Tenacibaculum polynesiense: T19A14A_0839
Help
Entry
T19A14A_0839 CDS
T11463
Name
(GenBank) Capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD
Organism
tpoy Tenacibaculum polynesiense
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
RmlD_sub_bind
GDP_Man_Dehyd
CoA_binding_3
3Beta_HSD
adh_short
C2185-like_N
KR
NAD_binding_10
NAD_binding_4
CoA_binding
PglD_N
NmrA
Ribonuc_L-PSP
MARVEL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL2109631
LinkDB
All DBs
Position
T190130A14A:complement(866743..868653)
Genome browser
AA seq
636 aa
AA seq
DB search
MLKNWVLKALDKYASRWVVLIIDIILVCFSFILAYTIRFNTSLNFDTEKLIYQLPFIALV
ALFSFLSVGSYRGIIRHTGTRDAFNVFIGLSLMSSLVIIAVLINSTFKIFPSITIPKSII
IIHFLTSVILLIISRFVFKAFYEIISTELDSITNVLIYGAGDSGLITYGALNRDSKNKYE
VLGFIDDDPKKQGKKIDRIKIYDGNRLTKNFIETKDVDEIIISIQNIKSEKLLVLTDKLL
SLGTKVKIVPPLSKWIDGDLEATQIKQVKIEDLLNRKPISIDNPIVSREVNNKTVMVTGA
AGSIGSEISRQLSSYNLHHLILVDQAESPLYEIEQELVQNGITNFTAFVADVRDVNRMNE
IFEEFKPQKVFHAAAYKHVPLMEKSPYEAVKINVLGTKNIADLAIKHKVERFVMVSTDKA
VNPTNVMGATKRIAEMYITCLSNNKEHTTKFTTTRFGNVLGSNGSVIPLFKKQIENGGPL
TVTHKEITRYFMTIPEACRLVLEAGTMGNGGEIYIFDMGKSVKIYDIAKRMIHLSGLSYP
DDIDIKITGLRPGEKLYEELLANGENTTPTYHEKIMIAKTQDIDNEYISRKIQKLCSSYN
NINNLNTVSLMKEIVPEYISKNSIYQELDAIKEKLN
NT seq
1911 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaagaattgggttttaaaagctttagataaatacgcctcaagatgggttgtactt
ataattgatataattttagtatgcttttcttttatccttgcttatactatcaggtttaac
acttcgctaaattttgatacggaaaaactaatctaccaacttccatttatagctttggta
gccctatttagttttttaagtgtaggttcttatagaggaattataagacacactgggact
agagatgcatttaatgtatttattggattgtcactaatgtcttcattagtaattattgca
gttctaataaatagtacttttaaaatttttccatctataacgattccaaagtcgattata
attattcattttcttacctcggttatactccttatcattagccgatttgtttttaaagct
ttttatgaaataatttctacagaattagatagcattaccaacgttttaatctatggagct
ggtgattctggtttaattacctatggtgccttaaacagagattctaaaaacaaatatgaa
gtattaggttttattgatgatgaccctaaaaaacaaggaaaaaaaattgatcgaataaaa
atctacgacgggaatagattaaccaaaaattttatagagacaaaagacgtcgatgaaatt
atcatttcaattcaaaatattaaatctgaaaagctacttgtactaacagataaattatta
agcttaggaacaaaagttaaaatagttccaccactttctaaatggattgatggtgattta
gaggctacacagattaaacaagttaagattgaagatttattaaacagaaaaccaatatca
attgacaaccctatagtaagtagagaagtcaataacaaaacggtaatggttactggagct
gcgggatctattggatctgaaatttcaagacagctcagttcatacaacctacaccatctt
attttagttgatcaagctgaatctccactgtatgaaatcgagcaagaattagttcaaaat
ggtatcacaaacttcacggcttttgtagcagacgttagagatgtaaaccgtatgaatgaa
atttttgaagagtttaaacctcaaaaagtttttcacgccgctgcatacaaacatgttcct
ttaatggaaaaatcaccctatgaggctgtcaaaatcaatgtcctaggaactaaaaatata
gctgatttagcaatcaaacataaggtggaacgatttgtaatggtttcaacagacaaagcc
gtgaatccaactaacgtaatgggagctacaaaacgaattgctgaaatgtatattacttgt
cttagtaataacaaagaacatactaccaaatttactacaactcgttttggaaatgtttta
ggttctaacggatcggttatccctttatttaagaaacaaattgaaaacggaggtccttta
acagtaactcataaagaaattactcgttattttatgaccattcccgaagcatgtcgttta
gtactggaagcgggaacgatgggtaacggaggtgaaatatatatttttgacatggggaaa
tcagttaaaatatatgatattgctaaaagaatgattcatttatcaggactttcttatcca
gatgacattgatattaaaataactggattaaggcctggagaaaaattatacgaagaactt
ttagcaaatggtgaaaataccactcctacatatcatgaaaaaatcatgatcgctaagact
caagatattgataatgagtatatttcaagaaaaatacaaaagctttgctcatcatataac
aatataaacaacttaaatacagtttctttgatgaaagaaattgtcccggagtacatttct
aaaaactctatttatcaagaattagatgcaatcaaagaaaaattaaattag
DBGET
integrated database retrieval system