Trifolium pratense (red clover): 123894002
Help
Entry
123894002 CDS
T08949
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
tpra
Trifolium pratense (red clover)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
DUF758
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123894002
NCBI-ProteinID:
XP_045799813
LinkDB
All DBs
Position
LG7:55343483..55349633
Genome browser
AA seq
1080 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPVIGGNEGSYGDEFEKEIGMLLRDQRRHEVDDHEPELNLYRSGSAPPTVDGS
LSAVGGLFGGGSTAATAAISEFSGNGFGSEEELRSDPAYLQYYYSNVNLNPRLPPPLLSK
EDWRFTQRLKGGASVVGGIGDRRKVNGGDDNGGRSMFATPPGFNNRKRESEVVVDEKARG
SAEWGGDGLIGLPGLGLGSKQKSLAEIFQDDMGRNTSVTGFPSRPASRNAFDENVDITSS
AEAELAHLRHDSSSTDGLRSGSNVQGSSASQNIGPQASYSYAAALGGSSLSRSTTPDPQH
IARAPSPCPTPIGSGRVSAAEKRGITSPDTFNDVSSGINGSADIMAAMSGMKLSADDGLD
GDNHFQSQVESDVNNYQRYLFGMQGGQDHGKQNSYLKKSESGHLQKTAHSDSGKRSGSGS
DMKNSTLDRHAEMQKSAVSPNNSYFKGSPGSPYGGGGGFPAQYQPSDGPNSPFNNYGPSG
GYGGNPAVASFMANQLGTGNLPPLFENVAAASAMASPGMDSRILGGGLPSGVASPSDVHV
LSRMGNQIAGGGALQTPYVDPMYPQYTRTPEYAAAQLAALNDPSVDRNYLGNSYMNLLEL
QKAYLGSLLSPQKSQYNVPLGGKSGGSNHHGYYGNPAYGVGLSYPGSPMANSLSSSPVGS
GSPIRHNDLNMHFASGMRNVAGVMAPWHLDAGNLDENFASSLLEEFKNNKTKCFELAEIS
GHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTDEKNMVYQEITPHALALMTDVFGNYVVQKFFEHGL
AAQRRELANKLYGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVQELDGNIMRCVRDQNG
NHVIQKCIECVPEDAIDFIISTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQVTSIQCFVTPFMYHKVLEC
NVIRFTWQRVLEHCEDPNTQQKVMDEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSTII
KELAGNIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPAERLLLVNEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANY
VVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPHTA
NT seq
3243 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattgggtaggaggccagtgattggtggtaacgagggttcatatggagat
gaatttgagaaggaaatagggatgttgcttcgtgatcaacgacgacatgaggttgatgat
catgaacctgagcttaatttgtataggagtggatcagctcctccaactgtggatggttca
ttgagtgcagttggagggttgtttggtggtggctctacggctgccacagctgcaatttcg
gagttttctgggaatggttttggttctgaggaagagcttaggtctgatccagcttatctt
caatattattactctaatgtgaatttgaatcctagacttccacctcctttgttatcaaag
gaggattggaggtttacacagagactaaaaggtggagcttctgtagttggtggaattggt
gacaggaggaaagtcaatggaggtgatgataatggtggtagatcaatgtttgccacgcct
ccgggatttaacaataggaaaagagagagtgaggtggtggttgatgaaaaagctagaggt
tctgccgagtggggtggtgatggactcatcggtttgccaggactaggtcttgggagcaaa
caaaagagccttgcagaaatttttcaggatgacatgggacgtaacacttctgtcactggc
tttccttctcgtccagccagtcgtaatgcatttgatgaaaatgttgatattacatcttct
gcagaagcagagctggctcatttacgccacgattcctcatccactgatggcttaaggtcc
ggatcaaatgttcaagggtcatctgcatcccaaaatattggcccgcaagcctcatattct
tatgctgctgcacttgggggttcttccctgtcacgaagcactactcccgatccacaacat
attgctagggctcctagtccctgtcccacaccgattggtagtgggagagtttctgctgcc
gagaagagaggtattactagtcccgatacatttaatgatgtttcatctggcatcaatggg
tctgcagatattatggctgcaatgtccggcatgaaattgtcagcagatgatgggttagat
ggtgataaccatttccaatcacaggttgagtcagatgttaataattatcagagatatctt
ttcggtatgcaaggtggtcaggatcatggcaagcagaattcatatttaaagaagtctgaa
tcaggacacttgcagaaaactgctcactcggattcaggtaagagaagtggaagtggttca
gacatgaaaaattctaccttggataggcatgctgagatgcaaaagtccgctgtctctccc
aataactcgtatttcaagggatcacctggctccccttatggtggtggaggtggttttcct
gcacaatatcagccttcagatggtcccaactcaccatttaataactatggcccgagtggt
ggatatggtggaaatccagcggtggcatccttcatggctaaccaacttggaactggtaat
ctgccacccctatttgaaaatgttgctgcagcatcagccatggcatcccctggaatggac
tctagaatccttggtggtggtttgccctctggagttgcttctccatctgatgtgcatgta
ctcagtagaatgggaaatcaaattgcaggtggtggtgctcttcagactccttatgttgat
ccgatgtatcctcagtatacgaggacacctgagtatgctgcagcacaacttgccgcactt
aacgacccatctgtggacaggaattacttgggaaactcttacatgaatttacttgagctt
cagaaagcttatcttggatctctactttcacctcagaagtcacaatacaatgttcccttg
ggtggaaaatctggtggttccaaccatcatggttattatggaaatcctgcgtatggcgtt
ggcttgtcttatccaggaagtccaatggcaaactctttatccagttctccagttggatct
ggcagtcctattaggcacaatgacctgaatatgcattttgcttctggaatgaggaatgta
gctggggtcatggcaccatggcacctagatgctggaaatttagatgaaaacttcgcttcg
tctctgttggaagagtttaaaaacaataaaacgaagtgttttgaacttgctgaaatttct
gggcatgttgttgaattcagtgctgatcaatatgggagccggtttattcaacaaaagctt
gaaacagcaactactgacgaaaaaaatatggtttatcaggaaataacaccacatgctctt
gctttgatgactgatgtctttggtaattatgtggttcagaagttttttgagcatggactt
gcagcccagagaagagagttagccaacaagctttatggccatgttctgactcttagcctt
caaatgtatggttgtcgagtcatccagaaggccatagaagttgttgatctggaccagaag
attaaaatggttcaagagcttgatggtaatatcatgcgctgtgtacgagatcagaatggc
aaccatgttattcagaagtgtattgaatgcgtacctgaagatgcaattgacttcattatc
tcaactttttttgatcaagttgtgacactatcaacccatccatatggttgccgggtgata
caggtaacatctattcagtgttttgttactccttttatgtaccacaaagtccttgaatgt
aatgtaatacgttttacatggcagagagtactagagcactgcgaagaccctaacacacaa
cagaaagttatggatgaaattttaggagctgttagcatgttagcccaggatcagtatggc
aactatgtcgtccagcatgtgcttgagcatgggaaacctcatgagcgttctacaattatc
aaggaattagcaggaaatatagttcaaatgagccagcagaagtttgcatctaatgttgtg
gagaagtgtttgacctttggaggtcctgctgaacgcctattgcttgtaaatgagatgctt
ggcaccactgatgaaaatgagcctcttcaggcaatgatgaaagatcagtttgctaattat
gtcgtgcaaaaggtgctggagacttgcgatgaccaacagcgtgagctcattctttctcga
attaaagttcatttgaatgcattgaaaaagtacacctatggaaagcatatcgtcgctcgt
gtagagaaacttgttgctgctggagagaggagaattgctgctcagtctcctcatactgct
tag
DBGET
integrated database retrieval system
