaatgactgttcataaagcaaagggtttagagttt
cctgttgtaataaatgtaattgatgctgaaaataactatgcccttattaataagaaaaag
ctagattatagtttctttatttatgaagaaaaaaccaattttgaagcggataaaagctca
ctttcactgcttcatattacaagagaagtagcacaaaagaataactttttaaatgagatt
ttatctgataaggatgttgattgtattttagacgacttgaatcttttatatgttgcaatg
acaagggcaaaatttgaactttataattttatgtgtattaaaaagatagaaactagtgac
aatttgtataatcttgaaaaagaagatggagaaaaaaagaaaataattgatgttgaagta
aatgattttgagtttgataattttaaaattaattatgaatttacggttgagcctttgggt
atagaacaaaattggaaaaagaatgacatagcaagtataaaaagaggaattttatttcat
aaaattttggaaagaataaaatataaagaggatctttttggcttggaaaatataactaaa
ctttatgaaaacgatataaagctttttgaaccagaaatagcaaaaaaaatttcatctata
gttatgaacgaacaattttctaaattttttagccctcttaacaaaatttttacagaagtt
gattttgttgataaaaagggtaatctttttaggattgatagattggtaatagagaaggat
attatttatgttgtggattataaaacgagcttaaaagaatattataaaaattttgaaaag
aaaaactatcttaggcagattaagctttatatgaaacttgtaaaaaacttttacaggaga
agtactgtaggggtaatattagatattgataatatgtcgaaagaaattataaaagatgag
taa
DBGET
integrated database retrieval system