Tenacibaculum platacis: T19A05C_1386
Help
Entry
T19A05C_1386 CDS
T11461
Name
(GenBank) FlaA1/EpsC-like NDP-sugar epimerase
Organism
tplt Tenacibaculum platacis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
RmlD_sub_bind
GDP_Man_Dehyd
CoA_binding_3
3Beta_HSD
adh_short
C2185-like_N
KR
NAD_binding_10
CoA_binding
PglD_N
NmrA
Glyco_transf_28
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL2082728
LinkDB
All DBs
Position
T190524A05C:1616505..1618406
Genome browser
AA seq
633 aa
AA seq
DB search
MIRNFLLKALNRHASHWVVLLIDTLLVALSFILAYTVRFNASLNFNTGNLAYQIPFVSFI
FLVCFWFVGSNRGIIRHTGTRDAFNVFIGVTIASMSIIFIVAINNVYEVLPSYTIPKTII
LIHYFITVFVLIVSRFIFKAFYEIISSELKDITNVMIYGAGDSGLITYGALNRDTKNNYE
VIGFIDDDRNKVGKKIDRVKIYHRSEIDKKFIEKKEVDEIIFSIQNIKSERLLFLTDKTL
ELGVKPKIVPPLSNWIGGDFEANQIKQVKIEDLLDRKPISIDNPIVKRDVNNKVVLVTGA
AGSIGSEISRQISKYNHKHLILVDQAESPLYEIQQELVRQGIENFTSIVADVRDIQRMES
VFEEFKPNKVYHAAAYKHVPLMEDSPYEAIKINVGGTKIIADLSIKYNVERFVMVSTDKA
VNPTNVMGATKRVAEMYISCLSSKSNTTKFTTTRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIEAGGPLT
VTHKNITRYFMTIPEACQLVLEAGTMGDGGEIYIFDMGKSVKIFDIAKRMIHLSGLKYPE
DIDIKITGLRPGEKLYEELLANGENTTPTYHEKIMIAKNQKIDTNLFKSKIEQLCIENIK
NDNGLSVKLLKEIVPEYKSNNSVYEKLDVQKTN
NT seq
1902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattagaaactttcttttaaaagctttaaacaggcacgcctcacattgggtagtgcta
ttaattgacactcttcttgttgcattatctttcattttagcttacaccgtaagatttaat
gcatctttaaattttaatactggaaatcttgcttatcaaatcccatttgtatcgtttata
tttcttgtgtgcttttggtttgtaggctcaaatagaggaattatcagacatactggtaca
agagacgcttttaatgtttttataggagttaccatcgcatctatgagtattatctttata
gttgcaattaataatgtatacgaggttttgccttcttacacaattcccaaaaccataatt
cttatacattattttattacagtttttgtcctaattgtaagtcgattcatatttaaagca
ttttatgaaattatttcttcagagttaaaagacataactaatgtaatgatttatggtgct
ggagattctggtttgattacatacggagctcttaatagagatacaaaaaacaattatgaa
gtaattggatttattgacgatgataggaataaggtcgggaaaaaaatagatagagtaaaa
atttaccatagatctgagattgacaagaaattcattgagaaaaaagaagttgacgagatc
attttctccattcagaatataaaatcagaaagactattatttttaacagataaaactcta
gaacttggagtaaagcctaaaatagttccacctttatctaattggattggtggggatttt
gaagctaatcaaattaaacaagtaaaaattgaagatttactagatcgtaaacctatatct
attgataatccaatagtaaagcgtgacgttaataataaagttgttttagtaactggtgct
gctggttctattggaagtgaaatatcacgccaaataagtaaatataatcataaacatctt
attttagttgatcaggcagaatctcccttatacgaaattcaacaagaattagtgcgtcag
ggtatcgagaatttcacatctattgtagccgatgttcgtgacatccaaagaatggaatca
gttttcgaagaatttaaacctaacaaagtctatcatgcagcggcctataaacatgtccct
ttaatggaagacagcccttatgaagcaataaaaataaatgtaggtggtactaaaattata
gcagatttatctattaaatacaatgttgaaaggtttgttatggtttcgactgataaagca
gttaaccccacaaatgttatgggagctacgaaaagagtcgctgaaatgtatatatcttgt
cttagttcaaaatctaatacaacaaaatttactacaactcgttttggaaatgtattaggt
tctaatggctctgtaatacctttatttaaaaaacaaatagaagctggtggtcctctaaca
gttactcacaagaatattacgagatattttatgacaatacctgaagcttgtcagttagtt
ctagaggctggtactatgggagatggaggtgaaatctacatttttgatatgggtaaatct
gtaaagatttttgatattgcaaaacgaatgatacacctttctgggttaaaatatccagaa
gacatcgatattaaaattacaggtttaagaccaggcgaaaaactttatgaagaattatta
gccaatggtgaaaatacaacaccgacctatcatgagaaaataatgattgccaagaatcaa
aaaatagacactaatctattcaaatcaaaaatagaacaattgtgtattgaaaacattaaa
aatgacaatggtttatccgttaaattactcaaagaaatagtacctgagtacaaatcaaat
aattctgtttacgaaaaactagatgttcaaaaaacaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
