Trichomycterus rosablanca: 134322765 Help Entry 134322765         CDS       T09921                                  Symbol reln Name (RefSeq) reelin   KO K06249   reelin [EC:3.4.21.-] Organism trn  Trichomycterus rosablanca Pathway trn04510   Focal adhesion trn04512   ECM-receptor interaction Brite KEGG Orthology (KO) [BR:trn00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     134322765 (reln)  09140 Cellular Processes   09144 Cellular community - eukaryotes    04510 Focal adhesion     134322765 (reln) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Reelin_subrepeat-B EGF_TEN EGF_Teneurin EGF_2 Reeler EGF_Tenascin EGF_DL_JAG Motif Other DBs NCBI-GeneID:  134322765 NCBI-ProteinID:  XP_062860161 LinkDB All DBs Position 11:24895846..25256307 Genome browser AA seq 3407 aa AA seqDB search MDLGALPLGFYPRFNPFFFLCTHHGEVESFGVAEGGSEMLLTFHIAGNPTTYSPGHEYQV TISTNTYFDGLLVTGLYTSTIVQAAPIPASAAFGFGVKEQQIGAQYVCSVVASHVSTLPT TSFSFVWIAPPPGTGCVNFLATAMNHGQLIFKDTLVTQLCEQEAPTESPVWPTLAEIHGI HAVLRDDFDSNEEGELDPNIWSDCSNCRVGEQCGVLLHGKAVTFCERLGQRELISVALNT STASVLQFALGSGYCRFSYSDPSIIVSCSMNNSYDWITLEKIRAPTNSNTVVHLLPVPSS CRGIDVHLRWFQESALGPDGYESCWGLDNILLVNMAHKPTLLEDNMDPLDTANWIFFPGA TIKHACQSDGNSMYFHGGEGLGHSFASTRDIDLHNEEEQHYWQEDFESPPDGWEIEGAVY GTQCGEIKSGSALVFLENGKRKVCTPYLDTTSYGNLRFHFAMGAGECHPGESHDNDVILF GRSEGRRNHVLLETLPFSAYRVPIMVSVPLPIELQTPVTQFCLEQKFHSGPSQHVWAVDF LQLLPVLPGDYTHMAQFSINLGCGSHQPANSVSLEFSTSQGRSWSLLHMECLPELCSGQH LPHSTIYSSENLSGWTRISIPLPNAALTESTQFRWRQTEAGTGNMWAIDNVYIGSACLHF CSGRGLCSRIGCKCDPGFSGPACEIASQTFPAFLSEGFSSQRLSSYHSFSSLRGAEVSFG CGVLASGKSLVFNRDSRRHLITTPLDSSQARYLQFTLRLGSRSSTCPGPDRPGEGILLHY TSDNGINWTLLQHYSYQGFHEPRIVSVELPPSAQKFGVQFRWWQPYHSGHGKDVWALDDI SMTAVLFNSISLDFSNVLDVTQSLGFYLGLVQPYCQHDWTLSFSGETITGSSIRYVETQS MQIGASYMLQFSLIMGCGHRSSPHIDTQVRLEFSTNHGLTWHLVKEACLPGMPSCTEFTA HSVYHPSEFTSWKRITLSLPQKTWSSATRFRWIQNYFREQDEWALDDIYIGQQCPQMCHG HGWCDHGHCKCDEGFSGTDCQPSSPLPSSVLSDFELKEELMTTWQEVTGGEIVTPDLGCG VVSSGSSLYFSKAGLRQLVSWNMDTEWAEFVQFYLRVGGDWVECNRADSREEGVLLQYSN NGGISWGLIAEMYFTDFTRPRFVHYELPLAAKTPCTQFRWWQPLHSGEGYDQWAIDDVII FSDREKHVIPLANPTLPQNFYEKPAFDYPLNQMSVWLMLGNEGMDTEQNISFCAPTPSAM IFGRSDGDRMAVTRDLTLRPGYTLQFKITGCKSDFPASAPVILQYSHDYGRTWALVHEGC FPDTPGATGCEGNGRELREPSVYYTGDYEDWTRVTVVIPRNVAASKTRFRWIQESSAYQN APAFALDSIYISEPCPNHCGGHGDCISGVCFCDMGFTVLQDSCVPSVPSPTELVEGFEGK LSPLWQITSGEQTLDGCGTISKGKALYFGGLGRREARTVPLDTTHTRLVQFYIRIGGKNL GPTCTRPRGRNEGVIVQYSTNNGVKWQFLRELDFGSFMETQLVTIELPPQAKTPYTVFRW WQPQLGKHSAQWSLDDILIGMNESSRTGFHDKFDGLLPLRHNWFRIEGGEVTEDCLSLNT VLVFHSDLGDTRYAESWDFEISDSSFLQFDLNMGCSKAVNSAQGVHLEFSTDCGHQWMLL TPECVPPAIGCAGYTQSSTYSTPKYSQWRRVTVYLPSASISPKTRFRWIQPHFTPGADSW AIKNVLLATGCPWMCSGHGLCDNGHCVCDTGFGGAHCVPLAALRSFLKEDFNKNLDPEIW PEVYGAERGTLSGEPLKSGTSLIFKGEGLRMLVSQDLDCTSSQYIQFSFKFITKGVPERS HSILLQHSVNGGISWLLLNEFYSPTSTDTLFLHLPLPPSAQTNATRFRLWQPYNNGKKEE VWVIDDFIIDGSSSHKPPIISEDFEGGPLELNWIFYPGGSIRSYCPNQKAGLNDGLALVF MSSELGEHSLTTRDIDVDENTIFQFEINVGCTSESSSSHPVHLEVSRDFGITWLLLVPLC AGNPKSSSFCSTELHPPSIYYPGTTKGWRREVIHLGKLHLCGSVRFRWYQGYFSAGMAPP TWAVDNIYIGPQCPEMCNGHGTCLKGTHCECDTGYSGQDCTIQDIPNPDFLKEDFEDGVL EAKHFKILSGGKPSRKCGIMTSGHHLFFSEDGLRMLETIDMDLSNARFVQFFLRLGCGKA APDPRSQPVLLQFSINGGFSWSVLQKFYFSNSSNQVHLVSIKIPLEARTTKTCLRWWQPS EIGHFHSPWVIDKIVVGGSASGWGPLEDDFSSPDARSWLLSPGGTHMPVCGSDGEAFAFI EKSNTRFGVTTDITIGQDAVIQFDFCASCSVTSSCYAVELEYSLDLGLTWHPLRRDCLPS SPDCSSYTLQQLLMSDTYNKWGRVTLPIPPYARSPATRFRWLQRAPFDKQQTWALDNLYI GDGCPEMCTGHGQCRQNSCACDQGWGGSYCDKAVVPLLSHLKDSFSRAPSFSHWHMLTGG KPSTICGAVASGAALHFSGLCTRQLVTVDLNLTSAEFIQFYFMFGCISPPKNRNQGVLLE FSLNGGISWSLLMEIYYSQFSKPGFMNVMLPPVARAVGVQVRWWQPQHDGADSGDWALDN VLISGLDMPVRIESFGDFALPSHERAPADGAPTVHIKTVHQEESSTVSEHWLFSEDCSIQ KFCNFQDRVMVCGNVDGREVYTVTHDIVPQKNWVMNFKIVVGCSAPEKHAERQVHVQYSV DFGVSWKYLVPQCLPANPRCGGQVSQPSVFFPEEGWRRAVYPLPDSLSDTAVRFRFYQQH SDMQWALENFYIGPACENHCGGHGDCVDRHCLCDSGFSGPNCYVTLVLEEFLKERFEWQG AHGPQWQVVEGGHPCNNCGALVEGMGLYFRGANARQAITADLDLRGAKFVQYWAKIGSED NMTLCQRPNCRKEGVLLDYSTDGGVSWTLLHEMDYLKYVSVRRDYIKLPEGALTNATRLR WWQPFTMSSGLVTPNLQRAQWALDNILVGGADINPSTLFDTFDDESKSHEENWSFYPNAV RTAGFCGNPSFHLYWPNKNQDGTHNILETRELIVQPGYILQFKIVVGCVAESCEDHHSVL LQYRKDAGSDSWLLVQAACLPSTVNNVGCSPFQFHESSIYSPVNSLVWTRVTVQLPDHVS SGSTQFRWIQKDGVDEKHGWGVDHVYIGEACPGLCSGHGYCTNGAVCICDEGHTGDDCSM WSSDLPNYIKDNFESGFVSEENWSIIQGGEVGSGCGQLSPHAHGDSLYFNGCKIRQAVTK PLDLNRSSKIMFVLQIGSISQTDSCNSALDQADTVDHAVLLQYSVNNGVSWHVIAQHQPK DFIKAQRVSYNIPLEARVKGVQLRWWQPRHGGAGRDQWALDHVEIVL NT seq 10224 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggatttaggggctttgccacttggcttttatccccgttttaacccgttcttcttcctg tgcacccatcacggagaagtggagagttttggggtggctgagggagggagtgagatgcta cttacctttcacattgctggcaaccccacaacctacagcccaggacacgagtatcaggtg accatctccactaatacatattttgatggattgctggtcacaggcctttacacctccact attgtccaagcagcacccataccggcttctgctgccttcggatttggagttaaagagcaa caaattggggctcagtatgtgtgcagtgtggtagcatcacatgtcagtactctgcccaca accagtttcagctttgtgtggatcgccccaccaccagggacaggctgtgtaaactttctg gctactgccatgaatcatggacagctaatcttcaaggacactctggtcacgcagctttgt gagcaggaagcccctactgaatctccagtgtggcctactttggctgaaattcatggaatt catgcagttcttcgtgatgattttgactctaatgaggaaggagagttggatcccaatatc tggtctgactgtagtaactgtcgggtgggggaacagtgtggtgtgttgttgcatggtaaa gcagtcactttttgtgaacgtcttggacagagagagctgatttcagtggctctgaacaca agcactgcctctgtattacagtttgctcttggctctggatactgtcgttttagttattca gatcccagcataatagtctcatgtagtatgaacaactcatatgattggatcaccttggag aagatcagagcacctactaacagcaacacagtagtacacctattgccagtaccatcaagc tgcaggggaatagatgtgcacctgcggtggtttcaggagtcagcactggggcctgatggc tatgagtcttgctggggactagacaacatcctgttggtcaacatggcccacaagcccacc ctgctggaggacaacatggatcctcttgatactgccaactggatttttttccctggtgcc accataaagcacgcctgtcagtcagatggaaactctatgtattttcatggtggagaggga ctgggacatagctttgcctccacacgggacattgatcttcacaatgaagaagaacagcac tactggcaggaggactttgagagcccacctgatggctgggaaattgagggagcagtgtat ggcactcaatgtggagaaattaagtcaggctctgcactagtttttcttgaaaatggaaaa aggaaagtttgtactccctacctggacacaacttcctatggcaatcttcggttccacttt gctatgggtgctggggagtgtcatcctggggagtcacatgataacgatgttatcctgttt ggtcggtcagaaggcagaagaaaccacgtgttattagagacacttccattttcagcctac agggtccctattatggtatcagtacccctgcctatagagcttcagactcctgtaactcag ttttgtttggagcagaagtttcattctgggcccagccaacatgtttgggcagtggatttc ctgcagcttctgccagtgctgcctggtgactacacacacatggcccagttttctatcaat cttggttgtgggtcccaccagcctgctaacagtgtcagtttagaattttcaaccagtcag ggtcgttcttggtctcttcttcacatggagtgtttgcctgagctgtgttctggacaacat cttccccacagcacgatttactcatcggaaaacttaagtggatggacaaggatttctatt cctcttcccaatgctgccctcacagaaagcactcagttccgctggaggcaaacagaagct ggaactggaaatatgtgggccattgataatgtatatattggttcagcttgtctgcacttt tgctcaggaagaggactttgctcacgcattggatgcaagtgtgacccaggtttcagtggt cctgcatgtgagatagcatcgcagaccttccctgcatttttgtcagaaggtttttccagc cagaggctctcttcttatcacagcttttcctctttgcggggggctgaggtcagctttggc tgtggggttttagccagtgggaagtctttggtcttcaacagagacagcaggagacatttg atcactactccactagatagctctcaggccaggtacctgcagtttaccctgaggttaggc agtcgtagtagtacatgtcctggtccagatcggcctggagagggtatactacttcattac acctcagataacggcattaactggaccctgctgcagcattactcttaccaaggcttccat gagcccaggattgtttcagtggagcttcccccaagtgcacagaagtttggggtgcagttt cgttggtggcaaccataccactcaggccatgggaaggatgtttgggcactggatgacata agcatgacagctgtgctctttaactctattagtctggatttcagcaatgtgctggacgtc acacaaagtctgggtttctacctgggccttgtgcagccttactgtcagcatgactggact ctcagtttctctggggaaaccattactggctctagtattcgttatgtggaaactcagtca atgcagattggggcctcatacatgctgcagttctccttaataatgggctgtggtcacaga tcctccccccacattgatacacaagtacggttggagttttctaccaatcacggtctgacc tggcatttggtcaaagaggcctgtcttccaggcatgccaagctgcacagagttcactgcc cacagtgtataccatccttccgagtttacttcctggaaaaggatcactctttctctacct caaaaaacatggtccagtgccacccggtttcgatggatccaaaactacttcagagaacag gatgagtgggcattagatgatatctacatagggcaacagtgtcctcaaatgtgccatgga catggctggtgtgatcatggtcactgcaaatgtgatgaaggtttttctggcacagactgt cagccttcctccccactaccctctagtgtactctcagactttgaattaaaagaagaactt atgaccacatggcaggaggtaactggtggagagatagtgacacctgacctgggctgtggt gttgtgtcatctggatcttctttgtattttagtaaggctggactgagacagcttgtaagt tggaacatggacacagaatgggctgagtttgtccagttctacttacgtgtgggtggagac tgggtggagtgtaacagggcagacagcagggaagaaggagtgcttcttcagtatagtaac aatggtggcattagctggggcctaatcgcagagatgtacttcacagactttaccagacca cggtttgttcattatgagttgccactggctgctaaaacaccatgtacacagtttcgctgg tggcaaccccttcattccggcgagggttatgaccagtgggctattgatgatgtcatcatt ttctctgacagagaaaaacatgttattccactagctaatcctactcttcctcagaacttt tatgagaagccagcatttgattatccactaaatcaaatgagtgtctggctaatgttgggc aatgagggaatggacacagaacaaaatattagtttctgtgcccctacaccatcagccatg atatttggaagatcagatggggacaggatggcagtgactcgagaccttacccttcgccct ggctacacattgcaatttaagattactgggtgcaagtcagattttcctgcttcagctcct gtgatacttcagtattcacatgattatggtcgcacctgggcgctggtgcatgagggctgt ttcccagacacacccggggctacaggctgtgaaggcaacgggcgtgagctaagagagccg tctgtctattacacaggagactatgaggattggaccagagttactgttgtaatcccacga aatgtggctgcaagtaagacacgattccgctggatccaagaaagcagtgcttatcagaat gcccctgcatttgccttggatagcatctacatctctgagccttgtcctaatcactgtggg ggtcatggagactgcatctctggagtctgcttttgtgacatgggatttacagtattgcag gacagctgtgtgccatctgtgcccagtcccacagagctggttgaaggttttgagggcaag ttgagtcctctttggcagataactagtggagaacagactttggatggttgtggtaccata agtaaaggaaaggccctttactttggtggtcttgggcgtcgggaagctcgcactgtgccc ttggacaccactcacacacgacttgttcaattctacatcaggattggtgggaagaacttg gggcctacctgcactaggcctcgtggtcgcaatgaaggggttattgtccagtactcaaca aataatggagtgaagtggcagttccttcgagagctagactttggctcctttatggaaaca cagctggtgaccattgaattgccccctcaagcgaagacaccttacactgtgttccgctgg tggcagccccagcttggaaaacactcagcccagtggtcacttgatgacattctgattggg atgaatgagagctccagaactggcttccatgacaagttcgatggcctattacccttaagg cacaactggttcagaatagagggaggagaagtgacagaagattgtctgtccttgaacacc gtcctcgtcttccactctgatttaggagacacacgctatgcagaaagttgggactttgag atttcagactcctcatttcttcagtttgatctgaatatgggctgcagtaaggctgtgaac tcagcacagggagtgcatctggaattctccactgactgtggccaccaatggatgcttctc acacctgagtgtgtgcctccagctattggttgtgctggatatactcagagctccacctac agtactcctaagtattctcaatggaggagggtcactgtctatctgcccagtgcttcaatt tctccaaaaacaaggttccgctggattcagcctcactttactcctggagcagatagctgg gcaattaaaaatgtgctgctggcaactggctgcccctggatgtgttctggacatggcctg tgtgataatggacactgtgtgtgtgacacaggttttggtggggctcactgtgtgcccctg gctgctttgcgttcttttcttaaggaagactttaataagaacctggacccagaaatctgg cctgaggtgtatggagcagaacggggcacactaagtggagagcctcttaaatcaggcaca tcgcttatttttaagggggagggattgcgcatgctggtttcacaggatctagactgtaca agctctcagtatatccagttttcatttaagtttatcaccaaaggagttccagagcgttct cattccattttgcttcagcattcagtaaatggagggatcagctggctgcttttaaatgag ttttacagtcccacctcgactgatactttgtttctacatctgccactgccccccagtgct cagactaatgctacacggtttagactgtggcagccttacaacaatggcaaaaaggaagag gtgtgggtaattgatgattttattattgatggaagctcttcacacaaaccaccaattatt tcagaagattttgagggtgggcctctggaattaaactggattttctacccaggaggcagt attcgctcttactgtccaaaccagaaagctggactgaatgatgggttggccttggtattt atgtccagtgagctgggagagcactctctcactactagagatattgatgttgatgagaac actatcttccagtttgagatcaatgtgggttgtacatcagagagctcttcttcacaccct gtgcatctggaggtttccagggactttgggatcacttggctccttttagttcctctgtgt gcaggcaacccaaaatccagctctttctgttcaactgaacttcatcctcccagcatttac tacccagggaccacaaagggttggaggagggaggtcattcatttaggaaaactgcatctg tgtgggtcggtgcggtttcgttggtaccaggggtatttttcagctggcatggcacctccc acttgggctgttgacaacatttacattggccctcagtgcccagagatgtgcaatggccat gggacatgtttaaagggcacacattgtgagtgcgacactggttactctggccaagactgc actattcaagatataccaaatccagactttctaaaggaagactttgaagatggtgttttg gaagctaaacattttaagattttgagtggaggaaagccttccagaaagtgcggtattatg accagtggacaccacctgttctttagtgaagatggattacgcatgctggaaaccatagac atggatctttcgaatgctaggtttgtacagttctttttgcgactgggttgtggaaaagct gcccctgacccacgctctcagcctgtactgctgcagttctcaataaatggaggattttcc tggagtgttctacagaaattctattttagcaacagcagtaatcaggtgcaccttgtgtca ataaaaattccactggaagctcggaccaccaaaacatgtctacgctggtggcagccatct gaaattggacactttcacagtccttgggtaattgataagatcgtggttggtggtagtgcc agtggctggggccctctggaggatgatttctcctctccagatgcccgttcttggctgctc agccctggaggaacacacatgcctgtatgtggttctgatggtgaggcatttgctttcatt gagaaatctaacactcgctttggtgtcaccactgatattactataggtcaggatgctgtg atccagtttgacttctgtgcttcctgctctgttacctcatcctgctatgctgtggaattg gaatattctttggacctcggtctgacttggcatcctcttaggagggactgtttgcctagt agtccagactgctcctcctacacactgcagcagctattaatgtcagacacgtacaataaa tggggcagggttactctacccattccgccctatgccaggtcaccagctacacgatttcgt tggctccagcgggctccctttgataagcagcaaacctgggctttggataatctatacatt ggagatggctgtcccgaaatgtgtactggccatggtcagtgtaggcaaaattcctgtgcg tgtgaccaggggtgggggggttcttattgtgacaaggctgtagtgccccttctttcacat cttaaggacagtttcagtcgtgccccctcctttagtcactggcacatgctgactggggga aaaccaagcacaatatgtggagctgtagcttcaggtgcagccttgcacttcagtggactc tgcactcgtcagctagtaaccgtggatttgaacttgaccagtgctgagtttatacaattc tacttcatgtttggctgtatttccccccctaaaaaccgaaaccaaggtgtcttgctggag ttcagtctcaatggaggcatcagctggagtttgctgatggagatatactatagccaattt agcaagccagggtttatgaatgtgatgttgccacctgttgctcgtgcagtgggagtgcaa gtgcgctggtggcagccacagcacgatggagcagacagtggggactgggctttggacaat gtgcttatctctggcttagacatgcctgttcggattgaatcatttggtgattttgccctt cccagtcatgagagagccccagctgatggtgcaccgactgtccacattaaaacagttcac caagaggagagcagcacagtgagtgaacactggctcttctcagaggattgctctatacaa aaattttgcaacttccaagatagagtaatggtgtgtggtaatgttgatggcagagaagtg tacactgtcacacatgacattgtcccccaaaaaaattgggtcatgaattttaagattgta gttggttgcagtgcacctgaaaaacatgctgagagacaggtccatgtccagtattcagtg gactttggtgtgtcctggaagtacctagtgccccagtgccttcctgctaaccctcgttgt ggaggacaagtatcacagccatctgttttcttccctgaagaaggctggaggagagctgtc tatccactacctgacagcctttcagacacagcagttcgtttccggttctaccaacaacac tcagacatgcagtgggcattagagaacttttacattgggccggcatgtgagaaccactgt ggaggtcatggtgactgtgtggatcgacattgcctttgtgactcaggattttctggaccc aactgctatgtcacattagttctggaggaatttctgaaagagcgctttgaatggcaaggg gctcatgggcctcagtggcaagttgtggaggggggtcatccatgtaataactgtggggca ttggttgaggggatgggcctgtactttaggggagctaatgccaggcaggctatcaccgct gacctggatctacgaggagccaagtttgtgcaatactgggctaaaattggaagtgaggac aatatgactttatgtcagcgtccaaactgtcgaaaagaaggtgtattgcttgactattcc acagatggaggtgtatcatggacacttcttcatgagatggactatttaaaatatgtgtct gtaaggcgggactacattaagttgccagagggtgctttgaccaatgctactcgcctacgc tggtggcagccatttacaatgtcttcaggccttgtaacccctaatcttcagcgtgctcag tgggccttagataatatcctggtgggaggtgctgacatcaaccccagtaccctgtttgat acatttgatgatgagagtaaatctcatgaagaaaattggagtttctatccaaatgctgtg cggacagcaggtttttgtggcaatccttcgtttcatctctactggcccaacaaaaatcag gatggaacccacaacattttggaaactcgagagcttattgtccaaccaggatatatcttg caatttaagattgtggttggttgtgtagccgaaagctgtgaagatcatcattcagtgctt ttacagtatagaaaggatgctgggtcagactcatggctgttggtacaggctgcatgcctc ccttctacagtgaacaatgttggatgttcccccttccagtttcatgaatccagcatctac agcccagttaacagcttggtgtggaccagagttaccgtgcagctacctgaccatgtctct tctggttccacacaattccgttggatacaaaaagatggagttgatgagaaacatggctgg ggagtcgatcatgtatacatcggtgaagcatgtcctggtctgtgtagtggacatgggtat tgcaccaatggagcagtctgcatttgtgatgaaggacacactggtgatgattgctccatg tggagcagtgaccttcccaactatatcaaggacaactttgagtcaggttttgtatcagag gaaaactggagtataattcaaggtggagaagttggaagtggctgtggccagctttcccca cacgcccatggagattccctgtattttaatggctgcaagattaggcaggctgtcacaaaa cctctggacctaaatagatccagcaagatcatgtttgtattgcaaattggaagtatttct cagacagacagctgtaactctgctctggaccaggctgacaccgtggaccatgcagtgttg ctccagtatagtgtaaataatggagtcagttggcatgtcattgcccagcaccagcccaaa gactttatcaaggcccagagagtatcgtataacattccacttgaagcccgcgtaaaagga gtgcagttgcgatggtggcagcctcgtcatggtggtgcaggacgtgaccagtgggccctc gaccatgtagaaattgttctgtaa

DBGET integrated database retrieval system