Thalassolituus oleivorans R6-15: R615_11980
Help
Entry
R615_11980 CDS
T03056
Name
(GenBank) histidine kinase
Organism
tor
Thalassolituus oleivorans R6-15
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
HisKA
Response_reg
PAS_8
PAS
HATPase_c_2
PAS_4
MLTR_LBD
PalH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHK16330
LinkDB
All DBs
Position
2565083..2568529
Genome browser
AA seq
1148 aa
AA seq
DB search
MIPVSQLITISICYIAVLFVIAWYGDRRAHQGKPLHGSGLVYSLSLAVYCTSWTFYGAVG
QAASSGWIFLAIYVGPIVFLLLFWNLLERIVRITKEKRLTSIADFIATRYGRDHTLAVIV
TLVAVMGVVPYIALQLKAISTTFELLTQPLGLDYAIPGSIWQDTGFYISVVMALFVIIFG
TRDIDASEQHPGMILAVAFESLVKLLAFVGVGIWVMTSVFESPEEILKLTRETASDHPLL
QSNMVSVSFILQSVLAGFAIVCLPRQFQVAVVENENTNHIQTARWLFPLYLAIMMLFVAP
IALTGHLFMQDLGFSPDTYVLSLPVSMGQDALAIIAFIGGGSAASGMIIVATIAVSTMVS
NELVLPAFFRHGQQQENQQPAGVQRLVLTVRRVVIIGLIGVSYLFYRIAGEFESLAAIGL
LSFAAIAQFAPALFGGLIWQGANRQGAVAGLLGGTFIWFQMLLWPVLSQQLFAPSGIDSI
VPNNMFGFDMDDFSFTVILSLLVNCTLFVFFSVVTNASVRERMLASDFTSVRSSNQRKHT
SSFNCKVDDVRVVLERILGYQKTDGFFTLYQARHGIQYDHAMASDDLLHDAEELLASVVG
SSSARVIFSTLLGGEQIQVRDLAFLASEASQAFTLSREQLQAALENLHQGVSVIDRNLNL
VAWNRRYLELFEYPKGFIQIGKPIEEVIAYNAMRGFCGEGAVTDQVKRRMDYLKTLSAHH
FERSLPHGIVVSMQGHPMPDGGFVTSFTDITAHRKAEQALRETNITLERRVEKRTQELDD
LTSQLIDANQSKTRFLAATGHDLMQPLNAAKLFASTLSQQSLTTEQQGLLKHLEGALQSA
EDVLSLLVEISKLDSGAMEPNLKPISLAAVLRPLRDEFTALAADQGLKLHVRECKHWVIS
DAHWLRRIIQNFLSNAVRYTNKGGILLGCRVRGEHLLLEVWDTGLGIPQDKLIEIFGEFK
RLNQGRQDTKGLGLGLAIVDRMSRRMEHSVSVSSRVGRGTCFRIELPLTPAQEQKVDKSD
VVLNNTGNFSGIPTFCIDNDEAVLAGMTALLSSWECDLYACQNETEAQNIPFEPRIMLAD
YQLDHESTGLDVMMGIRAKMNNPDIPGILITADPRPEIADQAKALGFYFLSKPVRPAALR
ALMRRLLS
NT seq
3447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcccgttagtcagctaatcacaatctccatttgttatattgccgtgctctttgtg
attgcttggtacggcgaccggcgcgcccatcaaggtaaacccttacatggcagtggcttg
gtttatagcttatcgctggcagtgtattgcacgtcatggaccttctatggagcggttggg
caagcggcatccagcggttggatctttttagcgatttacgtcgggcccatcgtatttcta
ctgcttttttggaatctacttgaacgcattgtgcgtatcaccaaagaaaaacgtctaacc
tcaattgccgactttattgccacgcgctacggtcgcgatcacaccctcgccgtcatagtc
acactcgttgccgttatgggggtcgttccttatatcgcgctgcagctaaaagcaatttcc
acgacgtttgagttactcacccagcctttagggctggattacgctattcctggctctatc
tggcaagacactggtttctacatcagcgtcgtcatggctctattcgtcattatatttggt
actcgcgatatcgacgccagtgagcaacatccgggcatgattttagcggtggcatttgag
tctctggtcaaattactggcctttgttggggttggcatttgggttatgacctcggtattc
gagagccctgaagagatattgaaattaactcgagaaacggccagcgatcatccgctacta
caaagcaatatggtctcagtgtcctttatcttacaaagcgtgctcgccggttttgccatt
gtgtgtttaccacggcagtttcaagtcgccgttgtcgaaaacgaaaacaccaaccatatt
caaacggcgcgttggttattcccgctgtatttagccatcatgatgttatttgttgccccg
attgcgttaacggggcatttatttatgcaagatttaggcttttcaccggatacctatgtg
ctcagtttgcccgtttctatgggccaagatgcactcgcgattattgcctttatcggcggc
ggcagcgctgctagcggcatgattattgttgccacaatagccgtcagcactatggtatct
aacgagctggtattacccgccttctttcgtcatgggcaacagcaagaaaaccaacaaccc
gctggagtacagcgattagttctaaccgtgcgtcgtgttgttattatcggactaatcggg
gtttcgtatttattttatcgaatcgccggggagtttgaatctctcgccgcaataggctta
ttgtcgttcgctgccatcgcacaatttgcgccagctctatttggcggcttgatatggcaa
ggagccaatcgtcaaggcgcagtcgcgggcttacttggcggtacttttatttggttccaa
atgttgctttggccggtactgagtcaacagctattcgcacctagcggaatcgactctatc
gtgcctaacaatatgtttggcttcgacatggacgacttcagttttaccgtaattttaagt
ttactagtcaattgcactctatttgtctttttctcggtggtcactaacgcatccgttcgc
gaacgtatgcttgctagtgatttcaccagcgtacgcagctccaatcaacgcaaacataca
tcatcgtttaattgcaaagtcgatgatgtacgcgtggtacttgaacgcattttagggtat
caaaaaaccgatggatttttcaccctgtatcaagctcgccatggtattcaatacgaccat
gcaatggcctccgatgatctcttacacgatgctgaagagctactagcgtccgttgttggc
tcatcatcggcgcgggttattttttcgaccctactaggcggagagcaaattcaagttcgc
gatttggctttcttagccagtgaagccagtcaggcatttacactcagccgtgaacaatta
caggctgcattagaaaacctccatcaaggggtcagtgtcattgaccgtaaccttaattta
gtcgcttggaatcgccgctacttagaattatttgaatacccgaaaggctttattcaaatt
ggaaaacccatcgaagaggtcatcgcctataacgccatgcgcggcttttgtggcgaaggc
gcggttaccgatcaagttaagcgacgtatggattacttaaaaacattatccgcacatcat
tttgaacgttctctgccccacggcatcgtcgtttctatgcaaggccaccccatgcctgat
ggcggtttcgttaccagttttaccgatataacagctcatcgaaaagcagagcaggcgttg
cgtgaaaccaacataaccttagaaagacgggttgaaaaacgaacgcaagaattagacgat
ctgacctcacaattaattgatgcaaaccaaagcaaaacgcgtttcttagcggcgacaggc
cacgatttaatgcagccattaaatgccgcaaagctgtttgcatcgacgctgtcgcagcaa
agtttaacgaccgaacagcaaggtctactaaagcatttagagggtgctttgcaatctgcc
gaggacgttctgtcattgctggttgaaatatcaaagctcgattcaggggcaatggaaccg
aacttaaagccgataagcttagccgcggtattacggccattacgcgatgagttcactgcg
cttgctgccgatcaaggcttaaagctgcatgtgcgcgaatgcaagcattgggtgattagc
gacgcgcattggctgcgcagaattattcagaacttcttaagtaatgccgtgcgctatacc
aacaagggtggcatcttattaggctgtagagtacgtggagagcatcttttattagaggtt
tgggatactggtcttggcataccacaagacaaattaattgaaatattcggcgaatttaaa
cgtctcaatcaaggacgccaagacactaaaggtctggggctaggactcgctattgttgat
cgtatgtcgcgtagaatggagcattcagtcagcgtgtcatcccgagttggacgcggcacc
tgtttccgcattgaattacctctaactccagctcaagaacaaaaagttgataaaagcgat
gtcgtactgaataacaccggcaactttagtggcataccaaccttttgtattgataacgac
gaggctgtattagcgggtatgactgctctactaagcagctgggaatgcgatttatatgca
tgtcaaaacgaaacggaagcgcaaaacatcccattcgaaccacgaattatgctggcagat
tatcagctcgaccacgaatcaacggggctagatgtcatgatgggcatacgtgcaaaaatg
aataacccagacattcctggaattttaattactgcagatcctcgtccagaaatagccgat
caagcgaaggcattagggttctattttttaagcaagcccgttcgcccagcggcattacga
gccttgatgcgacgcttactgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system