Tenacibaculum pacificus: PG913_07305
Help
Entry
PG913_07305 CDS
T08859
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
tpac
Tenacibaculum pacificus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_4
LRR_8
LRR_1
LRR_Zer-1
LRR_R13L1-DRL21
Nodulin_C
LRR_NXF1-5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX72718
LinkDB
All DBs
Position
complement(1639445..1641178)
Genome browser
AA seq
577 aa
AA seq
DB search
MIYYIISLLILIVIAFKIFGNSVPKDINKYKFLFRNDIFSSSKKEAQKDSKVYQLAPVMR
GKAYKPYYIYFPEKEQYLVCSRLEPFGFRRYDAYAPPFKKEIISHVLLNNKGEIIQSFDA
EFNFSHRSGMFFTQDFYINWLDSGDTTKLSYAGVYNKDVKMNKIQFADKFRELYAKSDYT
EYVNLRTKYSDDIGKGVVFKIKKEWHILLDAVMDSHIYAGNFKENEKTGVDSYIYSLKFD
YNDPDYKLTNPYPQSSSLIKSVYLETSNSRPYRFNSNATNDGLKLVKYQKLSSTGWQGIA
AIKGIPIFVPGTGEGIAYMQYKIGNETIHFKIPDVIKYDYRSVYNLGVRTFKIPAELQIT
EPLVFIESMQGFGNYQRIGGGVYVVKPCKISEYISSLPKDISEERYSKLPLSLQVALLDL
EGTTELKTEEWYPEIKLLSNLKYLKITGMIPILPDDISVLKKLEVLDLGSCRINDISDKI
AELKELKVLNLFSNNLNGFPLQICKLKELTHLNIGFNNIGEIPSCISNLSKLRELNLLSL
DSISLPETMVNMKELRIRRTENLKETLPENFHFLFKE
NT seq
1734 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttactatataatatcgttactaatattaattgtaatagcttttaaaattttcggt
aattctgttccaaaggatattaataaatataaatttctcttcagaaatgatatattcagc
agttcaaaaaaagaagcacagaaagatagtaaagtatatcaattagctcctgtaatgcga
ggaaaagcttacaaaccttattatatttactttcctgaaaaagagcaatatttagtttgt
agtcgtttagagccttttgggtttaggcgttacgatgcttatgctcctccttttaaaaaa
gaaataattagccatgttttactaaataataaaggagaaataatacaaagttttgatgct
gaatttaatttttcgcaccgctcgggtatgttttttacacaggatttttatataaattgg
ctcgattcgggtgataccactaagttgtcttatgctggtgtttacaataaagatgtaaaa
atgaataaaatacaatttgcggataaatttcgtgaattatacgctaaatcagattataca
gaatatgttaatttacgtacaaaatatagcgatgatataggaaaaggtgttgtttttaaa
ataaaaaaagaatggcatattttacttgatgccgtaatggattcgcatatatatgctggt
aattttaaagagaatgaaaaaacgggagttgatagttatatctattctttaaaatttgat
tacaatgatccagattataaattaacaaatccttatcctcaatcgtcatctttgattaaa
agtgtttatttagaaacaagtaattcaagaccttatcggtttaatagtaacgctactaat
gatggtttaaagttggtgaaatatcaaaaattgtcttctactggttggcaaggtattgca
gcgattaaaggaattccaatttttgtaccaggtactggagaaggtattgcttatatgcaa
tacaaaatagggaatgaaactattcattttaaaattccagatgttataaaatacgattat
cgttctgtttataatttaggtgtacgaacctttaaaatacctgctgaattacaaattact
gaaccattagtttttatagaatcaatgcaaggttttgggaattaccaaagaataggagga
ggcgtttatgtcgtaaaaccttgcaaaatatcagaatatatttctagtttacctaaagat
attagtgaagaacgttatagtaaattaccactatcattacaagttgctttattggattta
gaaggtacaaccgaattaaaaactgaagagtggtatccagaaattaaacttttatctaac
ctgaaatatttgaaaattacaggtatgatacctattttacctgatgatatttctgtactt
aaaaagctagaggtactcgaccttggtagctgtagaataaatgatatttctgataaaata
gcagagttaaaggagttaaaagttttaaatcttttttcaaataatttaaatggtttccct
ttacaaatttgtaaattaaaagaacttacccatttaaatatcggtttcaataatatcggt
gaaataccaagttgcatttctaacttatctaagttacgtgagttgaacttattgtctctt
gattcgatatcgttgcctgaaacaatggttaacatgaaagaattaagaataagacgaact
gaaaatttaaaagaaacattacctgaaaactttcattttctatttaaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
