Thalassotalea psychrophila: RGQ13_19965
Help
Entry
RGQ13_19965 CDS
T10151
Name
(GenBank) integron integrase
Organism
tpsy Thalassotalea psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_integrase
Phage_int_SAM_4
Phage_int_SAM_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNC72369
LinkDB
All DBs
Position
4772913..4773878
Genome browser
AA seq
321 aa
AA seq
DB search
MKSEFLKAVSKHMWTRRYAKKTIEAYLYWIKAFIIYNGKRHPKEMHNVETENFLSYLANE
RNVAPKTQAIALNALVFLYKNVLNKPLNLEMTFNRSTNQTKLPTVLTRKETVSFFHAINP
KYSLACQLMYGSGLRLMELIRLRTQDIDFDYFSVQVWNGKVGKHRRATLAKELVRPLKRQ
IEAVKLKHELDCQNSSYAGVWLPHALSRKFPNASKQFSWQFLFPSSRLSSDPENGAMRRH
HIDPTCVQKAVRTAALKADFDKRVTCHTLRHSFATHLLERGADIRTVQEQLGHSDVRTTQ
IYTHVIERGANGVLSPLSDLM
NT seq
966 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatctgaatttttaaaagctgtgtccaagcacatgtggactcgtcgatacgccaag
aaaaccattgaagcatatttatattggatcaaagcctttattatttataacggtaagcgc
caccccaaagagatgcataatgttgaaactgaaaatttcctttcttatttagctaacgaa
cgcaatgtagctcctaaaactcaagccatagctcttaatgctttagtgtttctttataaa
aacgttttaaataaacctttaaacctagagatgacttttaatcgcagcactaatcaaaca
aagctacctactgtattaactagaaaagaaacggttagcttttttcatgcaataaacccc
aagtattctcttgcttgccaattaatgtatggcagtggattacgcttaatggagcttatt
cgattaagaactcaagatattgattttgactatttttcagtgcaagtttggaatggtaaa
gtcggaaaacatagaagagcaactttagctaaagaattggttaggccacttaaaaggcaa
attgaagctgttaaattaaagcatgaattagattgtcaaaactctagctatgccggtgtt
tggttgccacatgctctatctcgtaaatttcccaatgcaagtaaacaatttagttggcaa
tttttattcccttctagcaggttaagctcagatcctgagaatggtgcaatgcgccgtcac
cacatagatccaacctgcgtacaaaaagcagtaagaactgccgcattaaaagcagacttt
gataaacgagtaacgtgccacactttaaggcactcttttgcaacacatttacttgaaaga
ggggctgacattcgtacagtacaagaacaattaggacatagtgacgtacgtaccacacaa
atttacactcatgttattgagcggggagcaaacggggtccttagtccgctttccgattta
atgtga
DBGET
integrated database retrieval system