KEGG   Thermodesulfobium narugense: Thena_1019
Entry
Thena_1019        CDS       T01488                                 
Name
(GenBank) UvrD/REP helicase
Organism
tnr  Thermodesulfobium narugense
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 UvrD_C_2 PDDEXK_1 DEAD NERD Terminase_6N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEE14648
UniProt: M1E7H4
LinkDB
Position
complement(1022081..1025203)
AA seq 1040 aa
MEDGLKRVSRLQRDDELTFPHFYLVSASAGSGKTYTLCMRFCQFLLSKCIQNNNLSNIIA
LTFTKNAANEMKQRILEWLKRISLGLLSEDDKNNLIELLSLPFNEIVTRSEKLIDLIFNN
FYEFQVSTIDSFMSKIFKVMAFETNILASNIKIDIEEIIDFAVDKFIQDIDFLELEEFIK
VIASNNSISFNPKEDLKKNLLTLLNLENRKLGYFKENKDIEPALDKVKLLMRNLALLAEK
SLRKSFKLNGKIKEENFYKLIEKLNNPEKNIINIIKSIYKTFPFNKEKSDDYIYLKSEWE
KNISEIYTYLPILSQIRFQPYIKLLSKFKLTLENCYKDFGAIYIGNMNKMIFENLNEETI
TKIQFCLGSYVYHILIDEFQDTDEVQWACIKKLCDDLLSRNGSVFAVGDIKQSIYSFRGA
NYKIMKETIEKPTKNTFLLNLEKNFRTDGIIIENIKNFFQRDISDKVSETNNISGLKDFI
QFPLEERKNSGFFKSQIVFFDEPEDKEILDSKDVRIGTLKTELLNLIYELSKRYKLSDIV
VLARSNSQVNKVATWLIENGYNVVSESSMDIRDRKIIREIVSLLKFIELPNDNLNFSIFI
LGKIMNKIFVDNNISQNEIREFIFLNRNKNLFNSFKNNYIDLWNKYFKEIYFKSGYISMY
NLITLIYSIFKIPENFPEESAYLVKLLEIISEIELTGYVDINKLLYLIEQDKSEFFRIEI
SNFTDALKLMTVHKAKGLEFPVVINVIDAENNYALINKKKLDYSFFIYEEKTNFEADKSS
LSLLHITREVAQKNNFLNEILSDKDVDCILDDLNLLYVAMTRAKFELYNFMCIKKIETSD
NLYNLEKEDGEKKKIIDVEVNDFEFDNFKINYEFTVEPLGIEQNWKKNDIASIKRGILFH
KILERIKYKEDLFGLENITKLYENDIKLFEPEIAKKISSIVMNEQFSKFFSPLNKIFTEV
DFVDKKGNLFRIDRLVIEKDIIYVVDYKTSLKEYYKNFEKKNYLRQIKLYMKLVKNFYRR
STVGVILDIDNMSKEIIKDE
NT seq 3123 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttggaagatgggttaaagagagtatcaagattacaaagagatgatgaactaacttttccc
cacttttatttagtaagcgcatctgcaggttctggcaaaacttatactttgtgtatgagg
ttttgccagtttttgttgtcaaaatgtatacaaaataataatttatcaaatatcattgct
ctaacgtttacaaaaaatgctgcaaacgaaatgaagcaaaggattttggaatggttaaaa
agaatatctctaggtttgttaagcgaagatgataaaaataatttaattgaattactatct
ctcccctttaatgaaatcgttactcgatctgaaaagctaatagatttaatatttaataat
ttttatgaatttcaggtaagcacgatcgacagctttatgtcaaaaatttttaaggtgatg
gcatttgaaactaacattttagcaagtaatataaaaattgatattgaagaaataattgat
tttgctgttgataaattcatacaagacattgattttcttgagcttgaggagtttataaaa
gttattgcttcaaacaactctataagctttaacccaaaagaagatttgaaaaaaaattta
ttaactttattgaatttagagaataggaaactaggatactttaaagaaaataaggatatt
gagccagctttagataaagtaaaattactcatgagaaatttagctttattggctgaaaag
tctttaagaaagagttttaagctaaacggaaaaattaaagaagagaatttctataaactt
atagaaaaattaaataatcctgaaaaaaatataatcaacattattaaaagtatttataaa
accttcccctttaataaagaaaaaagtgatgattatatctatttgaaatctgaatgggaa
aaaaatatttctgagatatacacatatttaccaattttgagtcaaataagatttcagcca
tacattaaattgcttagtaaattcaaattaactttagaaaattgctataaagattttggt
gctatttatattggcaacatgaataaaatgatttttgaaaatcttaatgaagaaactatt
acaaagattcagttttgcttaggaagttacgtttatcatattttaatagatgaatttcag
gatacagatgaagttcaatgggcctgtataaaaaaactttgtgatgatcttttgtctaga
aatggttcagtctttgctgtcggggacataaagcagtctatttatagttttagaggggcc
aactataagattatgaaggaaacaatagaaaaaccaactaaaaatacttttttgctgaat
cttgagaaaaattttagaactgatggaattataattgaaaatatcaagaatttttttcaa
agggatatatctgacaaagtatctgaaacgaataatatttcaggcttaaaggattttatt
caatttcctttggaagaaagaaagaattcaggattttttaaaagccaaatagtttttttt
gatgagcctgaagataaagagattctcgatagtaaagatgttagaataggtactttaaaa
actgaactgcttaatttgatttatgaattgagtaaaagatataaattaagtgatattgta
gtactagctagatcaaattctcaagtaaacaaagttgccacgtggcttatagaaaatgga
tataacgtagtttcagaaagctcaatggatatcagagataggaaaataattcgagaaatt
gtttcgttactaaaattcatagaattgcctaatgataacttaaatttttctatttttatt
ttaggcaagataatgaacaaaatttttgttgataataatatttctcaaaatgagataaga
gaatttatatttttaaacagaaataaaaatttatttaactcatttaagaataattatata
gacttatggaataaatatttcaaagaaatatattttaaatctggctatatctcaatgtat
aatcttattactttgatttactcaatttttaaaattcctgaaaacttcccagaggagtcg
gcctatttagtaaaattgttggaaattatttctgaaatagaattgacaggatatgtagac
ataaataagctgctatatcttatcgaacaagataaaagtgagttttttagaattgaaatt
tctaattttactgatgcattaaaattaatgactgttcataaagcaaagggtttagagttt
cctgttgtaataaatgtaattgatgctgaaaataactatgcccttattaataagaaaaag
ctagattatagtttctttatttatgaagaaaaaaccaattttgaagcggataaaagctca
ctttcactgcttcatattacaagagaagtagcacaaaagaataactttttaaatgagatt
ttatctgataaggatgttgattgtattttagacgacttgaatcttttatatgttgcaatg
acaagggcaaaatttgaactttataattttatgtgtattaaaaagatagaaactagtgac
aatttgtataatcttgaaaaagaagatggagaaaaaaagaaaataattgatgttgaagta
aatgattttgagtttgataattttaaaattaattatgaatttacggttgagcctttgggt
atagaacaaaattggaaaaagaatgacatagcaagtataaaaagaggaattttatttcat
aaaattttggaaagaataaaatataaagaggatctttttggcttggaaaatataactaaa
ctttatgaaaacgatataaagctttttgaaccagaaatagcaaaaaaaatttcatctata
gttatgaacgaacaattttctaaattttttagccctcttaacaaaatttttacagaagtt
gattttgttgataaaaagggtaatctttttaggattgatagattggtaatagagaaggat
attatttatgttgtggattataaaacgagcttaaaagaatattataaaaattttgaaaag
aaaaactatcttaggcagattaagctttatatgaaacttgtaaaaaacttttacaggaga
agtactgtaggggtaatattagatattgataatatgtcgaaagaaattataaaagatgag
taa

DBGET integrated database retrieval system