Tenacibaculum pacificus: PG913_04675
Help
Entry
PG913_04675 CDS
T08859
Name
(GenBank) cadherin-like domain-containing protein
Organism
tpac
Tenacibaculum pacificus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_5
Cadherin_4
Big_9
CHU_C
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX74494
LinkDB
All DBs
Position
complement(1018216..1023192)
Genome browser
AA seq
1658 aa
AA seq
DB search
MLFSQFSRAQTQPNAVNDINTTYINSNISVNVPGLLSNDTDIDNDVLTITNFSINTINFS
AGETANFSEGNITINSDGSYTFIPNTNYFGNVSTINYTISDGIFSDTASLQITVENETPP
IAVNDVNTTYLNTTSIINAPGVLTNDTDIDNNILTVTSFNINSVDFTVGETANFNEGNII
ISADGSYNFTPTTDYFGNLPIITYTISDGIFSTTANLQITVENETAPIAFNDFQIIDINT
ILNTNTPGLLDNDTDIDNDILTITDFSINTTSFTAGQTANFSEGSITINANGSYNFIPNT
NYIGEVTPITYTISDGIFSTSATLQITVENENEPEAFDDYDTADINTTLSVNAPGVLIND
IDIDNNVLTVTSFSINNINFTAGQTATFSQGNITINANGSYNFIPNTDYTGNVQLITYTI
FDGTYSTTADLYLTVENTTDLIEIRNLESCNQGYTVDGEYKVIYSMTIANSSTARDYHAS
SLISNIDLTNDLQAIFGNGCVTEVSEMNVTTSTTIDYIDNPYPLEFTTDIVNPNFLDLTS
SNIFNNTTVSNATLYPRQSINIRFCVTINPFCNGRPNPTPSGSGINFDTVFNVTSSTGNA
TENLEISDFHTTEAVVAAALFVPEENPLVNPDGTFDYNNRVIITNEGTTTATNVNYNMGL
GSFLDNGIVFTTLTVSQISGSSVNINTNYDGDTNPFLLNPNNSLAPGETIILDIFYLIAP
ISFSNTNSFNQLELSQTQGALDGFDETTTENKKQYSFVTWSDGLGNHLDRYYNTASDTGT
ASSTSQCDCNSAGMGFSFNSSSSTEKVVLNTNQVPNGILEHQELTFQITITNTSEAVQIE
QLQLQDDLNAICSGNIITVSTPVIQNSTATINPILNPLYNGVTDINFFDGNSGILEANES
ITIQFSVLFNEECIGDSTVDFLATDPLNNSANSTSTIPLNISTDTDNDTIINEIDIDDDN
DTITDIDEYGGLNPLDDHDNDFVPNYKDTDFNVDANNDGVIDIFDFDNDGVPNHFDLDSD
NDGIPDIIESGNGHLNNNSESKTDMDVGVNGLHNTVENNDTLTTGINYTILNSDTNGNPN
FIDIDSDGDGIVDHIEAQTTEDYIPHNNTYFITGIDTAYPNGIIPIDTDGDLIPDYIDLN
SDNDIRDDYIEGWDFNNDGTPETTALNIDTDNDGLDDAYDSNDNFVNPKNSQTPSDLPNI
DNTDTPERDWREINAVVVLINNVSATEGDTFTFTVSLVTKNDNSIITQSASEITMNLSSI
DGTDTASQYNIAVTPYDYNQINGATLSIPAFQETATFNAISLDDTIYELDEIFTINGTIT
SLNTVNTETSGIGNIIDNDLPPTITMNDSMEDEGIDLVHTVSISHPCSTPINIDIKTNDD
VAISPDDYTSVSTNLSIDGTINPADANTEASFNISTKTDNLNEPDIENLIVSGVVTSNNV
GIQDLNKTGSIVDIDPYPIIEIEDLTVTEGNPFMFEIKLLNASLEPMQNYAPIILNIITL
DETTTQSLDYQTIPTINTIPAYTESITQIIPTIDDNLNEEAETMLLQITVVDENPLIRLL
NTGTIKDNDVPNLFSPNGDGKSDTFKIAGIEDFPNFKLIIYDRWGSEIYNYSNNGRINPI
WWDGNHNEKPAPTGVYYYTLDFNDGNQKAKTNFIQLVR
NT seq
4977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcttttttctcaatttagtagagcacagacacaacctaatgcagttaacgacattaat
acaacatacattaatagtaatataagtgtaaatgtaccagggctactttcaaacgataca
gatatcgataatgatgttttaactattactaatttttcgataaacacgattaatttttca
gcaggtgaaacagctaattttagtgaaggtaatatcaccataaattctgatggtagttat
acctttattccaaatactaattactttggtaatgtatctactattaattatactatttcc
gatggaattttttctgatacagcaagcctacaaataactgttgaaaatgaaactccacct
atagctgttaatgatgttaacacaacttatcttaatactacttcaattataaatgcccca
ggggtacttaccaatgatactgatatcgacaataatattttaactgttacttcatttaac
attaatagtgttgattttacagtaggcgaaaccgctaattttaacgaaggtaatattatt
ataagtgctgatggtagttataattttactcctactactgattattttggcaacctacct
ataattacatatactatttctgatggaattttctcgaccacagcaaacttacaaataact
gttgaaaatgaaactgctcctatagcatttaacgattttcaaattattgatattaacacc
atattaaatacaaatacaccagggttactagataatgatactgatattgacaatgatatt
ttaactattactgatttctctataaataccactagttttacagcaggacaaacagctaat
tttagtgaaggaagtattactataaatgctaatggtagctataattttattcctaataca
aattatatcggagaagtaactccgattacatacactatttctgatggaattttctcaacc
tcagcaaccctacaaataactgttgaaaatgaaaatgaaccagaagcttttgatgattat
gatacagcagatataaatactactttatctgtaaatgctccaggggtacttattaatgat
atagatattgataataatgtattaactgtaacttcttttagtattaataacattaatttt
acagcaggacaaactgctacttttagtcaaggaaatattactataaatgcaaatggtagt
tataattttattccgaatacagattatacaggaaatgttcaacttattacctatactatt
tttgatggtacttattcaactactgctgatttatatttaaccgttgaaaatacaaccgat
ttaatcgaaataagaaacttagaaagttgtaatcaaggttatacagttgatggtgaatac
aaagtaatttacagtatgactatagctaacagtagtactgctagagattatcatgcttca
agccttattagtaatatcgatttgacaaacgatttacaagctatttttggaaacggttgt
gttactgaagttagtgaaatgaacgttacaacatcaacaacaatagattatatagataat
ccgtatcctttagaatttaccacagatattgtaaatcctaattttttagatttaacctca
agtaatattttcaataatactactgttagtaatgcaacattatatcctagacaatctata
aatattcgtttttgtgtgactataaatccattttgtaatggtcgtccaaatccgactcct
tcaggttctggaattaattttgatactgtttttaatgttacctcatcaacagggaacgcc
accgaaaacttagagatttctgattttcatactacagaagcagttgttgccgcagcacta
tttgtccctgaagaaaatcctttagtaaatcctgatggtacatttgattataataatcga
gtaataatcacaaacgaaggaacaacaacagcaaccaatgttaattacaacatgggatta
ggtagttttttagataacggaattgtttttactaccttaactgtttctcaaatttcaggt
tcgtctgtaaatataaatactaattatgatggagatacgaacccttttttactaaaccct
aataattctttagcaccaggtgaaaccattattttagatatattttatttaattgcacct
atttcattttcaaatactaattcttttaatcaattagaactttctcaaacacaaggtgct
ttagatggttttgatgaaacaactaccgaaaacaaaaaacaatattcttttgttacttgg
tctgatggtttaggtaatcatttagatcgttattataacacagcatcagatacaggaaca
gcctcttctacttctcaatgtgattgtaatagtgctggtatggggttttcatttaactca
tcttcgtcaacagaaaaagttgttttaaataccaatcaagtaccaaacggaattttagaa
catcaagaacttacctttcaaattaccataacaaatactagtgaagctgttcaaattgag
caattacaattacaagatgatttaaatgctatttgtagtggaaatattattactgtcagc
acacctgttattcaaaattctacggcaacaattaatccgatattaaacccattatataat
ggagttactgatattaattttttcgatggaaattcaggtattttagaagctaatgaaagt
atcactattcaattttctgttctttttaatgaagaatgtattggtgatagtactgtcgat
tttttagctactgacccgctaaataacagtgcaaactcaacaagcacaattcctctaaat
atttctacagatacagataacgatactatcattaatgaaattgatattgatgatgataat
gatactattacagatattgatgaatacggtggtttaaatcctttggatgatcacgacaat
gattttgttcctaattataaggacactgattttaatgtagatgcaaataatgatggcgtt
atcgatatttttgattttgataatgatggcgtaccaaatcactttgatttagatagcgat
aatgatggaattcctgatattatagaatctggaaatggtcatttaaataataattccgaa
tcaaaaacagatatggatgttggtgtaaatggtttacataatactgttgaaaacaatgac
actttaactacaggaatcaattatactattttaaattctgatactaatggaaatccaaat
tttatagatatcgattctgatggcgatggaattgttgaccatattgaagcacaaactacc
gaagattatattcctcataataacacctattttataacaggtattgacaccgcttatcct
aatggaataatacctatcgatacagatggagatcttattcctgattatattgaccttaat
tctgataatgatattcgtgatgattatattgaaggatgggattttaataacgatggaact
cctgaaacaaccgctttaaatatagatactgataatgatggattagatgatgcctatgat
agtaatgataactttgtaaatcctaaaaatagtcaaactccaagtgatttaccgaatatt
gataatacagacacaccagaaagagattggcgagaaatcaatgcagttgttgtgcttatt
aataatgtaagtgctaccgaaggagatacttttacttttacggtttcattagttactaaa
aatgataattcaataataactcaaagtgcttcggaaataacaatgaatctttctagtatt
gacggaacagacacagcaagtcaatacaatattgctgtaacaccatatgattataatcaa
ataaatggagctactttaagtattcccgcttttcaagaaacggctacttttaatgccatt
tctttggatgatacaatttatgaacttgatgagattttcaccatcaacggaactataact
tctttaaatactgtaaatactgaaacttcaggaattggaaatattatagataatgacctt
ccgccaacaattactatgaacgattctatggaagatgaaggaatcgatttagtacatact
gttagcattagtcacccttgttctactcctattaatatcgatattaaaacaaatgatgat
gttgccataagccctgatgattataccagtgtttcaacaaatttaagtattgatggaact
attaatcctgcggatgcaaatacagaagcatcttttaatatcagtacaaaaacagataat
ttaaacgaacctgacatcgaaaatttaattgttagcggtgtagtaactagtaataacgta
ggtattcaagacttaaataaaacaggtagtattgttgatattgacccttatccaataatc
gaaatagaagatttaactgttacagaagggaatccgtttatgtttgaaattaaactttta
aacgccagtttagaaccgatgcaaaattatgcacctatcattcttaatataattactttg
gatgaaacaacgacacaatcattggattatcaaacaataccgactataaatacaattcct
gcatatactgaatctataacacaaattatcccaacaattgatgataatttaaatgaagaa
gctgaaacaatgctactacaaataactgttgtagatgaaaatccattaataagattactt
aacacaggaacaattaaagataatgatgttcctaatttattttcgcccaatggcgatgga
aaaagtgacaccttcaaaatagcaggaattgaagattttcctaattttaaattaattatt
tatgatagatggggaagtgaaatatataactatagcaataatggaagaataaatcctatt
tggtgggatggaaatcataatgaaaaacctgcaccaacaggtgtttattattatacatta
gattttaatgacggtaatcaaaaagcgaaaacaaactttatacaacttgtaagatga
DBGET
integrated database retrieval system