Thalassolituus oleivorans MIL-1: TOL_1610
Help
Entry
TOL_1610 CDS
T02529
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase HrpA
KO
K03578
ATP-dependent RNA helicase HrpA [EC:
5.6.2.6
]
Organism
tol
Thalassolituus oleivorans MIL-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tol00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
tol03019
]
TOL_1610
Enzymes [BR:
tol01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
TOL_1610
Messenger RNA biogenesis [BR:
tol03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
Other RNA degradation factors
Others
TOL_1610
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3418
OB_NTP_bind
Helicase_C
DEAD
HA2_C
HA2_N
AAA_22
AAA_19
nSTAND3
ResIII
AAA_30
AAA_23
T2SSE
ABC_tran
NACHT
SLFN-g3_helicase
PhoH
SRP54
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCU72034
UniProt:
M5E3G2
LinkDB
All DBs
Position
1729570..1733481
Genome browser
AA seq
1303 aa
AA seq
DB search
MKLDLPELYKAVDQCLIKDRHSLRQQVKRLEALSKGRAADDEATNATLIKDTEKLIARIQ
RSQQVVASRSQPLALTYPDLPVSERRDDILQAIQNHQVVVIAGETGSGKTTQLPKLCIEA
GLGRFGRIGHTQPRRLAARAVAQRIADELQTPLGQAVGYQVRFTDQSQDDSRIKVMTDGI
LLAQTQGDRFLNEYDVIIIDEAHERSLNIDFLLGYLHQLLQKRRDLKLVITSATIDVERF
SKHFDNAPIIEVSGRTFPVEMRYRPLVRISEDEEDRSLFEGVRDALDELRLEDSKNGQPG
DVLVFLPGEREIRECTEFLRRSDLPATDILPLYARLSGADQQRIFKPHGGRRVVLSTNVA
ETSLTVPGIKYVIDSGVARISRYSYRSKVQRLPVEAVSQASANQRAGRCGRTSPGICIRL
YEEQDFIARSEFTDPEIRRTNLASVILQMLDLRLGDIRDFPFVDAPDERFVKDGFTLLAE
LEAVDAKKRITPLGQRMARLPLDPRIARLLMEADKQQCVRELTIIASAMTVQDPRERPPE
KQQAAAEKHKLWADDDSDFVAMINLWNAYEVERQALTQNQLRKWCTKHFLSFMRMREWRD
IHRQLHIVCKELGLKERDESANYEAVHKALLSGMLSQIGFKAEGQEYLGARNRRFFLFPG
SSIYKKAPKWVMAAEMVETSRLYARTLAKIEPEWIEEIGKPLLKYQYFEPHWSTQRGQVL
AFEQSTLYGLIVNPKKRVNYATTHPEEAREILITEGLVAQRLKSRVGFYQDNIRLLRDVT
EYEEKARRRDLVLDDAYLADFYRAHLPTHLFSARDIERWYNKASKVEQSSVQFTRDMLLS
PQASGIGVDAYPAELEWQGLAFPLSYSFAPGASDDGVTLTVPLAMLRQVPESRIEWLVPG
LVANKVIAIIKGLPKNIRKQFVPVPDTATEFLRQANPDAGGLFVQLLEFINRTLRPKIEL
DVLQNGQLEAHLQMNIRIVQDGKQVEQGRDLRALIERFGDAGQVQMLTLSDDRYQRSDIQ
KWDFGSLPTATETKINGLPVRAFPCLKATKSGVELTVEADSDAALQSHREGVLHLLRQSL
SPQERDIKQLIQKSMKPHWLLAKGLGSESELVNDLLSAVFAHILLPQSEPLPRNEDEFNQ
RLDRRGELWAHAETLMGLFVEWLKIRHQILKHMRGAVSLDKAMAFSDAKAHLERLLERGF
MLKADWPRLKSYSRYLKGIEYRLDKLQGNLPRDRQSMIEFESIYTPWRDLTEKNDAALRS
TLVEFGWLLEELRISLFAQPLGTQEPVSLKRLQKRWADIVQGG
NT seq
3912 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcttgatctccctgagttgtacaaggctgtggatcagtgcctgattaaagatcgt
cattcgttgcgtcagcaggtgaagcgcttggaagccttatcgaaaggtcgcgcagctgat
gatgaagctacaaatgccaccttgatcaaggataccgaaaagctcattgctcgaattcag
cgtagccagcaagtggttgcatcacgttcacagccactagcattaacctatcccgaccta
cctgtgagtgagcgccgcgatgatattttgcaggcaattcaaaatcatcaggtcgttgtt
attgctggtgaaacgggttcgggtaaaaccacacagttaccaaagttatgtattgaagcg
ggattgggtcgcttcgggcgtattggccatactcaaccgcgtcggttggctgcgcgtgca
gttgcacaacgcatcgccgatgaattgcaaacaccgcttggtcaggcggtaggttatcaa
gttcgatttaccgatcagagccaagacgatagccgcattaaagtgatgaccgatggtatc
ttactagcccagactcaaggagatcgttttcttaatgaatacgatgtcatcattattgac
gaggcgcatgagcgcagtctaaatattgattttctactcggttatttacatcaattactg
caaaaacgtcgtgatttaaagctggttattacgtccgctactattgatgttgagaggttt
tcaaaacactttgataatgcgccgattattgaagtatcgggccgtacttttcctgtggaa
atgcgttatcggcctttggtgcgcatcagcgaagacgaagaagatagatccttgtttgaa
ggtgttcgcgatgctttagatgaattacgcttggaagacagcaaaaacggtcagccgggt
gatgttttagtatttctgccgggtgagcgtgagattcgggaatgcaccgaatttctgcgt
cgtagcgatttgcctgccacggatatattgccactttatgcacgtttgagtggcgctgat
caacaacgaattttcaagccccacggcggtcgtcgtgttgtcctgagcacgaacgtagcc
gagacctcgttaacggttccgggtattaaatatgttattgattctggcgttgcccgtatc
agtcgttatagctatcgcagtaaagttcagcgtttaccggttgaggcggtttctcaagcc
agtgcgaatcaaagggctggtcgatgcgggcgaacgtctccggggatttgcattcgttta
tatgaagaacaagattttatagctcgttcggaatttactgatccagagattcgtcgaacc
aatttagcgtctgttattttacaaatgctggatttgcgtttaggcgatattcgcgatttc
ccctttgttgatgcacctgatgagcgctttgtaaaagacggttttactttgttggcggag
ctggaagcggttgatgcgaaaaagcgtatcacgcctctcggtcaacgaatggctcgcttg
ccattagacccccgtattgcacgtttattaatggaagccgataagcagcagtgcgtgcgc
gaactaacaattattgcttcggctatgacggtacaagatccgcgcgagcgtccaccagag
aagcaacaagcagcagctgaaaaacataaactctgggcggatgacgactcagattttgtt
gccatgattaatttatggaatgcctacgaagttgaacgtcaagcattgactcaaaatcaa
ttgcgtaaatggtgtactaagcattttctatcatttatgcgcatgcgtgagtggcgtgat
attcaccgccagttacatattgtatgcaaggaattaggtcttaaagagcgagacgaaagc
gctaattacgaagccgtacataaagcgctattgtctggcatgttaagtcagatcggtttc
aaggctgaggggcaagaatatttaggcgcacgaaatcgtcgtttctttttattcccaggt
tccagtatttataagaaggctcctaaatgggtaatggcagcagagatggttgagacctct
cggctctatgctcgaacgttagccaaaatcgaacctgagtggatcgaagagataggcaag
ccgttattaaaatatcaatattttgagccgcactggagtacgcaacgtgggcaagttttg
gcgtttgagcaaagtacgttatatggcttaatagttaatccgaaaaagcgggttaattac
gcgactacccatcctgaagaagcgcgtgaaattttaattacagaaggtttagttgctcag
cgattaaagagtcgagtgggattctatcaagataatatccggctattgcgtgatgtgact
gaatatgaagaaaaagctcgccggcgagatttagtattagatgatgcctatttagcagat
ttttatcgtgctcatttaccgactcatttgtttagcgctcgcgatattgagcgttggtat
aacaaggcctcaaaagtagagcagagttcggttcaatttactcgagatatgctgttaagt
ccgcaggcatcgggtattggtgttgatgcctatccagctgagttggagtggcaagggttg
gcatttccattgtcttattcatttgcaccgggcgccagtgatgatggtgttacgctaaca
gtgcctttggcgatgttacggcaagtgcctgaatctcgtattgaatggctcgtccccgga
cttgtcgccaataaagtgatagccatcattaaaggcctgccgaagaacattcgtaagcaa
tttgtccctgtgccagacactgcgactgagtttctccggcaagcaaatcctgatgctggc
ggattgtttgtgcaattacttgagtttattaatcgaactttaagaccaaaaattgaactg
gatgttctgcaaaacggtcagttagaagcacaccttcaaatgaacattcgcattgtgcaa
gatggaaaacaagtagagcaggggcgcgatctacgtgccttgattgagcgatttggtgac
gcaggccaggttcaaatgctcaccttgagtgatgaccgatatcagcgttcagatattcag
aaatgggatttcggttcattaccgacggcgacagaaactaaaatcaatggtttacctgtt
cgtgctttcccttgcctaaaagcaactaaaagcggtgtcgagctgacggttgaagccgac
tcggatgctgccttgcaatcacatcgtgaaggtgtattgcatttgttgcggcaatccttg
tcccctcaagaacgagatattaaacaattaattcaaaagtcaatgaagcctcattggttg
ctggctaaaggattgggtagtgaatcagagctggtaaatgatttattgtcggcggtattt
gctcatatattgttacctcaatccgaaccgttgccgagaaatgaagacgaatttaatcaa
cgtttagatcgccgtggtgagttgtgggcccacgcagaaaccttgatgggattgtttgtg
gagtggctaaaaattcgtcatcaaatactgaagcatatgcgcggggctgtttcactagac
aaggcaatggccttcagtgatgcaaaagcacatttagagcggttactggagcggggcttc
atgctaaaggctgattggcctcgattgaaatcatatagtcgttacttgaaagggatagag
tatcgcttggataaattgcagggtaatttacccagagatcgccaatctatgattgagttt
gagtcaatttatacgccttggcgagatttgactgaaaagaatgatgctgcgttgcgtagt
acattagtcgaatttggctggttgctcgaggagttgcggatatcgttattcgcacagccg
ttaggtactcaggagccagtttctcttaagcgcctgcaaaaacgctgggctgatatagtg
cagggtggataa
DBGET
integrated database retrieval system
