KEGG   Thalassotalea psychrophila: RGQ13_00040
Entry
RGQ13_00040       CDS       T10151                                 
Name
(GenBank) transglycosylase SLT domain-containing protein
  KO
K08309  peptidoglycan lytic transglycosylase [EC:4.2.2.29]
Organism
tpsy  Thalassotalea psychrophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tpsy00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:tpsy01011]
    RGQ13_00040
Enzymes [BR:tpsy01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.2  Acting on polysaccharides
    4.2.2.29  peptidoglycan lytic transglycosylase
     RGQ13_00040
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:tpsy01011]
 Peptidoglycan biosynthesis and degradation
  Lytic transglycosylase
   RGQ13_00040
SSDB
Motif
Pfam: SLT SLT_L Cucumo_coat TPR_6 TPR_19 DUF6586 TPR_16 TPR_8
Other DBs
NCBI-ProteinID: WNC72406
LinkDB
Position
9919..11793
AA seq 624 aa
MSMLLVVVAKADELDSLRADFLQAEAVKWNINSTPYKNKLKQFDGYPLQDYFQLAQLKKN
LLMKNEPQISEFLNLYNSTPLDWSLRKLWLSHLIRYKYKARFIKYYKPSSNKQFTCNYYQ
FQLDTGVNKGTVLPNITELWLTGESLPKECDRLFSLWTKKGYRTNELIWQRVMLAQKNRK
YGLVKYLLKLLPQKEQYLVELWKKIKRSSKQVVQLQKFKRNNEQETLVIVYGLKRLIWKD
EVLALSVFEKADKQGRFNREQKESILNTLVTAVARSDDPKAQLWFANLEREYIHSGAIQW
RVAALLRNGNYSDLTTELKQLNEEQQADRQWLYWLARAFEKTKQTDKAQQIYKQLATIRS
YYGFLAAAKIGDKSLLNHQPINIPGHLNDSISSVKAGQRAMELYRLNRLTEARREWNFWM
TQLDETEQMLAAKWAHQQGWYDRGIYSLSQIGSLNDMDVRFPMPFQNEFSKAAKRHNVNE
AWAYAIARKESIFMSDATSSVGALGLMQVKPITANYINKSKLKRWQILDPDTNIELGIKY
LSYLQKKFNNNIVLATVAYNAGPKKVYRWLKAEPSLPVDAWIETIPYKETREYVKSVLAF
TEIYQQKQGSGESPFIELIDMEIE
NT seq 1875 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtatgctcttggtcgtagttgctaaagcagatgaacttgatagccttagagccgac
tttctacaagctgaagctgttaaatggaatatcaattccacaccatacaaaaataagctt
aaacaatttgatggttatcccttacaagattattttcaattagcgcaattgaagaaaaac
ttattaatgaaaaatgaaccacaaatttcagaatttttaaatttatataacagcacgcca
ttagattggagcttacgcaaactatggctatcgcatttaatcagatataaatacaaagca
cgctttataaaatattataagccaagcagtaataaacaatttacctgtaactattatcag
tttcaattagatacgggggttaataaaggcacagtattaccaaatattactgaactttgg
ttaactggtgagtcattgccaaaagagtgtgacagactattctcactctggactaagaaa
ggctatcgaacaaatgagctaatctggcagcgagttatgttagctcaaaaaaatagaaaa
tatggcttagtaaaatatttattaaagctactaccacaaaaagagcagtacctagtcgag
ttgtggaaaaaaattaagcgatcgtccaagcaagtagtgcaactacaaaaatttaaacgt
aataacgaacaagaaactctggtcattgtttatggtttaaaacgtcttatatggaaagat
gaagtgttagcactatctgtatttgaaaaggcagataagcaagggcgatttaacagagaa
caaaaggaaagtattttaaataccttggttacagctgtagctcgttcggatgaccctaaa
gcgcaattatggtttgctaacttagagcgagagtatattcatagtggagctatccaatgg
cgtgtagcagcactattacgtaatggaaactatagtgatttaaccacagagctcaaacaa
ttaaacgaagaacagcaggctgatagacaatggttgtattggctggctagagcgtttgag
aaaactaaacaaacagataaagctcaacaaatatataagcagctagccactatacgtagc
tattatggttttttggcagcagcaaaaattggtgataaatctttattaaatcatcaacct
attaatatccccgggcatcttaatgatagtataagtagcgttaaagccggacaaagagct
atggaactataccggttgaatcgtctaaccgaagcaagacgggagtggaatttctggatg
actcagttagacgaaaccgaacaaatgctagccgccaaatgggcgcatcagcaaggttgg
tatgatcgtggaatttattcactgtcacaaattggttcattaaacgatatggatgttaga
tttccaatgccatttcaaaatgaattttctaaagcagctaaaaggcataatgttaacgag
gcatgggcctatgcaattgctcgtaaagaaagtatttttatgagtgatgctacatcctct
gttggggcattaggcttgatgcaagttaaaccaattacagcaaattacatcaataaatct
aagttgaagcgttggcaaatacttgatccagataccaatattgaactagggattaaatat
ttaagttacttacagaaaaagtttaataataacatcgtacttgccacggtggcttataat
gccggacctaaaaaggtttatcgctggcttaaagcagaaccaagtttacccgttgatgct
tggatcgagacaattccttataaagaaactcgcgagtatgttaaaagcgttttagcgttt
actgaaatttatcagcaaaagcagggcagtggcgagtcgccattcatagagctaattgat
atggagattgaatag

DBGET integrated database retrieval system