Trifolium pratense (red clover): 123902472
Help
Entry
123902472 CDS
T08949
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
tpra
Trifolium pratense (red clover)
Pathway
tpra03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpra00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
123902472
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
tpra03019
]
123902472
Messenger RNA biogenesis [BR:
tpra03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
123902472
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123902472
NCBI-ProteinID:
XP_045808156
LinkDB
All DBs
Position
LG1:complement(18571571..18575166)
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTNEEKLKEHFSNYGDVLNTSVMREKNTGKPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKRAFSREDQQISGNSRTGNSNSGMNSGNGGNMRTKKIFVGGLP
PTLAEEKFRQYFEAYGLVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGANSRMGGAGGGGAGMGGYPGYGASGGNQNAYDGRSDSSRYMQPQS
AAGGFPPYGSSAYSAAAAGYGYGSASNGLGYGAAYGSYGGAAAGYGGPAAATYGNPNVPN
AAYAAGGPRSSWPAQAASGYGSMGYGNTAPWGAPSGGAGSGSATAGQSPSAAAGYGNQGY
GYGGYGSGYGGSDNSYGNPGVYGAVGGRTGSAPNSNASGQGGSELQGSGGSGNYMGSGYG
DANGNSGYGNAAWRSEQAQASGNYGTPQGNGGQVGYGGGYGGAQSRQAQQQ
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcagggaaagcttttcatcggtgggatttcatgggatactaatgaggag
aagctgaaggagcatttcagcaattatggtgatgttttgaacacttcagttatgagagag
aagaacactggaaaacctagaggctttggtttcgttgttttttcagatccttctgttctt
gatagggttcttgaagacaagcatgttattgatggcagaacggttgatgccaagagggcg
ttctcaagagaagatcaacaaatttctggtaattcgagaactggaaactccaattctggt
atgaattcgggtaatggtgggaatatgaggacaaaaaagatatttgttggagggttacct
cccactctggctgaagaaaaatttcgtcagtactttgaggcttatggacttgtaactgat
gttgtagtcatgtatgaccagaatactggacgaccacgaggttttgggtttattacattt
gatactgaggaggcagttgatagggttttgcacaagacatttcatgatttaaatggtaaa
caagtagaggtaaagcgtgcacttccaaaggatgccaatccaggtgcaaatagccgaatg
ggtggtgctggaggtggtggtgctggaatgggtggttatccagggtacggggcttctggt
ggcaaccaaaatgcatatgatggtcgttcagattctagtaggtatatgcagcctcaaagt
gctgcaggtggattcccaccgtatggatcctctgcttatagtgctgctgctgctggatat
gggtatggttcagctagcaatggccttggttatggtgcagcatatggaagttatggtggt
gctgccgctggttatggtggacctgctgctgcaacatatgggaacccaaatgtccctaat
gctgcttatgctgctggtggcccaaggagttcatggcctgctcaggctgcctctggctat
ggctctatgggttatggtaacactgctccttggggtgctccaagcgggggtgctggatct
ggttcagcaactgcaggtcaatctcctagtgcagctgctggatatgggaatcaaggttat
gggtatggtggttatggcagcgggtatggtggaagtgataattcttatgggaatccaggt
gtatatggtgctgttggcgggcgtactgggagtgctccaaatagtaatgctagtggtcag
ggtggtagtgaactgcaaggtagtggtggcagtggcaactatatgggcagcggctatggg
gatgcaaatggaaattctggttacggaaatgcagcatggagatctgaacaggctcaggca
tctggtaattatgggactcctcagggaaatggtgggcaagttggttatggtggtggctat
ggtggtgctcagtctcgacaagcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
