Tolypothrix sp. PCC 7601: HG267_34020
Help
Entry
HG267_34020 CDS
T11260
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
toi Tolypothrix sp. PCC 7601
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
RP-C_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYD33845
LinkDB
All DBs
Position
complement(8392500..8395043)
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MSSECTQLKAEIAALRQEVAKLRTIDENAIITAAVKKSEASIVPQIAPAVAAGLTIAYNK
LEPQINSAASKAKDALERTFKNESAITNNEKNTLEAKKLAEKGISEAVEAKRIGNEAKGE
STSASREAKTASDAAKKADATATGAKQRLDVAEPKIFSADERSKIAETQAKLARKQAQET
AGDLKLVEGVANQADLKAGKAINKSTDAISDAAKAIKASGDAASEARDAKGLIDGVKKTL
GGLGEKIEKAEKLAGTAIVNAAKAVGISENALKAVAKWGGRILEILGVVANILTLIEQIA
VLETLGARIDAVERGLDALGNSVSGVLGTLFTLKRRIEAVAGTVPPVRELADQARIEALN
ASNQIPKIREAANSALGIATNAFQKAVSAQGTANTAVTVASGASSAAKKAQADALRAQAK
AELADQNAGLARKIGQQALNIGGKALDLGGKALTTALTAIAIAQLVKGLRGLPGPRGLQG
LPGLRGPRGFTGLQGAQGIPGRDGVTAVVQVQVPGQPGPQGPPGPRGDIGIGRDGRPGIN
GRDGKDMNPVDLAEIKAQLRVINAQTTANLALTNSANSKLGSPGAGGISGMLTRFQNAFD
KFDQWSKKTQLYSLITMFITLHNAMMLSNNLGQTLISIVNTGLQTIGLKDSKDQPYDVGS
IISSTFENMIKGVIGEENYQTLSQDWALANRIYQATANLINQVWNLANTVTSALEMIASW
NNKVGNALRKWGVVGGNAYSWMPENPSFQDSKLIRGLNLANEAANTVQAVVQVPLDVITQ
VQDIQQARIELQNSATQTSVTNNGQTIPPLSGVPVGEASKVKETADANKLVSAGLITDIT
DQFNANE
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctagcgaatgtacacagttgaaagcagaaattgccgcattgagacaagaagtagca
aagttaagaacgattgacgagaacgctattattactgctgctgtaaaaaaatctgaagct
tccattgttcctcaaatagcgccagcagtagcagcaggtttaacgattgcttataacaaa
ttggaaccgcaaattaatagcgcagcgagtaaagctaaagacgcactagaaagaacattc
aagaatgaatcagctatcactaataatgaaaaaaatactctagaagctaagaaattagca
gagaaaggaatatcggaagcggtagaagcaaaacgcatcggcaatgaagccaaaggagaa
tcaacaagtgcaagtagggaagcaaagacagctagtgatgctgctaaaaaagctgatgcg
actgctacaggagctaaacaacgtctagatgttgcggagcctaaaatattttcagcagat
gaacgctctaaaattgctgagacacaagcaaagctagctagaaaacaggcacaagaaaca
gcaggagacttaaagctagtagagggtgttgctaatcaggcggatttaaaagcaggtaaa
gctattaataaatcaactgatgctattagtgatgctgcaaaagctattaaagcctctggt
gatgcagctagcgaagcaagagatgcaaagggattaattgatggagtcaagaaaacttta
ggtggactaggggaaaaaatagagaaagctgaaaaattagcaggtacagcgattgttaat
gctgctaaagctgtaggtattagtgagaacgcattaaaagcagttgccaaatggggagga
agaattttagaaattcttggtgtagtagcaaatattcttacccttattgagcagatagca
gtacttgaaacattaggcgcaagaattgacgcagtagaaaggggtttggatgcattagga
aatagtgtaagcggtgtattgggtacactttttaccttaaaaagaagaattgaagcagta
gccgggacggttccaccagttcgagagttagctgaccaagcaagaattgaagcacttaac
gcgagtaaccaaatacctaagattagggaagctgcaaacagtgctttagggattgctact
aatgcatttcagaaagcggtatcagcacaaggtacagctaatactgcggttactgttgct
agtggtgcgagtagtgcagctaaaaaagctcaggctgatgcactaagggcacaggcaaaa
gctgaattggctgatcaaaatgccggactagccagaaaaattggacaacaagccctaaat
attggtggtaaagcattagatttgggcggtaaagccttaacaacagcactcacagctatt
gcgatcgcccaactagtcaaaggattgcggggacttcctggcccgcgtggacttcaagga
ctacccggactaagaggccctagaggttttacaggattgcaaggggcacaaggcattcct
ggtagagatggcgtgacagccgttgtacaagtgcaagtaccaggacagccagggccgcaa
gggccaccaggcccacggggggacattggcattggcagagatggtagaccaggaattaat
ggaagggatgggaaagacatgaacccagtagacttggcagaaattaaagctcaacttcga
gtcataaacgcacaaactacggctaatttagccctaacaaattcagccaatagtaaatta
ggcagtcctggggcgggtggaatttcaggaatgcttacaagatttcaaaatgcttttgac
aaattcgaccagtggagtaaaaaaactcagctttactcattaatcacaatgtttattact
ttgcacaatgccatgatgcttagtaataatttgggtcaaactttaatttcaattgttaat
actggactgcaaacaatcggacttaaagacagtaaagaccaaccctatgatgtgggtagc
ataatttctagcacctttgaaaacatgattaaaggtgtaattggtgaggaaaattatcaa
acactttcacaagattgggcattagctaacagaatttaccaagccaccgcaaatttaatc
aatcaagtttggaatttagccaacacggttacatctgcacttgagatgattgctagctgg
aataataaagttggcaatgcactaagaaaatggggtgttgttggtggcaatgcatactct
tggatgccagaaaatccttcattccaggattcaaaattaattcggggattaaatttagct
aacgaagctgcaaatacagtccaagctgttgttcaagttccgcttgatgttataacccaa
gttcaagatatccagcaagcaagaatcgaattacaaaattcagcaactcaaacgtcagta
actaacaatggacaaaccataccacctttaagtggtgtcccagtaggagaagcctccaaa
gttaaagagactgctgatgccaataaattagtaagtgctggattaattacagacattaca
gaccaattcaatgctaatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
