Trifolium pratense (red clover): 123913634
Help
Entry
123913634 CDS
T08949
Name
(RefSeq) nicastrin
KO
K06171
nicastrin
Organism
tpra
Trifolium pratense (red clover)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nicastrin
Ncstrn_small
Peptidase_M28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123913634
NCBI-ProteinID:
XP_045820391
LinkDB
All DBs
Position
LG3:complement(2358876..2367774)
Genome browser
AA seq
672 aa
AA seq
DB search
MALIFFFLFLFFASHLLSSISGQSSSMESVPDLQNTMYTDVDGYPCVRLLNLSGTIGCSN
PGRDKVVAPIVRFENVDDVSELSTILVSLDDFPTLFTRLSADPSFARKVGGVLIESVTDS
QKKLNGFSPDQKFPQAEFAPYHNISYEWNPIGSGIMWKSYSFPVFLLTESGTNTLKKFVL
KSENKKKAYTSNVAEFDLVMQTMKSGTHDSESCLKEGTCLPLGGYSVWSSLPPINISSSK
PPKPIILTVASMDSSSFFRDISLGADSPISGLIALLAAADALSRLDGLGELSKQLVFVVF
TGEAWGYLGSRRFLVELDEHSDAVHGLNHSLIEKVLEIGSVGKGLSQGQGQGAKNFFAHA
EGDSSATDQIMVALKHAQESLLSEDIRITSASASNPGIPPSSLMTFLNKNPGISGVVLED
FDSSFVNKFYHSYLDDLSNVNSSAVVAAASLVARTLYILASETNDVQNSTLAAINVNVTL
VEQLMDCLLDCDPGLSCELVKKYISPASTCASNYVGVILDEPSSTPYLGYINDVPRFIWN
FLADITSIPKENNSSSCQKGCNGRDEVCIKAETDGKGVCALSTTRYVPAYSTRLKFDSGV
WSVLPPNSSDKMGVVDPVWTESNWNTIGIRVYTVQIAAYDRVVLFGGIALTILAYLAITV
TRTFVAKATKRD
NT seq
2019 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgctaatcttcttcttcctcttcctcttcttcgcttctcacctcctctcttccatt
tctggtcaatccagctccatggaatcggttcctgatcttcagaatactatgtataccgac
gttgatggatatccttgtgttcgtttgttgaatctttctggaacaatcggttgttcaaat
cctgggcgtgataaggttgtggctccaattgtaaggtttgaaaatgttgatgacgtttcg
gagctatctactatattggtgtcattggatgattttccaactctctttaccagattatca
gctgatccaagctttgcaagaaaagttggtggtgtactaattgaatcagttactgattca
cagaagaagttaaatggattttctccagatcaaaagtttccgcaagctgaatttgctcct
tatcataatatcagctatgaatggaatccaattggttctggtattatgtggaaatcttac
agttttcccgtgtttctactcacagaaagtggcacaaatactcttaaaaagtttgtatta
aagagtgagaacaaaaagaaagcgtatacttctaatgtggccgagtttgatctggtgatg
cagacaatgaaatctggaacacatgattcagagtcttgtttaaaagaaggaacttgcctc
cctttaggtggatacagtgtttggtcgtctcttcccccaatcaacatttcatcctcgaaa
ccgcctaagcccattatattgacagtagcctctatggattcttcttcctttttccgggac
ataagcctcggtgcagattcccctatttctggtttaattgcattactggcagcagctgat
gcgctttctcgtttggatggccttggtgaacttagtaagcagcttgtttttgtagttttc
actggagaggcatggggttatcttggaagtaggagatttttggtagaacttgacgagcac
tcagatgctgtccatggccttaatcactcattaattgaaaaggtccttgaaattggttct
gttgggaagggtctcagtcaaggtcaaggtcaaggtgctaaaaacttttttgctcatgct
gaaggggattcttctgccacagatcagattatggttgccctgaaacatgcacaagaatca
ctgctatctgaagacatacggatcacatctgcaagtgcctcaaatcctgggatacctcca
tcatctttaatgacctttttaaataagaatcctggaatctctggtgtcgtgttagaagat
tttgactcttcctttgtcaacaagttctaccatagttatcttgatgatttatcaaatgtg
aactcatcggctgtagttgctgctgcttctcttgttgctcgaaccctttacatacttgct
agtgaaactaatgatgtacaaaattcaactttggctgctataaatgtaaatgtcacactt
gttgaacaacttatggattgcttgttggactgtgatcccggtctttcatgtgagttggtg
aagaaatatatttcacccgcttcaacctgtgcgagcaattatgtcggtgttatcttggat
gaaccttcatccacaccttatctaggatacattaatgatgttcctaggttcatctggaat
tttcttgccgacataacttctatcccaaaggagaataatagctcaagttgtcaaaagggt
tgcaacggtagagatgaagtttgcattaaagcggagactgatggaaagggtgtttgcgct
ctctctacaactaggtatgttccagcatattcaacacggttaaaatttgactccggagta
tggagtgttttgccccctaattcctctgacaaaatgggggttgtagacccagtctggaca
gaaagcaactggaatacaataggcattcgggtctacacagtccaaattgctgcatatgat
cgggttgttctgtttgggggaattgctcttacaatcttggcataccttgcaataacagtt
acaagaactttcgttgctaaagcgacaaagagggattga
DBGET
integrated database retrieval system
