Tenacibaculum ovolyticum: PG911_14865
Help
Entry
PG911_14865 CDS
T08793
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit UvrA
KO
K03701
excinuclease ABC subunit A
Organism
tov
Tenacibaculum ovolyticum
Pathway
tov03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tov00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PG911_14865 (uvrA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
tov03400
]
PG911_14865 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
tov03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
PG911_14865 (uvrA)
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
PG911_14865 (uvrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrA_inter
UvrA_DNA-bind
ABC_tran
SMC_N
AAA_16
AAA_29
RsgA_GTPase
nSTAND1
DnaJ_CXXCXGXG
nSTAND3
AAA_22
AAA_21
Viral_helicase1
AAA_18
AAA_25
cobW
MeaB
DUF1924
T2SSE
AAA_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX75912
LinkDB
All DBs
Position
3309389..3312211
Genome browser
AA seq
940 aa
AA seq
DB search
MKEQEYIEVYGARAHNLKNIDVKIPREKLVVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYIETF
SAYARQFLGGLERPDVDKIDGLSPVISIEQKTTNKSPRSTVGTITEIYDFLRLLFSRASD
AYSFNTNEKMVSYSDEQIRQLILKDFNEKRIAILAPLIKSRKGHYRELFEQISKQGFVRV
RVDGEIKEIEKGMKLDRYKTHDIEVVIDRLVVNEKSDKRLEETIKTALYTGNNILMVVDV
DDEKPRYFSRELMCPTTGIAYPNPEPNTFSFNSPRGACSNCNGLGTTNEINEQKVIPDHT
VSIKNGGIIPLGDQKSSWIFKQLQTIADRHNFKLTDPINKIPANAMNIILHGGNDKFEIN
SKDLGVTRNYEIDFEGIIAFIENQYKNAESSAIKRWAKDFMDEVKCSTCNGNRLKKEALH
FKFTNKSISDLAQMDITELAAWFENIESSLSEKQLKIASEILKEIRTRIQFLLDVGLDYL
TLDRTSKSLSGGEAQRIRLATQIGSQLVGVLYILDEPSIGLHQRDNEKLINSLIKLRDVG
NSVLVVEHDKDMIEQADFVLDIGPGAGIHGGKIVSEGTFEDLKTHSTLTADYLTERKQIT
VPKERRKGNGNFIKLSGATGNNLKNVSVKFPLGQMICVTGVSGSGKSTLINETLYPILNA
HIYRGVKKPMPYKKIEGLEHIDKVIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGTFGEIRSLFAKTPEA
AIRGYKPGRFSFNVKGGRCETCQGGGVRVIEMNFLPDVHVECETCQGKRFNRETLEIRYK
GKSISDILNMTINEATDFFELIPKIYRKLKTIKDVGLGYITLGQQSTTLSGGEAQRIKLA
SELSKRDTGNTFYILDEPTTGLHFEDIRVLMDVLNKLADKGNTVLIIEHNMDVIKLADHV
IDIGMEGGKNGGNVLVTGSPEKVAKHKTSYTAKFLKKELK
NT seq
2823 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaagaacaagagtacatagaagtatacggagcaagagctcacaatttaaaaaacatt
gatgttaaaattcctcgcgaaaagctagtcgttattactggtttaagcggtagtggaaaa
tcatcattagcttttgatactatttacgctgaaggacagcgacgttatatagaaactttt
tctgcctatgctcgtcagtttttaggaggactagagcgacctgatgttgataaaatagac
ggtttatctccagttatctctattgaacaaaagactacaaacaaaagtccacgatcaaca
gtaggtacaattacagaaatttacgattttcttcgtttacttttttctcgtgcctcggat
gcttattcttttaataccaatgaaaaaatggttagttattctgatgaacaaatcaggcag
ctaattttaaaagattttaacgaaaagcgtattgctattcttgctcctttaattaaatct
agaaaaggtcattatcgtgaactttttgagcaaatttctaaacaaggttttgttagggtt
cgtgtagatggagaaataaaggaaatcgaaaaaggtatgaagctagatcgatataaaacc
cacgatattgaggtagttattgatcgtttagttgttaatgaaaaatctgataaacgttta
gaagaaaccattaaaacagctttatataccggtaataatattttaatggttgttgatgtt
gacgatgagaaacctcgttactttagtcgagaattaatgtgtcctactaccggaatagca
taccctaatcctgaaccaaatacattttctttcaattcaccaagaggtgcctgttcaaat
tgtaacggactaggtactaccaatgaaattaacgaacaaaaagtaattcctgaccataca
gtttctataaaaaatggaggaattattcctttaggagatcaaaaaagcagctggattttt
aaacaacttcaaacaattgctgacagacataattttaaacttactgacccaataaataaa
attccggcaaatgccatgaatattattttacatggtggtaatgataagtttgaaattaac
tctaaagatcttggcgtaactagaaattatgaaattgattttgaaggaattatagctttt
attgaaaatcaatataaaaatgcagaaagtagcgctattaagcgttgggcaaaagacttt
atggatgaagttaaatgctcaacatgtaatggtaatagattaaaaaaagaagccttacac
tttaaatttactaacaaaagcattagtgatttagcgcagatggatattactgaattagct
gcttggtttgaaaatattgaaagtagcctttcagaaaaacaattaaaaatagcttctgaa
attttaaaagaaattagaaccagaatccagtttttattagatgttggtttagattattta
actttagatagaacttctaaatctctatctggtggtgaagctcaacgaattagattagcg
actcaaattggctcgcaattagttggtgtattatatattttagatgaaccaagtattggt
ttacatcaacgtgataatgagaaattaattaattctctaattaaattacgtgatgttggt
aattctgttttagttgttgaacatgataaagacatgattgagcaagctgatttcgtttta
gatattggtcctggagcaggaatacatggaggaaaaattgttagcgaaggtacttttgaa
gatttaaaaacgcatagcaccttaacagctgactatttaaccgaaagaaaacaaatcact
gtaccgaaagaacgtagaaaaggtaatggaaactttattaaactttctggtgctactgga
aacaacttaaaaaacgtctctgtaaaatttcctttaggacaaatgatttgcgttactgga
gtttctggaagcggaaaatctaccttaataaacgaaactctatatcctattttaaatgct
catatttatcgtggcgtaaaaaaaccaatgccttataaaaaaattgaaggcttagagcat
attgataaggttattgatattgaccaatctcctattggacgaacacctcgttcaaatccc
gcaacctatacaggtacctttggtgaaattagaagcttatttgcaaaaactcctgaagct
gcaattagaggctataaaccaggtcgttttagctttaatgtaaaaggtggtcgttgtgaa
acttgccaaggtggtggagttcgtgtaattgaaatgaactttttaccagatgttcatgta
gagtgtgaaacttgtcaaggaaaacgttttaatagagaaactttagagattcgctataaa
ggaaaatcaatttccgatatattaaatatgactattaatgaagctaccgacttttttgaa
ctcataccgaaaatatatcgtaagttaaaaacaattaaagatgttggtctaggctatatc
actttaggtcagcaatcgactacgctctctggtggagaagcacagcgtataaaactagct
tcagagttatcaaaaagagacactggtaatactttttatattttagatgaacctaccaca
ggtttacattttgaagacatacgtgttttaatggatgttttaaataaactagctgacaaa
ggaaacaccgtgcttattattgaacataatatggatgttattaaacttgccgatcatgtt
attgatataggtatggaaggtggtaaaaatggaggtaatgttcttgttactggttctcct
gaaaaagtagctaaacataaaaccagttatactgcaaagtttttgaaaaaagaattaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system