KEGG   Trifolium pratense (red clover): 123887497
Entry
123887497         CDS       T08949                                 
Name
(RefSeq) phytochrome B-2
  KO
K12121  phytochrome B
Organism
tpra  Trifolium pratense (red clover)
Pathway
tpra04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tpra00001]
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    123887497
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c HisKA PAS_4 PAS_9 PAS_8 PAS_3
Other DBs
NCBI-GeneID: 123887497
NCBI-ProteinID: XP_045792780
LinkDB
Position
LG5:22846315..22852904
AA seq 1142 aa
MASTSKTPPETNTNAANATTTKDEINNNNKLKSLSMKKAIAQYTEDARLHAVFEQSGDSF
DYTESIRVTAAATESVPEQQITAYLARIQRGGFIQPFGSMIAVDEPSFRVLAYSENARDM
LGIAPQSVPSLEDQDSFTSSFCLGIDVRSLFTNSSSILLEKAFAAREISLMNPIWIHSRS
TGKPYYGILHRIDVGVVIDLEPARSEDPALSIAGAVQSQKLAVRAISQLQSLPGGDVKVL
CDAVVESVRELTGYDRVMVYKFHEDEHGEVVAESKRIDLEPYIGLHYPATDIPQASRFLF
KQNRVRMIVDCNASPVRVFQDEALVQPVCLVGSTLRAPHGCHAQYMANMGSIASLVMAVI
INGNDEEGGGIGGTGRSSMKLWGLVVCHHTSARCIPFPLRYACEFLMQAFGLQLNMELQL
AVQSLEKRVLRTQTLLCDMLLRDSPTGIVTQSPSIMDLVKCDGAALFYQGNYYPLGVTPT
ESQIRDIIEWLLAFHGDSTGLSTDSLADAGYPGAASLGDAVCGMAVAYITEKDFLFWFRS
HTAKEIKWGGAKHHPEDKDDGQRMHPRSSFKAFLEVVKSRSMQWENAEMDAIHSLQLILR
DSFKEAENNDSKAVVHTHMAELELQGVDELSSVAREMVRLIETATAPIFAVDVEGRINGW
NAKISELTGLLVEDAMGKSLVHDLVYKESQESVDKLLSHALKGEEDKNVEIKMKTFGPGN
QNKAVFIVVNACSSKDYTNSIVGVCFVGQDVTGQKVVMDKFINIQGDYKAIVHSPNALIP
PIFASDDNTCCLEWNNAMEKLSGWSRADVIGKLLVGEVFGSFCQLKGSDSMTKFMIVLHN
ALGGQDTDKFPFSFLDRHGKYVQTFLTANKRVNIDGQIIGSFCFLQIVSPELQQALTVQR
QQDTSSFARMKELAYICQEVKNPLSGIRFTNSLLESTCLTDEQKQLLETSAACEKQMLKI
IRDIDLESVEDGSLELEKREFLLENVINAVVSQVMLLLRERNLQLIRDIPEEIKTLAVYG
DQLRIQQVLADFLMNVVRYAPSPDGWVEIHVFPRIKQISDGLTILHAEFRMVCPGEGLPP
ELIQDMFHNSRWVTQEGLGLSMSRKIIKLMNGEVQYVREAERCYFLVFLELPVTRRSLKN
VN
NT seq 3429 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcttcaactagtaaaacaccaccagaaacaaatacaaatgcagcaaatgcaacaacc
acaaaagacgaaatcaacaacaataacaaactcaaatcattatcaatgaaaaaagccata
gctcaatacaccgaagacgcaagacttcacgctgtttttgaacaatccggagattctttc
gactacactgaatcgattcgtgtaactgccgctgcaactgaatctgttcctgaacaacaa
ataactgcttatttagctagaattcaacgtggcggttttattcaaccttttggttcaatg
atcgcagttgatgaaccttcttttcgtgttcttgcttattctgaaaacgcacgtgatatg
cttggtattgctcctcaatctgttccttctttagaagatcaagattcttttacttcttct
ttttgtttaggtattgatgttcgttcactttttactaattcgagttcgattttgcttgag
aaagctttcgcggctcgtgaaattagtttgatgaatcctatttggattcattctagatct
actggtaagccttattatggaattttacatcggattgatgttggtgttgttattgatttg
gagcctgctagatctgaggatccagcactttcgattgctggtgctgttcagtctcagaag
ctagctgttagagcgatttcgcagcttcaatcgcttcctggtggtgatgttaaggtttta
tgtgatgctgttgttgagagtgttagagaattgactggttatgatagggttatggtttat
aagtttcatgaggatgaacatggggaagttgttgctgagagtaagaggattgatttggag
ccttatattggtttgcattatcctgctacggatatacctcaggcttcgaggtttttgttt
aagcagaatagggttaggatgattgtggattgtaatgcttctcctgttagggtttttcag
gatgaggcacttgttcagcctgtttgtttggttgggagtactcttcgtgctcctcacggt
tgtcatgctcagtatatggcgaatatgggttctattgcttctttggttatggctgttatt
attaatgggaatgatgaagagggtggtgggattggtggtactggaagaagttcgatgaaa
ctttggggtcttgttgtttgtcatcatacttctgctaggtgtattccttttcctcttagg
tatgcttgcgagtttttaatgcaggcttttgggcttcaattgaatatggaacttcagtta
gcagtgcagtcgttggagaaacgggttttgaggacacagactctgttgtgtgatatgtta
cttagggattctcctactgggattgttacgcagagtcctagtattatggacttggttaag
tgtgatggggctgctttgttttatcagggaaactactatccgttgggtgttactcctacg
gagtctcagataagggatattatagagtggttgttggccttccatggtgattcaacgggt
ttgagtactgatagtttggctgatgctggctatcctggggctgcttctcttggggatgca
gtttgtgggatggctgttgcgtatatcactgaaaaggatttccttttctggttcagatct
catacggcaaaagagattaaatggggtggtgcgaagcatcacccagaggataaagatgat
ggtcagagaatgcatcctcggtcttccttcaaggcctttttagaagtagtcaagagccgt
agtatgcagtgggagaatgcagaaatggatgcaattcactccttgcagcttattctgcga
gactcatttaaggaagccgagaataacgattcaaaggctgttgtgcatactcatatggca
gaactagagttgcaaggggtggatgaactgagttctgtggctagggaaatggtcaggtta
atagaaactgccactgctcccatatttgccgttgatgtcgaaggccgtatcaatgggtgg
aatgcaaagatttctgaattgacgggacttctggtagaggacgccatggggaagtctttg
gttcatgatcttgtgtataaggagtctcaagaatctgtggacaagcttctttctcatgct
ttaaaaggtgaagaagataagaatgttgagataaaaatgaagacgtttggcccagggaat
caaaataaggcagtttttatagtggtgaatgcttgctccagcaaggattatacaaatagt
atagttggagtgtgctttgttggtcaagatgttaccggtcaaaaagttgtaatggacaag
ttcattaacatacaaggtgactacaaggccattgtacatagtccaaatgcattgatccct
cccatttttgcatcggatgataacacatgttgcttagagtggaacaatgctatggaaaag
ctcagtggttggagccgtgcagatgttattggcaaattgttggtgggagaggtttttggt
agtttctgtcagttgaagggttcagattctatgacaaaattcatgattgtcttgcacaat
gcacttggtggacaagacacggacaaattcccattttcatttcttgaccgacatggaaag
tatgttcagactttcttgaccgcaaataaaagggttaacattgatggccagatcattggc
tctttttgctttttacaaattgtgagccctgaacttcaacaggctctgacagtccagaga
caacaggatactagtagctttgctaggatgaaagagttagcttatatttgtcaagaagta
aagaatcccttgagtggcatacgctttacaaactctcttttggagtctacatgcttgact
gatgagcaaaagcagttacttgagactagtgctgcttgcgagaagcaaatgttaaagata
atacgggacattgatctggaaagcgtcgaggatgggtccctggagcttgagaagcgggaa
ttcttgctcgagaatgtcataaatgcagtagttagccaagtaatgttattgctaagagaa
agaaatttacagttgattcgtgatattcctgaagaaatcaagacattggctgtctatggt
gatcaattgaggattcaacaagttttggctgatttcttaatgaatgtggtgcgctatgca
ccatctccagatggttgggtagagattcatgtgtttccaagaataaaacaaatttcagat
gggctcactattctgcatgctgaatttaggatggtgtgtcctggtgaaggtcttccgcct
gaattgattcaagacatgttccataacagtcggtgggtgactcaagaaggcttagggctg
agcatgagcaggaagataataaaattaatgaatggtgaagtccaatatgtcagggaggca
gaacggtgctactttttggtttttcttgaactacctgtgacgcggagaagccttaaaaat
gttaattag

DBGET integrated database retrieval system