Trichomycterus rosablanca: 134325091
Help
Entry
134325091 CDS
T09921
Symbol
fbxo30a
Name
(RefSeq) F-box only protein 30a
KO
K10307
F-box protein 30
Organism
trn
Trichomycterus rosablanca
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
trn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
trn04121
]
134325091 (fbxo30a)
Ubiquitin system [BR:
trn04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
SCF complex
Target recognizing subunit (F-box)
134325091 (fbxo30a)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
F-box_4
zf-TRAF_2
F-box
F-box-like
zf-TRAF
Lambda_CIII
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
134325091
NCBI-ProteinID:
XP_062863204
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(22077845..22083856)
Genome browser
AA seq
735 aa
AA seq
DB search
MDELHAHCQNCVNRRCMARPETGVSCDLVGCSLVCGAVFHLCKVEEHRLLCPYERVPCLN
SGFGCPFTIKRIKMAQHLKICPASVVCCTMEWNRWPVSYADRKSYENLSKEVYDVEQLDM
ALALQDQRMLLESLKVTTTVAKTVDEENEGINPSIQDVELRNGLLEIHGEAFNELYKASV
EKSRNLAAALDILSSANKGIDLIMENLSGANVDSNAACQRNGDFCMNEQIKESDTDSECE
LGAVGGVENLEDDGTEWKADLSTDEEEEMNVNINGSEQALCNGFINVGGHGHVRLEMQRE
INIGSSDIRPMLPHHSMAREQEIPPSPPLPLPHPMPLPDLVQNNVLQQLPVEIEDRWLER
KLQNLQVLRGMSMFTYNGRKTLLSNPYLLRAKMEDKAVDTSDLEVLDDPIGLHGIDLITA
ALLFCLGDSPGGRGISDSRFVDGYRIDFGTQTFSFPSAILATNTMVGDIASASACDHASP
QLSNPSPFHTLRLDLVLECVARYQTKQRSMFTFVCGQLFRRDEFSSHFKNVHGDIHAGLN
GWMEHRCPLAFYGCTFSQRRFCPSVQGSRIIHDRYLGSFGVQSGLATRPGEKLCQYGSHC
DHLSSLPFELLQHVASFLDGFTLCQLSRVSRRMRDVCASLLKSRGMVVLLWAKIRHADGS
SSWQIYDKVWRFSTAFGTVNEWKFANISSMADHLKTCKYNTVARREDAVPLPCMSHTREL
TKEGCSMCSVLRPLL
NT seq
2208 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaactacatgctcattgccagaattgtgtaaacagacgatgtatggcgagacca
gaaactggtgtttcatgtgaccttgtgggttgttctcttgtatgtggagcagttttccac
ttatgtaaagtagaggaacatcgcctactgtgcccttatgaaagagtgccttgccttaat
agtggatttggatgcccctttacaattaaaagaattaaaatggcacagcacctgaaaata
tgtccggcaagtgttgtgtgctgcacaatggaatggaaccggtggcctgtgagctacgca
gatcgcaagtcttatgagaacttgagtaaggaggtctatgatgtggaacaattagatatg
gcattggcattacaagatcaacgcatgttgcttgagtctcttaaagtgacaaccacagtg
gctaaaactgtagatgaggaaaatgaagggataaacccaagcatccaggatgtggaatta
agaaatggacttcttgaaattcatggggaggcatttaatgaactttacaaggcttcagta
gagaaaagcagaaatttagcagcagctttggatattctcagcagtgcaaacaaaggtatt
gacttgattatggaaaacctcagtggtgcaaatgttgattcaaatgcagcttgtcagagg
aatggggatttctgtatgaatgagcaaataaaagaaagtgacacagactcagagtgtgag
ctgggtgctgtaggtggggtagaaaatcttgaagatgatgggacggagtggaaggcagat
ctgtccactgatgaggaggaggaaatgaatgtcaatattaatggcagtgaacaagctctg
tgtaatggatttattaatgtagggggtcatggtcatgtcagacttgaaatgcagagagag
ataaatattggttcttcagacattcggccaatgttgcctcatcattccatggcacgggaa
caagagatacccccatcgccacctctaccacttcctcatcccatgcctctgcctgattta
gtacaaaacaatgttttacagcagctgcctgttgaaattgaagaccggtggctggagcgt
aaacttcagaacctacaagtgcttcgaggtatgagtatgtttacatataatggaaggaaa
actcttctgtccaatccctatttgcttcgggctaaaatggaggataaagcagtggacact
tcagacttagaggttttggacgatccaataggcctacatggtattgacttaattactgct
gcattacttttctgtcttggtgactctccgggaggcagaggcatttctgacagccgcttt
gtggatggatatcgaattgactttggcacacagactttttcctttccctctgctatactg
gccactaacaccatggtgggtgacattgcctctgcgtctgcctgtgaccatgccagccca
cagctgtccaaccccagccctttccacacactcagactggaccttgtgctagagtgtgtg
gctcgctaccagaccaagcagcgctccatgttcacatttgtttgtgggcagctgtttcgc
cgggatgagttctcgtctcattttaaaaatgttcatggtgacattcatgctggcctgaat
ggatggatggaacacaggtgccctttggcattctatggctgtactttctcccagagaaga
ttttgtccaagtgtgcaaggctcaagaatcattcatgaccgctacctgggctcatttggt
gttcagtctggcttagccacacgaccaggtgagaaactctgccaatacggatcccactgt
gaccaccttagtagcttgccctttgagctactgcagcatgttgcaagctttttggatggc
tttactctgtgtcagctgtcccgggtgtctcgtaggatgagggatgtttgtgccagtctg
ctaaaatctcgtggtatggtggtcttgctctgggcaaagattagacatgcagatggatcc
tcatcttggcagatttatgacaaggtatggagatttagcacagcttttggaacggtaaat
gagtggaaatttgccaacatctccagcatggctgaccacctaaagacatgcaagtacaat
acagtggctcgacgagaggatgctgtgcctcttccatgcatgagtcacacaagagaactg
actaaagagggctgctcaatgtgctctgtgctcagacccctgttatag
DBGET
integrated database retrieval system
