Tenacibaculum retecalamus: PG912_00105
Help
Entry
PG912_00105 CDS
T08858
Symbol
mfd
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
Pathway
trt03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
trt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
PG912_00105 (mfd)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
trt03400
]
PG912_00105 (mfd)
Enzymes [BR:
trt01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
PG912_00105 (mfd)
DNA repair and recombination proteins [BR:
trt03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
PG912_00105 (mfd)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TRCF
UvrB_inter
DEAD
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
ResIII
Cas3-like_C_2
RecG_dom3_C
CdiI_ImmP
TPP1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX71245
LinkDB
All DBs
Position
24262..27633
Genome browser
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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caaaaagtataa
DBGET
integrated database retrieval system
