KEGG   Tetrapisispora phaffii: TPHA_0I00810
Entry
TPHA_0I00810      CDS       T02235                                 
Symbol
TPHA0I00810
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K14550  U3 small nucleolar RNA-associated protein 10
Organism
tpf  Tetrapisispora phaffii
Pathway
tpf03008  Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tpf00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
    TPHA_0I00810 (TPHA0I00810)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:tpf03009]
    TPHA_0I00810 (TPHA0I00810)
Ribosome biogenesis [BR:tpf03009]
 Eukaryotic type
  90S particles
   U3 small nucleolar RNA-associated proteins
    TPHA_0I00810 (TPHA0I00810)
SSDB
Motif
Pfam: BP28CT U3snoRNP10 HEAT_HEATR1 ARM_ARMC5 HEAT_EF3_N CLASP_N DUF5785 mTOR_dom
Other DBs
NCBI-GeneID: 11532883
NCBI-ProteinID: XP_003687021
UniProt: G8BXF9
LinkDB
Position
9:complement(170005..175326)
AA seq 1773 aa
MSSLRDQLTQVASSNATVAFDRKRRQKLHSTSLIYNPKTAATQDYDTIFELATNALQELI
EIDPNFEIFEKTLFSESSISIDRNVQTKEEIKDLEQSINGFLMLASSKWHLTPTLYATEW
LVRRFQIHILNAEMFLLSTLNYYQTPSFKRILDIVKLPPLFQPLSAFVRSEKNPTNITMI
KLFNDNDFIKLYTNYLNKCIKHKFTYTNQLLFTTCWFINVIAFNSNNEEKLTELIPILLE
ASAKLLGSTSNDCQIAAHTIMVIFATALPLNKNIIIAAVETILAGYNDKLIKKSVLISIF
KLFQTLRGNDNVSQLPSNIYTLLNNKISLVELTEFISTSDIPTNADKFITKYIRSVIRYD
HSKLDDIVKLLEKVELENFEMRHIITDLIHLSEIIDDKTKLIELFSYFVSKNETLVIKCL
NSLNIATELFEIRLTTSLFTVKDKEQDNTDGLNIKNIDSEKVLGKEITIEPFKEFLEKHS
NLIYTKSLSFLTEKSEIFNKLLSLFIESIGKGYSSGLFLSSFLSTIESKITFLLRVVISP
AALTTVRIIAISNISKLLSNIDKDSNLFTLVPCLVCALNDVSKNVRQNVRKLLFQISKRP
STKHYFMLKEIYGENKEVPFLDPQDCSSWLSKFLDGYFVDNLDFSKLLVPRANDKILSLF
WANQALLIPLPYPKLVLLRNLMNVSKTSSYSYLFETFISSYVESRGTWEQECKLNKTNFI
DFETVIVNLISEKEKNNFMIDFMIEALNSSHEGLAEITSDRLIKLFPTFKPPVQLHIVQS
IVDSINSDDVSYDTAATLQALPMNADIFVSLLGNVRITSDDGVSDIAKRRRRRSSTNKPV
FQRDDVSLMAELHLRKLTILLETLDKSKPVGTAQLLSTLFTVLSDLETLGEDGALPVLYA
QETLASCMTNTIDSLKSQNFTQLPNTRADSIISAIRNSQSPQVQNKLLLVIGSLATLAPE
TVLHSVMPIFTFMGVHAIRQDNEFTAQVVEKTILTVIPALLESSQSNINEEIEFLLMTFA
TALNHVPKHRRVKLYFTLVKTLGASNAIAPFIFLISQQYSNCINTFKLGDAKGFVEFTKS
FLSSFDVADQLKGVCQFFDIVKLLISANSNEKTENSISSRTLFSNGICNYSDLELLSFYK
NAFTFVNKIVEDSDSDYYDFQSSLKLKLYSVLLDVTSDSTILESIQENFGSLLQTVVSFI
NGSKLLVNKTIKEFEDSSSENEVADYQTDIKNTLFSVMSNVLTLLPINYFVNSTLPLLNS
STSAEIRYNLTSVIGKKFESESSKAVDSVKIVIEMLVNRVETDKSDAMMLQVDLKVLSSL
AAKFGEKLEGSTITNLLSLGTNLLQSDKFEVKIPSLNLITNCIQILGIKSLSFYPKVVPQ
SLVLFKELQEGTNTYLRPQLQLSILLLFTAMVKRIPSFITSNLYDLIDIILFSNDVEVSS
RLSVVTLMIENIDQKEILKTLHKIWIKKLSKSSSSISISLFLSALESTVESISKKSATSQ
SPTFFKLMLALFEFRSISEFDNNTISRIEASVHQIANSYVLKLNDKVFRPLFVIVVKWAF
DGEGVTNKEIKEVERLIAFYKFFGKLQENLKTIITSYFTYLLEPTNELLKRFISRDLTDV
NLRRLILISLTSSFKYDKEDYWNSTSRFELISTSLVSQLSNIDNVIGNYLVKAIASLTTN
NGRIDEHNKIMHNLLVEHVKSSTRSSEKLWTIRTMKLIYSKVGEQWLILLPQLVPTIAEL
LEDENEEVENEVRTGLVKVVENVLGEPFDRYLS
NT seq 5322 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcttcattaagagaccaattaactcaagttgcatcctccaatgctactgtcgcattc
gataggaaaagaaggcaaaaattacattcaacttcgttgatctataatccaaagactgca
gcaactcaagattatgatacaattttcgaattggctactaatgctctacaggaattaata
gaaattgatccaaattttgaaatttttgaaaaaacattgttttcagaatcttctatttca
atcgatcgaaacgttcaaactaaagaagaaattaaagacttagagcaatcaatcaatggt
ttcttaatgttagcttcttcaaaatggcatttaactcctactttatatgctaccgaatgg
ttagttcgtcgttttcaaattcatattttaaatgcggaaatgtttttattatcaacttta
aattattaccaaacaccatcatttaagagaattttagatatcgttaaattgccaccatta
tttcaaccattgtcagcatttgttagatcagaaaaaaatccgacaaatataacaatgata
aaattatttaatgataatgattttattaaattatacaccaactatttgaataaatgcatt
aaacataaattcacatacacaaaccaattgctatttacaacatgttggtttattaacgtt
attgcattcaattccaataatgaagaaaagttaactgagttaattccaatccttttagaa
gcatctgcaaaattattaggatcaacttcaaatgattgtcaaatagctgcgcacacaata
atggtaatctttgctactgcgttgccattaaataagaatattatcatcgcagcagttgaa
acaatcttggctggttataatgataaattaattaaaaaatcagttctaatttccattttc
aaattgttccaaactttaagaggtaatgacaatgtttctcaattaccatcgaatatttat
actttgcttaataataaaatttcgttagttgaattaactgaatttatttcaacctctgac
ataccaactaatgccgacaaatttatcacaaagtacatcagatctgttataagatacgat
cattcaaaattagatgatatcgttaaattattagaaaaagttgagttggaaaattttgaa
atgagacatatcattactgatttaattcatttatctgaaattattgatgataaaacaaaa
ttaattgaattgttctcatattttgtatcaaaaaatgaaactctagttattaagtgtttg
aactcactaaatattgctactgaattatttgaaatcagattaactacttctttattcacc
gttaaggataaagaacaagataatacagatggattaaatattaaaaacattgattcggaa
aaggtactcggtaaagaaattacaattgaaccattcaaagaatttttagaaaaacattca
aatttaatttacactaaaagtttatcgtttttgactgaaaaatcagagatttttaataaa
ctattgtccttatttatagaatcaatcggtaaaggctattcttcaggtttgtttttatcc
agtttcttatctacaattgaatctaaaattacatttttgttaagagtcgttatctcacca
gcagctttaacgactgttcgtatcattgctatttcaaatatttctaagttattaagcaac
attgataaggattcaaatttattcactctagtgccatgtttagtatgtgctttgaatgat
gtctctaagaatgttagacaaaatgtaagaaagctattgttccaaatttctaagaggcct
tctactaaacattacttcatgctaaaagaaatttatggggaaaataaagaagttccattt
ttagatcctcaagattgttcttcttggttatctaaatttttagatggttactttgtcgac
aaccttgatttctcaaagctattagttccaagggcaaatgacaaaattttatcactattt
tgggctaatcaagcattattaataccattaccatatccaaaattagttttattaagaaac
ttaatgaatgtttccaaaacatcctcatactcctatctattcgaaacattcatctcatca
tacgttgaatcaagaggtacatgggaacaagaatgtaaactaaacaaaacaaatttcatc
gacttcgagaccgttatcgttaatctaatatcagaaaaagagaaaaataatttcatgatc
gattttatgattgaagcattaaatagcagtcacgagggtctagctgaaatcacttctgac
agattgataaaactattccctactttcaaaccacctgttcaattacacatcgtccaaagt
attgtggactctatcaattctgatgatgtttcatatgacactgctgctacactacaggcc
ctaccaatgaatgcggatatatttgttagtctacttggcaatgttagaattacttccgat
gatggtgtttctgacattgcaaaaagaagaaggagacgctcttccactaataaaccagta
tttcaaagagatgatgtttctctaatggctgaattacatttaagaaaattaactatcttg
ctggagactttagataaatctaaacctgtaggaactgcccaattattatccacattattt
actgtattatctgatttagaaacattaggagaagatggtgctttacctgttttatatgcg
caagaaaccctggcttcttgtatgacaaatacgattgattcattaaaatcacaaaacttt
acccaattaccgaacacaagagcagattcaattatttctgcaatcagaaattctcaatca
cctcaggtgcaaaacaaactgttacttgtaattggtagtttggcaactttagctccagaa
actgttttgcattcagttatgcctatctttacatttatgggtgttcatgctattcgtcaa
gacaatgaatttacagcccaagttgtggagaaaacaattctaaccgtcattcctgcatta
ttagagagcagtcaaagtaatatcaacgaagaaatcgaattcttattaatgacttttgct
actgctttaaaccacgttccaaaacatagaagagttaaattatattttactttagtcaaa
actttgggcgcatccaatgccatagctccatttatatttttgatttctcaacaatattct
aactgtatcaatactttcaaattgggcgatgctaagggatttgttgaattcactaaatca
tttttatcttcatttgacgttgctgatcaattaaagggtgtctgccaattttttgacata
gtaaaacttctaatttctgccaactcaaacgaaaagactgaaaactctatttcttcaaga
actctattttcaaatggtatttgcaattattctgatcttgaattattatcattctataag
aatgcatttacattcgttaataagattgttgaagattcagactctgattactatgatttc
caaagcagtttaaaattgaaactttattctgtattgttggacgttacatcagactcaact
attttggagagtattcaagaaaatttcgggtcattattacaaactgttgtttctttcatt
aacggaagtaaattactagtgaataaaaccattaaagaatttgaagactcctcttctgaa
aacgaagttgccgattatcaaactgatatcaaaaatactctattttctgtcatgagcaat
gttctaaccctactacccatcaattattttgttaattctaccttaccattattaaattcc
agcacttctgctgagataagatataacttaacatctgtcattggcaaaaaatttgaatct
gaatcaagtaaagctgttgactctgtcaaaattgtcattgaaatgttggtcaatagggta
gaaacagataaatcggatgctatgatgcttcaagttgacttaaaagtactatcatctttg
gctgctaaatttggtgaaaaattagaaggctctaccattactaatttattatctttagga
actaatttgttacaaagtgacaaattcgaagttaaaataccatcattgaatttgataact
aactgtattcaaattctaggtattaaatctttgtctttctatccaaaggttgttccacaa
tctttggtattattcaaagagttacaagaaggtacaaatacatacttaagaccacaacta
cagttatccatattgttattatttacagccatggtgaaacgtattccaagttttattaca
tctaacctttatgacttaattgatattattttattctctaacgatgttgaagtttcctct
agattatcagttgtcactttaatgattgaaaatattgaccaaaaagaaattttgaaaaca
ttgcacaaaatttggattaaaaaactgtcaaaatcgagtagttctataagcatatctcta
ttcttaagtgctttagaatcaactgttgaatctataagtaagaaatctgctacttctcaa
tcaccaacattctttaagttaatgctagcattatttgaatttagatcaatttctgagttt
gataataatactataagtagaattgaagcatctgtgcatcaaattgcaaatagttatgtg
ttaaaattaaacgataaagttttcagaccattatttgtcattgtggttaaatgggctttc
gatggtgaaggtgtaacaaataaagagataaaagaagtggaaagattgattgcattttac
aagttttttggtaagttacaagaaaatctgaagactattatcacttcctattttacttat
ttactagaaccaacaaacgagttactaaaaagatttattagccgcgatttaacagatgta
aatttaagacgtttaattttaatctcgttaacatcttcctttaaatatgacaaggaagat
tattggaactcaacttcgagatttgaattaatcagtacctctttggtcagtcaactatct
aatatcgataatgtcattggtaattatctggtcaaagcaattgcttctttaactactaat
aatggtagaattgacgagcataataagatcatgcataacctattagtcgaacatgtgaaa
tcttctactagatcttccgaaaaattatggaccattagaacgatgaaactaatttacagt
aaggttggtgaacaatggttaattttactacctcaattagtcccaactattgctgaatta
ctagaagatgaaaacgaagaagttgaaaacgaagtgagaactggtcttgttaaagttgtt
gagaatgttctaggtgaaccatttgatagatacttaagttaa

DBGET integrated database retrieval system