Thalassiosira pseudonana: THAPSDRAFT_bd997
Help
Entry
THAPSDRAFT_bd997 CDS
T01078
Symbol
RPOC
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
tps
Thalassiosira pseudonana
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7447374
NCBI-ProteinID:
XP_002297514
JGI:
bd997
UniProt:
B8LEQ1
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
696 aa
AA seq
DB search
MIRSEKEFDYIKIKLASPMRILQWSHRKLPNGQFVGEVQKSETINYRTFKPEMDGLFCER
IFGPSKSLECACGKYKRVRYEELTESRVRRHRMGHINLIYPVTHVWYTNSRPNYIALLLE
VEQCEKRLDTGWTEFADLRDIKEKDNKDIPEYPSSEIECRNYLASPKAILNCKEFLKEKS
KAKKSNIVNFYDERIKRIKLASLAYFIAEDEIAFYGLHWDLQQYRRCRELGFTGYPLKPH
SKSRNRRRNTPKYLLRSTPNYLIEKLNLDQEIIKTRNFIMLCSKVLHKEQPFYNFSHWSR
KWEYQRIYKLRDQSIKRIRILENLLTTGANPAWMIITILPVIPPALRPMIQLEGGRFATS
DLNELYRRIITRNNRLLRLLEIDAPQLIILDTLIDNGKRGKIALSASNRPLKSLSDIIKG
KHGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLKLNQCGLPYEMAIELFQPFIIPSNMKVAKNLL
QQNEPIINPVLEKVLANHPIFLNRAPTLHRLGIQAFQPIIVQGRAIKLHPLVCSAFNADF
DGDQMAVHVPLSLEAQAECYMLMLAPYNFLSPANGEPIIMPSQDMVLGCYYLTVNNINGL
LGSNHYFADLNDVILAYNQDQIEIHTSIWVRYKHKISKPSNFIKKIILNDKSYIEYYENI
QIRKDENDQIIVQYLQTTTGRVLLNYIIQTTLNLKP
NT seq
2091 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacgctctgaaaaagaatttgattatatcaaaataaaattagcttctcccatgaga
atcctacaatggtctcatcgaaagttacctaatgggcaatttgttggagaagttcaaaaa
tctgagacaatcaattaccgaacatttaaaccagaaatggatggtttattttgtgaaaga
atttttggtccaagtaaaagcttagaatgtgcatgtggaaaatataaacgagtacgatat
gaagaattaacagaatctagagttcggcgtcatagaatgggacatataaatttaatatat
cctgttactcatgtttggtatactaatagtcggccaaactatatcgctttattattggaa
gtagagcaatgtgaaaaaagattagatacaggatggacagaatttgcagatctacgagat
attaaagaaaaagataataaagatataccggaatatccatcttctgaaattgaatgtcgt
aattacctggctagtccgaaagccattttaaattgcaaagaatttttgaaagaaaaatcc
aaggcaaaaaaatcgaatattgttaatttctatgatgaacggatcaaacgtataaaatta
gcttcacttgcctatttcattgcagaagatgaaatcgctttttacggacttcattgggat
ttacaacaatatcgccgttgtcgagagttaggatttacaggttatcctttaaaaccacat
tcaaaatctcggaatagacgtcgaaatactcctaaatatttattacgatcaacgccaaac
tatttaattgaaaaattaaatcttgatcaagaaataattaaaacaagaaattttattatg
ctctgcagtaaggttttacataaagagcaacctttttataatttttcacattggtcacgt
aaatgggaataccaacgaatttataaactaagagaccaatcaattaaacgcattcgtatt
ctagaaaatttattaactactggggcaaacccagcttggatgattataactatattacca
gttataccacccgcattacgacctatgattcaattagaaggaggacgtttcgcaacttct
gatttaaatgaattatatagaagaataattacacgaaataatcgccttcttcgattatta
gaaattgatgctccacaattaattattcttgatactttaattgataatggaaaacgtggg
aaaattgctttaagtgcaagtaatagacccttaaaatcattatctgatattataaaaggt
aaacatggtcgatttagacaaaatttacttggaaaacgcgtagattactcaggccgatct
gtaattgtagttggtcccagtttaaaactaaatcaatgtggtttaccctatgaaatggca
attgaattgtttcaaccatttataattcctagtaatatgaaagttgcaaaaaacttattg
cagcaaaatgaaccaattataaatccggtacttgaaaaagttttagcgaaccatccaatt
tttttaaatagagcaccaacattacaccgcttaggaatccaggccttccaaccaattatt
gtacaaggccgtgcaattaaacttcatcctttagtttgttctgcatttaatgctgatttt
gatggcgatcaaatggctgttcatgttcccctttcgttggaggcacaagcagaatgttat
atgttaatgttagcaccatataattttttatcaccagcaaatggtgagccaattattatg
cctagtcaagatatggtattaggttgttattatttaacggtaaataatattaatgggtta
ttaggctcaaatcattattttgctgatttaaatgatgttattttagcatataatcaagat
caaattgaaattcatacctctatttgggttcgttataaacataaaatttctaaaccttca
aactttataaaaaaaattatattaaacgataaaagttatattgaatactatgaaaacatt
caaatccgtaaagatgaaaatgatcaaattattgttcaatatttacaaactacaactgga
cgcgtgttattaaattatatcattcaaacaacgttaaatcttaaaccataa
DBGET
integrated database retrieval system
