Tolypothrix sp. PCC 7910: HCG51_19565
Help
Entry
HCG51_19565 CDS
T06504
Name
(GenBank) sigma 54-interacting transcriptional regulator
Organism
toq
Tolypothrix sp. PCC 7910
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
cNMP_binding
Fer4_5
Sigma54_activ_2
Fer4
Fer4_6
Fer4_10
Fer4_2
Fer4_9
Fer4_8
Fer4_7
Fer4_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIR41508
LinkDB
All DBs
Position
4911974..4914496
Genome browser
AA seq
840 aa
AA seq
DB search
MTSPDTVIWLQERTALEILSPTVLEAIAQVMELQVVPANTTLVSEGTPPQALYIVQNGQL
ESETSQTNLALPRGFLPGEVIHLKELLLDELTPFAITTLSECQLWVVPAAKFRELVTQYP
EINQAFFRLLAQELAQVTSALSYEQERAVALRPYLVTKAQRGIVGTSRYAVRLREQIREA
SSDRKSVEIFGEPGLEKDNIATLIHFSSPKRREPIIKINCGILQTSGAELFGRAGGKPGL
LEWLGEGSLILNNIQELPQELLPEVAQLLQTNTYTPISRPGEPKAEPLSTQARIFIVSEK
ADSQIERCIGHVIKVPPLRVRKADIKAQVEYYSSLYSRARGLEKQRITPEALRRLQAYDF
PGNLKELKNLVERAIVQAGEGKELTEEIFWSAEPQKKQFRVNLLNAYPGLRRFLRSDWWP
DRINYGFTFAAFAFLVGVLFIGPQTRDRNFALNLFWAWWWPFFLFLFPFLGRIWCSICPF
MIYGEITQKLSLWLFPRKLQRWPREKAEKWGGWFLFGLFTLIFLWEELWKLEDTAYLSAC
LLLLITAGAMIFSAIFERRFWCRYLCPIGGMNGLFAKLSMTELRAQQGICSASCTTYQCY
KGGPQKGEGMETNGCPLYSHPAQLEDNRDCVLCMTCLKACPHRSVEFNLRPPGIELWTTH
IAHNYEVALLFLLLGGVYLHRLPELQAWLGLNVDLTIFWQHLGLSLLVLIVPAAICLVAY
GLTQLFNSGRKPKKFIELAYGYLPLVLGGNFAHYLHLGLGEGGRILPITFATFGFNGEQL
PVLIAHPAVIDFLQGSTLILSVLLTVVLTQNIARQPLKALLWQHLAAIGLAASMWMIIVF
NT seq
2523 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacatctccagatacagtgatttggctacaagaacgcacagctttagaaattctctca
cctacggttttagaagcgatcgctcaggtgatggagttacaagttgtgccagctaacact
actctagtaagcgaaggtactcctccgcaagcactttatattgtccaaaatggtcaatta
gaaagtgaaactagtcaaactaacttagctttacctcgaggatttctcccaggagaagta
attcaccttaaagaattactgttagatgaattaacgccattcgcaattactaccctctca
gaatgtcaattatgggttgtacctgcggctaaatttcgcgagttagtaactcaataccca
gaaattaatcaggcttttttccggctattagcgcaagaattggcacaggtaacatcggct
ttaagctacgaacaagaacgggctgtagctttacgtccatatttagtcaccaaggcgcaa
cggggaattgttggtacaagtcggtatgcagtacgtctacgggaacagattcgagaagct
agtagcgatcgcaaatctgtagaaatctttggcgaaccagggttagaaaaagataatatc
gctactttaattcactttagctctccaaagcggcgagaaccaattattaaaattaattgt
ggcattctgcaaaccagtggtgcagagttattcggccgcgctggcggaaaaccaggactg
ttggaatggttgggggaaggtagtttaattctcaataatatccaagaattaccccaagaa
ttattacccgaagtcgcccagttactccaaacaaatacatatactcccattagtcgccct
ggagaaccaaaagctgaacctcttagtactcaagccagaattttcattgtttccgaaaaa
gctgactctcagattgaacgatgtattggtcatgtgattaaagtaccaccgctacgggta
cgcaaagctgatattaaagcacaggtggaatattactccagtctctacagccgcgctaga
ggtctggaaaaacagcgtattacccccgaagccttacgccgcttgcaagcttacgatttt
cccggtaatctcaaagaattgaagaatttagtagaaagagcgatagtccaggcaggagaa
ggaaaagaacttacagaagagatattttggtcagccgaaccccagaaaaagcaatttcgc
gttaatttattaaatgcttatcctggtttgcggaggtttttgcgtagtgactggtggccc
gatcgcattaattatggttttacctttgcagcctttgcttttttggtaggtgtattattt
attggcccccaaacacgcgatcgcaattttgctttaaatctcttttgggcttggtggtgg
ccgttctttctgtttctgttcccttttctagggcgtatttggtgttctatctgcccgttt
atgatttatggtgaaattacgcaaaaattatcgctgtggttgtttcccagaaaacttcag
cgttggcccagagaaaaagcggagaaatggggcggctggtttttatttggcctatttacc
ctaattttcctatgggaagaactctggaaattagaagatacagcttacctctcagcttgc
ttgctgctattaattaccgctggggcaatgatattttccgccatttttgagcgcagattt
tggtgccgctatctttgtcccatcggcggcatgaatggtttatttgctaaactatccatg
acagaactccgcgcccagcaaggtatctgttccgccagctgcaccacttatcaatgctat
aaaggcggcccgcaaaaaggtgaggggatggaaacaaacggctgtcctttgtactctcat
cctgcacaattagaagataacagagattgcgtgttgtgcatgacttgcctgaaagcctgt
ccccatcgttccgtcgagtttaacctacgtcccccaggtattgaactatggacaactcac
atagcccacaactatgaagtagcactattatttttgctcttgggtggtgtatatctgcat
cgactgccagaattacaagcttggttaggtttaaacgtagatttaacaattttttggcag
catttaggattatctctgctagtcttgatagttccagcagcaatttgcttagtagcttat
ggcttaacgcaactgtttaattcagggcggaaacctaaaaaatttattgagcttgcttat
ggttacctaccattagtattaggaggtaactttgcccattatctgcatctaggcttagga
gaaggtgggcggattcttcccataacttttgctacctttggcttcaatggagaacagtta
ccagtcttgatagcacaccccgcagtcatcgactttttgcaaggcagcaccctgatatta
tccgtgttgttaaccgtagtattaacgcaaaacattgcgcgtcaacctctgaaagccctg
ctttggcagcacttagcagcgattgggctggctgctagtatgtggatgattatcgttttt
taa
DBGET
integrated database retrieval system