Tympanuchus pallidicinctus (lesser prairie-chicken): 128089538
Help
Entry
128089538 CDS
T08967
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2 isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
tpai
Tympanuchus pallidicinctus (lesser prairie-chicken)
Pathway
tpai04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpai00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
128089538 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tpai00536
]
128089538 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
tpai00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
128089538 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128089538
NCBI-ProteinID:
XP_052557032
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2903 aa
AA seq
DB search
MGRRRWMRLQPCFLWLSCLALCANGAAGQQKPPPRVRPAGGAGGIYPAAAVVAHREEGAG
SAAAAGRVRRRGQQEALRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSR
PNMCTCASGQISPTCGPKSTQQCSIRCMNGGTCADDRCQCQKGYVGVYCGQPVCEKGCQN
GGRCIGPNRCACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRA
WGHPCEMCPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCINTVGSYECKCPAG
HRQNEATQKCDDINECSIIPGVCEGGECSNTVGSYFCLCPRGYVSSTDGSRCIDQRTSTC
FSNLVNGRCAQELPGRFTKRQCCCESGRCWAIGSVPEMCPVRGSDEHRRLCVDGVPVGGG
SRGGGGTGGNGFLPGGNGNGYSPGGAGFIPIPGNNGFSPGVGGAGVGTGGQTPTGNGPII
TGLTILNQTIDICKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCS
NGDCVNTPGSYYCKCHAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAG
FELTTDGKNCVDHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLSPNGRYCTDIDECQTS
GICMNGHCINTEGSFRCECPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGACIRPFPGAVTK
SECCCANPDYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGICE
NLRGSYRCNCNSGYEPDPSGRNCVDIDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCTCPKGYVFST
ETDTCEDINECESSPCVNGACRNNLGSFSCECSPGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDS
RCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACSRGFARVKGVTCEDVNECDVFPGV
CPNGRCVNSRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECIQSVPGKFRMDAC
CCAVGAAWGSDCEECPKPGTKEYEALCPRGPGFSNRGDILTGRPFYKDINECKVFPGMCM
NGKCRNTIGSFKCRCNSGFALDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFDG
YESGFMMMKNCMDIDECERNPLLCRGGMCVNTEGSFQCNCPVGHELSPSREECIDVNECS
LSDNLCRNGNCVNMVGTYQCSCNSGYQATSDRQGCVDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYE
CSCSDGYALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCID
VNECDLNSNICMFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEMGAHNCDMHASCV
NVPGSFKCTCREGWFGNGIKCIDLDECSNGTHQCSVNAQCVNTPGSYRCACAEGFTGDGF
TCSDVDECAENINLCENGQCLNVPGAYRCECEMGFTPASDSKSCQDIDECSFQNICVFGT
CNNLPGMFHCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLN
PTGVGCVDNRVGNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVN
STEYNTLCPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLSE
ETRICEDIDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYN
GTTCENELPFNVTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKNICGNIPGFTFDIHTGK
AVDIDECKEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNA
DCINSPGSYRCECAAGFKLSPNGACVDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCICHNGFKA
SQDQTMCMDVDECERHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVC
RNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTVDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICPP
GYEVKSESCIDINECNEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPTGFVLSDNGRRCFDTRQSFCF
TNFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGI
DDTREDVNECLESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDFTGVHCIDTDECSIGNPCGN
GTCTNVIGSFECNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYEL
REDQKMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMTRRPDGEGCTDENECRTK
PGICENGRCMNVIGSYRCECNEGFLSSPSGIECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLV
TKSECCCDGGRGWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYTTDGRDIDECKVMPNLCRHGQC
INTMGSFRCFCKVGYTTDISSTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYVLQE
DGKTCKDLDECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPSLCGSK
GICQNTPGSFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQ
HYQWNQCVDENECSNPNTCGSASCYNTLGSFKCACPSGFSYDQFSSACHDVNECSSAKNP
CNYGCSNTEGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPVDGDADEENALSPEACYEC
KINGYPKKDNRKKRSLNETIEEVSLESLDVDSPLKMRVNVSRLDSKEHILQLMPAIEPLT
NHVRYIISQGNDDGIFRIHQRDGLSYLHTAKKKSVPGTYTLEITSIPLYKKKELKRLEDS
NEDNYLLGELGEALRMRLWLELY
NT seq
8712 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcagacggcggtggatgcgcctgcagccctgcttcctgtggctcagctgcctggcg
ctctgcgcgaacggagccgccgggcaacaaaagccgccgccgcgggtccgccctgcggga
ggagcgggcggcatctaccccgccgccgccgtcgtcgcgcaccgggaggaaggggccggc
agtgccgccgctgcgggccgggtccgccggcggggacagcaggaggcgctccgcgggcca
aatgtgtgtggctctagattccattcctactgctgccctggatggaaaacgctcccagga
ggaaatcagtgcattgttccaatctgcagaaatagctgtggtgatggattttgctctcgc
cctaacatgtgcacttgtgcaagtggacaaatatcacctacttgtggaccgaaatctacg
cagcagtgcagcatcaggtgcatgaacggtggtacctgcgctgatgaccggtgccagtgc
cagaagggctatgttggggtctactgtggacagcctgtctgtgaaaaaggctgccagaat
ggaggacggtgtattggacctaatcgctgtgcatgtgtctacgggtttactggccctcag
tgtgaaagagattacagaacaggtccttgtttcacacaagttaataatcagatgtgtcaa
ggccagctaaccggaatagtttgcacgaaaaccctctgttgtgcaaccattgggcgtgca
tggggtcacccctgtgaaatgtgccctgctcagcctcagccatgtcgtcgtggtttcatc
cctaatattcgcactggagcttgtcaagatgttgatgaatgtcaggctattcctggagtc
tgccaaggaggaaactgcattaatacagtaggttcctatgagtgcaagtgtcctgctggt
cacaggcagaatgaggcaactcaaaaatgtgatgatattaatgaatgcagcatcatccca
ggagtctgtgaaggtggtgaatgttctaacacagtgggaagttatttctgcctctgcccc
cggggatatgtctcatctacagatggctcccgctgtatcgatcagaggacaagtacatgc
ttctccaacctagtgaatggccgctgtgcccaggaacttcctggtagattcaccaaaagg
cagtgctgctgtgagtctggccggtgctgggccattggatctgttccagagatgtgtcct
gttagaggatctgatgaacaccgcaggctttgtgtggatggtgtgcctgttggaggtggc
tccagaggtggtggtggaactggaggaaatggattccttccaggtggcaatggcaatggc
tacagcccaggaggagcaggattcattcccatccctggaaataatggtttctccccaggt
gtaggtggagcaggagtaggaacgggtggtcagacccccactgggaatggcccaataata
acagggctaacaatactcaatcagacaatagacatctgtaagcatcatccaaacctttgt
ttaaatggacgttgtataccaaccatctctagttaccgttgtgagtgcaatatggggtat
aagcaggatgcaaatggtgattgtattgatgttgatgaatgcacgtccaacccatgctct
aatggagattgtgtcaacacacctggttcatattactgcaagtgccatgcgggtttccag
agaactcctaccaagcaagcttgcattgatatagatgagtgcatccagaatggtgtcctt
tgtaaaaatggccgatgtgtaaacactgatggaagttttcagtgtatttgcaatgctgga
tttgaattgactacagatggaaaaaactgcgtggaccatgatgagtgtacaactacaaac
atgtgtttaaatgggatgtgcataaatgaggatgggagttttaaatgcatctgcaaacca
ggatttgttctgtctccaaatggacggtactgtactgacattgatgaatgtcagacatcg
ggaatttgcatgaatggtcattgcataaatactgaaggatcctttcgatgcgaatgtcca
cctggcttggctgttggagttgatggtcgtgtgtgtgtagatactcatatgcgtagcaca
tgctatggaggtatcaaaaaaggagcatgcattcgtcccttccctggtgctgtgacaaaa
tctgaatgttgctgtgccaatcctgactatggttttggagagccatgtcacccctgccct
gctaaaaactcagcggagtttcatggcctgtgtagcagtggaataggcattaccgtggat
ggacgagatattaatgagtgtgcattggatcctgacatttgctcaaatggaatttgtgaa
aacctgcgtggcagctatcgttgtaactgtaacagtggctatgagcctgatccttctgga
aggaactgtgtggacattgatgaatgttcagtgaatgggctgctgtgtgataatggcctc
tgtcgaaacactcctggaagttatagctgcacttgtccaaagggctatgtatttagcact
gagacagacacgtgcgaagatataaatgaatgtgaaagcagcccatgtgtcaatggtgcc
tgcaggaacaatcttggatctttcagttgtgaatgttcacctggcagcaagctggactct
acaggactgatctgcatcgatagcctgaaggggacttgctggcttaatatccaggacagt
cgctgtgaagtcaacatcaatggtgctacactgaaatctgaatgctgtgctactttagga
gcagcttggggcagcccatgtgagcggtgtgaattagacacagcttgttcaagaggattt
gccagagttaagggtgttacctgtgaagatgtaaatgagtgtgatgtttttcctggagtt
tgtcccaatggacgatgtgttaacagtaggggctcatttcattgtgaatgcccagaagga
ctgacgctggatggaacagggcgagtgtgtttggatatccgcatggagcagtgttacctg
aagtgggatgaagatgaatgtattcagtctgtacctggcaaatttcgtatggatgcctgc
tgttgtgctgtgggtgctgcctggggctctgactgtgaggagtgtccaaagcctggcaca
aaggagtatgaggctctgtgccccagaggtcctggtttttctaacagaggagatattcta
actggcagaccattttataaagatatcaatgagtgcaaggtattccctggtatgtgcatg
aatggtaaatgcaggaatacaattggaagtttcaaatgtaggtgtaacagtgggtttgct
ttagatatggaggaaagaaattgtacagatattgacgagtgccggatctccccagacttg
tgtggaagtggtacttgtgttaacactcctggaagctttgagtgtgagtgctttgatggt
tatgaaagtgggttcatgatgatgaagaactgtatggatattgatgaatgtgaacgcaac
cctctactgtgtagaggtggcatgtgtgtgaatacagaagggagttttcagtgtaactgt
cctgtgggacatgagctgtcaccatcacgtgaggaatgcattgatgtaaatgaatgctca
ctaagtgacaatctctgcagaaatggcaactgtgtgaacatggttggaacataccagtgt
tcctgtaactctggataccaagccacatctgacagacagggctgtgtagatattgatgaa
tgtatgataatgaatggtggctgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctacgaa
tgtagctgcagtgatggctatgctctaatgccagatgtcaggacgtgtgcagatattgat
gagtgtgaaaacaatccagatatatgtgacggagggcaatgtactaacattccaggggag
tatcgctgtctctgttacgatggatttatggcttctatggacatgaaaacttgtattgat
gtgaatgaatgtgatttgaattccaacatttgtatgtttggggaatgtgagaacactaaa
ggttccttcatttgtcactgccagctgggatattcagtcaagaaaggaaccactggatgc
acagatgtggatgagtgtgaaatgggtgctcacaattgtgacatgcatgcctcatgtgtc
aatgtaccaggaagttttaaatgtacttgcagagagggatggtttggaaatggcattaaa
tgtattgatcttgatgaatgttctaatggaacacaccagtgcagtgtgaatgctcagtgt
gtgaatacaccagggtcataccgctgtgcctgtgctgagggattcacaggagatggattt
acctgctctgatgttgatgaatgtgcagaaaatattaatctgtgtgaaaatggacagtgt
ttgaatgtccctggtgcataccgttgtgaatgtgagatgggattcactcctgcctcggac
agcaaatcatgccaagatatcgatgaatgctccttccagaatatatgtgtatttggtacc
tgtaataatctaccaggaatgtttcattgcatctgtgatgatggctatgaactagataga
actgggggaaactgtacagatattgatgaatgtgctgatcccattaactgcgttaatggt
ctttgtgtaaatactcctgggaggtatgaatgtaactgtcctccagatttccagctgaat
cctactggagtgggttgtgtggataatcgtgttggcaattgctacctgaagtatggacca
cgaggggacggaagcctatcctgcaatactgaaattggagttggagtcagtcgttcttcg
tgctgctgctctctgggaaaggcttggggaaacccctgtgaaacatgtcctcctgtaaat
agcacggaatacaatactctttgtccaggaggagaaggattcagaccaaatcccatcact
attattttggaagacattgatgaatgtcaggagctgccaggtctctgccaaggaggaaat
tgcatcaatacttttggcagcttccagtgtgaatgtccaaaaggctactacctcagtgaa
gagacaagaatctgtgaagatattgacgagtgtgttgcacatcctggtgtctgtggtcct
ggcacctgctacaatactctgggaaactacacctgcatttgccctcctgaatatatgcag
gtcaatggaggacataactgcatggacatgaggaaaagcttttgctacagaagttataat
ggaactacctgtgagaatgaactgcccttcaatgtaaccaaaaggatgtgctgctgcacc
tacaatgttgggaaagcctggaacaaaccttgtgaaccatgtccaactccaggaacagct
gaattcaagaacatatgtggcaatattcctggctttacttttgacattcatactggaaaa
gctgttgacatcgacgaatgtaaagaaatcccagggatctgtgcaaatggtgtttgcatc
aatcagatcggcagcttccgttgtgaatgcccaactggattcagctacaatgacctgctc
ttggtctgtgaagatattgatgagtgcagtaatggagacaatctctgtcagaggaacgca
gactgtatcaacagtcctggtagttaccgttgtgaatgtgctgctggttttaaactttca
cccaatggtgcctgtgttgatcgcaatgaatgtctggaaattcctaatgtttgcagtcat
ggtttatgtgtggacatgcagggaagttaccagtgcatatgtcacaatggttttaaggca
tctcaagaccagactatgtgcatggatgttgatgaatgtgaacgccatccatgtggaaat
ggaacatgtaaaaacactgttggatcatataactgtctgtgttatccaggatttgaatta
actcataataatgattgtatggatattgatgagtgcagttccttctttggtcaggtgtgc
agaaatggccggtgtttcaatgaaattggttccttcaaatgtttatgtaatgaaggatat
gaacttactgtagatggcaagaattgcattgatactaacgagtgtgtggcactgcctggt
tcatgttcccctggtacctgtcaaaatttggaaggatcattcagatgcatctgtccacca
ggatatgaagtgaagagtgaaagttgtattgatattaatgagtgcaatgaggatcccaac
atctgtctctttggctcttgtacaaacactccaggaggcttccagtgcatttgtcctaca
ggttttgtcctgtctgataatggacggagatgttttgatacccggcagagcttctgtttc
actaattttgagaatgggaagtgctctgtcccaaaggctttcaacaccacgaaggcgaag
tgttgctgcagtaaaatgccaggagaaggatggggtgatccttgtgagctttgcccaaag
gaggaagaagttgcttttcaggacctctgcccatatggtcatggaactattcctggaatt
gatgatacacgtgaagatgttaatgaatgccttgaaagcccagggatttgctcaaatggt
cactgcatcaacactgatggatccttccgctgcgagtgcccaatgggatacaacttagat
ttcactggagtacattgtatcgatactgatgaatgttcaattggcaacccgtgtggaaat
ggtacatgcactaatgtgattggcagttttgaatgcaactgtcatgaaggatttgagcca
ggcccaatgatgaattgtgaagatataaatgagtgtgctcagaaccccttgctgtgtgct
tttcgatgtatcaatacttatgggttctatgaatgcacctgtccagttggctatgaactg
agagaagaccaaaagatgtgcaaagatctggatgaatgtgctgaaggtctccatgactgt
gagtctagaggcatgatgtgcaaaaatttgattggtaccttcatgtgcatttgtcctcct
ggaatgaccaggagacctgatggagaaggctgtacagacgaaaatgaatgccgtaccaag
ccaggtatctgtgagaacggtcgctgcatgaatgttattgggagctaccgatgtgaatgt
aatgaaggattcctgtcaagcccgtcaggcatcgagtgccttgataaccgccaaggcttt
tgttttgctgaagttctacagacaatgtgtcagatggcatcaagcagccggaatcttgtc
accaaatctgagtgctgctgtgatggaggccggggctggggtaaccagtgtgagctctgc
ccacttcctggaaccacccaatacaagaaactctgtccacatggaccaggatatactaca
gatggaagagatattgatgaatgtaaagtcatgccaaacctttgtagacatggacaatgt
atcaacactatgggctcattccgctgcttttgcaaagttggctatacaactgacatcagc
agcacatcttgtgtggatctggatgaatgctcacagtctcctaaaccatgcaattttatc
tgcaagaattcagaagggagttatcaatgctcatgtcctcgaggctacgtccttcaagaa
gatgggaagacgtgtaaagatcttgatgaatgtcaaactaaacagcacaattgtcagttt
ctctgtgtcaacacccttggaggcttcacatgcaaatgtccacctggttttactcaacat
cacacagcttgtattgacaacaatgaatgtggttctcagccatcactgtgtggatcgaaa
ggaatttgccaaaacactccaggaagttttacctgcgaatgccaaaggggattttctctg
gattctactggattaaactgtgaagatgtggatgaatgcgatggaaatcatagatgccag
catggctgtcaaaacatcctaggtggatacagatgtggatgcccacaagggtatattcag
cattaccaatggaatcagtgtgttgatgaaaatgagtgttccaatcctaacacatgtggc
tctgcttcttgctacaatacgcttggaagtttcaagtgtgcctgcccttcaggattttct
tacgaccagttctccagtgcatgccatgatgttaatgaatgttcttctgccaagaacccc
tgcaattatggttgttccaacactgaaggtggttatctttgtggctgtccaccaggctat
tatagagttggacagggccactgtgtctcagggatgggatttaacaaaggccagtacctg
ccagtggatggagatgctgatgaagaaaatgctttatcccctgaagcctgttatgagtgc
aaaattaacggctatccaaaaaaggacaacagaaagaaaagaagtcttaatgaaactatt
gaggaggttagcttggaaagcctggacgtggatagtcctttgaagatgagagtcaacgtt
tcaaggctcgacagcaaggagcacatcctacagctcatgccagccattgagcctcttacc
aaccacgtgcgctacatcatctcacagggcaacgatgacggcatttttcgaatccatcag
agggatggactcagttacttgcacacagctaaaaagaagtcagtgcctggaacatacaca
ctggaaatcactagcattcctctatacaagaagaaggagctaaagagactggaagacagc
aatgaggacaactacctccttggagagcttggggaagctctcagaatgaggctgtggcta
gaactctactag
DBGET
integrated database retrieval system
