Tetrapisispora phaffii: TPHA_0F00220 Help Entry TPHA_0F00220      CDS       T02235                                  Symbol TPHA0F00220 Name (RefSeq) hypothetical protein   KO K19525   vacuolar protein sorting-associated protein 13A/C Organism tpf  Tetrapisispora phaffii Brite KEGG Orthology (KO) [BR:tpf00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    04131 Membrane trafficking [BR:tpf04131]     TPHA_0F00220 (TPHA0F00220) Membrane trafficking [BR:tpf04131]  Endosome - Golgi transport   Rab GTPases and associated proteins    Rab associated proteins     TPHA_0F00220 (TPHA0F00220) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  VPS13_VAB VPS13_N VPS13_M VPS13_C Motif Other DBs NCBI-GeneID:  11535340 NCBI-ProteinID:  XP_003685943 UniProt:  G8BUS7 LinkDB All DBs Position 6:complement(33615..42941) Genome browser AA seq 3108 aa AA seqDB search MLESLAANVLNRLLGAYIENFDPAQLNVGIWSGDVVLKNMKLRKDCLDSLDLPIDVKFGV LGNLVLTVPWSSLKNKPVKIIIEDCFLLCAARDPLNCDTQDIIARELSLKLKKLAEWELR NQHIDSIDTNNENNETFMQSLLTKIVDNLQITIKNIHIRYEDTKCVLSKEPYSLGITLRE ISAVSTDEGWVPNFISISRPITHKLLTLNSLCLYWNVDSTNIENYNENEDFDTTVEKFKR AILSSETEVDNYRYLLKPINGIGKLSVNKLGSTEVQPHILLEMEYDEFSVDLGDVEYANL MHTLSSLQINKDIEKYKGRRPLCSVTDDPKAWLKYTIQTIAEKIKSENQKWTWENIKKSC DQRREYIALWLDKLQLPTIDDELADSKKQQRLSELESELSFEAIILYRSMAKKMNAQLQK ENDNQIKDNELNRASQNSTGTWLSSIWTGKPLAETQKELELSEEQRKELYEAIEFTEDDD AILPIPSDRVKLKVTSVLKKGSFSIIKRENVRKLGEIIFEGCSFHFCQRPHSYLASFQIH QFRLEDGSPNTLYKHIISVNALKTLLQDETTSQDPETEPLLDISYDSNPLNNEADTKLSI RLRGMTVFYHVHFINEIINFFNQQNDNQDTIGAIINAAETTMEGWTSQTRMGLEALLEEH KTIDLNLDLQAPLILLPLDPHKWDTPCAVIDAGHIKVTSELISKEKIKSVKEMSVEDYDK IDGSEINRLMFDRFHVSAQDTQILIGPDVRRTISSLAESNVTNNFSILEKIYLNLIVDVS ILPKAHNLPKIRSFVSLPELSVSLNDEQYKYMMLIINNIMPTPIELNSDEFLNSDKGNAY IESKKMEIKLAQTANMLKNKSESELNQKLLDINFDINNINLTVYHCKDTQTMKSTKLISI VGNSLKFNFIQRVKEMKVNILINSLDVDDYIVMDNLGSLPTKLISSKSNLNETSTDLFQV DYLRQQRIVNHEGTLIEVFDQNVELDMEQLHLSLNAKSVLTLINYSLTTFIDPTGAEAPA DVLRHNDEDREDAPQKTLMKIRMAGLTMDFNEDNINIASWILTAGEFSLILLPERMKISM KLGNMEVLDGNSSKTFNNEFKKLITLEGEEEVELIYETFDPADNDKDYDSIFTYKAASLH INFVEESLNRIISYFNKFMRMKSLFEKAREVTYNQTPSIDSVNNMKLDVNIRSPIIIFPK LSEWSDEHFDKLEFHSGDFIVSNVFIMANEGHKINDILINIKECMLSSVINLESNSIQDF NIIKDLGLDLQVKHNPHSKIDEPTFNVNGVFNTPPTSLTELQLSFLFSLSDRIMQAFSID DVQSDELDKELHYVNHVVDTASDDNLSSSGLIDSINPSPQLKKADEEGVYVDFSFEIPEI IISLFNNTVECTNLDKYGLTKFKFEKLGVKLITNYNGTLSGESFIGSFTIDDIRDIKDNK HTELIPKLSAVENSFISKVSRILVNGSLTTTLSITIDNPMVILAMDYLFELKSFYDNSIG LASKVAVSGTVNLPSEAELKPTEDDIQSNPFQYTFSIINPQVILLADVSDIKSEAVVFKV GEIQFSSQNIQSLLVNNVGVFLSKLNSENDYKVRLLDDFSSSVIIDQRNSTTENMLTEIT SSIEPLLMRISLRDIRLAMLIFNKTVALMNKASQESSAKRKSLTDSVSKEEIPTGTDLNT TSKELVKRKSNDANSTIPTILGENLHIEVGGLRLVLIGDVHEMPILDMNINAFEVFAKDW STELDAMATLETYVNVFNYARSSWEPLIEPVPISFHLSNGLDEDSCMVFEIVTRKIAEIT LSSRSLSMLSQIPNSLSGELILKPRGLEKPYILYNDTELNINVWKVTDTQDERINLITLA PGSSLPWEFEDWRTVREKLDIDNKRSMLGFAISGSKYSTTMKINATNEGEQLFVLEPPVD HVHNRLICDLKSTEDNIKMITFRSTLILENTTEIDIQFMVINENNPKQIIHTVSPSDTKS IPLEMAYSSIILVKPVSDDFLWPDQKIQWKDLLTKPISIECKSESTEEKKYYFEVNGKFD TKEPLAKIFPRMKIIVSSPIVIENLLPCDLNFSLIDKRKDGNNYTFLEKRGKIFIHDVSL DTFLLLSVQPLMDNAIPSKPAIVNTPPKSSLDTETDVSLTLDDGEQMLKLKLFYQSVEGT RAKIIRIYSPYIIRNSTGKEIFIQDGNGNLAQSRLVLDSQNSYYTTPKMFSFLGGIYDNN RANIRFKDSDWSIPLSFDAIGQSHDVVLNIPNKNQDSNLGMTVYEGEGKYSLSKIIEFAP RYMVYSDLDFAIELCEAGSTASMELEAKASVPMYRMRNIVNKQLKIKFLGANTDWSSPFF IKDVGSTFLKVLKTDKTHMLLKIEIVLDKATLLIRITDGKNLWPYSIRNFSDQEFIFYQR DPRVIDDYYESEEVEEITNIEYKPLYYRVPARSIMPYAWDYPAARQKRMILTCRGRKREV NIAEIGNLTPMRLPGNAPNDPVDMVEISVIADGPTQALTITNYSQSSSLYKLNTKFNASS SSINSSREIFEGKEVKETIFRKLIINFKGLGVSFINKRLQELFYLSISDVKLKYIDSDLS QTFSWSVQWLQVDDQLFNANFPNVVYPTLIEGVAADMSDRPVLLGSVSKLKDDKYGVLYF KHLTVLLQELSIQLDEDFLYALIDFVKVPGAAWNKNTQEVIYNDIVTLPEFKELKLSEDV YFEVFHIQPTMLHLSFVRSETITKEDEGASKLDDSERNTRTLSFFINVLTMTIGNVNDAA IRMNSLYMDNLSVPVDTLINSIRTHYGQQFIYQLHKILGSADFLGNPVGLFNTISSGVWD LFYEPYKGYIMNDRPGDIGINIAKGSLSFAKKTVFGISDSMSKVTGSMAKGLSITQDMEF QESRRLQNRITNNSRNVLATSAQSFATTIGSGLSGIALDPYKGVQKEGAAGFIKGIGKGL FGLPTKTAIGILDLTNNLSQGVKSTTTITNATTNPGRVRMTRYIGHDNIIKTYNLREAQG QCWLKTANGGVYMNDRYLAHVVLPGRQLTVVVSMQHIAEIKIADEEIMWSTAYQDIQGII LEKGGIEIKLKSQAEYFIPIADRLERKSIYRNIAIAVTEYNKYCEATL NT seq 9327 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttagaatcacttgctgctaatgttttgaatagactgttaggtgcatacattgagaac ttcgatcctgcacaattgaatgttgggatatggagtggtgatgttgtattgaaaaatatg aaattgaggaaagattgtttagattcattagatttacctatcgatgtcaaatttggtgtt ttagggaatttagtcttgactgtcccatggtcaagtttgaagaacaaaccggttaaaatt ataattgaagattgttttctattatgtgccgccagagatccattgaactgtgatacacaa gatatcattgcaagagaattaagtttgaaattgaaaaaattggcagaatgggaattgaga aatcaacatatcgattcaatagatactaacaatgaaaataacgaaacttttatgcagtca ttattaaccaaaattgttgataatttacaaattacaattaaaaatattcatatcagatat gaagataccaaatgtgtcctatcaaaagaaccgtactctttgggaataacattaagggaa atatcagcagtatcgactgatgaaggttgggtcccaaattttatatcaattagtagacca attacacataaattgttaacattaaattctctttgtttatattggaatgttgattcaaca aacattgaaaactataatgaaaatgaagacttcgatactactgttgaaaagtttaaaaga gcaatcttatcttctgagactgaagtagataattatcgttatctcttaaaacctataaat ggtattggtaaattgagtgtgaacaaactggggtcaactgaagttcaacctcatatttta ttagaaatggagtacgatgaattttccgttgatctaggagatgtagaatatgctaacttg atgcacacgttatcatctttacaaatcaacaaagacatagagaaatataaaggaagaaga cctctatgttcagtaactgacgatccaaaagcttggctaaaatatacaatacaaacaata gcagaaaaaataaaatcggaaaatcaaaaatggacttgggaaaatataaagaaaagttgt gaccaaagacgtgaatacattgcgctgtggctagataaattacaattaccaaccatcgac gatgaattagccgactctaagaagcaacaaaggcttagcgagctagaaagtgaattaagc tttgaggctattatcttatatagatctatggccaaaaaaatgaatgctcagcttcaaaaa gaaaatgataatcagataaaagacaatgagttaaatcgtgcttctcagaattcaactggc acgtggttatcttcaatttggacaggcaaacctcttgctgaaactcaaaaggaattagaa ctttctgaagagcagagaaaagagttatatgaagccatcgagtttacagaagatgatgat gctattttaccaattccaagtgaccgagtaaaattaaaagttacaagtgttctgaaaaag gggtctttttcgattataaaaagagagaatgttagaaaactaggcgaaattatctttgag ggttgttcatttcatttctgccagcgcccccactcttatttggcttccttccaaatacac caatttagattagaagatgggtctccaaacactttatataaacacataattagtgtgaat gccttaaaaaccttactacaggatgaaactacatcccaagatccagaaactgagcctttg ttagatatttcatacgacagtaacccgctcaacaatgaggcagacactaaattgtcaatc agattacgtggtatgaccgtgttctaccatgttcattttataaatgaaatcataaacttt tttaatcagcaaaatgacaatcaagacacaattggtgcaataattaatgctgctgaaaca accatggagggatggacttctcagactagaatgggcttagaagcattattagaggaacat aaaactattgatttgaacctagatttacaggcaccattgattttattacctttagatcct cataaatgggacacgccttgcgcagttatcgatgctggtcatattaaggtcacaagtgaa ctaatttcaaaagagaagattaaaagcgtaaaggaaatgtccgtagaagactatgataag attgatggaagtgaaatcaatagattaatgtttgatagatttcatgtaagtgctcaggat actcaaatcctgattggtcccgatgtaagaagaactatctcaagtttagctgagtccaat gtcaccaataactttagtatattagaaaaaatatatctaaacctaatagtagatgtatcg atacttccaaaagcccataatttacccaaaataaggagttttgtttcattacctgaatta agcgtctctttaaatgatgaacagtataaatatatgatgttaattattaacaatattatg ccaacaccaattgaattaaattctgatgagtttttaaatagtgataaaggtaatgcttat attgaatcaaagaaaatggaaattaaattggcccaaactgctaatatgttgaaaaataaa tcagaatctgaattgaatcagaagctacttgatatcaactttgatattaacaatataaat ttaacagtttatcattgtaaagatacacagaccatgaagagtacaaagttaatatctatt gttggaaactctttgaaattcaattttattcaaagagtgaaggagatgaaagttaatatt ttaataaattctttggatgttgacgactatatcgtgatggataatttaggttcattacca actaagctaatttcttcaaaaagtaatttaaatgaaacctcaacagatttgtttcaagtt gactatctcagacaacagagaattgttaaccatgaaggtacgttaattgaagtttttgat cagaatgtagaacttgacatggaacagttacatttatctttgaatgctaaatctgttttg actctaattaattactcattaactacgtttatcgatcctacaggtgctgaagcccctgct gatgtattgcgccacaacgatgaagatagagaagatgcgccacagaagacgttgatgaag atcagaatggctggattaacaatggatttcaatgaagataatataaatatagctagctgg atattaactgccggagaattttcattgattttgttacctgaaaggatgaaaatatcaatg aaattaggaaatatggaggttctagatggaaattcttcaaaaacatttaataatgaattc aaaaaattaatcactttagaaggtgaagaagaagtagaacttatctatgagacttttgat ccagccgataacgataaagattatgactcgatttttacatataaagctgcttcgttgcat attaattttgtcgaagaatctctaaatcgcataatatcctactttaataaatttatgaga atgaaaagtttgtttgagaaggcacgagaagtaacatataaccaaacaccatccattgat tccgtaaacaatatgaagttagatgttaatattagaagtcctatcattatattcccaaaa ctctccgagtggtcagatgagcactttgataaacttgaattccattctggtgatttcata gtttccaatgtttttatcatggcaaatgaaggtcacaaaattaatgacattttaataaat attaaagaatgtatgctttcttctgtgataaatttagagagtaactcaattcaagacttt aacattattaaagatttaggtttagatttacaggtaaaacacaatccacattctaagatt gatgaacctacattcaatgtcaatggtgtattcaatacacctcctacttctctaacagaa ctgcaattgtcatttttgttttctttatctgatagaataatgcaagccttttctatagat gacgtccaatctgatgagttagataaggaattgcattatgtcaatcatgttgttgacact gctagtgatgacaatttatcttcgtctggactaattgatagtataaatccttcgccacaa ttaaaaaaggcagatgaagaaggtgtatatgttgatttctcattcgaaattcctgaaatt ataatatctttgtttaataatactgtcgaatgcactaatttagacaaatatggattaaca aagtttaaatttgaaaaattaggtgtcaaattaattacaaattacaatggtactctctct ggtgagtcctttataggatcattcacaattgatgatataagagatatcaaggacaataaa cataccgaattaattccaaaattaagtgctgttgaaaactcctttatttctaaagtttct cgaattttggtcaatggttcgctaactaccactctttctataacaattgacaatcctatg gtaatcttagcaatggattacttatttgaactgaaatcattttatgataactctattgga ttagcaagcaaagttgctgtaagtggcaccgtaaacctaccatcagaagctgagcttaaa cctaccgaagatgatattcagagcaatccatttcaatatacattttctattataaatccc caagttatattactggctgatgtatctgatattaaatctgaagctgttgtatttaaagtt ggagagattcaattttcaagccaaaatatacagtcattactagtaaataatgttggtgtt ttcctttcaaaactcaattctgagaatgattataaagtacgtttgttagatgatttttca tcttcagttataattgatcagcgtaattcaacaacagaaaatatgttaacggaaataact tcatcaatcgaacctttgctaatgagaatttcacttagagatataagattagcaatgtta atttttaacaaaactgtcgcgttaatgaacaaggcatctcaagaaagttcagcgaagaga aaatcattaacagattctgtttcaaaggaggagattccgacaggtactgatttaaacacc acttctaaagaattagttaagagaaaatctaatgatgcaaacagtactattcctacaatt ctaggtgaaaatttacacatagaagtaggcggactaaggcttgtgttaattggtgatgtt catgagatgccgatattagatatgaatataaatgcttttgaagtttttgctaaagactgg tctactgaattagatgctatggcaacgctcgaaacatatgttaatgttttcaattatgct agatcaagttgggaaccattgattgaacccgtaccaatatcatttcatttatcaaatggt cttgatgaagattcgtgcatggtatttgagatcgtgacaaggaagatcgctgaaattaca ttatcttctagatctctttctatgttatcacaaatacctaattcattgtcaggtgagttg atcttaaaacctagggggttagaaaaaccatacattttatataacgacactgagttaaat attaatgtgtggaaggtaactgacacacaagacgaaagaatcaacctaataactctcgca cctggttcttcgttaccatgggaatttgaagattggagaacagtgagagagaaattagat atcgataataagagaagtatgcttggttttgccatttctggatcaaaatattcaacaacc atgaaaattaacgctacaaatgaaggtgaacagctatttgttttggaacctccagttgat catgttcataatagattaatctgtgatttgaaatctactgaggacaatatcaagatgata acgttcagatcaactttaattttggagaatactactgagattgatattcaatttatggtt atcaatgaaaataatcctaagcaaattattcatacagtctctccatctgatacaaaatct atccctttagaaatggcatattctagtattattttagtgaaaccagtatctgatgacttt ttatggccagatcaaaagatccaatggaaagacttattaactaaaccaatttcaattgag tgtaaatcggaatccaccgaagagaagaaatattactttgaagtgaatggaaaatttgat actaaagaacctttggcaaagatttttccacgcatgaaaattattgtttcatcgccaata gtgattgagaatttgttaccttgtgatttaaacttttcattgattgataagcgtaaagat ggtaataattatacattcctagagaaacgtggtaaaattttcattcatgatgtttccttg gatactttcctattactatctgttcaaccattgatggataatgcaataccatcaaaacct gcaattgttaacaccccaccgaaaagttcattggatactgaaacggacgtttcattgact ttagatgatggtgagcaaatgttgaaacttaagttattttaccaaagtgtggagggcaca agagctaaaattattagaatttattccccttacataattagaaattctactggtaaggaa atttttattcaagatggaaatggaaatttagcacagtctagattagtattagattcgcag aattcttattacactacaccaaaaatgttttctttcttaggtggtatttacgataataat agggctaatattcgatttaaggattccgattggagtattccattatcatttgatgcaatc ggacaatcccatgacgttgtgttgaatatacctaacaaaaatcaagattctaaccttgga atgactgtatatgaaggggaaggaaaatattctttgagtaaaatcattgagtttgctcca agatatatggtttatagtgatttagattttgcgattgagttatgtgaagccggatccact gcttcaatggaattggaagcaaaggcatctgttccaatgtacagaatgagaaatattgtc aataagcaattaaaaattaaatttttaggtgcaaatactgattggtcttctccatttttc attaaagatgttggttctactttcttaaaggtactgaaaaccgacaaaacacatatgcta ttgaaaatcgaaattgtgttagacaaagccaccttattaataaggataactgatggaaaa aatctgtggccttattctataagaaattttagtgatcaagaatttattttttatcaacgt gatcctagagtaattgacgattattatgaatccgaagaagtagaggagataactaatatc gagtataagcctttatattatagggttcctgctagaagtattatgccatatgcctgggat tatccagctgctagacaaaagagaatgattttaacgtgcagaggtaggaaaagggaagta aatattgcagagatcggtaatttaacaccaatgcgtttaccaggaaacgctccaaatgat cccgtagatatggttgaaataagtgttattgctgatggtccaacacaagcattaacaatt actaattattctcaaagttcaagtttatataagttgaatacaaagttcaatgcctcatca tcatccatcaatagctcaagagagatatttgaaggaaaagaagttaaagagacaatcttc agaaagttgattattaattttaaaggcttaggtgtttctttcattaacaaacgtttacaa gaattattttatttaagtattagtgatgtcaaattaaaatacatcgattctgatctatca caaactttctcctggagtgtacagtggctgcaagtagatgaccaattgtttaatgcaaat ttccctaatgttgtataccctactttaattgaaggtgttgcagcagatatgagcgatcgt ccagttttattaggttccgttagcaaattgaaagatgataagtatggcgttctttatttt aagcatttaactgtattgctacaagaattatctattcaacttgatgaagatttcctttac gctttaattgattttgtgaaggtaccaggagctgcatggaacaagaatacccaagaagtg atatacaatgacatagttacgctacctgaattcaaggaactaaagctatcggaagatgtt tactttgaagtattccatattcagcctactatgttacacttatcatttgttagatccgaa actattactaaggaagatgagggtgcatctaagcttgatgattctgagcgtaatacaaga actttatcgttcttcatcaacgttttgactatgacaattggtaatgttaatgacgcagca ataaggatgaattccttgtatatggataacctaagtgtgcctgttgatacattaataaat tcaattcgtacccattatggacaacaatttatttaccagttacataaaattctgggttct gctgactttttgggtaatcctgtcggtttattcaatacaattagttctggtgtttgggat ctcttctatgagccttacaagggctatattatgaatgatagacccggtgacattggtatc aatattgccaagggtagtttaagttttgctaagaagacagtatttgggatatctgatagt atgtctaaagttacaggatctatggctaaaggactttctataactcaagatatggagttt caagaaagcaggagactgcagaatcgtattactaacaacagccgtaatgtgcttgccaca tctgctcagtcgtttgctactactatcggtagtggtctctccggaatagccttagatcca tataagggcgtccagaaagaaggagctgctgggtttataaaaggtatcggcaagggtttg tttggtttgccgacaaaaactgcgatcggaatacttgatttgactaacaacttaagtcag ggagttaagagtaccacaacaattacgaacgccacgacgaatcccggtagagtccggatg acaaggtacatcggccatgataatattataaagacgtacaatctgcgcgaggcacagggc caatgctggctaaagactgcgaacgggggcgtgtacatgaacgaccgttatcttgcacac gttgtgctgcctggccgtcaacttacggtcgttgtttcaatgcagcacattgctgaaatc aaaatcgccgacgaggagattatgtggtcgaccgcgtaccaggatatccaaggtatcatc ctagagaagggtggcattgagatcaaattgaagtcacaggccgagtactttatccctatt gctgacagactcgagcgaaagtccatctaccgtaacatcgccatcgccgtaacggagtac aacaagtactgtgaggccactctctga

DBGET integrated database retrieval system