Tetrapisispora phaffii: TPHA_0A01020
Help
Entry
TPHA_0A01020 CDS
T02235
Symbol
TPHA0A01020
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K03021
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
tpf
Tetrapisispora phaffii
Pathway
tpf03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
TPHA_0A01020 (TPHA0A01020)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
tpf03021
]
TPHA_0A01020 (TPHA0A01020)
Enzymes [BR:
tpf01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
TPHA_0A01020 (TPHA0A01020)
Transcription machinery [BR:
tpf03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
TPHA_0A01020 (TPHA0A01020)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_5
RemA-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11532741
NCBI-ProteinID:
XP_003683621
UniProt:
G8BMQ9
LinkDB
All DBs
Position
1:198478..201906
Genome browser
AA seq
1142 aa
AA seq
DB search
MVSQKRSHSHDHEKDDSFDDLLKPVYKGKKLTDAIDTAEDKWNLLPAFLKVKGLVKQHLD
SFNYFVDKDLKKIIEANQVILSDVDPEFYLKYVDIRIGEKSTGSKEKLVPPHECRLRDMT
YSAPIYVDIEYTRGRNIIMHKDVEIGRMPIMLRSNKCILNGADQKVMAKLNECPLDPGGY
FIVNGTEKVILVQEQLSKNRIIVEADEKKSIVQASVTSSTHERKSKTYVVTKNGKIYLKH
NSIAEEVPIAIILKACGIVSDLEIMQLVCGNDSSYQDIFAINLEEAVKLNISTQQQALEY
IGSKVKTIRRQKLSILQEGIEAIATTVIAHLTVEALDFREKALYIAMMTRRVVMAIENPK
MVDDRDYVGNKRLELAGQLISLLFEDLFKKFNSDFKASIDKVLKKPNRAMEYDALLSINV
HSNNITSGLNRAISTGNWSLKRFKMERAGVTHVLSRLSYISALGMMTRISSQFEKSRKVS
GPRALQPSQFGMLCTADTPEGEACGLVKNLALMTHITTDDEEDPIKKLCYMLGVEDITLI
DSASLHLNYGVHLNGTLIGTTRFPLNFVSQFRQLRRTGRVSEFVSIYTNSHQQAVHIATD
GGRICRPLIIVSNGKSHVKAEHLKELLEGKLDFDDFLKLGLVEYLDVNEENDCFIALYEK
DLSNRSTHLEIEPFTVLGAVAGLIPYPHHNQSPRNTYQCAMGKQAIGAIGYNQFKRIDTL
LYLMIYPQQPMVKTKTIELIDYDKLPAGQNATVAVMSYSGYDIEDALVLNKASIDRGFGR
CETRRKTTTVLKRYPNHTQDIIGGMRVDENNNPIWQHEALGPDGLGEVGVKVNSGQIYIN
KSVPTNASDSVLTSTQSQYKETPVVYRSPVPSHIDQVMMSVSENDQALIKVLLRQNRRPE
LGDKFSSRHGQKGVCGIIVNHEDMPFNDEGISPDIIMNPHGFPSRMTVGKMIELVSGKAG
VLNGSLEYGTCFGGSKLEDMSQILVENGYNYSGKDMLYSGVTGECLQAYIFFGPIYYQKL
KHMVLDKMHARARGPRAVLTRQPTEGRSRDGGLRLGEMERDCVIAYGASQLLLERLMISS
DAFEVDVCHKCGLMGYSGWCTTCKSAEFIVKMTIPYAAKLLFQELLAMNIAPRLRLEDLF
KE
NT seq
3429 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttctcaaaaacgttcccactctcacgaccatgagaaggatgattcctttgatgat
ttgttgaaacctgtctataaaggtaagaaattgactgatgccattgatactgctgaggat
aaatggaatttattaccagctttcttgaaagttaaaggtttggttaagcaacatttagat
tcctttaattactttgttgataaggatttgaagaaaatcattgaagcaaatcaagtcatt
ttaagtgatgtcgatccagaattctatttaaagtatgttgatattagaatcggtgaaaaa
tcaactggttctaaagagaaattagttcctccacatgaatgtagattgagagatatgact
tactcggctccaatatacgttgacatcgagtacacaagaggaagaaatataattatgcat
aaggatgtcgaaattggtagaatgccaataatgttaagatctaataagtgtatattaaat
ggtgctgatcaaaaagtcatggcaaaattaaatgagtgtcccttagatccaggtggatac
ttcattgtcaacggtacagaaaaagtaattttagttcaagaacaattatcaaagaatcgt
attattgtagaagcagatgaaaagaagtccattgtccaagcttctgtcacttcatcgact
cacgaaagaaaatctaaaacttatgtcgttactaagaacggtaagatttacttgaagcac
aattctattgccgaagaagtcccaattgctattattttgaaagcatgtggtattgtctcc
gacttagaaattatgcaattggtgtgtggtaacgatagcagttatcaagatatctttgca
attaacttggaagaagctgttaaattaaacataagtactcaacagcaagcgctggagtac
ataggttccaaggtgaaaactattagaagacaaaaactatcgatactacaagaaggtatt
gaagctatagcgaccactgtgattgcacatttaacagtagaagctttagattttagagaa
aaagcactatacattgcaatgatgacgcgtagagtagtaatggctattgagaatcctaaa
atggtagatgatagagattatgtcggtaataaacgtttagaattggcaggacaattgatt
tctttgttatttgaagatttattcaagaaattcaatagtgatttcaaggcaagtattgat
aaagtattaaaaaaaccaaatagagctatggaatatgatgctttgttatcgattaatgtt
cattcaaataatataaccagcggtttgaatagagccatttcaactggtaactggtctcta
aaaagatttaagatggaaagagctggtgtcactcatgtcttatctcgtctatcttatatt
tcagctttaggtatgatgacaagaatttcatctcaattcgaaaagtcaagaaaggtttcc
ggcccaagagcgctacaaccttcccaatttggtatgttatgtacagctgatactcctgaa
ggtgaagcttgtggtttggttaagaacttagccttgatgacccatatcaccacagatgat
gaagaagacccaattaaaaaattatgttatatgctgggtgttgaagatattacacttatt
gatagtgctagcttacatttaaattatggtgttcatctaaatggtacattaataggtaca
actagatttcctctaaactttgtgtcccagtttagacaattaagaagaactggtagagtt
tctgaatttgtttccatttacacaaattctcatcaacaggctgttcacattgctactgat
ggtggtagaatttgtagaccattgatcattgttagtaatggtaaatcacatgttaaagca
gaacacttaaaggaattattggaaggtaaattagattttgatgatttcttaaaactgggt
ttagtagaatacttagatgttaacgaagaaaacgactgctttattgcgttgtatgaaaag
gatttatcaaatcgtagtacccatttagaaattgaaccattcactgttttgggtgcagtt
gcaggtttaattccatatccacaccataatcaatctccacgtaacacatatcaatgtgcg
atgggtaaacaagcaattggtgctatcggttataaccaatttaagagaattgatacatta
ttgtatttaatgatttatccacagcaacctatggtgaaaactaagaccattgagctaatt
gattacgacaaattacctgcaggtcaaaatgcaactgttgctgttatgtcatattctggt
tacgatattgaggatgctttggtattgaataaagcttcgattgatagaggttttggtcgt
tgtgaaaccagaagaaaaactacaactgttttaaaaagatatccaaatcatacacaagat
atcataggtggtatgcgtgttgatgaaaacaacaatccaatttggcaacatgaagcgcta
ggaccagatggtttgggtgaagtaggtgttaaggttaacagtggtcaaatttatattaat
aagtcagttcctacaaatgcatctgatagtgtgttaacaagtacacaatcacaatataaa
gaaactccagttgtatatagatcccccgtaccttcacatattgatcaggttatgatgtca
gtttctgaaaatgatcaagccttgattaaggtactattgagacaaaatagaagacctgaa
ttaggtgataaattttcatctagacatggtcaaaagggtgtctgtggtattatcgttaac
catgaagatatgccatttaatgatgaaggtatctctcctgatattatcatgaacccgcat
ggtttcccatcccgtatgacagtcggtaagatgatagaattagtttctggtaaagcaggt
gttttaaatggtagtttagaatatggtacctgttttggtggttcgaagcttgaagatatg
tctcaaatattagttgagaatggttacaactattccggtaaagatatgttgtattcgggt
gttacaggtgaatgtttacaagcttatattttctttggtccaatttattaccaaaaatta
aaacatatggtattggataaaatgcatgcaagagccagaggtccaagagctgtattaact
cgtcaaccaactgaaggtagatctagagatggtggtttaagattaggtgaaatggaaaga
gattgtgttatcgcttatggtgcctctcaactattattagaaagattaatgataagttca
gatgcttttgaggttgatgtatgtcataaatgtggcttaatgggttacagtggttggtgt
actacatgtaagagtgcagaattcattgttaagatgacaattccgtacgctgctaaatta
ttattccaagaattattggccatgaacattgctcctagactaagattagaagatctcttt
aaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
