Tenacibaculum retecalamus: PG912_05220
Help
Entry
PG912_05220 CDS
T08858
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
Organism
trt
Tenacibaculum retecalamus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
AAA_15
AAA_25
RsgA_GTPase
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBX72168
LinkDB
All DBs
Position
1069564..1071330
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MQQHTSSKENKKKPKVSIGKAFKTIIWPRKSLVLIGLVLIVISRLASLVAPLKIKSLLDD
VIPNKDYNALYSLLFVVGTAILIQAITSFLLTRILSVQAQYLISELRAKVQKKVLSLPIS
FFDNTKSGALVSRIMSDVEGVRNLIGTGLVQLVGGSITAIISLILLINISWSMTLFVLIP
VIIFGLVALKAFKYIRPIFRNRGVINAEVKGRLTETLAGVRVIKAFNAEQQENESFEKGV
ALLFQNVKKSLTATAIMTSSATFLLGIASTGIMGIGGYKIMMGELTVGDFLSFTFLLGLM
IAPIVQMSNIGSQLTEALAGLDRTEELMNMEAEEDDAERTIELKDVNGAIKFDDVSFSYE
EGKQVLNNISFKVPKGTVTALVGSSGSGKSTIAGLSATFLNPKSGKVSIDDYDMSKVKLS
SYRKNLGVVLQDEFLFEGSIRENILFPRPDATEQELQNAVKAAYVNEFTDRFDDGLNTLI
GERGVKLSGGQRQRLAIARAILANPKIIILDEATSSLDTESEALIQKSLSELIKDRTTIV
IAHRLSTIKQADQILVIEAGSIVERGTHDELIKKQGRYFELYTYQSKI
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagcaacatacatcatcaaaagaaaacaaaaagaaacctaaagtatcaataggaaaa
gcatttaaaactattatttggccacgtaaaagcttagttttaattggtttagttttaata
gtaataagtaggttggcaagtttggttgctccgttaaaaattaaatcactgctagatgat
gtaattcctaataaagattacaatgcgttatacagcttattatttgttgttggtacagct
attttaattcaagcaataacttcatttttattaacacgtattttaagtgtacaagcacaa
tatttaatttcagaattgcgcgcaaaagtgcaaaagaaagttttgtctttacccattagt
tttttcgataacacaaaatcaggagctttagtttctcgaattatgagtgatgtagaaggg
gttcgtaatttaataggaaccgggttggttcaattagttggaggatcaatcacagccata
atttctttaattttattgataaacataagttggtcaatgacgctgtttgtattaatacct
gtaattatttttgggttagttgctttaaaagcatttaaatatatcaggcctatttttaga
aatagaggcgtaattaatgctgaggtaaaaggacgattaactgaaacgttggcaggtgta
agagtcataaaagcatttaatgcagagcaacaagaaaacgaatcttttgaaaaaggagta
gctcttttgtttcagaatgtaaaaaagagtttaacagcaacggcaatcatgacaagttcg
gcaacttttttattaggaattgcttctacaggaattatgggaattggtggttataaaatt
atgatgggtgaattaaccgttggagattttttatcatttacttttttattaggtttaatg
attgcgccaattgtacaaatgagtaatatcggaagtcaattaacggaggctttagcaggt
ttagatagaaccgaagagttgatgaacatggaagctgaggaagatgatgcagaaagaact
attgagttgaaagatgtaaacggagccataaaatttgacgatgtttctttttcatatgaa
gaaggaaaacaagtactaaataatattagttttaaagtacctaaaggaactgtaacagca
ttggttggaagttctggttctggtaaatctaccattgcaggattatcagcgactttttta
aatccaaaatcaggaaaagtatcgattgatgattacgatatgtcaaaagttaaattaagc
agttaccgtaaaaatttaggagtcgttttacaggatgagtttttatttgaaggatcaata
agagaaaacattttattcccaagaccagatgcaactgaacaagaattacaaaatgctgta
aaagcagcgtatgtaaatgaatttaccgatcgttttgatgacggattaaatacgttaatt
ggtgaaagaggtgtaaaactttctggcggacaacgtcagcgtttggcaattgcaagagcc
attttagcaaatcctaaaattattattttagatgaagctacctctagtttagataccgaa
agtgaagcgttgattcagaaaagtttatcagaattaataaaggacagaacaactattgta
attgcgcatagattaagtacgattaaacaagcagatcaaatattggtgattgaagccggt
tcgatagtagaaagaggtacacatgacgagttgataaaaaaacaagggagatattttgag
ttgtacacctatcaatcaaaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system