Tetrapisispora phaffii: TPHA_0I00810
Help
Entry
TPHA_0I00810 CDS
T02235
Symbol
TPHA0I00810
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14550
U3 small nucleolar RNA-associated protein 10
Organism
tpf
Tetrapisispora phaffii
Pathway
tpf03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
TPHA_0I00810 (TPHA0I00810)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
tpf03009
]
TPHA_0I00810 (TPHA0I00810)
Ribosome biogenesis [BR:
tpf03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
TPHA_0I00810 (TPHA0I00810)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BP28CT
U3snoRNP10
HEAT_HEATR1
ARM_ARMC5
HEAT_EF3_N
CLASP_N
DUF5785
mTOR_dom
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11532883
NCBI-ProteinID:
XP_003687021
UniProt:
G8BXF9
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(170005..175326)
Genome browser
AA seq
1773 aa
AA seq
DB search
MSSLRDQLTQVASSNATVAFDRKRRQKLHSTSLIYNPKTAATQDYDTIFELATNALQELI
EIDPNFEIFEKTLFSESSISIDRNVQTKEEIKDLEQSINGFLMLASSKWHLTPTLYATEW
LVRRFQIHILNAEMFLLSTLNYYQTPSFKRILDIVKLPPLFQPLSAFVRSEKNPTNITMI
KLFNDNDFIKLYTNYLNKCIKHKFTYTNQLLFTTCWFINVIAFNSNNEEKLTELIPILLE
ASAKLLGSTSNDCQIAAHTIMVIFATALPLNKNIIIAAVETILAGYNDKLIKKSVLISIF
KLFQTLRGNDNVSQLPSNIYTLLNNKISLVELTEFISTSDIPTNADKFITKYIRSVIRYD
HSKLDDIVKLLEKVELENFEMRHIITDLIHLSEIIDDKTKLIELFSYFVSKNETLVIKCL
NSLNIATELFEIRLTTSLFTVKDKEQDNTDGLNIKNIDSEKVLGKEITIEPFKEFLEKHS
NLIYTKSLSFLTEKSEIFNKLLSLFIESIGKGYSSGLFLSSFLSTIESKITFLLRVVISP
AALTTVRIIAISNISKLLSNIDKDSNLFTLVPCLVCALNDVSKNVRQNVRKLLFQISKRP
STKHYFMLKEIYGENKEVPFLDPQDCSSWLSKFLDGYFVDNLDFSKLLVPRANDKILSLF
WANQALLIPLPYPKLVLLRNLMNVSKTSSYSYLFETFISSYVESRGTWEQECKLNKTNFI
DFETVIVNLISEKEKNNFMIDFMIEALNSSHEGLAEITSDRLIKLFPTFKPPVQLHIVQS
IVDSINSDDVSYDTAATLQALPMNADIFVSLLGNVRITSDDGVSDIAKRRRRRSSTNKPV
FQRDDVSLMAELHLRKLTILLETLDKSKPVGTAQLLSTLFTVLSDLETLGEDGALPVLYA
QETLASCMTNTIDSLKSQNFTQLPNTRADSIISAIRNSQSPQVQNKLLLVIGSLATLAPE
TVLHSVMPIFTFMGVHAIRQDNEFTAQVVEKTILTVIPALLESSQSNINEEIEFLLMTFA
TALNHVPKHRRVKLYFTLVKTLGASNAIAPFIFLISQQYSNCINTFKLGDAKGFVEFTKS
FLSSFDVADQLKGVCQFFDIVKLLISANSNEKTENSISSRTLFSNGICNYSDLELLSFYK
NAFTFVNKIVEDSDSDYYDFQSSLKLKLYSVLLDVTSDSTILESIQENFGSLLQTVVSFI
NGSKLLVNKTIKEFEDSSSENEVADYQTDIKNTLFSVMSNVLTLLPINYFVNSTLPLLNS
STSAEIRYNLTSVIGKKFESESSKAVDSVKIVIEMLVNRVETDKSDAMMLQVDLKVLSSL
AAKFGEKLEGSTITNLLSLGTNLLQSDKFEVKIPSLNLITNCIQILGIKSLSFYPKVVPQ
SLVLFKELQEGTNTYLRPQLQLSILLLFTAMVKRIPSFITSNLYDLIDIILFSNDVEVSS
RLSVVTLMIENIDQKEILKTLHKIWIKKLSKSSSSISISLFLSALESTVESISKKSATSQ
SPTFFKLMLALFEFRSISEFDNNTISRIEASVHQIANSYVLKLNDKVFRPLFVIVVKWAF
DGEGVTNKEIKEVERLIAFYKFFGKLQENLKTIITSYFTYLLEPTNELLKRFISRDLTDV
NLRRLILISLTSSFKYDKEDYWNSTSRFELISTSLVSQLSNIDNVIGNYLVKAIASLTTN
NGRIDEHNKIMHNLLVEHVKSSTRSSEKLWTIRTMKLIYSKVGEQWLILLPQLVPTIAEL
LEDENEEVENEVRTGLVKVVENVLGEPFDRYLS
NT seq
5322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttcattaagagaccaattaactcaagttgcatcctccaatgctactgtcgcattc
gataggaaaagaaggcaaaaattacattcaacttcgttgatctataatccaaagactgca
gcaactcaagattatgatacaattttcgaattggctactaatgctctacaggaattaata
gaaattgatccaaattttgaaatttttgaaaaaacattgttttcagaatcttctatttca
atcgatcgaaacgttcaaactaaagaagaaattaaagacttagagcaatcaatcaatggt
ttcttaatgttagcttcttcaaaatggcatttaactcctactttatatgctaccgaatgg
ttagttcgtcgttttcaaattcatattttaaatgcggaaatgtttttattatcaacttta
aattattaccaaacaccatcatttaagagaattttagatatcgttaaattgccaccatta
tttcaaccattgtcagcatttgttagatcagaaaaaaatccgacaaatataacaatgata
aaattatttaatgataatgattttattaaattatacaccaactatttgaataaatgcatt
aaacataaattcacatacacaaaccaattgctatttacaacatgttggtttattaacgtt
attgcattcaattccaataatgaagaaaagttaactgagttaattccaatccttttagaa
gcatctgcaaaattattaggatcaacttcaaatgattgtcaaatagctgcgcacacaata
atggtaatctttgctactgcgttgccattaaataagaatattatcatcgcagcagttgaa
acaatcttggctggttataatgataaattaattaaaaaatcagttctaatttccattttc
aaattgttccaaactttaagaggtaatgacaatgtttctcaattaccatcgaatatttat
actttgcttaataataaaatttcgttagttgaattaactgaatttatttcaacctctgac
ataccaactaatgccgacaaatttatcacaaagtacatcagatctgttataagatacgat
cattcaaaattagatgatatcgttaaattattagaaaaagttgagttggaaaattttgaa
atgagacatatcattactgatttaattcatttatctgaaattattgatgataaaacaaaa
ttaattgaattgttctcatattttgtatcaaaaaatgaaactctagttattaagtgtttg
aactcactaaatattgctactgaattatttgaaatcagattaactacttctttattcacc
gttaaggataaagaacaagataatacagatggattaaatattaaaaacattgattcggaa
aaggtactcggtaaagaaattacaattgaaccattcaaagaatttttagaaaaacattca
aatttaatttacactaaaagtttatcgtttttgactgaaaaatcagagatttttaataaa
ctattgtccttatttatagaatcaatcggtaaaggctattcttcaggtttgtttttatcc
agtttcttatctacaattgaatctaaaattacatttttgttaagagtcgttatctcacca
gcagctttaacgactgttcgtatcattgctatttcaaatatttctaagttattaagcaac
attgataaggattcaaatttattcactctagtgccatgtttagtatgtgctttgaatgat
gtctctaagaatgttagacaaaatgtaagaaagctattgttccaaatttctaagaggcct
tctactaaacattacttcatgctaaaagaaatttatggggaaaataaagaagttccattt
ttagatcctcaagattgttcttcttggttatctaaatttttagatggttactttgtcgac
aaccttgatttctcaaagctattagttccaagggcaaatgacaaaattttatcactattt
tgggctaatcaagcattattaataccattaccatatccaaaattagttttattaagaaac
ttaatgaatgtttccaaaacatcctcatactcctatctattcgaaacattcatctcatca
tacgttgaatcaagaggtacatgggaacaagaatgtaaactaaacaaaacaaatttcatc
gacttcgagaccgttatcgttaatctaatatcagaaaaagagaaaaataatttcatgatc
gattttatgattgaagcattaaatagcagtcacgagggtctagctgaaatcacttctgac
agattgataaaactattccctactttcaaaccacctgttcaattacacatcgtccaaagt
attgtggactctatcaattctgatgatgtttcatatgacactgctgctacactacaggcc
ctaccaatgaatgcggatatatttgttagtctacttggcaatgttagaattacttccgat
gatggtgtttctgacattgcaaaaagaagaaggagacgctcttccactaataaaccagta
tttcaaagagatgatgtttctctaatggctgaattacatttaagaaaattaactatcttg
ctggagactttagataaatctaaacctgtaggaactgcccaattattatccacattattt
actgtattatctgatttagaaacattaggagaagatggtgctttacctgttttatatgcg
caagaaaccctggcttcttgtatgacaaatacgattgattcattaaaatcacaaaacttt
acccaattaccgaacacaagagcagattcaattatttctgcaatcagaaattctcaatca
cctcaggtgcaaaacaaactgttacttgtaattggtagtttggcaactttagctccagaa
actgttttgcattcagttatgcctatctttacatttatgggtgttcatgctattcgtcaa
gacaatgaatttacagcccaagttgtggagaaaacaattctaaccgtcattcctgcatta
ttagagagcagtcaaagtaatatcaacgaagaaatcgaattcttattaatgacttttgct
actgctttaaaccacgttccaaaacatagaagagttaaattatattttactttagtcaaa
actttgggcgcatccaatgccatagctccatttatatttttgatttctcaacaatattct
aactgtatcaatactttcaaattgggcgatgctaagggatttgttgaattcactaaatca
tttttatcttcatttgacgttgctgatcaattaaagggtgtctgccaattttttgacata
gtaaaacttctaatttctgccaactcaaacgaaaagactgaaaactctatttcttcaaga
actctattttcaaatggtatttgcaattattctgatcttgaattattatcattctataag
aatgcatttacattcgttaataagattgttgaagattcagactctgattactatgatttc
caaagcagtttaaaattgaaactttattctgtattgttggacgttacatcagactcaact
attttggagagtattcaagaaaatttcgggtcattattacaaactgttgtttctttcatt
aacggaagtaaattactagtgaataaaaccattaaagaatttgaagactcctcttctgaa
aacgaagttgccgattatcaaactgatatcaaaaatactctattttctgtcatgagcaat
gttctaaccctactacccatcaattattttgttaattctaccttaccattattaaattcc
agcacttctgctgagataagatataacttaacatctgtcattggcaaaaaatttgaatct
gaatcaagtaaagctgttgactctgtcaaaattgtcattgaaatgttggtcaatagggta
gaaacagataaatcggatgctatgatgcttcaagttgacttaaaagtactatcatctttg
gctgctaaatttggtgaaaaattagaaggctctaccattactaatttattatctttagga
actaatttgttacaaagtgacaaattcgaagttaaaataccatcattgaatttgataact
aactgtattcaaattctaggtattaaatctttgtctttctatccaaaggttgttccacaa
tctttggtattattcaaagagttacaagaaggtacaaatacatacttaagaccacaacta
cagttatccatattgttattatttacagccatggtgaaacgtattccaagttttattaca
tctaacctttatgacttaattgatattattttattctctaacgatgttgaagtttcctct
agattatcagttgtcactttaatgattgaaaatattgaccaaaaagaaattttgaaaaca
ttgcacaaaatttggattaaaaaactgtcaaaatcgagtagttctataagcatatctcta
ttcttaagtgctttagaatcaactgttgaatctataagtaagaaatctgctacttctcaa
tcaccaacattctttaagttaatgctagcattatttgaatttagatcaatttctgagttt
gataataatactataagtagaattgaagcatctgtgcatcaaattgcaaatagttatgtg
ttaaaattaaacgataaagttttcagaccattatttgtcattgtggttaaatgggctttc
gatggtgaaggtgtaacaaataaagagataaaagaagtggaaagattgattgcattttac
aagttttttggtaagttacaagaaaatctgaagactattatcacttcctattttacttat
ttactagaaccaacaaacgagttactaaaaagatttattagccgcgatttaacagatgta
aatttaagacgtttaattttaatctcgttaacatcttcctttaaatatgacaaggaagat
tattggaactcaacttcgagatttgaattaatcagtacctctttggtcagtcaactatct
aatatcgataatgtcattggtaattatctggtcaaagcaattgcttctttaactactaat
aatggtagaattgacgagcataataagatcatgcataacctattagtcgaacatgtgaaa
tcttctactagatcttccgaaaaattatggaccattagaacgatgaaactaatttacagt
aaggttggtgaacaatggttaattttactacctcaattagtcccaactattgctgaatta
ctagaagatgaaaacgaagaagttgaaaacgaagtgagaactggtcttgttaaagttgtt
gagaatgttctaggtgaaccatttgatagatacttaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system