Trichomycterus rosablanca: 134332120
Help
Entry
134332120 CDS
T09921
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
trn
Trichomycterus rosablanca
Pathway
trn04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
trn00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
134332120
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
trn00536
]
134332120
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
trn00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
134332120
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
134332120
NCBI-ProteinID:
XP_062869666
LinkDB
All DBs
Position
18:complement(23585654..23641774)
Genome browser
AA seq
2882 aa
AA seq
DB search
MMCYKSSWWCLAGFVVLLGVLVMNSSGQMPGRSLPVQVGSRVRRRGKQESLQGPNVCGSR
LHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCPTGQIASSCASRSSQQCSIK
CMNGGVCEGNHCQCQKGFTGTFCGQPVCEKKCQNGGRCIGPNRCSCVYGFTGPQCERDYR
TGPCFSQLVNKICQGQVSGIVCTKTLCCATVGQAWGHSCEECPTQPQPCRRGFTPNIRTG
ACQDVDECLAMPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHRLNNGTNKCEDVDECSTVPHVCEGG
QCINSAGSFSCVCPSGFMLSADNTRCLGQHTGSCFAAVLGGRCAQELPGRLTKAQCCCDK
GRCWARGTVPEMCPTRRSDEFLRMCFEGTALGEYPDVDPGVVGVRLPQQPSGHDSSLDGQ
MLYPLNGNGHTHPQLPQIPHVHVSENGRGQRPQGPVVSLNQTVNKCLLNPNLCLNGRCIP
VRSSHRCECNSGYQLDGQAECSDINECASDPCINGDCVNTAGSYYCKCHTGYHRPAGKQT
CYDTDECLNNGMLCRNGRCVNTEGSFRCICNTGFQLTPDGRNCKDHDECSITNMCLNGMC
INEDGSFKCVCKHGFTLASNGHYCTDINECLIPGICINGRCINTEGSYKCECMAGLAIGS
DGRTCLDTHMRSTCYGAIKKGVCVRPFQGAVTKSACCCASPEYSFGEPCQPCPVLNSDEF
NALCQSGIGYSVDGSDINECALDPDICSNGVCENLWGRYRCICNIGYEADLSGQTCIDVN
ECLINRLICDNGLCRNSPGSYTCTCPSGFIFRQELDSCEDLNECESSPCINGVCVNNAGS
FSCECSPGSKLDPTGLICYDSLKATCWMTMQDGRCEVNINGATLRSECCATLGAAWGSPC
EPCETDPVCLRGLARPRGTICEDVNECELFPGVCHNGRCVNTRGSFKCQCPAGLTLDASG
LRCVDIRLERCYLTYDEDMCGLPVPGKFRMDACCCTVGSAWGKECDACPEPGTREYEAVC
PRGPGIVNRGDVITGRPVYKDINECKVFPSICTHGTCRNTIGSFRCRCNSGFALDAEERN
CTDIEECKISPDLCGHGTCVNTPGSFECDCFPGYESGFMMMKICMDIDECERNPGLCRGG
SCKNTEGSFQCVCPPGHHVSEESHACEDVNECELSVTLCPNGECVNVAGTYHCSCFSGYQ
STPDRKTCVDIDECTIENGGCDFLCTNSEGSYACSCVHGYVLMPDQRTCADVDECEEEPD
ICDGGQCTNAPGEYHCLCYDGYMASIDTHMCIDVNECDINANICMFGECENTKGSFICHC
EVGYSVKKGSSGCTDVDECKTDAHNCDMHATCANTPGSFHCSCREGWVGNGVKCIDVDEC
TDRTHKCSSNAKCVNTPGSYRCSCSEGFEGDGFTCKDVDECTTNPDLCENGQCLNIPGDF
RCECEMGFTSAPDNRACQDIDECSLQHICVFGTCKNLPGMFRCICDEGYELDRSGGNCTD
VDECLDPINCVNGHCVNTPGSYECNCPLDYELNPTGVGCVDPRVGTCYLEAVNRGRVGFA
CSVEVGIGVSRSSCCCSLGRSWGNPCELCPAVNSSDYNTLCPGGEGFRPNLITVILEDID
ECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPRGYYLNVDTRICEDTDECLMNPGICGPGTCYNTL
GNYTCICPQDYMQVNGGNRCMDMRKGLCFRNYNGTSCENELAFNISHRICCCGYNMGKAW
NKPCQKCPLPGTEEFHTLCGNIAPGYKIDIETGQPVDIDECREIPGICASGVCFNQIGSF
HCECPRGFSYNDLLLVCEDNDECSDSENLCQRNADCINTPGSYRCECSDGFKLSPVGACI
DRKECLETPNLCSHGKCVDIHGGYMCTCHTGFTATSNNKMCIDVDECVRQPCKNGTCKNT
VGSYNCFCHTGFELTLNNQCTDIDECSAAYGQLCRNGHCINSVGSFQCLCDDGYEPSLDG
KNCVDVNECVILSGICAPGTCQNMDGSFRCHCPPGYIVQNSQCVDENECEEDPNICLFGS
CYNKPGSFECVCKPGFVLSGNGRRCYDTRESFCFNRFENGKCTNPQAFNTTKAKCCCSAI
PKEGWGYPCELCPKENEAGFADLCPFGFGIVPGIGDTVIDMNECVENPGICDNGHCVNTD
GSFRCECPTGYTLDSSGIHCIDVDECATGNPCGNGTCVNVIGGFECNCEEGFEPGPIMTC
EDLNECGQNPLLCAFRCINTFGSYECSCPSGYTLREDGRMCQDLDECLEGLHDCDTRGMN
CKNLVGTFMCLCPPGTMRKMDDELCQDENECRTKPDICENGRCVNTIGSFMCECEEGFQP
DSSLTHCVDYRQGFCFTEVLQTMCQMSSSSRIPSTKSQCCCDGGRGWGNQCELCPLPGTA
KYKKLCPHGPGYDTDGTDIDECKLIPDVCKNGRCINTMGTFRCHCDIGYKASIMGTSCVD
LDECTMSPKPCNFICKNTHGSYMCSCPRGYTLQEDGRTCKDLDECQSRRHNCQFMCVNTI
GGFTCKCPPGFTQHHTACIDKDECGSEPNRCGAKGMCHNSPGTFSCKCQQGFSLDSTGLH
CKDVDECKSNHRCQYGCDNMIGGYRCSCPQGYSQHYQWNQCVDENECSTQGTCGTASCYN
TLGSFKCACPSGYTFEQFSNSCQDLDECTSFKNPCNYGCSNTEGGYVCGCPTGYYRVGQG
HCVSGLGFGKGQQGSVSAAGAVEDNILSSEGCYNCNSNGHQKRGIRKSRAANQTELKEEA
PVSLASVDMDQPLLLVLNTSQCNSKKHILELVPALRSLTHHVSYSITAGNEDGIFVLQQR
DGLSYLHCVRKKASAGLYVLVISSYPLYDHTQLLELEDSRNRDYLSGELGQNLHMKLQVT
LQ
NT seq
8649 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtgttataagagcagttggtggtgtttagcgggttttgtggttctgctgggggtt
ttggtgatgaactcttcaggacagatgcccgggagaagcctgccggttcaggtggggagc
agagtgaggagacgtggtaaacaggagtcactgcaggggccaaatgtgtgtggatctcgt
ttgcattcctactgctgtccaggctggaagactttgcctgggggcaaccagtgtatagta
cccatatgccgtaacagctgcggtgatgggttctgttccaggccaaacatgtgcacatgt
ccaacaggtcaaatcgcttcatcctgtgcctccagatcatcccaacagtgtagcatcaag
tgtatgaacggaggggtgtgtgaggggaatcactgccagtgccaaaagggtttcacaggg
accttctgcggacagcctgtgtgtgagaagaagtgtcagaatggagggcgctgcattggg
cccaatcggtgctcatgtgtgtatggatttactggcccacagtgtgaaagagattacaga
acgggtccttgtttctcccagctcgtcaacaagatatgccagggccaggttagtggcatt
gtatgcaccaagactctgtgctgtgccactgttggccaggcctggggtcattcatgtgaa
gaatgtcccactcaaccacagccctgtcgcagaggattcaccccaaacatccgtactgga
gcctgccaagatgttgatgaatgcctagctatgccaggtctatgccaaggaggaaactgc
atcaatacagtgggctcatatgaatgcaagtgtcctgctggccatcgcctgaacaacgga
accaataaatgtgaagatgtggacgagtgctccactgttccacatgtgtgcgaaggagga
cagtgcatcaactcagctggtagtttctcgtgcgtctgtccatctggattcatgttgtcg
gcagataatactcgttgtcttggccagcacacaggttcctgttttgcagcggtgttgggt
gggcgctgtgctcaggagctgcctggacgtctcactaaagctcagtgctgttgtgacaaa
ggccgctgctgggctcgagggacagtgccagagatgtgcccaacccgcagatctgatgaa
ttcctcaggatgtgttttgaaggaacggcactgggagaatatccagatgtggatcctggc
gttgttggagtaagacttcctcagcagcccagtgggcatgattccagtctcgatggacaa
atgctgtatccattaaatgggaacggtcacacacatcctcagcttccccaaatcccccat
gttcatgttagtgaaaatggcaggggacagagaccacaaggacctgtggttagtttaaat
cagacagtcaacaaatgcctgctgaatcccaacttgtgtctcaatggtcgctgtatccca
gtgaggtctagtcatcgttgtgagtgcaacagtggctaccagttggacggtcaagctgaa
tgctcagacataaacgaatgtgcttctgacccgtgcataaatggagactgtgttaacacg
gctggctcgtactactgcaagtgtcatacgggttaccacagacctgcaggcaagcaaacc
tgctatgacactgacgaatgcttgaataacggaatgctgtgtcggaatggccgatgtgta
aacaccgagggcagctttcggtgcatctgcaacacaggcttccagctcacccctgatgga
agaaactgcaaggatcatgatgaatgttccattacaaacatgtgtctgaatggtatgtgc
attaatgaagacggcagcttcaaatgtgtctgcaaacatggtttcacactcgcctctaac
gggcactactgcacagatatcaatgagtgcctgattccaggtatctgcataaatgggcga
tgcataaacactgagggttcatacaagtgtgagtgcatggcaggactagccatcgggtct
gatggacgcacatgcctggacacacacatgcgcagcacctgctatggagctattaaaaag
ggtgtttgtgtgcgcccttttcagggagcagttaccaaatcagcatgctgctgtgccagc
ccagaatacagttttggtgagccttgccagccatgtcctgtcctgaactcagatgaattc
aatgccctgtgtcaaagcgggattggatattcagtagacggatcagacataaatgagtgt
gcactggatcctgatatctgctccaacggagtgtgtgagaatctatggggacgctaccgt
tgtatttgcaacatcggttatgaagctgatctgagtggacagacctgtatagatgttaat
gagtgtctaataaatcgactcatatgtgataacggtctttgtcggaacagtccaggtagc
tacacctgtacatgtccatcaggatttatatttagacaggaattggattcatgtgaagac
ctgaatgaatgtgagagcagcccatgcatcaacggagtgtgtgtaaacaatgctggctct
ttctcctgcgaatgctctcccggcagcaaactggatccaactggcctaatttgctatgac
tctctgaaggcgacttgctggatgaccatgcaggacggccgctgcgaggtgaacattaac
ggggccaccctgaggtcggaatgctgcgctacgctgggagctgcatggggaagtccttgt
gagccctgtgagactgatcctgtctgtttgagaggcttagctcgaccaagagggactatt
tgtgaagatgtaaatgagtgtgagctgtttcctggcgtgtgtcacaatggacgttgcgtg
aacacaagaggctcatttaagtgccagtgtcctgcaggcctgacactggatgccagcgga
ctacgctgcgttgacattcgtttagagcgctgctacctgacctacgacgaggacatgtgt
ggcctgccagtgcccggtaagttcaggatggatgcatgctgctgcacggttggctcagcc
tgggggaaggagtgtgacgcatgcccagagcctggcacacgcgagtatgaagcagtgtgc
cccagaggacctggcattgtcaaccgtggcgacgtgatcacaggcagacccgtgtataaa
gacatcaacgaatgtaaagtgtttcccagcatttgtactcacggaacatgccggaacaca
atcgggagtttcagatgtcgctgtaatagcgggtttgctttagatgcagaagaacgaaac
tgcacagacatcgaggagtgcaaaatctcacctgacctgtgtggacatggcacatgtgtg
aacactccaggcagttttgaatgtgactgctttccaggttatgagagtggatttatgatg
atgaagatctgtatggatattgatgaatgtgaacgaaaccctggactgtgtcggggaggc
tcgtgtaagaatacagaaggaagtttccagtgcgtttgtccacctggccaccatgtgtct
gaggagtcacatgcctgtgaagatgtgaacgagtgtgagctaagtgtcactctgtgccca
aacggcgagtgtgtaaacgtggctggcacttatcactgctcatgtttttctggataccag
tccactcctgacagaaaaacatgcgtagacatagatgagtgcaccatagagaatggagga
tgtgactttctctgtaccaactcagaaggcagctacgcctgcagctgtgtacatggatat
gtgctgatgccagatcagagaacctgtgcagatgtggacgaatgtgaagaagagcctgac
atatgtgatggtggtcagtgtaccaacgctcctggagagtaccactgtctttgttatgac
ggatacatggcttccattgacacacacatgtgtatagatgtgaatgagtgtgacatcaat
gccaacatctgcatgtttggggaatgtgaaaacactaagggatctttcatctgccactgt
gaggttggttactctgtgaagaagggttcctcgggctgcacagatgttgatgagtgtaag
actgatgcccacaattgtgacatgcatgccacctgtgccaacacccccggaagcttccat
tgctcctgcagagagggatgggttgggaatggtgtgaaatgcattgatgtggacgaatgt
accgataggacccacaagtgcagctctaacgcaaagtgtgtaaacacaccaggatcgtat
cgctgttcttgttcagagggctttgaaggagatggcttcacctgtaaagatgtggacgag
tgtactacgaatcctgacctgtgtgaaaatggccagtgtctgaacattccgggagacttt
cgttgcgagtgtgagatgggctttacttcagcccccgacaaccgagcctgccaagatatt
gacgagtgttctcttcagcatatctgtgtgtttggtacatgtaaaaacctccctggcatg
ttccgctgcatttgtgacgagggttatgagctggacagatccgggggcaactgcacagat
gttgacgaatgcttggatcctataaactgtgtgaacggacactgtgtgaacacaccaggc
tcttatgaatgtaactgccctctagattatgaactcaaccctactggagttggttgcgtt
gaccctcgtgttgggacctgttacctggaggctgtgaatcggggtagggttggattcgcc
tgtagtgtggaggtgggcatcggggtcagtcgctcatcctgctgttgctcgctgggtcga
tcctggggaaacccctgtgaactttgtcccgctgtcaacagctctgactacaacacactg
tgtccaggaggagagggatttagacccaatctcatcactgttatactggaggacatagac
gagtgccaggagcttcctggtctgtgtcagggtggaaactgcattaacacgtttggaagc
tttcagtgcgagtgcccgagaggttactacctcaacgtggatactcgaatctgtgaggat
actgatgagtgtttgatgaatcctgggatttgtggtcctggcacatgctataacacgctg
ggcaattacacatgtatctgccctcaagactacatgcaggtcaatggaggcaatcgatgc
atggacatgcgaaaaggcctttgctttcgcaactacaatggaactagctgtgagaacgag
ttggccttcaacatttcacatagaatctgctgctgtggctacaacatgggcaaagcctgg
aataaaccctgccagaaatgtcccctaccaggaacagaggagtttcacacactctgtgga
aacattgcaccagggtataagatagacattgaaactggacaaccagtggatattgatgaa
tgtcgggagatcccaggaatctgcgccagtggtgtatgtttcaaccagattggaagtttt
cattgtgaatgtccaaggggattcagctacaacgatttgctactagtttgtgaagacaac
gatgagtgtagtgactcagaaaacttgtgccagaggaacgcagactgtattaacactcct
ggcagctatcgttgtgagtgctcggatgggttcaagctctcacccgttggagcctgcata
gaccgcaaggagtgtctggaaacccccaacctctgcagccatggcaagtgtgtggacatc
cacggtggttatatgtgtacctgccatactggctttacggccacctccaacaacaagatg
tgcatagatgttgatgaatgtgtgcgtcagccctgtaaaaatggcacatgtaagaacact
gtgggatcctacaattgtttctgccacactggctttgagctcaccctaaataaccaatgc
acagatattgatgaatgttcagcagcgtatggtcagctgtgtaggaatggccactgcatt
aacagtgtgggctccttccagtgtctatgtgatgacggttatgagccgagtctggatgga
aagaactgtgttgatgtaaacgagtgtgtaatcctatccggtatctgtgctcctggaaca
tgccagaacatggacggctctttccgctgtcactgtccgccaggttacattgtgcagaac
agtcagtgtgtagatgaaaacgagtgtgaggaagatcccaacatctgtctgtttggctcc
tgctacaacaaaccaggcagctttgagtgcgtgtgcaaacctggcttcgtgctctctggg
aatggacgccgctgttatgacacacgagagagcttctgcttcaaccgctttgagaatggc
aaatgcaccaaccctcaggccttcaacactaccaaagccaagtgctgctgtagtgcaatt
cccaaagagggctggggttacccctgtgagctctgccccaaagagaatgaagctggattt
gcggacctgtgtccttttggttttgggatcgttccaggcattggggacacagtcatagac
atgaacgagtgtgtggagaatccaggcatctgtgataacggccactgtgtcaacactgat
ggctccttccgctgtgaatgccccacaggctacacacttgattcttctggtatccattgt
atagatgtcgacgagtgtgccacagggaatccatgtggaaacggtacttgcgttaatgtg
attggtggttttgagtgcaactgcgaagaaggattcgaaccaggtcccataatgacatgt
gaagatttaaatgaatgtggacagaatcctttgctttgtgcatttcgctgcataaatacg
tttggaagctacgaatgctcctgcccatcaggctacactctacgggaggatggcagaatg
tgccaggacctggatgagtgtttggagggtttacatgactgtgacaccaggggaatgaac
tgtaaaaaccttgtcggcacttttatgtgtttgtgcccgcctggaacaatgagaaaaatg
gatgatgaattgtgtcaggatgagaacgagtgtcgtactaagcctgatatttgtgagaac
ggccgctgtgtgaacaccataggcagcttcatgtgtgagtgtgaagagggcttccagcca
gactcttctcttactcactgtgtcgactacaggcaaggattctgtttcactgaggtgcta
cagaccatgtgtcagatgtcctccagtagccgaattccaagcaccaagtcccagtgctgc
tgtgacggtggccgtggctggggtaaccagtgcgagctctgtcctctgcctggcactgcc
aagtacaagaaactgtgtccacacggtcccggatatgacaccgatggcacagatatagat
gagtgtaagctgatcccagacgtgtgtaagaatggcaggtgtatcaacactatgggtacc
ttcagatgccactgtgatatcggttataaagccagcattatgggcacttcttgtgttgac
ctggatgagtgtactatgtctccaaagccatgcaatttcatctgtaagaacacacacggg
agctacatgtgctcctgtccacgtggttatacgctgcaggaggacggccggacatgtaaa
gatttggacgaatgccagtcgagaagacacaactgccagttcatgtgtgttaacactatt
ggtggcttcacgtgcaagtgtccaccgggcttcacacaacaccacactgcttgtatagat
aaagatgagtgtggttcagagccaaatcggtgcggagcaaagggcatgtgtcacaactca
cccggcaccttcagctgtaaatgccaacaaggattcagcctggactctactggcctgcat
tgtaaagatgttgatgagtgtaagagtaatcacagatgtcagtacggatgtgataatatg
ataggaggataccgctgcagttgcccacaaggctatagccagcactaccagtggaaccag
tgcgtcgatgaaaatgaatgctccacccaaggcacctgtggtactgcttcctgttacaac
acactgggcagcttcaagtgtgcctgtccctctggctacacctttgagcagttctctaac
agctgccaggatctggatgagtgtacctctttcaagaacccctgcaattatggctgctcc
aacactgaaggaggctacgtgtgtggctgcccaactggatactaccgggtgggccaaggg
cactgtgtttcagggctgggatttggaaagggtcagcaaggatctgtcagtgcagctgga
gcggtggaggataacatcctttcttctgaaggctgctacaactgcaatagcaacggccat
caaaagaggggcatcaggaagagtcgtgctgccaaccaaacagagctaaaagaggaagct
ccagtcagcctggccagtgtggacatggatcagccgttgcttctggtactcaacacatcc
cagtgcaactctaaaaagcacattctggagttggtgcccgccctcaggtctctcacccat
cacgtctcatactccatcacagcgggcaacgaggatgggatttttgtactccagcagcgg
gatgggctgagctacctgcactgtgtacgcaagaaagcctctgctggactgtatgttctg
gtgatcagcagttatcctttgtatgatcacacacaactgctcgagctggaggacagcaga
aacagagactacctctcaggtgagctagggcagaacctgcacatgaagctacaagtcaca
ctgcagtag
DBGET
integrated database retrieval system