Tenacibaculum ovolyticum: PG911_10445
Help
Entry
PG911_10445 CDS
T08793
Name
(GenBank) immunoglobulin domain-containing protein
Organism
tov
Tenacibaculum ovolyticum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
LRR_4
Ig_3
Ig_2
I-set
LRRNT_2
ig
Ig_5
PKD_3
fn3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX75076
LinkDB
All DBs
Position
complement(2351902..2359608)
Genome browser
AA seq
2568 aa
AA seq
DB search
MKSNKYIIILLFLVLGKSNIYGRLLTEIETFKKLSISSTCSVSEIEKQALIALYNATDGA
NWTNKWDLTKPVCEWHGVTVVGGKVTKLILSNNNLIGNISPKIGELSNLEEINFYRNKLS
GSIPTEIKNLSSLIKLNFGINLLTGEIPKWIKNLSNLKNLELYTNKLSGSIPIEIGEHSS
LTSINFGGNLLTGEIPFNLGNLLKLRSLLLYNNNLTGEIPPNFGNLPALAHLNLQGNNLT
GIIPLELGNLSTLVELNLSDNNLTGSIPLELGNNLGLNRIGLSGNQLEGKVPIFADKSLF
LTQYDLKNNRFIFNDLKDYFIAFKNKVRSLNYFPQAKVDKIETKSVKIGSSITLTSNVLI
NPNNNYQWFKDGRVIAGETQKNLVINNASLKDKGNYHFTATNNIVTGLTLIRNTITLEVT
EPVDTCGVSEIEKQALIALYNSTNGANWTNTWDLTKPVCDWYGVTVVDNKVTGVNLKHNN
LVGVIPVELGQLIHLFALDFTGNRLTGVIPKELGNIKTLRFLHLNHNQLTGSIPTELGAL
INLKQLHLHFNQLSGIIPISLAGLRALTRLALNSNQLSGTLPVELSELSSLTDLLLSVNK
LTGIIPSELGQLTNLKNLSLSYNQFSGVIPVELGLLTNLINLDLYSNKLTGVIPKELGQL
IKLNYLYLNNNQLSGVIPKELGQLIKLNYLHLHNNQFSSSIPKELSFLINLKVLNLQLNQ
LTGEIPKEFKNLLNLRTFNLFKNKITGSIPLELGNLSNLEAINLSGNNLEGKIPFTINKS
PNIVQLQIENNQFIFNDFENNFIAYQNISNGFSYSPQGKVDKIETKSVKIGSSITLTSNV
LINPNNNYQWFKDGRVIVGETQKNLVINNASLKNKGNYHFTATNNIVTGLTLIRNTITLE
VTEPVDTCGVSEIEKQALIALYNSTNGANWKNTWDLTKSVCDWFGVTVVDNKVTGVNLKY
NNLVGVIPTELGALINLKQLDLHFNQLSGTLPVELSELSSLTDLLLSINKLTGIIPSELG
RLTNLKNLSLSYNQFSGVIPVELGLLTNLINLDLYSNKLTGVIPKELGQLIKLNYLYLNN
NQLSGVIPKELGQLIKLNYLHLHNNQFSGSIPKELSFLINLKVLNLQLNQLTGEIPKEFK
NLLNLRTFNLFKNKITGSIPLELGNLSNLEAINLSGNNLEGKIPFTINKSPNIVQLQIEN
NQFIFNDFENNFIAYQNISNGFSYSPQAKVDEEETLSVVLGNSITLTTSVLTSVNNSYQW
YKNGVAITGANSKNFTISNVADTDKGIYHFTATNSIITDLTLTRNTITLEVTEPVDTCGV
SEIEKQALIALYNSTNGANWTNTWDLTKPVCDWYGVTVFQNKVTNLALNSNNLVGSIPSS
IGNLSNLLIISLYKNQITGTIPSSLEKLLNLTTLSLYSNKLSGTIPPELGNLPLLKQILL
SNNSLTGEIPSSLGNLLNLKGLWLQGNKLSGMIPLELGNLSNLELINLSGNKLEGKIPFT
INKSPKITYFIIQNNQFVFNGFENNFVAYQNSIQTFSYSPQAKVDIEETLSVELGNSITL
TSAVLTSLNNSYQWYKDGVAIAGATSKNFTISNVADADKGIYHFTATNSIVIDLTLTRNT
ITLEVTEPVDTCGVSEIEKQALIALYNSTDGANWTNTWDLTKSVCDWYGVTVVDNKVTKI
LLDQNNLVGVIPEEIGNLSSILFLFLSNNLLTEEIPKTIGNLSKLISLKLDRNNLQESIP
IEISNLSNLESLTLSNNKLTGSIPKELGNLSKLVNLNLALNSLTGFIPSELQNLIKLRQL
YLNSNDLTGSIPKELGSIDVLEIILLNNNSLTGIIPIELGKIKTIKSLFLFNNQLTGEIP
SELGNLSELVQILLNNNSLIGEIPLELGNLSNLEVINLSGNNLEGKIPFTINKSPNIAQL
QIENNQFIFNDFENNFVTYQNISNGFSYSPQAKVDQVEIKSVKIGSSITLTSNVLINPNN
NYQWFKDGRVIAGETQKNLVINNASLKDKGNYHFTANNSIVTGLILTRNPITLKVTSCPT
QNIISKLLVNPISSNSIELNWSVSAVGDNTYYEIAYGKLLEVNLNNPTTYKTVKVFTRRG
SKLITGLEASVGYGFYIKYQCQNNELYVGPIEVTTLNDSIDVDIDIEAIKATPGTSFRPM
YEKKYVVSGWVKENYNDGKPKSEYKNSMIRLYTLALENDVLSPPVFINDFYAKGAVIDGW
QRIEEIFIIKTPDNGEMVPNNLIIELVNKSSEATSYFDDIRIFPINGSMKSFVYDNKTKK
LMAELDENNFATYYEYDKEGGLVRVKKETTKGVYTIQETRSSNVKSKKIKQIIVLLCLVS
FSSIKAQSDVKKILESYKVAVENDTEYQVNLTYKVYKGHSERIPIEVQKGILYKKGNNSY
TKLSDVEMINTVNTYLKINHNEKAVLIADGVQKPEGLNLKLDELYKYVNAKIINENPKTW
VIKLTPKGKVTQLPFSSLIIELSKGTYRVKKQLFYYLTQMDFSEDLRKTDVANVKLEVLF
GKYNTSNLGYLSDVFTIKKYIKKEKDVFKPLGSIRKYEVVNMKTNKKL
NT seq
7707 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagcaataaatatataataatattactttttttggttttaggaaaaagtaatatt
tatgggaggctactaactgaaattgaaacttttaaaaaactatctattagttctacatgt
agtgtttcagaaattgaaaaacaagcattaatagctttgtataatgctacagatggagca
aattggacaaataaatgggatttaacaaaacctgtatgtgaatggcatggagtaacagtc
gtcggaggtaaagtgactaaattaatattatctaataataacttaattggaaatatttct
ccaaagataggtgagttatctaatttagaagaaataaatttctatcgaaataaattatct
ggtagtattcccacagaaataaagaatctttcttcattgataaagttaaattttggaata
aatttattaactggggaaattcctaaatggataaaaaacttatctaatttaaaaaactta
gagttatatactaataaattatctggtagtattcctatagaaataggtgaacattcttca
ctaacctctataaattttggtggtaatctattaacaggagaaataccttttaatttagga
aacttattaaaattaagatctttgcttttatataacaacaatttaacaggagaaatacct
cctaattttggaaatttaccagctttagcgcatttgaatttacaaggtaataacctaaca
ggaataatacctttagagttagggaacctatcaactttagtggagttaaatttaagtgat
aataatctaacaggaagcataccattagaattaggaaataatttaggtttaaacagaata
gggttatctggtaatcaattagaagggaaggtaccaatctttgctgataaatctttattt
ttaacacaatatgatttaaaaaataatcgatttatttttaatgatttgaaagattatttc
atagcatttaaaaataaagtaagaagtcttaattattttcctcaagcgaaagtagataag
atagaaactaaatcagtaaaaattggtagttcaataacattaacaagtaatgtgttaatt
aatccaaacaataattatcaatggtttaaagacggaagagttatagcaggagaaacacag
aagaatttagtaattaacaatgcatcactaaaagataaaggtaattatcatttcacagct
actaataatatagtaacaggtttaactttaattcgtaatacaattacgcttgaagttaca
gaacctgtagatacttgtggtgtgtcagaaattgaaaaacaagcactaatagctttatac
aattcaacaaatggtgccaactggacaaatacatgggatttaacaaaacctgtatgtgat
tggtatggggttacagtggttgataataaagtaactggtgttaatttgaagcacaataat
ttggtaggtgtaattccagtcgagcttggtcaattaattcatttatttgcattagatttt
acaggaaataggcttactggtgtaatacctaaagagcttggtaatattaaaactttaaga
tttttacatttaaatcacaaccaattaacgggttcaattcctacagagttaggtgcatta
attaatctaaaacaattacatttacattttaatcaattatcaggtataatacctataagt
ttagctggattaagggctttaactaggttagctttaaatagtaaccaactttcagggaca
ttaccagttgagttgtctgaattatccagtttaacggacctgttgcttagtgtcaataag
ttaacgggaattattccgagtgaattaggacaattaactaatttgaagaacctatctctt
agttataatcaattttctggtgtaatacctgttgagctaggtttgttaactaatttaatt
aatttagatctttattcaaataagcttacgggagtaattccgaaggaattaggtcaattg
attaagttaaattatttatacttaaataataatcaactctcaggagtaattccgaaggaa
ttaggtcaattgattaagttaaattatttacacttacataataatcaattctcaagttca
atacctaaagagttatcttttttaataaatttaaaagttttaaatcttcagttaaatcaa
ttaacaggagaaatacctaaagagttcaaaaatttgttaaatctaagaacttttaatctt
tttaaaaataaaattacaggttcaattcctttagaattgggtaatctttcaaacttagaa
gcaataaatttatctggtaataatttagaaggaaaaataccatttacgataaataaatcg
ccaaatattgtacaacttcaaattgaaaataatcaatttatttttaatgattttgaaaac
aattttattgcatatcaaaatatttcaaatgggtttagttactcaccccaagggaaagta
gataagatagaaactaaatcagtaaaaattggtagttcaataacattaacaagtaatgtg
ttaattaatccaaacaataattatcaatggtttaaagacggaagagttatagtaggagaa
acacagaagaatttagtaattaacaatgcatcactaaaaaataaaggtaattatcatttc
acagctactaataatatagtaacaggtttaactttaattcgtaatacaattacgctagaa
gttacagaacctgtagacacttgtggtgtgtcagaaattgaaaaacaagcactaatagct
ttatacaattcaacaaatggtgccaactggaaaaatacatgggatttaacaaaatctgta
tgtgattggtttggtgttacagtggttgataataaagtaactggtgttaatttgaagtac
aataatttggtaggtgtaattccaacagagttaggtgcattaattaatctaaaacaatta
gatttacattttaaccaactttcagggacattaccagttgagttgtctgaattatccagt
ttaacggacctgttgcttagtatcaataagttaacggggattattccgagtgaattagga
cgattaactaatttgaagaacctatctcttagttataatcaattttctggtgtaatacct
gttgagctaggtttgttaactaatttaattaatttagatctttattcaaataagcttacg
ggagtaattccgaaggaattaggtcaattgattaagttaaattatttatacttaaataat
aatcaactctcaggagtaattccgaaggaattaggtcaattgattaagttaaattattta
cacttacataataatcaattctcaggttcaatacctaaagagttatcttttttaataaat
ttaaaagttttaaatcttcagttaaatcaattaacaggagaaatacctaaagagttcaaa
aatttgttaaatctaagaacttttaatctttttaaaaataaaattacaggttcaattcct
ttagaattgggtaatctttcaaacttagaagcaataaatttatctggtaataatttagaa
ggaaaaataccatttacgataaataaatcgccaaatattgtacaacttcaaattgaaaat
aatcaatttatttttaatgattttgaaaacaattttattgcatatcaaaatatttcaaat
gggtttagttactcaccccaagcaaaagtagatgaagaggaaacattatctgtcgtatta
ggtaatagtattactctaacaactagtgtgttaactagtgttaacaacagttatcaatgg
tataaaaacggagtagctataactggagcaaattcaaaaaacttcactataagtaatgta
gcagatacagataaaggaatctatcattttacagcaaccaatagcatcataacagattta
actttaacacgtaatacaattactttagaagttacagaacctgtagacacttgtggtgtg
tcagaaattgaaaaacaagcactaatagctttatacaattcaacaaatggtgccaactgg
acaaatacatgggatttaacaaaacctgtatgtgattggtatggggttactgtttttcaa
aacaaggttacaaatttagcattaaatagtaataatttagtaggatcgattccttcttct
ataggtaatttatctaatttgctaataatatctctgtataagaatcaaataacaggaaca
attccttctagtttagaaaaacttttaaacctaacgacacttagcttatattcaaataaa
ctatcaggaacgattcctcctgaattaggaaacctacccttattaaagcaaatattatta
agtaataattcattgacaggcgaaattccttctagtttaggaaaccttttaaatttaaaa
ggtctttggttgcaaggaaataaactatcaggaatgattcctttagaattaggaaatctt
tcaaatttagaattaataaatttatctggtaataaattagaaggtaaaataccatttacg
ataaataaatcgccaaagattacatactttattattcaaaataaccaatttgtttttaat
ggttttgaaaataattttgttgcatatcaaaatagtatacagacttttagttattcgccc
caagcgaaagtagatatagaggaaacattatctgtagagttaggtaacagtattacttta
acaagtgcggtgttaactagcttaaataatagttatcaatggtataaagatggggtagct
atagctggagcaacttcaaaaaactttaccataagtaatgtagcagatgcagataaagga
atctaccattttacagcaaccaatagcattgtaattgatttaactttaacacgtaataca
attactttagaagttacagaaccagtagatacttgtggtgtgtcagaaattgaaaaacaa
gcgctaatagctttatacaattcaactgatggtgcaaactggacaaatacatgggattta
acaaaatcggtatgtgattggtatggtgttacagtggttgataataaagtaacaaaaatt
ttattagatcaaaataatttagttggagttatacctgaagaaataggaaacttatcttca
atattatttttatttttatcaaataacttattgacagaagaaattccaaaaactataggg
aatttatctaaattaatttctctaaagttagatagaaataatttacaagaaagtattcct
atagaaattagtaatttatctaatttagagagccttactttaagtaataataaattaaca
gggtcaattccaaaagaattagggaacttatctaaacttgttaatttaaatttagctctt
aatagccttacaggatttattccatctgaattacaaaatcttataaagttaagacaacta
tatttaaacagtaatgatttaactggctcaatacctaaagaattaggttctattgatgtt
ttagaaatcattcttttgaataataatagtttaacagggataattcctatagagttgggg
aaaataaaaaccattaaatctctttttctattcaataatcagttgactggagaaattcct
tctgaattagggaatttatctgaattggtgcaaatattattgaataataattcattaata
ggagaaattcctttagaattaggtaatctttcaaacttagaagtaataaatttatctgga
aataatttagaaggaaaaataccatttacgataaataaatcgccaaatattgcacaactt
caaattgaaaataatcaatttatttttaatgattttgaaaacaattttgttacatatcaa
aatatttcaaatgggtttagttactctcctcaagccaaagtagatcaggtagaaattaaa
tcagtaaaaataggtagttcaataacattaacaagtaatgtgttaattaatccaaacaat
aattatcaatggtttaaagacggaagagttatagcaggagaaacacagaagaatttagta
attaataatgcatcactaaaagataaaggtaattatcatttcacagctaataatagtatt
gtaacaggtttaatattaacacgtaaccctattactttaaaggttacatcatgtcctaca
caaaatattatttctaaacttttagtaaacccaatatcttctaacagtattgaattaaat
tggagtgtttcagcagtaggcgataatacttattatgaaatagcttatggtaaattgtta
gaagttaatttaaataatcctacgacatacaaaacagtaaaagtatttactagaagaggt
agtaagttaataactggattagaagcttctgttggttatgggttttatataaagtatcaa
tgtcaaaataatgaactatatgtaggtcctatagaagtaacaactttaaatgattcaata
gatgttgatattgacatagaagctataaaggctacacctggtacatcatttagaccaatg
tatgagaagaaatatgtagttagtggttgggtaaaagaaaattataatgacggtaagcct
aagtccgaatataaaaactcaatgatacgtttatatactttggcactcgaaaacgacgtt
ttatctcccccagtatttataaatgatttttacgcaaaaggagccgttattgatggatgg
caaagaattgaagaaattttcattataaaaaccccagataatggtgagatggtacccaat
aatttaattattgaattggttaataaatcttcagaagcgacaagttattttgatgatatt
agaatttttccaattaatggaagcatgaaaagttttgtatacgacaacaaaacaaaaaaa
ctaatggctgaattagatgaaaataattttgcaacttactatgagtatgataaagaagga
gggttggtaagagtaaaaaaagaaacgactaaaggagtttatactattcaagaaacaaga
tcaagtaatgttaagagtaaaaaaattaaacagatcatagttttactatgtttagtgtct
ttttcttccattaaagcacaaagtgatgttaaaaaaatacttgaatcatataaagtggcg
gtagagaatgacacagagtatcaagtaaatcttacatataaagtttataaaggacattca
gagagaatacccattgaagttcaaaaaggtattttgtataaaaaaggcaataattcttat
acaaaattgagtgatgtagaaatgattaatacagtaaatacttatttaaaaattaatcat
aatgagaaagctgttttaattgccgacggagtacaaaagcctgagggtttaaacttaaaa
ttagatgaattatataagtatgtaaatgctaagattattaatgaaaatcctaaaacctgg
gtaattaaactaacacctaaaggaaaagttacacaattaccatttagcagtttaataata
gaattaagtaaaggaacttatagagttaaaaagcaattattttattatttaactcaaatg
gatttttctgaagatctaagaaaaacagatgtagctaatgtaaaattagaggtgttgttt
ggtaaatataatacgtctaatttaggttatttatcagatgtatttacaataaaaaaatat
attaaaaaagaaaaagatgtttttaaacctttaggatctataagaaaatatgaggttgtt
aatatgaaaacaaataaaaaattatag
DBGET
integrated database retrieval system
