Thalassotalea psychrophila: RGQ13_19630
Help
Entry
RGQ13_19630 CDS
T10151
Name
(GenBank) alpha-amylase family glycosyl hydrolase
Organism
tpsy Thalassotalea psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC72304
LinkDB
All DBs
Position
complement(4706279..4708048)
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MNIIKTTFLGFCALTLSACDSANKQTTQVETQIKTAKISAELPHYLERDIRDEIFYFVMP
DRFNNGDSSNDNGSATILESQGGFDPTSNGHYHGGDIIGLKEKLPYLQNMGITAIWMTPI
MRNQAVQGDSSGYHGYWVLDFTEIDPHLGSNQDLKDLIDAAHALNMKVFFDIIANHSADV
IKFKECHGEDGKQWLGAKPGLCDYKTLEQVANGDEYSVFIPEGSENIKTPQWLNDPKYYN
NQGDSTWEGESAIYGDFAGLDDIDTANPEVISGLIEVFKGVVSEFKPDGFRIDTVKHVNM
EFWTEFSPAIVEHAKSLGIPQFFMFGEVYDFTPEFLSTFTTTGKMQSILDFALQGAIAKA
LVEHEGTDQLEALFNGDHYYQDEDSDASMLVTFTGNHDMGRFAHILDRENPDMSEAEKLA
RVKLSNALMYFSRGIPVVYYGDEQGFVGDGNDKNSRQDMMPSKVDIYNDDDLLGTDATTA
DANFDQSHVLYQDLVSLGNLYQAHEALRHGKQEQVYSQQTPGLYAFTRTDENGQYLIVAN
TATTDQSQTMTLSYKGFEPVVLAKDKDEQDGVVTINLAPLSYAIYKAYK
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataataaaaaccacatttttagggttttgtgccttaacgttaagtgcttgtgat
tctgcaaataagcaaacgacgcaagttgaaactcagataaaaacagcaaaaatcagtgcc
gaactaccacattatttagaacgcgacatccgtgatgaaattttttattttgttatgcct
gaccgttttaataatggtgatagcagtaatgataatggctcggccactattttagagtcg
caaggtggctttgatccaacaagcaacggtcattatcatggcggtgatattatcggctta
aaagaaaagctgccgtatttacaaaacatgggtattactgcaatttggatgacgccaata
atgcgtaaccaagcagtgcagggcgacagctctggttatcatggctactgggttctagat
tttaccgaaatcgacccacatttaggctctaatcaagacttgaaagatttaattgatgca
gcacatgcacttaatatgaaggtgttttttgacattattgccaatcacagtgccgatgtt
attaagtttaaagagtgtcatggtgaagacggtaaacaatggcttggtgcaaagcctggg
ttatgtgattacaaaaccttagagcaagtagcgaacggtgatgaatattcggtatttatc
cccgagggcagtgaaaacattaaaacgccgcagtggttaaatgaccctaagtattacaac
aaccaaggcgacagtacttgggaaggtgaaagcgctatttacggtgattttgctggcctt
gatgatattgatactgcaaacccagaagtgatctctggtttaattgaggtgttcaaaggc
gtggtgtctgaatttaaacctgacggctttaggattgatacggttaaacatgtgaatatg
gagttttggacagagttttctcctgccattgttgaacatgctaaatcattgggtattcca
cagttctttatgtttggtgaagtctacgattttaccccagaatttctaagcacatttacc
actactggcaagatgcaatcaattttagattttgccctgcaaggcgctatcgctaaggcg
ttggttgaacatgaaggcactgatcaattagaagccctttttaacggtgatcattattat
caagatgaagacagtgatgctagcatgctggttacctttactggtaatcatgatatgggc
cgctttgctcacattcttgatagagaaaatcctgatatgagcgaagctgaaaaactggca
cgagtgaaattgtctaatgcgttaatgtatttttctcgaggtattccagtggtttattat
ggcgacgaacaaggctttgtcggtgacggtaatgataaaaattcacgccaagatatgatg
ccttcaaaggtcgatatttataatgatgatgacttacttggtacagatgcgacaacggct
gatgccaactttgaccaaagccatgtgctttatcaagatttggtaagtttggggaattta
taccaagcgcatgaagcccttcgtcatggtaagcaagagcaagtatactcgcagcaaacc
cctggactttatgcctttactcgcactgatgaaaatggccaatacttaattgttgcaaat
acggcaacgacagatcaaagccaaaccatgacactttcatacaaaggttttgaaccagtt
gtattagcgaaagataaagacgaacaagacggggtcgtaaccattaatttagctcctttg
agctacgccatttataaagcatataaatag
DBGET
integrated database retrieval system