Tympanuchus pallidicinctus (lesser prairie-chicken): 128090280
Help
Entry
128090280 CDS
T08967
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1 isoform X1
Organism
tpai
Tympanuchus pallidicinctus (lesser prairie-chicken)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
ig
Ig_2
THB
Pur_ac_phosph_N
Receptor_2B4
V-set
Tissue_fac
C2-set_2
fn3_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
128090280
NCBI-ProteinID:
XP_052558425
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2348 aa
AA seq
DB search
MTTRPGVKTLQKSSIRGVHITQFVDKIPKGCSTPDFERKPVSLTLQEGKNAIFRAVVKGV
PAPEVKWKRAKGEINDPAKYLMFYSPATSEHILQINKITAGDSDLYRCFAVNEYGEASCS
AGLRIIQVGFKRKANYVTGHPAEELKKSLQDLKKTLKKRAPLPKQKVLDKDAVFQLLLHA
DKKDYERICIKYGISDFRGMLRALQDLRKDTENEQAKLIHSIKYMEHIKVNKDGSASFTV
EMDLKSASSNIYLLKDGEKVRYGTGDEYRKYYLRQIGKRYHFIVNDVHPEDAGLYQVRVE
DVPIFSTELDAESIPVRFQKPLRDLHCHEDEDVVFDCVLRSPCFDAVWLHKAHPLEASEK
HQISVSPDGLSHQLIIKNAVTADSGLYTLDTGLCSSRAWLLVEHAREAKIQDEEHEKSDH
QKGTPDKDRAKRLKRGEYVGDEDHPMDAGMKRGGWHRSDHGGGQGYSPDADGEFKLLGKE
GLHKIGDEIMGPGQFAREEDTGLKFGEDKIGLRHVHSQDSMSGRGDTDDGLGGGTKSHSV
AGRHDSMLGAADVDMGDAEGAYSWHDKNAKLGDASSGAAFGGMKSLDATDGSSVSGGINL
GSAGVGGAHSVYSKDGLPAAVDMNAVSINREGEIGSPYSKGNLLVDAGGHVGQAGMSGLL
YGAGGVPAGDGGRPGAGGSFVGEMEVLYGPDGLPVGAGVDAKRGDLYGKHGQSSEPYGKD
GLPAGMEAGLGGAGLEGAGSVYGKGAAGGAAGAGQFGPLYGKDGLPAGAVIGGTGAGGVG
SPFGKDGLPAGAGAGVDGAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGAGVDGAAGLAGAGGVGFPYGK
DGLPAGAGVDGAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGGGVDGAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGAG
VGAAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGAGVGAAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGAGVGAAGLAG
AGGVGFPYGKDGLPAGAGVDGAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGAGVDGAGLAGAGGLGIPF
GKDGLPAGAGVGAAGLAGAGGVGFPYGKDGLPAGGGVDGAGLAGAGGLGIPYGKDGLPAG
AGVGAAGLAGAGAAGSPYGTDGLPAGAGVDGAGLAGAGGLGIPYGKDGLPAGAGVGAAGL
AGAGAAGSPYGKDGLLAGAGAGAGIGAAGLAGVEAIGSPYGTDGLLAGAGVGAAGLAGAG
GVGSPYGKDGLLAGADAGGAGLAGSPFGKDGLPAGAGVGAAALAGAGAAGSPFGKDGLPA
GAGAGVGVAGLAGAGEVGSPYGKDGLPAGAGGSIAGVRDAGSSYGKDGLSAAAGSGAAHF
PSGGEEVMGSHRGRDAMLGRAQGSLGGAGGAGLSSEGGGVGGSAIRGAGSAHGSAGSRAG
ESSAGRLGGDGSELYSVHGKEGVVGAVGMAGEYGLDSRAGKSPYGEAGKGTASDLRGSEH
KGSSHDRESLSGQGDARAEARDLGQSGSPYDRDSSFGGAEGKFHDKLFSGWKPGISSQSS
QGSDQMSALHGGPSVSQRKQGPGLDIKAGDFLKSTESTENRRRHHLDDLKAPRSRVNKQL
ADVRVLKGEPTELSCAVNRHDLTGTWFKDGLKLTSMEGVTLEKEGLVHKLIISKVEDIHA
GKYRFEAGDIKTEASIFVEDPPQVNEILLKNLMSVPTVAKAGEKVVIKIPFEGRLPVRAM
WLKDKIELGDDSRIRVDKTDTFTMLSISNAERKDCGDYKVRLKNDSGILDIDLKVEVIDK
PQRPAGPLKIVESSANDVTIQWNPPKDDGGKPVQNYIIEKQQVGKSDWVTVGETPRSCTT
FTTSKVEQDMSYYFRVRAVNAEGSSDALESDEVVTISKATPGAPDPPEIVGVSADTITIS
WKAPRKTGSSRISGYIVQKRKMGSMTWVPVNSVPIADKKLKVTDLKKGLQYEFCVAAVNA
SGMGDISAASQAAFARDSTKPPGKVRDLKMTISDSSSVTLTWNVPEAEEGSGAKGYNVEM
RSANSLSWTKCNIFPIETTTYKIKGLQAKESYFLRVRAINDCGPGEATELEAFTEVVRPV
VFPRFIIDKTVKNFLLIKAGNAIRVNIPFEAPPDSVLTWLKDGASLPSRAKISTQDGSSQ
LLIKAAEFTDSGIYTVELTSGTGKRETFSFQVQVTDIPQPPGPIELRENVPNIVTVTWEP
STSEKWESNLYYTVMKRESQKGVWHVVGDLIYTNKFTYTSVIPGRDYYFRVVAKNYLGSS
RPSDTAQPWRIRKQKADVQLRPQRYKGVNQNQPPRFLVPLKPHVVIPGTECRMSCAVGGH
PPPKITWYKDGRDLSNNPSYFGTNNFGVCSLVIFGASKADEGDYMVEATNDLGRAFSKAS
LIVKDSCL
NT seq
7047 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacccgtccgggagtgaaaactctccagaaatcttccatccgaggagttcacatt
acccagtttgtggataagattccaaaaggatgcagcacaccggactttgagcggaaacct
gtcagtctaacattgcaggaaggtaaaaatgccatattcagagctgtggtcaagggtgtc
cccgcccctgaggtgaaatggaaacgtgcaaaaggagaaataaatgatcctgccaaatat
ctgatgttctacagtccagctacaagcgaacacattctgcagataaataaaatcactgca
ggtgactctgatttgtaccgttgctttgctgtaaatgaatatggggaagcttcatgttct
gctggcctcaggatcatacaagttggctttaagaggaaagcaaactatgtgactggccat
cctgctgaagaattgaaaaagagtcttcaggacctcaagaagacgctgaagaagcgggct
ccactaccaaaacagaaagtactggacaaagatgcagtcttccaactgttgctgcatgca
gataagaaagattatgagagaatctgtatcaagtatggaatttctgacttccgtggcatg
ctgagagcgctgcaggatttgaggaaggatacggagaatgaacaagcaaagttaattcac
agtatcaaatacatggaacacattaaggtcaacaaggatggaagtgcttcgtttactgtg
gagatggacctgaaaagtgctagcagcaacatttatctgcttaaggatggtgagaaggtc
cgttatggaactggggatgaatacagaaagtattaccttagacagattggaaagaggtat
cattttattgtcaacgatgtgcatccagaagatgcaggcttgtatcaagtcagagtggag
gatgtacctattttctcaactgagctggacgctgaatccatccctgtgagatttcagaag
ccgctcagagatctgcattgtcacgaggacgaagatgttgtgtttgattgtgtcctgcgc
tctccctgctttgatgctgtgtggttgcataaagcccatcccctcgaggcaagtgagaag
caccagatctctgtgagccccgatggcctgagccaccagcttatcatcaaaaatgctgtg
accgctgacagcggcttgtacaccctcgacactggactctgctcctccagggcttggctt
cttgtagagcatgccagagaggcaaagatacaggatgaggaacatgaaaaatctgaccat
cagaagggaacgccagataaagacagagctaagaggcttaaacgtggagagtatgttggc
gatgaagatcatcctatggatgctggcatgaaaagaggtggctggcacaggagtgaccac
ggcggcggtcaaggctactcccctgatgctgatggagaatttaaacttttaggaaaagaa
gggctgcacaaaattggggatgaaatcatggggcctgggcagtttgctagagaagaggac
actggattaaaatttggagaagacaaaattggattgaggcatgtacacagtcaggattct
atgtcaggcagaggagatactgatgatggattaggaggaggaactaaatctcattctgta
gctggtagacatgatagcatgttaggtgcagctgatgttgacatgggtgatgcagaaggt
gcgtactcttggcatgacaagaatgctaaactaggtgatgctagttctggagctgccttt
ggtggtatgaagagtttagatgccactgatggaagttctgtgtcaggtggaatcaatctt
ggttcagccggagtgggaggtgcgcattctgtctatagcaaggatggtctgcctgctgca
gttgatatgaatgcagtcagtataaatagagaaggagaaatagggtctccctacagcaaa
ggaaacctgttagttgatgctggtggtcatgtaggtcaggcgggaatgtctggcttgctg
tatggtgcaggtggtgttccagctggagatgggggcaggcctggtgcaggtggcagcttt
gtaggagaaatggaggttttatacggtccagatggtctaccagttggggcaggtgttgat
gctaaaaggggggatctgtatgggaagcacggtcagtcaagtgaaccttatggaaaggat
ggtttaccagcaggaatggaagcagggcttggtggtgctggtttggaaggtgccggctct
gtgtatggaaagggtgcagctggtggtgcagctggtgcagggcaatttgggccgttatat
ggaaaagatggactcccagctggggctgtcattggtggcactggtgcagggggtgttggg
tctccatttgggaaggatggtctcccagctggagctggggctggtgttgatggtgcaggt
ttagctggtgcagggggagttgggtttccatatgggaaggatggtctcccagctggagct
ggtgttgatggtgctgcaggtttagctggtgcagggggagttgggtttccatatgggaag
gatggtcttccagctggagctggtgttgatggtgcaggtttagctggtgcagggggagtt
gggtttccatatgggaaggatggtcttccagctgggggtggtgttgatggtgcaggttta
gctggtgcagggggagttgggtttccatatgggaaggatggtcttccagctggagctggt
gtaggtgctgcaggtttagctggtgcagggggagttgggtttccatatgggaaggatggt
cttccagctggagctggtgttggtgctgcaggtttagctggtgcagggggagttgggttt
ccatatgggaaggatggtcttccagctggagctggtgttggtgctgcaggtttagctggt
gcagggggagttgggtttccatatgggaaggatggtctcccagctggagctggtgttgat
ggtgcaggtttagctggtgcagggggagttgggtttccatatgggaaggatggtcttcca
gctggagctggtgttgatggtgcaggtttagctggtgcagggggacttgggattccattt
gggaaggatggtcttccagctggagctggtgtaggtgctgcaggtttagctggtgcaggg
ggagttgggtttccatatgggaaggatggtctcccagctgggggtggtgttgatggtgca
ggtttagctggtgcagggggacttgggattccatatgggaaggatggtctcccagctgga
gctggtgtaggtgctgcaggtttagctggtgcaggggcagctgggtctccatatggaaca
gatggtctcccagctggggctggtgttgatggtgcaggtttagctggtgcagggggactt
gggattccatatgggaaggatggtctcccagctggagctggtgtaggtgctgcaggttta
gctggtgcaggggcagctgggtctccatatgggaaggatggtctcctagctggagctggg
gctggggctggtattggtgctgcaggtttagctggtgtagaggctattgggtctccatat
ggaacagatggtctcctggctggggctggtgttggtgctgcaggtttagctggtgcaggg
ggagttgggtctccatatgggaaggatggtctcctggctggggctgatgctggtggtgca
ggtttagctggatctccatttgggaaagatggtctcccagctggagctggtgttggtgct
gcagctttagctggtgcaggggcagctggatctccatttgggaaggatggtctcccagct
ggggctggggctggtgttggtgttgcaggtttagctggtgcaggtgaagttgggtctcca
tatgggaaggatggtctcccagctggggctggtggtagtatagctggtgtaagggacgct
ggctcttcctatggaaaagatggtctctcagcagcagctgggtcaggagctgctcatttt
ccttcaggaggcgaagaagtgatgggatctcaccgtggtcgggatgctatgctgggcaga
gctcaagggtctctgggtggagcaggaggagctggcttgtcctcagaaggtgggggtgtt
ggtggctctgccatacgaggtgctggatctgcacatgggtcagctggatccagggctggg
gaaagcagtgctggcagactggggggcgatgggagcgagttgtactcagtccatggtaaa
gaaggtgtggttggtgctgttggaatggctggtgaatatgggctggactcacgtgctggc
aaatctccatatggtgaagctgggaaggggactgccagtgatttgagaggatcagagcac
aaaggttcatcccacgacagagaatcactttctggtcaaggtgatgctagggctgaggcc
agggatttaggacagtcaggctctccttatgacagggattcctcctttggaggtgcagag
ggcaaattccacgataaattgttcagtgggtggaagccaggtatttccagtcaaagttca
cagggttctgatcagatgtcagcccttcatggtggtccttcagtaagccagagaaaacag
ggacctggccttgatattaaagcaggtgatttcttgaagagtacagaaagtacagaaaac
agaagacgtcatcacctggatgatctgaaagctccacgctctcgtgtcaacaagcagtta
gctgatgtcagagtcctgaaaggggaaccaactgagctgtcgtgtgctgtcaatagacat
gacttaacaggaacctggtttaaggatgggttaaagttaacaagcatggaaggagtcact
ttggagaaggaaggcctagttcacaaactcattattagcaaggtagaagacattcatgct
gggaagtacaggtttgaagctggagatataaaaactgaagcttcaatttttgttgaagat
cctccacaggtgaacgaaattctcctaaaaaacttaatgagtgttcctactgtggccaag
gcaggggagaaagttgtgatcaagatcccttttgagggccggcttccagtcagagcaatg
tggctaaaggacaaaatagaactgggagatgactcaaggattcgtgttgataaaacagac
accttcaccatgctgtccatctccaatgcagagagaaaggactgtggggattacaaagtc
aggctgaagaatgacagtggaatcctggatattgacctaaaggttgaggtaatagacaag
ccacagcgacctgcaggacccctgaaaattgtagaaagctctgcaaatgatgtcaccatt
cagtggaatcccccgaaagatgatgggggcaaaccagtacaaaactatattattgagaaa
cagcaggtgggcaagagcgactgggtgaccgtgggagaaacccccaggagctgcaccacg
ttcactaccagcaaagtggaacaggacatgagttactacttcagagtgagagctgtgaat
gcagagggaagcagcgatgcactggaatcagatgaggtggtgacaatcagtaaagctaca
cctggtgccccagatcctcccgagatcgtcggtgtcagcgcagacaccatcacaatatcc
tggaaggcacctcggaaaactgggagctcccgaatttcggggtacatcgttcagaaacgc
aagatgggcagcatgacctgggtgccagtcaacagtgtgcccatagcagacaagaagctg
aaagtaactgatctcaagaagggtctgcaatatgaattttgtgtggcagctgtcaatgct
tctggtatgggagatatcagtgcagcatcacaagctgcctttgctcgggactccacaaaa
cctccaggtaaagtgagggaccttaagatgaccatcagtgacagcagcagtgtcaccttg
acctggaacgtacctgaagcagaagagggaagtggtgcgaaaggctacaacgtggagatg
cgatctgccaacagcctcagctggaccaaatgcaacatttttcctatagaaacgaccact
tacaaaattaaaggcctgcaagccaaggagtcgtacttcctacgtgtgagagccatcaat
gactgtggcccaggagaagccacagagcttgaagctttcactgaagttgttcgtcccgtt
gtttttcccaggttcataatagacaaaacagtgaaaaatttcctgcttataaaagcagga
aacgccattcgagtgaatattccttttgaggcacctccagattctgtgttgacctggtta
aaggatggagcttctcttccaagccgtgctaaaataagcacccaggatggttcctcccag
ctgctgattaaagcagctgagttcactgacagtggcatctatactgttgagctcacgagt
gggacagggaagagagaaacattcagcttccaagttcaagttacggatatcccacaacca
cctggacctattgaactgagagagaatgtgccaaatatagtgacagtaacctgggagccg
tcgacatctgagaaatgggaaagcaatctctactacacagtcatgaaacgcgaatcacag
aagggcgtgtggcacgtggtgggtgacctgatctacaccaacaagttcacgtacaccagt
gtgatcccaggcagggattactacttcagggtggtggcaaaaaattacttgggatccagt
cgtccatccgacactgcgcagccttggagaattcgaaaacagaaggctgacgttcaactc
agaccacagaggtacaagggagtaaatcagaaccagccgccaaggttcctcgtccccctg
aagcctcacgtggtgatccctggcaccgagtgccgcatgagctgtgcggttggaggccac
ccaccccccaaaatcacgtggtacaaagatggcagagacctctccaacaatccctcctac
ttcggcacaaacaactttggtgtctgctccctggtgatcttcggtgcttccaaggctgat
gaaggtgactacatggttgaagccaccaatgatttgggccgtgctttcagcaaagcctcc
ctcattgttaaagactcctgcctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
