Tenacibaculum pacificus: PG913_10780
Help
Entry
PG913_10780 CDS
T08859
Symbol
secDF
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
tpac
Tenacibaculum pacificus
Pathway
tpac02024
Quorum sensing
tpac03060
Protein export
tpac03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpac00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
PG913_10780 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
PG913_10780 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
PG913_10780 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
tpac02044
]
PG913_10780 (secDF)
Secretion system [BR:
tpac02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
PG913_10780 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
MMPL
T4SS
bPH_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX73323
LinkDB
All DBs
Position
2356291..2359311
Genome browser
AA seq
1006 aa
AA seq
DB search
MQNKGLIKLFAILFGLVSLYQLSFTFFANKVEDSAKVYAKENAKSNSGRELAKFERKYLD
SVANDEVVNLGVAKYTYNDIKEREMNLGLDLKGGINAILQVSVKDILVALANNSENTVFR
TALAKASEAQKDSQENYLDLFLTQFETASNGKVKLSDPEIFGTKALRDREVILFNDNNEK
VKLALQQEINTSINTSFEVLRSRIDKFGVTQPSIQRIGNSGRIQIELPGAKDIERVTKLI
TSTAELQFWEVYTNAEVQNFFFTANARVAELLKDNTVTATTEVKDTTKTDDIDDLLGEST
ESTKKADTQKNLFTYLYPNVAQNQQQMSSLVAQAKVQDTAQVNSLLADKSVRALLPANLK
YVKFLWDYKAQKSADGTAEIIGLYAIKSNRNDKATIDGDVIADANQDFDQMSKPVVSMLM
NGTGTKKWAKMTGDNVGKFVAVVLDNYVYTAPVVNGAITGGSTQISGGTMTVEEAQDIST
VLKAGKLPAPARIIQAEVVGPSLGQESIDASIWSFGLAILLILGWMLLYYGKAGLYANIA
LLVNILFIFGWLASYNAVLTLPGIAGIILTIGMSVDANVIIFERIKEALKGGQTLETAVD
EGFSFKGALSAIIDANITTFLTGVILFIFGTGPIKGFAYTLMLGIATSLFTAIFITRLFI
DKSVEKGTALPFNTNISKNWFQNINIEFLKKRKLAYIISGFFILAGLISIFTLGLKQGVD
FKGGRSYVVRFDQPMNATEVASSLKNAFGAAPEVKTYGSDNQLKITTAFKIDEEGSEVDD
SVQNSLFTGLKSYLGTTSYEDFKPGFEKAGSGIMSYMKVEPTIADDIKKSALWAVIGSLI
VVFLYILLRFRKIAFSIGAVAAVFHDVLVVLGVFSICYKFTPFDMEIGQSFIAAILTVVG
YSLNDTVVIFDRIREYAGSSKNFTADLVNKALSSTLGRTINTSLTTLLVMLAIFFFGGDS
IKGFMFALIVGVVVGTYSSLFVATPIMFDTSKEEEEKQEDKIQETV
NT seq
3021 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaacaaaggtcttattaaattatttgctatcctttttggattagtaagcttgtac
caattgtcgtttacattttttgctaataaagtagaagatagcgctaaagtatatgcaaag
gaaaacgctaaaagcaacagcggtagggagttagctaaattcgaaagaaaatatctggat
agcgtcgcaaatgatgaagttgtaaatttaggggtagctaaatatacttacaacgacatt
aaggagcgtgaaatgaatcttggtttagacttaaaaggaggtattaatgctattttacaa
gtatctgtaaaagatatcttagttgctttagctaataactcagaaaacactgtttttaga
actgctttagcaaaagctagtgaagctcaaaaagacagtcaagaaaactacttagactta
tttttaacgcaatttgaaactgctagtaacggaaaagttaaattaagtgatcctgaaatt
tttggaacaaaagctttacgtgatcgtgaagtaattttatttaacgataataacgaaaaa
gtaaaattagctttacaacaagaaattaatacttctattaatacttctttcgaagtatta
cgtagccgtattgataaatttggtgtaacacaaccaagtattcaacgtatcggaaactct
ggaagaattcaaattgaattaccaggtgctaaagatattgagcgtgttactaaattaatt
actagtactgctgaattacagttttgggaagtatatacaaatgctgaagttcaaaacttt
ttctttactgcaaatgcaagagttgctgaattattaaaagataatacagtaactgctaca
acagaggttaaagacactacaaaaacagatgatattgatgatttattaggagaatctact
gaatctacaaaaaaagctgatactcaaaagaacttatttacttatttatatcctaatgta
gctcaaaatcaacaacaaatgagctcgttagttgcacaagctaaagttcaagatactgca
caagtaaatagcttacttgctgataaatctgtaagagctttattacctgcaaatttaaaa
tatgttaaatttttatgggattataaagcacaaaaaagtgctgatggtactgctgaaatt
attggattatatgcaataaaatcgaacagaaatgataaagctactattgatggagatgta
attgctgatgcaaatcaagatttcgatcaaatgagcaagccagttgtatctatgttaatg
aacggtacaggaactaaaaaatgggcaaaaatgactggcgataacgttggtaaatttgtt
gccgttgttttagataactacgtatatacagcaccagttgtaaacggagctattacagga
ggaagtactcaaatttctggaggaacaatgactgttgaagaagctcaagatatttcaaca
gtattaaaagctggtaaattacctgctcctgcaagaattattcaagcagaagttgttgga
ccatcattaggtcaagaatctattgacgcaagtatttggtcattcggattagctatttta
ttaatattaggttggatgcttttatactacggtaaagcgggtctttatgcaaacattgcc
ttattagtaaacattttatttatcttcggatggttagcttcatataatgcagttttaact
ttacctggtattgctggtattattttaacaatcggtatgtcggtagatgcgaatgttatt
atttttgaaagaattaaagaagccttaaaaggtggacaaactttagaaactgccgttgat
gaaggatttagttttaaaggagctttatctgctattatcgatgcaaatattacaacattc
ttaacaggtgttattttatttatcttcggaacaggaccaattaaaggtttcgcctacact
ttaatgttaggtattgcaacatctttatttactgcaatttttatcactcgtttatttatt
gataaatctgttgaaaaaggaactgctttaccttttaacacaaatatctctaaaaactgg
tttcaaaatataaacattgaatttttaaagaaacgtaagttagcttacattatttctgga
ttctttattttagctggattaatatcaatctttactttaggtttaaaacaaggagttgat
tttaaaggaggtcgttcttatgttgttcgttttgatcagccaatgaatgcaactgaggtt
gcttctagtttaaaaaatgcttttggagctgctcctgaagttaaaacttacggttcagat
aatcaattaaaaataacaacagcttttaaaattgatgaagaaggtagtgaagttgatgat
tcagttcaaaactcattatttacaggattaaaatcttacttaggaactacttcttatgaa
gactttaaaccaggattcgaaaaagcaggtagcggaattatgagctacatgaaagtagaa
ccaacaattgctgatgatattaaaaaatcagctttatgggcggtaatcggttcattaatt
gttgttttcttatatattttattacgttttagaaaaatagctttctctattggtgcagta
gcagcagtatttcatgatgtattagttgtattaggtgtattttctatctgttataaattc
acgccttttgatatggaaataggacaatcatttattgcagcaattttaacagtagttgga
tactcgttaaatgataccgtggtaatttttgatagaattagagagtatgcaggaagcagt
aaaaactttacagctgatttagttaacaaagcattaagtagtactttaggtagaacaata
aatacctctttaactacattattagtaatgttagcaattttcttctttggaggagacagt
attaaaggatttatgttcgcattaatcgtaggtgtggttgtaggtacgtattcatcttta
ttcgtagcaacaccaattatgtttgatacttctaaagaagaagaggaaaaacaagaagat
aaaattcaagaaacagtataa
DBGET
integrated database retrieval system