Tenacibaculum retecalamus: PG912_02110
Help
Entry
PG912_02110 CDS
T08858
Name
(GenBank) MerR family transcriptional regulator
KO
K22491
MerR family transcriptional regulator, light-induced transcriptional regulator
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
trt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
trt03000
]
PG912_02110
Transcription factors [BR:
trt03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
MerR family
PG912_02110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MerR_1
MerR
B12-binding_2
TROVE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX71608
LinkDB
All DBs
Position
427874..428767
Genome browser
AA seq
297 aa
AA seq
DB search
MNNIKNSFTIKDLENVSGVKAHTIRIWEKRYGLLSPERTDTNIRYYSSDNLQKLLNVVLL
NTNNHKISKIAEMSNETIIVKARELAFKVAVDDEAINSFKLSMFQFDKVLFNNTYNKLLN
KKTFREIFKDVFIPFLGHIGLLWQTDTLLPAHEHFISNLIAQKIQISTERLEYSVINSET
TYVLFLPENEVHELGLMYLNYELVLRGNSTIYLGQSLPLSNLDYFFESDTKICFITSLTV
QPYDDKIVSYFQEINDIIKGTEHQLIAVGSKTLKVKEIDFEADISLYPSVVSLLKTL
NT seq
894 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaacaacattaaaaattcttttacaattaaagatcttgaaaatgtttcaggggtaaaa
gcgcatactattcgtatttgggagaaacggtatgggttattatcgccagaaagaacagat
actaatattcgatattattcatcagataatttacagaaattgttaaatgttgttttgtta
aatacaaataaccataaaatttctaaaatagctgaaatgtctaatgaaacgattattgtt
aaagcaagagagttggcatttaaagtggctgttgatgatgaggcgattaattcgtttaag
ctctctatgtttcagtttgataaagttttgtttaataatacttataataaattgttaaat
aaaaaaacatttagagagatttttaaagatgtttttattccttttttaggacatataggt
ttattgtggcaaacagatacattgttgccagcgcacgagcatttcatatctaatttaata
gctcagaaaattcaaattagcacagagagattagagtattctgtaattaattcagaaact
acttatgttttatttttgccagaaaatgaggtacatgagcttgggttgatgtatttaaac
tatgaacttgttttaagggggaattcaacaatctatctagggcaaagcttgccattaagt
aatcttgattatttttttgaaagtgatactaaaatttgctttataacatcattaactgtt
cagccttatgatgataagattgtaagttattttcaggaaattaatgatattattaagggg
acagaacatcaattaatcgctgttggtagtaaaactttaaaagtaaaagaaattgatttt
gaagctgatatttctctatatccatcagtagtatcattgttaaaaacattgtag
DBGET
integrated database retrieval system