Treponema rectale: DYE49_03955
Help
Entry
DYE49_03955 CDS
T06877
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
trc
Treponema rectale
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Flg_new
DUF3106
Yip1
MFS_1
DcuC
DUF1841
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOS39659
UniProt:
A0A7M1XJ38
LinkDB
All DBs
Position
896173..901725
Genome browser
AA seq
1850 aa
AA seq
DB search
MKKTMLKVLALSMFVLCGGVIGAKPNQVFPIAVKRASTTVTLGHLNANNGGSTIFASGSD
GQYLTWTKPTTVEQKIVAWNVAKDGLVRFDVAVPASERALTKKKFVMFNNINTNPAGLWS
FHMYADGVDGTLQSQVQELTLTTKVYKVYSTLKFEYNAASQVSFVIKNISGKAQTLTLIP
NMYFYMSSSDISDYVTYIPLNKNGGSGGPDSVAAASSSSASEVTPYKIGVPTRTGYTFLG
YYDGNTKYFDANGNPTITAWPSPLPSSLTAKWEQKYTITLNADGGSGGTASVSASYNENM
PSITKPSKTGYTFNGYYTEKNGKGTKYYNSDGTSAKKWDKNANTTLYAYWTANTYTVTYN
ANGGTGGTTSATATYGQAMPGITKPTRTGYDFAGYYDSKSGGTEYYNESGSSSRSFNKTS
NTTLYARWNAKIYNNIYLDAQGGSGHTQKIMTTYDAAMPSGIVLPVRDGYVFCGYYSGTD
GTGTKYYNADGTSARTWNIDKDKTTLYAYWSYNSEIQSVVDKIKAIKGPSSVTYPGSKQA
ILDAEAAYAELIASHPEYATIISDEHDELVQDRETYDTQRQDAINNVNTLIGNMLDDQGH
IIVTYPDSHDDLYGAENALDALDEEDMTSEIIPNMDKLEDCRDEYNAQAATKIIAVEEAI
HNIYRDEQGKLVYGESKKSLLVAEELYNALAPEEKYPTNKVRNYADLVQAREEYNLLIQG
RASEVIYAINNIDKPFGEHYKEQIEIAKDLFDDLDEDEQSSYYVTNLSILEDAMAADKVV
DMILALQNYESYSDKEAFVKAVDDAMNAYLSLTTSQKDYLNESQKAILFSMDDANSVIKG
IDKLGDVTYDHGVEDSKGGIEYYQGLYDALGDEYKSVVDHFNKDVLDHDALVYNHVDEVA
NLIRAIPQASESDEYYDAVDAAKDAYDNLTQEEKAIIDAATDMDYEKYLLDHVAARDVIE
RIQDIMEVNYDNGDLDSLEDIEYADQGYNNLTDDQKAIVDAVNHNTLVTDREMYDHVDEV
ADMIRSLTPAESDEYYDAVDAAKAAYEALSDKEKHILEFALDMDYIKTLNDHVESKEVIK
MIEEIGNVTFDSGNNDSLKAISDAKDAYDDLSSDQKAIVDTVNSATLFEDKENYDAVAET
ALLIKAIPEASESQAYYDAVDAAKASYDSLSEEQKAILDAAIDFDYDKHLEDQVAAKDVI
KRIDDIDEVTYAGGENDSADAIAYALEGYEALSDEQKAIVDAVNHDTLVEDKKAYDAVDQ
VADLIRDLTPAESEEYYSALEEAKKAYDALDEKEKAILDAALDQDYEKDLADQLEAKEVI
KLIEEIGKVTYDGGQEDSLKAINDAEDAYALLTDDQKAIVDEVNHDTLVEDRETYDEVDK
TVKLIEEIGEVSYGGEEDSKEAIDAAREAYDSLDEEEKELVKGHKESYKALDDSEHVYEA
LEKIESIGEVEYDTLSEETIAEAREVYDSLSEDQKAKLGENPFGTLTAAENKFAEMKHSA
NVTVTIFLILSSLTLVGGLVMLFLLLFKRNDEEEEKKKENSPKSVKTYSFLGFLPILALT
SHYVDSPFMALYIISGLAIFVWIAVLVLFLLKKNHKLPVLAMPNFKLPFKPKAVMKKDKE
ENKSDYVENDTLVTSTSSISPAPSTIGIADPSILIDGPIAIQPKKKTKKVEVVKKNEDED
VIIVKDEKGDLIQIRYIKSFLAKLSQASAELKDYYNELKNYVLSFEKVNSRVSFYYDAIN
NGRNPILRFAIRGKTLCLFMATSVEKYEGSKYKVEKTKNSRFKDYECLYRIKNERRMRYA
KDLILDIMKSLNLSKTKDYHSEYRIPYEDNARLLAKGLIKERKVKIKVKK
NT seq
5553 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaacaatgctgaaagttttggctttatccatgtttgttttatgtggtggggtg
ataggtgctaaaccaaatcaagtatttcctatagcggtcaaacgcgcatcgactactgtg
actttaggacatctcaatgccaacaatggtggcagtactatctttgctagcggttctgat
ggccaatatctgacctggaccaaaccgactacggtagaacaaaaaatcgtggcctggaat
gtagccaaagatggtttggtcagatttgatgtcgctgttccagcctccgaaagagccctg
acaaagaaaaagtttgtcatgttcaacaatatcaacacgaatcctgcaggtctctggagt
ttccatatgtatgccgatggtgtagatggaaccctccaaagccaagtccaagaactcacg
cttactaccaaggtctataaggtttattctaccctcaaatttgaatacaatgcggcaagc
caagtctcctttgtcatcaaaaacatcagcggaaaagctcagaccttgactctcattccc
aatatgtacttttacatgagcagtagtgatatctccgattatgtcacttacatccctttg
aataaaaatggcggcagtggtggaccagatagtgttgctgctgcttcgtcaagtagtgca
tcggaagttaccccatataagattggtgttccgacaagaaccggttatacttttttaggt
tattatgatggtaacacgaaatattttgatgcaaatggtaacccgactataaccgcttgg
ccaagtcctcttccttctagtttaaccgccaagtgggaacaaaaatataccattacgctc
aacgcggatggtggcagtggtggtactgcttctgtctctgccagttataacgaaaacatg
ccatctatcactaagcctagcaagactggttataccttcaatggttactatactgaaaag
aatggtaaaggtactaaatactacaattctgatggcacttctgcaaaaaaatgggataag
aatgccaatacgactctttacgcttactggacagcaaatacctataccgtaacctataac
gccaatggcggaacaggtggaacaactagcgctactgctacttatggtcaagcgatgcca
ggtattaccaagccgacaagaaccggttatgattttgctggttattatgatagtaaaagt
ggaggaacggagtactataacgaaagtggcagttcttcaaggtccttcaacaagacaagt
aataccaccctttatgctagatggaacgctaagatttataataacatctatctagacgcc
cagggcggaagtggacatactcaaaagattatgaccacctatgatgctgcgatgcctagt
ggcattgtcttacctgtgagagatggttatgtgttctgcggatattattctggtacagat
ggtacaggaacaaaatattacaatgccgatggtacatcggctagaacctggaatatcgat
aaggataagaccactttatacgcctattggtcctataattctgaaattcagtctgtcgtc
gataagatcaaggcaatcaaaggaccatcaagtgttacctatccaggctccaaacaagct
attttggatgcggaagcagcttatgctgaacttattgcatctcatcctgagtatgccaca
atcatttctgatgaacatgatgaattagtccaggatagagaaacctatgatactcaaaga
caagatgctatcaataacgtcaacaccttgattggcaatatgcttgatgatcaaggtcat
atcattgtcacctatcctgatagccacgatgatctttatggtgcggaaaatgccctcgat
gctttagatgaagaagatatgacaagtgaaattatccctaacatggataaacttgaagat
tgtcgagatgaatataacgcccaggctgctactaaaattatcgctgtagaagaagcaatc
cataacatctacagagatgaacaaggtaaacttgtctatggcgaaagtaaaaaatctctt
ttagtggctgaagaactctataatgctttagcccccgaagaaaaatacccaacgaataaa
gtcagaaactatgctgatttagtccaggcaagagaagaatacaatcttctaattcagggt
agagcaagtgaagtcatctacgccatcaacaacatcgataagccatttggtgagcattac
aaagaacagatcgagattgccaaagacctctttgatgatcttgacgaagatgaacagtcc
tcttattatgttactaacttatcgattcttgaggatgctatggctgccgataaagtcgtt
gatatgattttggctttgcagaattatgaatcctattctgataaagaggcttttgtcaaa
gcggttgatgatgctatgaacgcttatctttctttgacgacgagtcagaaagattatcta
aacgaatcccaaaaagccattttattctccatggatgatgccaatagtgtcatcaagggt
attgataagctaggggatgtgacttatgaccatggtgtcgaagattctaaaggcggtatt
gaatattaccaaggtttatatgatgctctaggtgatgagtataagagtgttgtagatcac
ttcaataaagatgtcttagaccatgatgctttagtctataaccatgttgatgaagtagct
aatcttatcagagctatccctcaggctagtgagtctgatgaatattatgatgccgttgat
gctgctaaagatgcttatgataatttgactcaagaagaaaaagctatcattgatgcggct
actgacatggactatgaaaagtatcttcttgaccacgtcgctgctagagatgtcattgaa
agaatccaagacatcatggaagtcaattacgataatggagatttggattccttagaagat
atcgaatatgctgatcagggttataacaacttgaccgatgaccagaaagccatcgttgat
gccgttaaccataacacccttgttacggatcgagaaatgtatgatcatgttgatgaagtt
gccgatatgatcagaagtttaactccagctgaaagtgacgaatattatgatgccgttgat
gctgctaaagccgcttatgaagctttaagtgataaagaaaagcacattcttgaatttgct
ttagacatggattacatcaagacgttaaatgaccatgttgaaagtaaagaagtcatcaag
atgattgaggaaatcggtaatgtcacttttgattccggtaacaatgattccttaaaagcc
atcagtgatgccaaagatgcctatgatgatttatcatctgatcagaaggcaattgtcgat
actgtcaactctgctaccctatttgaagataaagaaaattatgatgctgttgctgaaaca
gccttgttgattaaagccattcctgaagctagtgagtctcaagcatactatgatgccgtt
gatgctgccaaggctagttatgattctttaagcgaagaacaaaaagccattcttgatgcc
gctattgattttgattacgataagcatctagaagatcaggttgccgcgaaagatgtcatc
aagagaattgatgatattgatgaagtgacttatgctggtggtgaaaatgattctgctgat
gccattgcttatgcattagaaggatatgaagccttaagtgatgagcagaaagcgattgtt
gatgctgtcaatcatgatacccttgttgaagataagaaagcttatgatgcggttgaccag
gttgctgatttaattagagatttgactccagcagaaagtgaagaatattattctgctctt
gaagaagccaagaaggcttatgatgccctagatgagaaagaaaaagccatccttgatgct
gctcttgatcaggattacgaaaaagacttagctgaccagttagaagccaaagaagtcatc
aagctcattgaagagattggcaaagtcacctatgatggtggtcaagaagactccttaaag
gccattaacgatgctgaggatgcttatgctttattgactgatgatcaaaaagccattgtc
gatgaagtcaatcacgacacccttgttgaggatagagaaacctatgatgaggtcgataag
actgtaaaactcattgaagagatcggtgaagtatcttatggcggagaagaagattccaaa
gaagccattgatgcggcaagagaagcgtatgattctttagatgaagaagaaaaagaatta
gtcaaaggtcataaggaatcctataaggccttagatgattctgaacatgtctatgaggcg
ttagagaagattgaaagtatcggtgaagtagaatatgacacccttagtgaagagacaatt
gctgaagctagagaagtctatgattctttaagcgaagaccagaaagccaaacttggtgaa
aacccatttggtacacttactgctgccgaaaacaaatttgccgagatgaaacattctgct
aatgtcactgttaccatcttcttgattctctcttctttgactttagttggtggcttagtg
atgttattccttcttcttttcaagagaaatgacgaagaagaagagaaaaagaaagaaaac
tctcctaaaagcgtaaagacatactcctttctaggctttcttccaattctagctttaact
agccattatgtcgactctccatttatggccttatatatcatctctggattagccatattt
gtctggattgctgttttggttctcttcttattaaagaagaatcataaattaccagttctg
gctatgcctaatttcaaacttccattcaagccaaaggctgtcatgaagaaagacaaagaa
gaaaataaatctgactacgttgaaaatgacactcttgttacctctacttcttctatctct
cctgctccttctacgattggtattgctgatccatccattctgattgatggtccaattgct
atccaaccaaaaaagaaaaccaagaaggtggaagtagtcaaaaagaatgaggatgaagat
gtcatcatcgttaaagatgaaaaaggagatttgatccagatcagatatatcaaatccttc
cttgcgaaactttctcaagctagtgctgaattaaaagactactacaatgaattaaagaat
tatgttctctcctttgaaaaagtaaactctcgtgtctctttctattatgacgccattaac
aatggtagaaatcctatccttcgctttgccattaggggaaagaccttgtgcttgtttatg
gctacttccgtagagaaatatgaaggtagcaaatacaaagtagaaaagacgaagaattct
cgattcaaggattatgaatgtctctatcgcatcaagaatgaacgtcgtatgagatatgct
aaggatttgattcttgatatcatgaagtctttgaatctttccaagactaaggattaccat
agcgaatatcgtattccttatgaagataatgctagattattagcaaaaggcttgatcaag
gaaagaaaagtgaagatcaaagttaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system