Thalassotalea psychrophila: RGQ13_04060
Help
Entry
RGQ13_04060 CDS
T10151
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
tpsy Thalassotalea psychrophila
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tpsy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
tpsy02000
]
RGQ13_04060
Transporters [BR:
tpsy02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RGQ13_04060
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DUF7167
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC74267
UniProt:
A0ABY9U0L6
LinkDB
All DBs
Position
966228..968780
Genome browser
AA seq
850 aa
AA seq
DB search
MALVGTSAYAAEEGEAIAEENIEQIVVVGSRAAPRSVADSAVPIDVVGGDELGKSGATDM
LDMLASAVPSFAARAQPISDAASLIRPVNLRGLPSDSTLVLVNGKRRHRASVIAFQGGGV
NDGAQGPDISVIPSVALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIAGVMNFVLKDDADGGSISVKTGEF
SEGDGAATIIDGNVGLPFTDDGFVNISFQLKNADATSRSIQRPDAQGLIDAGNTDVISPA
QIWGNPEIEDDITIFANVGLDLGDDKEFYMFGNYSERDVTGGFYYRNPHSRGNVYSIDEG
ETLLVGDVGLAETGVPSCSFSNATAAVPLAPSNVPANVGNVLNTQPYMDMIADPNCFSMN
QVRPGGYTPAFGGNITDTSLTIGTKGDIKSGFLTDWMYDLSGSVGRNESSFNLSNTLNPS
LGLSTPTTFETGKYIQLEKTFNADLVRGIDIGLYEDLNFAAGIEWREESFEIVAGEESSW
KAGPYADQGFNIGSHGFKGFGPETAGTNVRRNIAAYVDVEAYITESLMLGAAVRHEDFNT
FGTTTDYKLTAQFALTDDLSLRASHSTGFRAPTVGQANVVNTQTSIVEGNLIQTFLAPAT
DPLAAFYGASELTPEESTSFAGGMVYQNGDFFLTVDAYSIEVTDRLAQSSQVDVLAEDYD
DLRLLGVQNPELISGVTFFTNDFDTTTSGLDIVSNYSMSLFGGETGLAMAYNFNQTEVDS
FNPDTTSDGKVRRLEEGMPEHRGTFTVSQSWDSMSMFLRANYFGEYWAVHADDTSDWGAE
TADSAVTFDAEASYFLNDSITLTAGANNILDQEAQELKPGTKGAVGGVYYESGPFDYNGA
YYYVKATYSF
NT seq
2553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttagtaggtacgtctgcatatgcagccgaagaaggcgaagcaatagccgaagaa
aacattgagcaaatcgttgtagtaggtagccgtgcggcacctcgttctgtagctgattca
gctgtaccaattgatgttgttggtggcgatgaattaggtaaatctggcgctactgacatg
ttagatatgttagcaagtgcggtaccttcatttgctgcacgtgctcaacctatctctgat
gcagcatcacttatccgcccagttaacctgcgtggtttgccatcagattcaactcttgta
cttgttaacggcaaacgtcgtcaccgtgcatctgtaattgccttccaaggtggtggtgtt
aacgatggtgcacaaggtccagatatctctgtaattccttctgttgcattgaagcaagta
gaagtacttcgtgacggtgctgctgcacaatatggttcagatgctattgctggtgtaatg
aactttgttttaaaagatgatgcagacggtggttctatctctgttaaaacaggtgaattt
tctgaaggcgatggcgcggcaactattatagacggtaacgttggtttaccatttaccgat
gatggttttgttaacattagtttccaattgaaaaatgctgatgcgacaagccgaagtata
cagcgtccagacgctcaaggtttaattgatgctggtaacacagatgtaattagccctgca
caaatttggggtaatcctgaaattgaagacgatattactatttttgcgaatgttggctta
gatttaggcgatgacaaagaattttacatgtttggtaattactctgagcgtgatgtaacc
ggtggtttctactatcgtaacccacactctcgcggtaacgtatactcaatcgatgaaggt
gaaacgttattagtcggtgatgttggtttagctgaaacaggtgttccaagttgttcattt
tcaaatgcaacagccgctgtaccacttgcaccttcgaatgttccagctaacgtaggaaat
gtacttaatacgcagccatatatggatatgattgccgatccgaactgtttctcgatgaac
caagttagaccaggtggttacacccctgcgtttggtggtaatattactgatacctcatta
actatcggtactaaaggtgatattaaatctggtttcctaaccgattggatgtacgattta
agcggctcggttggtcgtaacgaatcatcatttaatttatcaaacacattaaacccatct
ttaggtttaagtactccaacaacgtttgaaacaggtaagtacattcaattagaaaaaacc
tttaatgccgatttagttcgtggtatcgatattggtttatatgaagatttaaactttgct
gctggtattgaatggcgtgaagaatcttttgaaatcgtagccggtgaagaatcatcatgg
aaagcaggtccttatgctgaccaaggttttaacattggttcacatggtttcaaaggcttt
ggtccagaaactgcaggcacaaacgtacgacgtaatattgcagcttatgttgatgttgaa
gcatacattactgaaagcttaatgttaggtgcagctgtgcgtcatgaagatttcaacacc
tttggtacgactactgattacaaattaactgcacaatttgcactaactgatgatttatca
ttacgtgcttcacacagtactggtttccgtgctcctacagttggtcaagcaaacgttgta
aatacgcaaacatcaattgtagagggtaacttaattcaaacatttttagcgccagctact
gatccgcttgctgcgttttacggtgctagtgaattaacacctgaagaatcgaccagtttt
gctggtggtatggtttatcaaaatggcgatttcttcttaacggttgatgcttactcaatt
gaagtaactgatcgtttagcacaatcaagccaagttgatgtgttagcagaagattatgat
gacttaagattacttggtgtacaaaatcctgaattaatttctggtgttacttttttcact
aatgattttgatacaacaacttctggtttagatatcgtgtcaaactattcaatgtcatta
tttggcggcgaaactggtttagcaatggcgtacaacttcaaccaaactgaagttgactca
ttcaatcctgatacaacgtctgatggtaaagttcgtcgtttagaagaaggtatgccagag
caccgtggtacgttcacagtatctcaatcttgggattcaatgagcatgttcttacgtgct
aactactttggtgagtactgggctgttcatgctgatgatacatcagactggggtgctgaa
actgcagactctgctgtaacgtttgatgcagaagcaagttacttccttaacgacagcatt
accttaactgctggtgctaacaacattcttgatcaagaagctcaagagctgaagcctggt
actaaaggtgctgttggtggtgtttattacgaaagtggtccatttgattacaatggtgct
tactactacgtaaaagcaacatacagcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system